1. Стандартная запись Swiss-Prot

2. Стандартные поля: entry, name, origin
Название записи, уникальный идентификатор (ID), предыдущие
идентификаторы соответствующей записи, даты первой и последней
модификаций, распространенное название белка и его синонимы (EC
номер для ферментов), название гена, организм и его таксономия,
уровень подтверждения

3. Enzyme (ферменты)
http://enzyme.expasy.org/EC/2.7.10.1

4. NiceZyme View
http://www.icp.ucl.ac.be/~opperd/lysozyme00/results/enzyme-search-ec.html

5. UniProt - Taxonomy
http://www.uniprot.org/taxonomy/9986

6. Ссылки на статьи, использованные для
аннотации

7. Комментарии

9. Возможные разделы комментариев

10. Cross-References

11. Cross-References
регистрация

12. 3D-Structure (список структур)

13. Reactome - курируемая база знаний биологический путей
http://www.reactome.org/ReactomeGWT/entrypoint.
html
http://www.genomeknowledge.org/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=177934

14. GO terms
Определение
термина,
синонимы,
родительские
(Hierarchy) и
дочерние термины,
ключевые слова,
дата последней
модификации
http://www.geneontology.org/
Поиск гена или
его продукта,
BLAST, поиск по
GO ID, просмотр
онтологии

16. Cross-References, Keywords

17. KEGG Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
http://www.genome.jp/kegg/

18. KEGG (pathway viewer)

19. DrugBank

20. UniProt http://www.uniprot.org/

21. http://www.uniprot.org/uniprot/Q7M419

22. Keywords

23. Сервер Expasy http://www.expasy.org/

24. Словарь ключевых слов
http://www.uniprot.org/docs/keywlist

25. FASTA format
Программа FASTA (1988, WR Pearson & DJ Lipman):
>(the definition line)_уникальный_ID + короткое описание
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ БЕЛКА (ИЛИ ДНК) В ОДНОБУКВЕННОМ
КОДЕ
RAW format – без definition line

26. Базы данных
Exp.Method Proteins Nucleic Acids
Protein/NA
Complexes
Other Total
На 22.02.2011
PDB

27. Базы данных OCA