Homology modeling, moleculardynamic simulationand docking studies of cyclindependent kinase 1Lei Zhang, Huawei Zhu, Qiang ...
INTRODUCCIÓN
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OBJETIVO   Modelar la estructura teórica de CDK-    1 y simular interacciones con sus    inhibidores para conocer las    ...
EXPLICACIÓN   Homología    ◦ Mejorar la eficiencia y racionalidad para el      desarrollo de inhibidores de CDK1. Fue ve...
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RESULTADOS y DISCUSIÓN
RESULTADOS y DISCUSIÓN   Simulación de dinámica molecular
RESULTADOS y DISCUSIÓN
RESULTADOS y DISCUSIÓN
RESULTADOS y DISCUSIÓN
RESULTADOS y DISCUSIÓN   Análisis de    acoplamiento
RESULTADOS y DISCUSIÓN
CONCLUSIÓN   Para diseñar inhibidores más potentes    ◦ Tiene que haber múltiples dadores y      aceptores de puentes de ...
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Homology modeling,molecular dynamic simulation and docking studies

  1. 1. Homology modeling, moleculardynamic simulationand docking studies of cyclindependent kinase 1Lei Zhang, Huawei Zhu, Qiang Wang, HaoFang,Wenfang Xu, Minyong Li Autor: Jon Luzuriaga
  2. 2. INTRODUCCIÓN
  3. 3. INTRODUCCIÓN
  4. 4. OBJETIVO Modelar la estructura teórica de CDK- 1 y simular interacciones con sus inhibidores para conocer las modificaciones químicas y optimización necesaria para mejorarlos.
  5. 5. EXPLICACIÓN Homología ◦ Mejorar la eficiencia y racionalidad para el desarrollo de inhibidores de CDK1. Fue verificada la buena calidad de la estructura para analizar. Dinámica molecular ◦ Conocer las propiedades estructurales. ◦ Detalles de unión del complejo Flavopiridol-CDK1.
  6. 6. EXPLICACIÓN Acoplamiento y modelamiento farmacofórico ◦ Estudiar interacción entre otros inhibidores y los residuos centrales. ◦ Así conocer la estructura necesaria de los inhibidores de la unión a CDK1.
  7. 7. RESULTADOS y DISCUSIÓN Verificación del modelo construido CDK TIPO % COMPARTIDO RMSD CDK2 64 1,241 CDK4 44 1,337 CDK5 56 0,748 CDK6 46 0,967 CDK7 44 1,258 CDK9 41 0,813
  8. 8. RESULTADOS y DISCUSIÓN
  9. 9. RESULTADOS y DISCUSIÓN Simulación de dinámica molecular
  10. 10. RESULTADOS y DISCUSIÓN
  11. 11. RESULTADOS y DISCUSIÓN
  12. 12. RESULTADOS y DISCUSIÓN
  13. 13. RESULTADOS y DISCUSIÓN Análisis de acoplamiento
  14. 14. RESULTADOS y DISCUSIÓN
  15. 15. CONCLUSIÓN Para diseñar inhibidores más potentes ◦ Tiene que haber múltiples dadores y aceptores de puentes de H. ◦ La cadena lateral que se extiende al bolsillo más grande debe ser prolongado  Grupos hidrófobos- Unión al bolsillo hidrofóbico.  Terminación átomos polares- Unión a Leu83 ◦ Algunos átomos de oxigeno deben ser reemplazados por átomos de nitrógeno y sulfuro en la apertura del bolsillo.

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