Nukleotida adalah prekursor untuk asam nukleat DNA dan RNA yang terdiri dari basa, gula, dan fosfat. Asam nukleat adalah polimer nukleotida yang membawa informasi genetika dan diturunkan dari generasi ke generasi melalui DNA dan RNA.
3. Merupakan prekursor / dasar untuk asam
nukleat, RNA dan DNA
Struktur terdiri dari
– Basa
– Gula
– phosphat
4. Nukleotida berbeda dengan nukleosida
karena nukleosida tdk mempunyai gugus
fosfat
Sehingga kita sering menuliskan nukleotida
sebagai
– Nukleosida monofosfat
– Nukleosida difosfat
– Nukleosida trifosfat
Tergantung pada jumlah fosfat yg dimiliki
Deoksiribonukleotida ditulis dng tambahan
“d” menunjukkan adanya gugus hidroksil
pd atom C nomer 2
5. Terdiri dari 2 golongan :
– Ribonukleotida
– Deoksiribonukleotida
Jenis nukleotida :
– Nama tergantung pada basanya
– Jumlah fosfat yang dimiliki
Adenin AMP, ADP, ATP, dAMP, dADP, dATP
Guanin GMP, GDP, GTP, dGMP, dGDP, dGTP
Sitosin CMP, CDP, CTP, dCTP, dCDP, dCTP
Timin TMP, TDP, TTP, -
Urasil UMP, UDP, UTP, dUMP, dUDP, dUTP
6.
7.
8.
9. Nukleotida mengikat basa nitrogennya
pada atom C no. 1, dgn ikatan glikosida
Gugus fosfat terikat pada gugus hidroksil
atom C no. 5
Kedua kondisi diatas, menyebabkan
nukleotida mempunyai sifat sifat:
– Gugus phosphat bertindak sbg asam
kuat (pKa= 1)
– Gugus amina dr basa purin dan
pirimidine, dpt di protonasi
– Nukleotida mampu menyerap sinar uv
dapat diukur konsentrasinya
10. Asam nukleat
Merupakan bagian organisme hidup yg
sangat penting
Membawa informasi genetika yang akan
diturunkan / ditransfer dr generasi ke
generasi. Semua informasi yg ada dlm sel
DNA
Ada 2 macam:
– Asam deoksiribonukleat : AND / DNA
– Asam ribonukleat : ARN / RNA
Asam nukleat mrpk polimer nukleotida yg
dihubungkan dgn ikatan fosfodiester
11.
12. DNA (DeoxyriboNucleic Acid )
Dikenal sebagai materi genetik
Merupakan komponen kromosom
Merupakan polimer
deoksiribonukleotida yg dihubungkan
dengan ikatan fosfodiester
Backbone (rangka) terdiri dr: gugus
fosfat dan gula yg saling berseling
Memiliki orientasi 5’ 3’ jk gugus
fosfat dr C5 berikatan dgn OH C3
13. Didalam sel dalam
jalin ganda (double
helix)
Dimana gugus fosfat
berada di luar dan
basa nitrogennya di
dalam
Jalin ganda yg
terbentuk bersifat anti
parallel ?
14.
15. Susunan basa nitrogen
pada jalin ganda DNA
tidak random
Guanin (G) – Sitosin (C)
Adenin (A) - Timin (T)
Antara basa nitrogen satu
dengan yang lain
dihubungkan dengan ikatan
hidrogen
Watson and Crick :
replikasi sangat mungkin
untuk suatu DNA
diperbanyak dg informasi yg
sama
16. DNA di dalam sel
ditemukan 3
bntk utama
– Bentuk B
– Bentuk A
– Bentuk Z
Perbedaanya ?
17.
18. seperti halnya protein, asam nukleat juga
mempunyai struktur primer, sekunder dan
tersier
– asam nukleat mempunyai arah sense
- Mempunyai individualitas ditentukan dari
urutan basa nitrogennya disebut sebagai
struktur primer
- Informasi genetik ada pada struktur primer
A C G T C
3’ 3’ 3’ 3’ ACGTC
3’
P P
P P P P OH
5’ 5’ 5’ 5’
5’
19. Struktur sekunder
Double helix
– Watson n Crick menjawab struktur 3D DNA
dgn X-ray diffraction pattern : hsl penelitian
Rosalind Franklin
– Mampu menyimpulkan bahwa :
mempunyai struktur double helix
dengan 10 basa setiap putaran
putaran 360°,
basa Nitrogen A-T , G – C
cekukan mayor and minor
double helix memutar ke kanan
self replication
20. Semikonservatif pd Replikasi DNA
Mekanisme pengkopian
DNA melibatkan
pembukaan double helix
Setiap rantai menjadi
pola / templat untuk pita
baru
Semi konservatif apa
beda dengan konservatif
dan dispersive?
21. X-ray diffraction : ada 2 macam
Yg telah diterjemahkan struktur 3 D
nya : B form
Bentuk yang umum adalah B form
A form RNA double helix
– Gugus OH pd RNA tidak
memungkinkan melipat lebih dekat
membentuk A form yang lebih lebar
22. Dalam kondisi normal (kondisi fisiologis) DNA
relatif stabil
Kadang menjadi tidak stabil krn proses2 replikasi,
transkripsi
23. Disosiasi double helix DNA
denaturasi
– apabila DNA dipanaskan diatas melting
temperaturnya (Tm) maka double helix
akan terbuka
– Tm tergantung pada rasio (G+C)/
(A+T)
– G/C content dapat dihitung dengan
(G+C) / (Total Basa N) x 100%
26. hnRNA heterogeonous nuclear RNA
merupakan hasil transkripsi langsung dr DNA
mRNA
– telah mengalami proses posttranskripsi
menghilangkan intron
informasi genetik dlm btk codon
(urutan 3 nukleotida)
rRNA
– Komponen ribosom dimana translasi berlangsung
tRNA
– Menerjemahkan kode genetik
– Menghubungkan antara asam nukleat dengan asam
amino protein
snRNA
– Small nuclear RNA membantu proses splicing dalam
post transkripsi proses
27. Transfer RNA (tRNA)
composed of
a nucleic acid and
a specific amino acid
provide the link between
the nucleic acid sequence
of mRNA and the amino
acid sequence it codes
for.
An anticodon a
sequence of 3
nucleotides in a tRNA that
is complementary to a
Structure of tRNAs
codon of mRNA
28.
29. Fungsi biologis
DNA sebagai
pembawa informasi
genetik
– DNA komponen
dr kromosom
Fungsi yang lain:
– Nukleotida sbg
pembawa energi
– Nukleotida sebagi
koensim
– enzim