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UPBox e DataNotes:
Ferramentas colaborativas para dados
de investigação em domínios diversos

Cristina Ribeiro DEI- FEUP/ INESC TEC
João Rocha da Silva DEI- FEUP/ INESC TEC
João Correia Lopes DEI- FEUP/ INESC TEC
Conteúdo
•
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Motivação e objetivos
A prática corrente na curadoria de dados
Proposta de um workflow de gestão de dados
Proposta de uma arquitetura de ferramentas
Conclusões e trabalhos em curso
Os repositórios de dados

✓

Reposit órios de dados

- Partilha de conjuntos de dados
- Prova/Evidência da produção científica
- Publicações com dados-base associados são mais citadas
Os repositórios de dados

!

A probabilidade dos dados
serem deposit ados cai após a
publicação dos r esult ados

- O esforço de preparação de dados por vezes não garante
recompensa a curto prazo
- Falta de financiamento para curadoria
- Elementos dos projectos saem das equipas
- Os curadores podem tornam-se um " bottleneck" do processo
devido ao processo manual de curadoria
A prática corrente

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Proposta de workflow
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1

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. /& " +
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Partilha transparente com
investigadores autorizados
Permite partilha mais rápida
de dados
Suporta colaboração entre
diferentes instituições

Depósito e
anotação
colaborativa dos
dados

2

01, ) * +,
! "#$%'( )&
& $

Validação de datasets
e anotações
com vista ao seu depósito
Arquitetura da solução
Upload e Download
de ficheiros e pastas

Anotação de
estruturas de
directórios

Hierarquia de directórios

1

UPBox

Dat aNot es
Exportação
RDF

- Metadados
- Controlo
de acessos

- Apresentação de
estruturas de directórios
- Formuários de
descrição

- Estruturas de
directórios

Semantic
MediaWiki

2

- Controlo
de Acessos
- Colaboração
Jena
MySQL
MySQL Storage
- Metadados
de descrição
Workflow de
depósito,
3
embargos...
Repositório
METS SIP
METS SIP
UPBox
Upload e Download
de ficheiros e pastas

Anotação de
estruturas de
directórios

- Apresentação d
estruturas de dire
- Formuários de
descrição

Hierarquia de directórios

1

UPBox

Dat aNot es
Exportação
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- Metadados
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directórios

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MediaWiki

- Controlo
de Acessos
- Colaboração
MySQL
- Metadados
de descrição
Workflow de

Jena
DataNotes
Upload e Download
de ficheiros e pastas

Anotação de
estruturas de
directórios

- Apresentação de
estruturas de directórios
- Formuários de
descrição

Hierarquia de directórios

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UPBox

Dat aNot es
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Controlo
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directórios

MySQL Storage

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MediaWiki

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de descrição
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depósito,
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Depósito de dados em repositórios
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estruturas de
directórios

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UPBox

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depósito,
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Conclusões e Trabalho em curso
• Ferramentas foram testadas com investigadores de diversos
domínios
– Boa aceitação
– Alguma necessidade de apoio na escolha de modelos de
metadados para anotação

• Passagem de protótipo a serviço é problemática
• Ferramentas são para apoio aos investigadores, não
preparam ingestão no repositório
• Dados preparados com as ferramentas ficam disponíveis e
com descrição já preparada
Contactos e ligações
Cristina Ribeiro

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João Rocha da Silva

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UPBox e DataNotes: ferramentas colaborativas para dados de investigação em domínios diversos

  • 1. UPBox e DataNotes: Ferramentas colaborativas para dados de investigação em domínios diversos Cristina Ribeiro DEI- FEUP/ INESC TEC João Rocha da Silva DEI- FEUP/ INESC TEC João Correia Lopes DEI- FEUP/ INESC TEC
  • 2. Conteúdo • • • • • Motivação e objetivos A prática corrente na curadoria de dados Proposta de um workflow de gestão de dados Proposta de uma arquitetura de ferramentas Conclusões e trabalhos em curso
  • 3. Os repositórios de dados ✓ Reposit órios de dados - Partilha de conjuntos de dados - Prova/Evidência da produção científica - Publicações com dados-base associados são mais citadas
  • 4. Os repositórios de dados ! A probabilidade dos dados serem deposit ados cai após a publicação dos r esult ados - O esforço de preparação de dados por vezes não garante recompensa a curto prazo - Falta de financiamento para curadoria - Elementos dos projectos saem das equipas - Os curadores podem tornam-se um " bottleneck" do processo devido ao processo manual de curadoria
  • 5. A prática corrente ! "#$% ' #($) ( & $*$#+ 1 !" #$%'( ) * +, $% & , +- "./*($) ( 0% .- *& + 12 3) 2 6 ) +- ".& # ' 7(6 ) 05+./# 3 - . , ) * +, 4) 0#+./5".#
  • 6. Proposta de workflow !" #$%'( ) * +, $% & 1 !" #$%'( ) * +, & . /& " + $, Partilha transparente com investigadores autorizados Permite partilha mais rápida de dados Suporta colaboração entre diferentes instituições Depósito e anotação colaborativa dos dados 2 01, ) * +, ! "#$%'( )& & $ Validação de datasets e anotações com vista ao seu depósito
  • 7. Arquitetura da solução Upload e Download de ficheiros e pastas Anotação de estruturas de directórios Hierarquia de directórios 1 UPBox Dat aNot es Exportação RDF - Metadados - Controlo de acessos - Apresentação de estruturas de directórios - Formuários de descrição - Estruturas de directórios Semantic MediaWiki 2 - Controlo de Acessos - Colaboração Jena MySQL MySQL Storage - Metadados de descrição Workflow de depósito, 3 embargos... Repositório METS SIP METS SIP
  • 8. UPBox Upload e Download de ficheiros e pastas Anotação de estruturas de directórios - Apresentação d estruturas de dire - Formuários de descrição Hierarquia de directórios 1 UPBox Dat aNot es Exportação RDF - Metadados - Controlo de acessos - Estruturas de directórios MySQL Storage 2 Semantic MediaWiki - Controlo de Acessos - Colaboração MySQL - Metadados de descrição Workflow de Jena
  • 9. DataNotes Upload e Download de ficheiros e pastas Anotação de estruturas de directórios - Apresentação de estruturas de directórios - Formuários de descrição Hierarquia de directórios 1 UPBox Dat aNot es Exportação RDF Metadados Controlo de acessos - Estruturas de directórios MySQL Storage 3 2 Semantic MediaWiki - Controlo de Acessos - Colaboração MySQL - Metadados de descrição Workflow de depósito, embargos... Jena
  • 10. Depósito de dados em repositórios Upload e Download de ficheiros e pastas Anotação de estruturas de directórios Hierarquia de directórios 1 UPBox Dat aNot es Exportação RDF - Metadados - Controlo de acessos - Apresentação de estruturas de directórios - Formuários de descrição - Estruturas de directórios Semantic MediaWiki 2 - Controlo de Acessos - Colaboração Jena MySQL MySQL Storage - Metadados de descrição Workflow de depósito, 3 embargos... Repositório METS SIP METS SIP
  • 11. Conclusões e Trabalho em curso • Ferramentas foram testadas com investigadores de diversos domínios – Boa aceitação – Alguma necessidade de apoio na escolha de modelos de metadados para anotação • Passagem de protótipo a serviço é problemática • Ferramentas são para apoio aos investigadores, não preparam ingestão no repositório • Dados preparados com as ferramentas ficam disponíveis e com descrição já preparada
  • 12. Contactos e ligações Cristina Ribeiro mcr@fe.up.pt João Rocha da Silva joaorosilva@gmail.com João Correia Lopes jlopes@fe.up.pt Mais informação: http://dendro.fe.up.pt/