SlideShare una empresa de Scribd logo
1 de 15
DNS hibajavítás, rák és RecQ
helikázok
Kocsis Zsuzsa
ELTE Biokémiai Tanszék,
ELTE-MTA “Lendület” Motor
Enzimológiai Kutatócsoport: mk-lab.org
2013.11.14.
A DNS
szerkezet
•Cukor és foszfát egységek alkotják a
gerincet
•Négy szerves bázis: kettő-kettő
egymást kölcsönösen meghatározza
•A bázisok hármassával adják a kódot
•Két szál
A hibák okai
Endogén források:
Oxidatív károsítás
(szabad gyökök-oxigén anyagcsere)
Replikatív hibák
Spontán DNS módosulás
Alkiláló szerek
Exogén források:
UV-sugárzás
Légszennyezés
Dohányzás
Élelmiszerek
(malondialdehid)
Diagnosztika
(ionizáló sugárzás
Röntgen sugárzás)
Kemoterápia
A DNS-ben
keletkező
hibák:
akár 100.000
hiba/nap/sejt1
1: Lodish et al, Molecular biology of the Cell, 2004
A rák kialakulása
A tumor kialakulásához szükséges
Túl sok sejt: túl gyors osztódás, lassú pusztulás
1, Külső szabályozás nélküli sejtosztódás – oncogének aktiválódása
2, Rezisztencia a növekedési gátlással szemben – pl. kontakt gátlás megszűnése
3, Programozott sejthalál kiiktatása – pl. az anoikis jelenségének felfüggesztése
4, Immortalizáció, az öregedés megszűnése – telomeráz enzimaktivitás megjelenése
5, Angiogenezis elősegítése – új vérerek kialakulása a daganat ellátása érdekében
6, Invázió és metasztázis – proteázok szekréciója, fokozott sejtmozgás, integrinek
kicserélődése, stb.
Folyamatos hiba felhalmozás: Nincs két ugyanolyan ráksejt!!
Hibajavító útvonalak
Mismatch javítás
Rekombináció-alapú
javítás
HR / NHEJ
Hiba-tolerancia
TLS
Kivágó javító útvonalak:
BER / NER
A homológ
rekombinációs
javítás
Decognites A., et al. Front Genet. 2013
A RecQ helikázok
• Helikázok!
• Hiánybetegségeik: Bloom, Werner, Rothmund-
Thompson szindróma
• Genomkarbantartók: homológ rekombináció
nem-mutagén irányba
D-loop felbontása
• Replikációs villa
• Telomer karbantartás
Williams and Wilkens Publishing
Domén-
szerkezet
Módszerünk: a Stopped-flow
Források: http://www.atascientific.com.au, és http://chemwiki.ucdavis.edu
Mérhető adatok
1E-4 1E-3 0,01 0,1 1
0,4
0,6
0,8
1,0
10
-4
Normalizált
Trp
fluoreszcencia
Idő (s)
10
-3
0 50 100 150 200 250
0
6
12
300
600
900
1200
ADP.AlF4
apo
ADP.AlF4
AMPPNP
ADP
AMPPNP
ADP
apo
k
megfigyelt
(s
-1
)
[dT54
] (M, nt)
Extension
(µM)
Módszerünk: a magnetic tweezer
Köszönöm a figyelmet!
• A kutatás a TÁMOP 4.2.4.A/1-11-1-
2012-0001 azonosító számú Nemzeti
Kiválóság Program – Hazai hallgatói,
illetve kutatói személyi támogatást
biztosító rendszer kidolgozása és
működtetése országos program című
kiemelt projekt keretében zajlott. A
projekt az Európai Unió
támogatásával, az Európai Szociális
Alap társfinanszírozásával valósul meg.

Más contenido relacionado

Más de Budapest Science Meetup

Bereczki Zsolt: Agyafúrt ősök - Koponyasebészeti beavatkozások kutatásának ak...
Bereczki Zsolt: Agyafúrt ősök - Koponyasebészeti beavatkozások kutatásának ak...Bereczki Zsolt: Agyafúrt ősök - Koponyasebészeti beavatkozások kutatásának ak...
Bereczki Zsolt: Agyafúrt ősök - Koponyasebészeti beavatkozások kutatásának ak...Budapest Science Meetup
 
BpSM 2014.09. - Molnár Erika: Néma tanúk vallomása a rák történetéről
BpSM 2014.09. - Molnár Erika: Néma tanúk vallomása a rák történetérőlBpSM 2014.09. - Molnár Erika: Néma tanúk vallomása a rák történetéről
BpSM 2014.09. - Molnár Erika: Néma tanúk vallomása a rák történetérőlBudapest Science Meetup
 
BpSM 2014.09. - Sebestyén Endre: Alternatív splicing változások elemzése rákg...
BpSM 2014.09. - Sebestyén Endre: Alternatív splicing változások elemzése rákg...BpSM 2014.09. - Sebestyén Endre: Alternatív splicing változások elemzése rákg...
BpSM 2014.09. - Sebestyén Endre: Alternatív splicing változások elemzése rákg...Budapest Science Meetup
 
BpSM 2014.09. - Haidegger Tamás: Sebészrobotok nálunk és más nemzeteknél
BpSM 2014.09. - Haidegger Tamás: Sebészrobotok nálunk és más nemzeteknélBpSM 2014.09. - Haidegger Tamás: Sebészrobotok nálunk és más nemzeteknél
BpSM 2014.09. - Haidegger Tamás: Sebészrobotok nálunk és más nemzeteknélBudapest Science Meetup
 
2014.06.: Ősi Attila - Dinoszauruszok Magyarországon: egy 85 millió éves ökos...
2014.06.: Ősi Attila - Dinoszauruszok Magyarországon: egy 85 millió éves ökos...2014.06.: Ősi Attila - Dinoszauruszok Magyarországon: egy 85 millió éves ökos...
2014.06.: Ősi Attila - Dinoszauruszok Magyarországon: egy 85 millió éves ökos...Budapest Science Meetup
 
BpSM 2014.06.: Hajdu Tamás - Kulturális hatás vagy vándorlás? Népességváltozá...
BpSM 2014.06.: Hajdu Tamás - Kulturális hatás vagy vándorlás? Népességváltozá...BpSM 2014.06.: Hajdu Tamás - Kulturális hatás vagy vándorlás? Népességváltozá...
BpSM 2014.06.: Hajdu Tamás - Kulturális hatás vagy vándorlás? Népességváltozá...Budapest Science Meetup
 
BpSM 2014.05.: Aliczki Manó: Kannabinoidkezelések a szorongásos zavarok teráp...
BpSM 2014.05.: Aliczki Manó: Kannabinoidkezelések a szorongásos zavarok teráp...BpSM 2014.05.: Aliczki Manó: Kannabinoidkezelések a szorongásos zavarok teráp...
BpSM 2014.05.: Aliczki Manó: Kannabinoidkezelések a szorongásos zavarok teráp...Budapest Science Meetup
 
BpSM 2014.04. - Vásárhelyi Gábor: Drón vs. galamb - csoportos mozgás a köbön
BpSM 2014.04. - Vásárhelyi Gábor: Drón vs. galamb - csoportos mozgás a köbönBpSM 2014.04. - Vásárhelyi Gábor: Drón vs. galamb - csoportos mozgás a köbön
BpSM 2014.04. - Vásárhelyi Gábor: Drón vs. galamb - csoportos mozgás a köbönBudapest Science Meetup
 
BpSM 2014.04. - Kopniczky Margarita: Mit építsünk az élet anyagából?
BpSM 2014.04. - Kopniczky Margarita: Mit építsünk az élet anyagából?BpSM 2014.04. - Kopniczky Margarita: Mit építsünk az élet anyagából?
BpSM 2014.04. - Kopniczky Margarita: Mit építsünk az élet anyagából?Budapest Science Meetup
 
BpSM 2014.04. - Raffai Péter: Kozmikus dallam a múltból - Hogyan fedezte fel ...
BpSM 2014.04. - Raffai Péter: Kozmikus dallam a múltból - Hogyan fedezte fel ...BpSM 2014.04. - Raffai Péter: Kozmikus dallam a múltból - Hogyan fedezte fel ...
BpSM 2014.04. - Raffai Péter: Kozmikus dallam a múltból - Hogyan fedezte fel ...Budapest Science Meetup
 
BpSM 2014.03. - Molnár János: A mangalica genom jellemzése bioinformatikai mó...
BpSM 2014.03. - Molnár János: A mangalica genom jellemzése bioinformatikai mó...BpSM 2014.03. - Molnár János: A mangalica genom jellemzése bioinformatikai mó...
BpSM 2014.03. - Molnár János: A mangalica genom jellemzése bioinformatikai mó...Budapest Science Meetup
 
Yamaji Bogdán: A jövő atomreaktora(i)
Yamaji Bogdán: A jövő atomreaktora(i)Yamaji Bogdán: A jövő atomreaktora(i)
Yamaji Bogdán: A jövő atomreaktora(i)Budapest Science Meetup
 
Varjú Zoltán: Miért vagy olyan negatív? - tartalomelemzés és kognitív torzulá...
Varjú Zoltán: Miért vagy olyan negatív? - tartalomelemzés és kognitív torzulá...Varjú Zoltán: Miért vagy olyan negatív? - tartalomelemzés és kognitív torzulá...
Varjú Zoltán: Miért vagy olyan negatív? - tartalomelemzés és kognitív torzulá...Budapest Science Meetup
 
BpSM 2013.12. - Markó Ferenc: Biometrikus azonosítás Afrikában
BpSM 2013.12. - Markó Ferenc: Biometrikus azonosítás AfrikábanBpSM 2013.12. - Markó Ferenc: Biometrikus azonosítás Afrikában
BpSM 2013.12. - Markó Ferenc: Biometrikus azonosítás AfrikábanBudapest Science Meetup
 
BpSM 2013.12. - Molnár László: A végtelenbe, és tovább! - Voyager-1 módra
BpSM 2013.12. - Molnár László: A végtelenbe, és tovább! - Voyager-1 módraBpSM 2013.12. - Molnár László: A végtelenbe, és tovább! - Voyager-1 módra
BpSM 2013.12. - Molnár László: A végtelenbe, és tovább! - Voyager-1 módraBudapest Science Meetup
 
BpSM 2013.11. - Paszternák András: Nano - Tudomány - Kommunikáció
BpSM 2013.11. - Paszternák András: Nano - Tudomány - KommunikációBpSM 2013.11. - Paszternák András: Nano - Tudomány - Kommunikáció
BpSM 2013.11. - Paszternák András: Nano - Tudomány - KommunikációBudapest Science Meetup
 
BpSM 2013.11. - Szabó Róbert: Exobolygók mindenhol
BpSM 2013.11. - Szabó Róbert: Exobolygók mindenholBpSM 2013.11. - Szabó Róbert: Exobolygók mindenhol
BpSM 2013.11. - Szabó Róbert: Exobolygók mindenholBudapest Science Meetup
 
BpSM 2013.10. - Pacher Tibor: Pulit a Holdra! - Három év krónikája
BpSM 2013.10. - Pacher Tibor: Pulit a Holdra! - Három év krónikájaBpSM 2013.10. - Pacher Tibor: Pulit a Holdra! - Három év krónikája
BpSM 2013.10. - Pacher Tibor: Pulit a Holdra! - Három év krónikájaBudapest Science Meetup
 
BpSM 2013.10. - Müller Viktor: Megállíthatnánk-e a HIV-járványt, ha igazán ak...
BpSM 2013.10. - Müller Viktor: Megállíthatnánk-e a HIV-járványt, ha igazán ak...BpSM 2013.10. - Müller Viktor: Megállíthatnánk-e a HIV-járványt, ha igazán ak...
BpSM 2013.10. - Müller Viktor: Megállíthatnánk-e a HIV-járványt, ha igazán ak...Budapest Science Meetup
 
BpSM 2013.09. - Ferenci Tamás: Nehéz kérdések a védőoltások biztonsága kapcsán
BpSM 2013.09. - Ferenci Tamás: Nehéz kérdések a védőoltások biztonsága kapcsánBpSM 2013.09. - Ferenci Tamás: Nehéz kérdések a védőoltások biztonsága kapcsán
BpSM 2013.09. - Ferenci Tamás: Nehéz kérdések a védőoltások biztonsága kapcsánBudapest Science Meetup
 

Más de Budapest Science Meetup (20)

Bereczki Zsolt: Agyafúrt ősök - Koponyasebészeti beavatkozások kutatásának ak...
Bereczki Zsolt: Agyafúrt ősök - Koponyasebészeti beavatkozások kutatásának ak...Bereczki Zsolt: Agyafúrt ősök - Koponyasebészeti beavatkozások kutatásának ak...
Bereczki Zsolt: Agyafúrt ősök - Koponyasebészeti beavatkozások kutatásának ak...
 
BpSM 2014.09. - Molnár Erika: Néma tanúk vallomása a rák történetéről
BpSM 2014.09. - Molnár Erika: Néma tanúk vallomása a rák történetérőlBpSM 2014.09. - Molnár Erika: Néma tanúk vallomása a rák történetéről
BpSM 2014.09. - Molnár Erika: Néma tanúk vallomása a rák történetéről
 
BpSM 2014.09. - Sebestyén Endre: Alternatív splicing változások elemzése rákg...
BpSM 2014.09. - Sebestyén Endre: Alternatív splicing változások elemzése rákg...BpSM 2014.09. - Sebestyén Endre: Alternatív splicing változások elemzése rákg...
BpSM 2014.09. - Sebestyén Endre: Alternatív splicing változások elemzése rákg...
 
BpSM 2014.09. - Haidegger Tamás: Sebészrobotok nálunk és más nemzeteknél
BpSM 2014.09. - Haidegger Tamás: Sebészrobotok nálunk és más nemzeteknélBpSM 2014.09. - Haidegger Tamás: Sebészrobotok nálunk és más nemzeteknél
BpSM 2014.09. - Haidegger Tamás: Sebészrobotok nálunk és más nemzeteknél
 
2014.06.: Ősi Attila - Dinoszauruszok Magyarországon: egy 85 millió éves ökos...
2014.06.: Ősi Attila - Dinoszauruszok Magyarországon: egy 85 millió éves ökos...2014.06.: Ősi Attila - Dinoszauruszok Magyarországon: egy 85 millió éves ökos...
2014.06.: Ősi Attila - Dinoszauruszok Magyarországon: egy 85 millió éves ökos...
 
BpSM 2014.06.: Hajdu Tamás - Kulturális hatás vagy vándorlás? Népességváltozá...
BpSM 2014.06.: Hajdu Tamás - Kulturális hatás vagy vándorlás? Népességváltozá...BpSM 2014.06.: Hajdu Tamás - Kulturális hatás vagy vándorlás? Népességváltozá...
BpSM 2014.06.: Hajdu Tamás - Kulturális hatás vagy vándorlás? Népességváltozá...
 
BpSM 2014.05.: Aliczki Manó: Kannabinoidkezelések a szorongásos zavarok teráp...
BpSM 2014.05.: Aliczki Manó: Kannabinoidkezelések a szorongásos zavarok teráp...BpSM 2014.05.: Aliczki Manó: Kannabinoidkezelések a szorongásos zavarok teráp...
BpSM 2014.05.: Aliczki Manó: Kannabinoidkezelések a szorongásos zavarok teráp...
 
BpSM 2014.04. - Vásárhelyi Gábor: Drón vs. galamb - csoportos mozgás a köbön
BpSM 2014.04. - Vásárhelyi Gábor: Drón vs. galamb - csoportos mozgás a köbönBpSM 2014.04. - Vásárhelyi Gábor: Drón vs. galamb - csoportos mozgás a köbön
BpSM 2014.04. - Vásárhelyi Gábor: Drón vs. galamb - csoportos mozgás a köbön
 
BpSM 2014.04. - Kopniczky Margarita: Mit építsünk az élet anyagából?
BpSM 2014.04. - Kopniczky Margarita: Mit építsünk az élet anyagából?BpSM 2014.04. - Kopniczky Margarita: Mit építsünk az élet anyagából?
BpSM 2014.04. - Kopniczky Margarita: Mit építsünk az élet anyagából?
 
BpSM 2014.04. - Raffai Péter: Kozmikus dallam a múltból - Hogyan fedezte fel ...
BpSM 2014.04. - Raffai Péter: Kozmikus dallam a múltból - Hogyan fedezte fel ...BpSM 2014.04. - Raffai Péter: Kozmikus dallam a múltból - Hogyan fedezte fel ...
BpSM 2014.04. - Raffai Péter: Kozmikus dallam a múltból - Hogyan fedezte fel ...
 
BpSM 2014.03. - Molnár János: A mangalica genom jellemzése bioinformatikai mó...
BpSM 2014.03. - Molnár János: A mangalica genom jellemzése bioinformatikai mó...BpSM 2014.03. - Molnár János: A mangalica genom jellemzése bioinformatikai mó...
BpSM 2014.03. - Molnár János: A mangalica genom jellemzése bioinformatikai mó...
 
Yamaji Bogdán: A jövő atomreaktora(i)
Yamaji Bogdán: A jövő atomreaktora(i)Yamaji Bogdán: A jövő atomreaktora(i)
Yamaji Bogdán: A jövő atomreaktora(i)
 
Varjú Zoltán: Miért vagy olyan negatív? - tartalomelemzés és kognitív torzulá...
Varjú Zoltán: Miért vagy olyan negatív? - tartalomelemzés és kognitív torzulá...Varjú Zoltán: Miért vagy olyan negatív? - tartalomelemzés és kognitív torzulá...
Varjú Zoltán: Miért vagy olyan negatív? - tartalomelemzés és kognitív torzulá...
 
BpSM 2013.12. - Markó Ferenc: Biometrikus azonosítás Afrikában
BpSM 2013.12. - Markó Ferenc: Biometrikus azonosítás AfrikábanBpSM 2013.12. - Markó Ferenc: Biometrikus azonosítás Afrikában
BpSM 2013.12. - Markó Ferenc: Biometrikus azonosítás Afrikában
 
BpSM 2013.12. - Molnár László: A végtelenbe, és tovább! - Voyager-1 módra
BpSM 2013.12. - Molnár László: A végtelenbe, és tovább! - Voyager-1 módraBpSM 2013.12. - Molnár László: A végtelenbe, és tovább! - Voyager-1 módra
BpSM 2013.12. - Molnár László: A végtelenbe, és tovább! - Voyager-1 módra
 
BpSM 2013.11. - Paszternák András: Nano - Tudomány - Kommunikáció
BpSM 2013.11. - Paszternák András: Nano - Tudomány - KommunikációBpSM 2013.11. - Paszternák András: Nano - Tudomány - Kommunikáció
BpSM 2013.11. - Paszternák András: Nano - Tudomány - Kommunikáció
 
BpSM 2013.11. - Szabó Róbert: Exobolygók mindenhol
BpSM 2013.11. - Szabó Róbert: Exobolygók mindenholBpSM 2013.11. - Szabó Róbert: Exobolygók mindenhol
BpSM 2013.11. - Szabó Róbert: Exobolygók mindenhol
 
BpSM 2013.10. - Pacher Tibor: Pulit a Holdra! - Három év krónikája
BpSM 2013.10. - Pacher Tibor: Pulit a Holdra! - Három év krónikájaBpSM 2013.10. - Pacher Tibor: Pulit a Holdra! - Három év krónikája
BpSM 2013.10. - Pacher Tibor: Pulit a Holdra! - Három év krónikája
 
BpSM 2013.10. - Müller Viktor: Megállíthatnánk-e a HIV-járványt, ha igazán ak...
BpSM 2013.10. - Müller Viktor: Megállíthatnánk-e a HIV-járványt, ha igazán ak...BpSM 2013.10. - Müller Viktor: Megállíthatnánk-e a HIV-járványt, ha igazán ak...
BpSM 2013.10. - Müller Viktor: Megállíthatnánk-e a HIV-járványt, ha igazán ak...
 
BpSM 2013.09. - Ferenci Tamás: Nehéz kérdések a védőoltások biztonsága kapcsán
BpSM 2013.09. - Ferenci Tamás: Nehéz kérdések a védőoltások biztonsága kapcsánBpSM 2013.09. - Ferenci Tamás: Nehéz kérdések a védőoltások biztonsága kapcsán
BpSM 2013.09. - Ferenci Tamás: Nehéz kérdések a védőoltások biztonsága kapcsán
 

BpSM 2013.11. - Kocsis Zsuzsa: DNS hibajavítás, rák és RecQ helikázok

  • 1. DNS hibajavítás, rák és RecQ helikázok Kocsis Zsuzsa ELTE Biokémiai Tanszék, ELTE-MTA “Lendület” Motor Enzimológiai Kutatócsoport: mk-lab.org 2013.11.14.
  • 2. A DNS szerkezet •Cukor és foszfát egységek alkotják a gerincet •Négy szerves bázis: kettő-kettő egymást kölcsönösen meghatározza •A bázisok hármassával adják a kódot •Két szál
  • 3. A hibák okai Endogén források: Oxidatív károsítás (szabad gyökök-oxigén anyagcsere) Replikatív hibák Spontán DNS módosulás Alkiláló szerek Exogén források: UV-sugárzás Légszennyezés Dohányzás Élelmiszerek (malondialdehid) Diagnosztika (ionizáló sugárzás Röntgen sugárzás) Kemoterápia
  • 4. A DNS-ben keletkező hibák: akár 100.000 hiba/nap/sejt1 1: Lodish et al, Molecular biology of the Cell, 2004
  • 6. A tumor kialakulásához szükséges Túl sok sejt: túl gyors osztódás, lassú pusztulás 1, Külső szabályozás nélküli sejtosztódás – oncogének aktiválódása 2, Rezisztencia a növekedési gátlással szemben – pl. kontakt gátlás megszűnése 3, Programozott sejthalál kiiktatása – pl. az anoikis jelenségének felfüggesztése 4, Immortalizáció, az öregedés megszűnése – telomeráz enzimaktivitás megjelenése 5, Angiogenezis elősegítése – új vérerek kialakulása a daganat ellátása érdekében 6, Invázió és metasztázis – proteázok szekréciója, fokozott sejtmozgás, integrinek kicserélődése, stb. Folyamatos hiba felhalmozás: Nincs két ugyanolyan ráksejt!!
  • 7. Hibajavító útvonalak Mismatch javítás Rekombináció-alapú javítás HR / NHEJ Hiba-tolerancia TLS Kivágó javító útvonalak: BER / NER
  • 9. A RecQ helikázok • Helikázok! • Hiánybetegségeik: Bloom, Werner, Rothmund- Thompson szindróma • Genomkarbantartók: homológ rekombináció nem-mutagén irányba D-loop felbontása • Replikációs villa • Telomer karbantartás Williams and Wilkens Publishing
  • 11.
  • 12. Módszerünk: a Stopped-flow Források: http://www.atascientific.com.au, és http://chemwiki.ucdavis.edu
  • 13. Mérhető adatok 1E-4 1E-3 0,01 0,1 1 0,4 0,6 0,8 1,0 10 -4 Normalizált Trp fluoreszcencia Idő (s) 10 -3 0 50 100 150 200 250 0 6 12 300 600 900 1200 ADP.AlF4 apo ADP.AlF4 AMPPNP ADP AMPPNP ADP apo k megfigyelt (s -1 ) [dT54 ] (M, nt)
  • 15. Köszönöm a figyelmet! • A kutatás a TÁMOP 4.2.4.A/1-11-1- 2012-0001 azonosító számú Nemzeti Kiválóság Program – Hazai hallgatói, illetve kutatói személyi támogatást biztosító rendszer kidolgozása és működtetése országos program című kiemelt projekt keretében zajlott. A projekt az Európai Unió támogatásával, az Európai Szociális Alap társfinanszírozásával valósul meg.

Notas del editor

  1. Mi az ami a DNS-en történik: Tervrajz: Osztódás: DNS szintézis RNS átírás, abból fehérje pl.
  2. Pl: csontáttétnél a daganatsejtek stimulálják az oszteoklasztok kollagént emésztő proteázt szekretálnak csontvelőnek megfelelő integrint expresszálnak angiogenezist fokoznak