Introducción a la ofimática y a la bioinformática. Clase correspondiente a la materia Informática Médica del Instituto Universitario de Ciencias Biomédicas de Córdoba (IUCBC)
SEMANA 1 GENERALIDADES Y TERMINOLOGIAS EN BIOSEGURIDAD.pptx
Informatica medica 1
1. CONCEPTOS BÁSICOS PARACONCEPTOS BÁSICOS PARA
INFORMÁTICA EN CIENCIASINFORMÁTICA EN CIENCIAS
BIOMÉDICASBIOMÉDICAS
Materia: Informática Médica - Unidad 9Materia: Informática Médica - Unidad 9
Profesor: Dr. Alberto Díaz AñelProfesor: Dr. Alberto Díaz Añel
2. OFIMÁTICAOFIMÁTICA
Conjunto de técnicas, aplicaciones y herramientas informáticas que seConjunto de técnicas, aplicaciones y herramientas informáticas que se
utilizan para optimizar, automatizar y mejorar los procedimientos o tareas.utilizan para optimizar, automatizar y mejorar los procedimientos o tareas.
Las herramientas ofimáticas permiten idear, crear, manipular, transmitir y/oLas herramientas ofimáticas permiten idear, crear, manipular, transmitir y/o
almacenar la información. Las más utilizadas son:almacenar la información. Las más utilizadas son:
• Procesador de textos (Word).Procesador de textos (Word).
• Hojas de cálculo (Excel).Hojas de cálculo (Excel).
• Herramientas de presentación multimedia (PowerPoint).Herramientas de presentación multimedia (PowerPoint).
• Utilidades: agendas, calculadoras, etc.Utilidades: agendas, calculadoras, etc.
• Programas de correo electrónico, correo de voz, mensajeros.Programas de correo electrónico, correo de voz, mensajeros.
• Herramientas de reconocimiento y síntesis del habla.Herramientas de reconocimiento y síntesis del habla.
3. Procesadores de textoProcesadores de texto
•Brindan una amplia gama de funcionalidades, ya sean tipográficas,Brindan una amplia gama de funcionalidades, ya sean tipográficas,
idiomáticas u organizativas.idiomáticas u organizativas.
•Como regla general, todos pueden trabajar con distintos tipos y tamañosComo regla general, todos pueden trabajar con distintos tipos y tamaños
de letra, formato de párrafo y efectos artísticos; además de brindar lade letra, formato de párrafo y efectos artísticos; además de brindar la
posibilidad de intercalar o superponer imágenes u otros objetos gráficos dentroposibilidad de intercalar o superponer imágenes u otros objetos gráficos dentro
del texto.del texto.
•Como ocurre con la mayoría de las herramientas informáticas, los trabajosComo ocurre con la mayoría de las herramientas informáticas, los trabajos
realizados en un procesador de texto pueden ser guardados en formarealizados en un procesador de texto pueden ser guardados en forma
de archivos (documentos), así como impresos a través de diferentes medios.de archivos (documentos), así como impresos a través de diferentes medios.
4. Procesadores de textoProcesadores de texto
•La mayoría de los procesadores de texto más utilizados en la actualidad seLa mayoría de los procesadores de texto más utilizados en la actualidad se
basan en el concepto WYSIWYG (del inglésbasan en el concepto WYSIWYG (del inglés What You See Is What You GetWhat You See Is What You Get,,
“lo que ve es lo que obtiene”).“lo que ve es lo que obtiene”).
•Los procesadores de texto incorporan correctores de ortografía y gramática,Los procesadores de texto incorporan correctores de ortografía y gramática,
así como diccionarios multilingües y de sinónimos que facilitan en granasí como diccionarios multilingües y de sinónimos que facilitan en gran
medida la labor de redacción.medida la labor de redacción.
5. Procesadores de texto más utilizadosProcesadores de texto más utilizados
ComercialesComerciales
Microsoft Word (Windows y Mac)Microsoft Word (Windows y Mac)
Word Perfect (Windows)Word Perfect (Windows)
Documents to Go (Android, iOS)Documents to Go (Android, iOS)
GratuitosGratuitos
Apache OpenOffice Writer (Windows, Mac y Linux)Apache OpenOffice Writer (Windows, Mac y Linux)
LibreOffice Writer (Windows , Mac y Linux)LibreOffice Writer (Windows , Mac y Linux)
En líneaEn línea
Google Docs (Windows y Mac)Google Docs (Windows y Mac)
6. Procesadores de textoProcesadores de texto
¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?
Trabajo de investigación profesionalTrabajo de investigación profesional
Seguimiento personal de pacientesSeguimiento personal de pacientes
TesisTesis
Redacción delRedacción del curriculum vitaecurriculum vitae
Informe científico y técnicoInforme científico y técnico
Comunicación con colegas o institucionesComunicación con colegas o instituciones
Pedidos de informes, bibliografía, etc.Pedidos de informes, bibliografía, etc.
Documentos legalesDocumentos legales
Publicaciones en revistas especializadasPublicaciones en revistas especializadas
Notas de divulgaciónNotas de divulgación
7. Microsoft WordMicrosoft Word
Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la
redacción de documentosredacción de documentos
Tipo y tamaño de letraTipo y tamaño de letra
Arial 11 (digital)
Times 12 (impreso)
8. Microsoft WordMicrosoft Word
Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la
redacción de documentosredacción de documentos
Espaciado sencilloEspaciado sencillo
Dejar un espacio luego de títulos,Dejar un espacio luego de títulos,
subtítulos, secciones, etc.subtítulos, secciones, etc.
9. Microsoft WordMicrosoft Word
Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la
redacción de documentosredacción de documentos
Utilizar márgenes adecuadosUtilizar márgenes adecuados
10. Microsoft WordMicrosoft Word
Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la
redacción de documentosredacción de documentos
Hacer uso inserciones cuando seaHacer uso inserciones cuando sea
necesario:necesario:
EncabezadoEncabezado
Pie de páginaPie de página
Número de páginaNúmero de página
Cuadros de textoCuadros de texto
TablasTablas
ImágenesImágenes
11. Microsoft WordMicrosoft Word
Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la
redacción de documentosredacción de documentos
¡Revisar la ortografía y la gramática!¡Revisar la ortografía y la gramática!
12. Hojas de cálculoHojas de cálculo
•Son un tipo de documentos que permitenSon un tipo de documentos que permiten
manipular datos numéricos y alfanuméricos dispuestos en forma demanipular datos numéricos y alfanuméricos dispuestos en forma de
tablas, las cuales se componen detablas, las cuales se componen de celdasceldas que se organizan en unaque se organizan en una
matriz bidimensional dematriz bidimensional de filasfilas yy columnascolumnas..
•La celda es la unidad básica de información en la hoja de cálculo,La celda es la unidad básica de información en la hoja de cálculo,
donde se insertan los valores y las fórmulas que realizan losdonde se insertan los valores y las fórmulas que realizan los
cálculos.cálculos.
•Es posible realizar cálculos complejos con fórmulas y funciones yEs posible realizar cálculos complejos con fórmulas y funciones y
crear distintos tipos de gráficos con los datos ingresados.crear distintos tipos de gráficos con los datos ingresados.
13. Hojas de cálculo más utilizadasHojas de cálculo más utilizadas
ComercialesComerciales
Microsoft Excel (Windows y Mac)Microsoft Excel (Windows y Mac)
Corel Quattro Pro para Word Perfect (Windows)Corel Quattro Pro para Word Perfect (Windows)
Documents to Go (Android, iOS)Documents to Go (Android, iOS)
GratuitasGratuitas
Apache OpenOffice Calc (Windows, Mac y Linux)Apache OpenOffice Calc (Windows, Mac y Linux)
LibreOffice Calc (Windows , Mac y Linux)LibreOffice Calc (Windows , Mac y Linux)
En líneaEn línea
Google Docs (Windows y Mac)Google Docs (Windows y Mac)
14. Hojas de cálculoHojas de cálculo
¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?
Trabajo de investigación profesionalTrabajo de investigación profesional
Seguimiento personal de pacientesSeguimiento personal de pacientes
Análisis estadísticosAnálisis estadísticos
Realización de cálculos complejos de uso periódicoRealización de cálculos complejos de uso periódico
Creación de gráficos a partir de grandes volúmenes de datos para unaCreación de gráficos a partir de grandes volúmenes de datos para una
mejor comprensión visualmejor comprensión visual
18. Programas de presentaciónProgramas de presentación
•Un programa de presentación es un paquete de software que seUn programa de presentación es un paquete de software que se
utiliza para mostrar información, a través de una serieutiliza para mostrar información, a través de una serie
de diapositivas.de diapositivas.
•Típicamente incluye tres funciones principales: un editor queTípicamente incluye tres funciones principales: un editor que
permite insertar un texto y darle formato, un método para insertar ypermite insertar un texto y darle formato, un método para insertar y
manipular imágenes, gráficos, sonidos y videos, y un sistema paramanipular imágenes, gráficos, sonidos y videos, y un sistema para
agregar a los contenidos efectos de animación.agregar a los contenidos efectos de animación.
19. Programas de presentación más utilizadosProgramas de presentación más utilizados
ComercialesComerciales
Microsoft PowerPoint (Windows y Mac)Microsoft PowerPoint (Windows y Mac)
Documents to Go (Android, iOS)Documents to Go (Android, iOS)
GratuitasGratuitas
Apache OpenOffice Impress (Windows, Mac y Linux)Apache OpenOffice Impress (Windows, Mac y Linux)
LibreOffice Impress (Windows , Mac y Linux)LibreOffice Impress (Windows , Mac y Linux)
En líneaEn línea
Google Docs (Windows y Mac)Google Docs (Windows y Mac)
Prezi (prezi.com)Prezi (prezi.com)
20. Programas de presentaciónProgramas de presentación
¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?
Clases en universidades u otras instituciones educativasClases en universidades u otras instituciones educativas
Conferencias en congresos, ateneos, etc.Conferencias en congresos, ateneos, etc.
Defensas de TesisDefensas de Tesis
Charlas de divulgaciónCharlas de divulgación
Pósters para congresosPósters para congresos
23. 1.1. Tratar de que sean simples.Tratar de que sean simples.
2.2. De ser posible, usar un estilo personal y único.De ser posible, usar un estilo personal y único.
3.3. Las presentaciones deben ser fáciles de ver y de leer, aun en pantallasLas presentaciones deben ser fáciles de ver y de leer, aun en pantallas
pequeñas. Usar tipos de fuentes que faciliten la lectura y no fatiguen alpequeñas. Usar tipos de fuentes que faciliten la lectura y no fatiguen al
lector, elegir el tamaño adecuado para cada uso.lector, elegir el tamaño adecuado para cada uso.
4.4. Cuando se pueda, usar siempre imágenes, fotografías y otros elementosCuando se pueda, usar siempre imágenes, fotografías y otros elementos
gráficos, los cuales son procesados más rápidamente por nuestro cerebrográficos, los cuales son procesados más rápidamente por nuestro cerebro
que el texto.que el texto.
Consejos para las presentacionesConsejos para las presentaciones
24. 5.5. Cuando sea necesario y lo requiera, usar audio, música y videos en lasCuando sea necesario y lo requiera, usar audio, música y videos en las
presentaciones, le agregarán valor.presentaciones, le agregarán valor.
6.6. Evitar las transiciones muy complicadas y sofisticadas.Evitar las transiciones muy complicadas y sofisticadas.
7.7. Usar las páginas de notas para agregar información extra, pero necesariaUsar las páginas de notas para agregar información extra, pero necesaria
en cada dispositiva.en cada dispositiva.
8.8. Comprobar siempre la ortografía y la gramática.Comprobar siempre la ortografía y la gramática.
Consejos para las presentacionesConsejos para las presentaciones
25. La edición digital de imágenes se ocupa de la edición apoyada en programas La edición digital de imágenes se ocupa de la edición apoyada en programas
de manejo de imágenes digitales, en la mayoría de los casos fotos o de manejo de imágenes digitales, en la mayoría de los casos fotos o
documentos escaneados. Estas imágenes son modificadas para optimizarlas, documentos escaneados. Estas imágenes son modificadas para optimizarlas,
manipularlas, retocarlas, etc., para su posterior exposición o comunicación.manipularlas, retocarlas, etc., para su posterior exposición o comunicación.
Estos programas también pueden incluir herramientas de diseño gráfico, las Estos programas también pueden incluir herramientas de diseño gráfico, las
cuales se utilizan para concebir, programar, proyectar y cuales se utilizan para concebir, programar, proyectar y
realizar comunicaciones visuales destinadas a realizar comunicaciones visuales destinadas a
transmitir mensajes específicos a diferentes grupos, posibilitando la transmitir mensajes específicos a diferentes grupos, posibilitando la
comunicación gráfica de ideas, hechos, investigaciones, etc.comunicación gráfica de ideas, hechos, investigaciones, etc.
Editores de imágenes científicasEditores de imágenes científicas
27. Características principalesCaracterísticas principales
Formatos másFormatos más
utilizadosutilizados
•GIF: se utiliza para laGIF: se utiliza para la
web. Menos colores yweb. Menos colores y
más pequeños.más pequeños.
•JPEG: ideal paraJPEG: ideal para
presentaciones. Sonpresentaciones. Son
archivos comprimidosarchivos comprimidos
(pierden información).(pierden información).
•TIFF: conservan todaTIFF: conservan toda
la información de lala información de la
imagen. Son archivosimagen. Son archivos
más grandes y pesados.más grandes y pesados.
28. ImageJ (http://imagej.nih.gov/ij/)ImageJ (http://imagej.nih.gov/ij/)
•Desarrollado por elDesarrollado por el
NIHNIH
•GratuitoGratuito
•Permite agregarPermite agregar
“plugins” para“plugins” para
procesar y analizarprocesar y analizar
datosdatos
•Es de programaciónEs de programación
abiertaabierta
Programas de edición de imágenes más utilizadosProgramas de edición de imágenes más utilizados
29. Fiji (http://fiji.sc/Fiji)Fiji (http://fiji.sc/Fiji)
•Se originó a partirSe originó a partir
del ImageJdel ImageJ
•GratuitoGratuito
•Posee mayorPosee mayor
número denúmero de
“plugins” para“plugins” para
procesar y analizarprocesar y analizar
imágenesimágenes
científicascientíficas
(microscopía)(microscopía)
•Es deEs de
programaciónprogramación
abiertaabierta
30. Adobe PhotoshopAdobe Photoshop
•Ideal paraIdeal para
edición de fotosedición de fotos
y para diseñoy para diseño
gráficográfico
•Es pagoEs pago
•Gran variedadGran variedad
de filtros yde filtros y
efectosefectos
•IncorporaIncorpora
impresión 3Dimpresión 3D
31. Corel DrawCorel Draw
•Ideal paraIdeal para
diseño gráficodiseño gráfico
•Utiliza otroUtiliza otro
programa paraprograma para
edición de fotosedición de fotos
(Corel Photo(Corel Photo
Paint)Paint)
•Es pagoEs pago
•Gran variedadGran variedad
de filtros yde filtros y
efectosefectos
32. GIMP (http://www.gimp.org/)GIMP (http://www.gimp.org/)
•Ideal paraIdeal para
edición de fotosedición de fotos
y para diseñoy para diseño
gráficográfico
•Similar alSimilar al
PhotoshopPhotoshop
•GratuitoGratuito
•Se incluye enSe incluye en
muchosmuchos
sistemas Linuxsistemas Linux
35. "La informática médica es la aplicación de la"La informática médica es la aplicación de la
tecnología informática a todos los ámbitos de latecnología informática a todos los ámbitos de la
medicina - la atención médica, la enseñanza de lamedicina - la atención médica, la enseñanza de la
medicina y la investigación“.medicina y la investigación“.
Morris F. Collen, 1977Morris F. Collen, 1977
37. Dominios de la Informática MédicaDominios de la Informática Médica
El cuidado clínicoEl cuidado clínico: prestación de servicios al paciente: prestación de servicios al paciente
El sistema de saludEl sistema de salud: entorno de atención clínica, incluyendo educación e investigación: entorno de atención clínica, incluyendo educación e investigación
La información y la comunicaciónLa información y la comunicación: herramientas para captura, transmisión y uso de: herramientas para captura, transmisión y uso de
datos, información y conocimientodatos, información y conocimiento
38. USOS MÉDICOS DE LA INFORMÁTICAUSOS MÉDICOS DE LA INFORMÁTICA
• Historia clínica electrónicaHistoria clínica electrónica
• Intercambio de informaciónIntercambio de información
• Sistemas para la administración de la atenciónSistemas para la administración de la atención
médicamédica
• Diseminación y recuperación de informaciónDiseminación y recuperación de información
• Sistemas de monitorización de los pacientesSistemas de monitorización de los pacientes
• Procesamiento electrónico de imágenesProcesamiento electrónico de imágenes
• BioinformáticaBioinformática
39. BioinformáticaBioinformática
Es la investigación, desarrollo y/o aplicación de herramientasEs la investigación, desarrollo y/o aplicación de herramientas
computacionales para la expansión del uso de datos biológicos, médicos ocomputacionales para la expansión del uso de datos biológicos, médicos o
conductuales, incluyendo aquellas herramientas que sirvan para adquirir,conductuales, incluyendo aquellas herramientas que sirvan para adquirir,
almacenar, organizar, analizar o visualizar tales datos.almacenar, organizar, analizar o visualizar tales datos.
40. BioinformáticaBioinformática
Es el estudio de cómo la información se representa y transmite en losEs el estudio de cómo la información se representa y transmite en los
sistemas biológicos, empezando por el nivel molecular, incluyendosistemas biológicos, empezando por el nivel molecular, incluyendo
información sobre secuencias (ADN, proteínas), estructuras y vías deinformación sobre secuencias (ADN, proteínas), estructuras y vías de
señalización biológicas.señalización biológicas.
La bioinformática se vincula con la informática médica en tanto queLa bioinformática se vincula con la informática médica en tanto que
abarca las bases de datos sobre bibliografía especializada, el genomaabarca las bases de datos sobre bibliografía especializada, el genoma
humano, las enfermedades hereditarias a nivel molecular, las víashumano, las enfermedades hereditarias a nivel molecular, las vías
metabólicas y muchos otros datos de utilidad para los profesionales de lametabólicas y muchos otros datos de utilidad para los profesionales de la
salud.salud.
41. HISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICAHISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICA
1953: Watson y Crick proponen la estructura de doble hélice1953: Watson y Crick proponen la estructura de doble hélice
del ADN.del ADN.
1955:1955: Frederick Sanger secuencia la primera proteínaFrederick Sanger secuencia la primera proteína
(insulina bovina).(insulina bovina).
1958: Jack Kilby construye el primer circuito integrado en los1958: Jack Kilby construye el primer circuito integrado en los
laboratorios de Texas Instruments.laboratorios de Texas Instruments.
1965:1965: Margaret Dayhoff, una de las pioneras de la bioinformática,Margaret Dayhoff, una de las pioneras de la bioinformática,
publica el primero de los Atlas de secuencias de proteínas.publica el primero de los Atlas de secuencias de proteínas.
1969:1969: Nace , que enlaza computadoras de diferentes universidadesNace , que enlaza computadoras de diferentes universidades
de los EE.UU., esbozo de lo que seríade los EE.UU., esbozo de lo que sería
42. HISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICAHISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICA
1970:1970: Se crea el algoritmo de Needleman-Wunsch para alineamientoSe crea el algoritmo de Needleman-Wunsch para alineamiento
de secuencias.de secuencias.
1972:1972: Paul Berg crea la primera molécula de ADN recombinante.Paul Berg crea la primera molécula de ADN recombinante.
1977: Frederick Sanger comienza la secuenciación de ADN y el1977: Frederick Sanger comienza la secuenciación de ADN y el
desarrollo de software para analizarlo.desarrollo de software para analizarlo.
1978: Se publica la primera secuencia de genes completa de un1978: Se publica la primera secuencia de genes completa de un
organismo, el fago Φ-X174 (5.386 pares de basesorganismo, el fago Φ-X174 (5.386 pares de bases
que codifican 9 proteínas).que codifican 9 proteínas).
1982: Kurt Wüthrich publica el método de utilización de la RMN1982: Kurt Wüthrich publica el método de utilización de la RMN
(Resonancia Magnética Nuclear) para determinar estructuras de(Resonancia Magnética Nuclear) para determinar estructuras de
proteínas.proteínas.
43. HISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICAHISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICA
1981-1988: Aparecen importantes bases de datos biológicas (GenBank y1981-1988: Aparecen importantes bases de datos biológicas (GenBank y
SwissProt).SwissProt).
1983: Se descubre la PCR (Polymerase Chain Reaction, reacción en1983: Se descubre la PCR (Polymerase Chain Reaction, reacción en
cadena de la polimerasa), que permite la multiplicación de muestras decadena de la polimerasa), que permite la multiplicación de muestras de
ADN para su análisis.ADN para su análisis.
1988:1988: Arranca el Proyecto Genoma Humano.Arranca el Proyecto Genoma Humano.
1990:1990: Tim Berners-Lee crea la World Wide Web (protocolos de red eTim Berners-Lee crea la World Wide Web (protocolos de red e
hipertextos).hipertextos).
1990: Se crean algoritmos de búsqueda rápida de similitudes entre1990: Se crean algoritmos de búsqueda rápida de similitudes entre
secuencias (BLAST).secuencias (BLAST).
44. HISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICAHISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICA
1994:1994: Aparece el programa ClustalW para el alineamiento múltiple deAparece el programa ClustalW para el alineamiento múltiple de
secuencias.secuencias.
1995-1999: Se secuencian los primeros genomas de bacterias (1995),1995-1999: Se secuencian los primeros genomas de bacterias (1995),
levadura (1996, primer eucariota),levadura (1996, primer eucariota), CaenorhabditisCaenorhabditis (1998, primer(1998, primer
multicelular), y el primer cromosoma humano (1999, el #22).multicelular), y el primer cromosoma humano (1999, el #22).
2000:2000: Se publican los primeros genomas de plantas e insectos.Se publican los primeros genomas de plantas e insectos.
2001:2001: Aparece publicado el genoma humano.Aparece publicado el genoma humano.
2005:2005: Se completa el proyecto HapMap, que cataloga las variacionesSe completa el proyecto HapMap, que cataloga las variaciones
genéticas en el ser humano.genéticas en el ser humano.
2008:2008: Se presenta el primer borrador del proteoma humano.Se presenta el primer borrador del proteoma humano.
Todas ellas pueden estar agrupadas en una Suite ofimática, que es un paquete de múltiples herramientas ofimáticas.
El cuidado clínico: como la prestación de servicios clínicos a un paciente individual.
El sistema de salud: es decir, las estructuras, procesos y los incentivos que dan forma al entorno de la atención clínica, en todos los niveles, desde la salud pública hasta la salud individual, incluyendo la EDUCACIÓN y la investigación clínica.
La información y la comunicación: es decir, las herramientas que permiten la CAPTURA eficiente, la ENTREGA, la TRANSMISIÓN, y el USO de DATOS, INFORMACIÓN y CONOCIMIENTO; y el conocimiento de cómo aplicar esas herramientas de manera eficaz.