Fosfato
Pentosa
Base púrica o
pirimidínica
(a) Estructura general de los nucleótidos
Pirimidina Purina
(b) Bases nitrogenadas
Adenina Guanina
Citosina Timina (ADN) Uracilo (ARN)
Pirimidina
Purinas
Nomenclatura de Nucleótidos y Ácidos Nucléicos
Bases Nucleósidos* Nucleótidos* Ácidos Nucléicos*
Purinas
Adenina Adenosina...
Nucleótido:
Símbolo:
Nucleósido:
Desoxiadenilato
(desoxiadenosina
5 -monofosfato)
Desoxiguanilato
(desoxiguanosina
5 -mono...
Nucleótido:
Símbolo:
Nucleósido:
Adenilato (adenosina
5 -monofosfato)
Guanilato (guanosina
5 -monofosfato)
Uridilato (urid...
Ribosa
Ribosa Ribosa
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Inosina
7-Metilguanosina 4-Tiouridina
Pseudouridina
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Adenina
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Adenina
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extremo 5 extremo 5
extremo 3 extremo 3
ADN ARN
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mayor
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Base
sin-Adenosina anti-Adenosina anti-Citidina
(b)
28 Å
Forma A Forma B Forma Z
Forma A Forma B Forma Z
Giro de la hélice derecha derecha izquierda
Diámetro ~ 26 Å ~ 20 Å ~ 18 Å
Pares de bases por 11 10...
Repetición
especular
Palíndromo
5 3
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Horquilla
(a)
5 3
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Bucle
interno
Horquilla
(a)
Doble hélice en horquilla
(b)
Guanina
Uracilo
ADN doble hélice
Desnaturalización Renaturalización
ADN parcialmente
desnaturalizado
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de hebras
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Muestra 1 Muestra 2
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3 -Fosfoadenosina difosfato
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Ácidos Nucléicos

  1. 1. Fosfato Pentosa Base púrica o pirimidínica (a) Estructura general de los nucleótidos
  2. 2. Pirimidina Purina (b) Bases nitrogenadas
  3. 3. Adenina Guanina Citosina Timina (ADN) Uracilo (ARN) Pirimidina Purinas
  4. 4. Nomenclatura de Nucleótidos y Ácidos Nucléicos Bases Nucleósidos* Nucleótidos* Ácidos Nucléicos* Purinas Adenina Adenosina Adenilato RNA Desoxiadenosina Desoxiadenilato ADN Guanina Guanosina Guanilato ARN Desoxiguanosina Desoxiguanilato ADN Pirimidinas Citosina Citidina Citidilato ARN Desoxicitidina Desoxicitidilato ADN Timina Timidina o Timidilato o ADN desoxitimidina desoxitimidilato Uracilo Uridina Uridilato ARN Tabla 10-1 * Nucleósido y Nucleótido son términos genéricos que incluyen ambos las formas ribo- y desoxirribo-. Adviértase que estos ribonucleósidos y ribonucleótidos se nombran simplemente como nucleósidos y nucleótidos (ej. riboadenosina como adenosina), y los desoxirribonucleósidos y desoxirribonucleótidos como desoxinucleósidos y desoxinucleótidos (ej. desoxirriboadenosina como desoxiadenosina). Ambas formas de nomenclatura son válidos, pero las formas más cortas son de uso más frecuente. La Timidina es una excepción; el término ribotimidina se emplea para destacar su aparición inusual en el ARN.
  5. 5. Nucleótido: Símbolo: Nucleósido: Desoxiadenilato (desoxiadenosina 5 -monofosfato) Desoxiguanilato (desoxiguanosina 5 -monofosfato) Desoxitimidilato (desoxitimidina 5 -monofosfato) Desoxicitidilato (desoxicitidina 5 -monofosfato) A, dA, dAMP G, dG, dGMP T, dT, dTMP C, dC, dCMP Desoxiadenosina Desoxiguanosina Desoxitimidina Desoxicitidina (a) Desoxirribonucleótidos
  6. 6. Nucleótido: Símbolo: Nucleósido: Adenilato (adenosina 5 -monofosfato) Guanilato (guanosina 5 -monofosfato) Uridilato (uridina 5 -monofosfato) Citidilato (citidina 5 -monofosfato) A, AMP G, GMP U, UMP C, CMP Adenosina Guanosina Uridina Citidina (b) Ribonucleótidos
  7. 7. Ribosa Ribosa Ribosa Ribosa Inosina 7-Metilguanosina 4-Tiouridina Pseudouridina (b)
  8. 8. Adenina Adenina Adenina Adenina Adenosin 5 -monofosfato Adenosin 2 -monofosfato Adenosin 3 -monofosfato Adenosin 2 , 3 - monofosfato cíclico
  9. 9. extremo 5 extremo 5 extremo 3 extremo 3 ADN ARN 5 3 5 3 Unión fosfodiester
  10. 10. AA C G T P P P P P OH Extremo 5 Extremo 3
  11. 11. Guanina Adenina Timina Citosina 5 5 3 3
  12. 12. 36 Å 3.4 Å Surco mayor Surco menor 20 Å (a) (b) (c)
  13. 13. 36 Å 3.4 Å Surco mayor Surco menor 20 Å (a)
  14. 14. 5 5 3 3
  15. 15. NuevaNueva 35 Cadena parentalCadena parental Cadenas hijas
  16. 16. (a) 3 5 1 2 3 4 7 5 6 Base
  17. 17. sin-Adenosina anti-Adenosina anti-Citidina (b)
  18. 18. 28 Å Forma A Forma B Forma Z
  19. 19. Forma A Forma B Forma Z Giro de la hélice derecha derecha izquierda Diámetro ~ 26 Å ~ 20 Å ~ 18 Å Pares de bases por 11 10.5 12 vuelta de hélice Aumento de hélice por 2.6 Å 3.4 Å 3.7 Å par de bases Inclinación normal de 20º 6º 7º la base respecto al eje Conformación de pliegue terminal C-3 terminal C-2 terminal C-2 para del azúcar pirimidinas; C-3 para purinas Conformación del anti anti anti para pirimidinas; enlace glucosil sin para purinas
  20. 20. Repetición especular Palíndromo
  21. 21. 5 3 35 Horquilla (a)
  22. 22. 5 3 (b) 53 5 3 3 5 Cruciforme
  23. 23. (a) Monocistrónica (b) Policistrónica 5 5 3 3 Gen Gen 1 Gen 2 Gen 3
  24. 24. (a) Monocistrónica 5 3 Gen
  25. 25. (b) Policistrónica 5 3 Gen 1 Gen 2 Gen 3
  26. 26. Cadena simple Bulbo Bucle interno Horquilla (a)
  27. 27. Doble hélice en horquilla (b)
  28. 28. Guanina Uracilo
  29. 29. ADN doble hélice Desnaturalización Renaturalización ADN parcialmente desnaturalizado Separación de hebras Unión de hebras por emparejamiento de bases Hebras separadas de ADN en madejas aleatorias
  30. 30. 3 m
  31. 31. Dúplex híbrido Muestra 1 Muestra 2 Mezcla y enfriamiento Dúplex de la muestra 1 Dúplex de la muestra 2 Dúplex de la muestra 1 y 2
  32. 32. P P P P P P P P P 3 A AC G G C T TC P P PPP T G C C G P P OH OH P P P OH A dATP dGTP (a) ––– ––– ––– ––– ––– Hebra molde Hebra copia
  33. 33. 3 Copia Molde de secuencia desconocida ADN polimerasa cuatro dNTPs, cuatro ddNTPs Desnaturalización A A T T C G G G G T T C Resultado generado por ordenador después de pasar por el detector de migración de bandas Etiquetas con pigmentos en segmentos se someten a electroforésis en un gel capilar Migración ADN Detector Rayo Láser Láser C C T G T T T G A T G G T G G T T C C G A A A T C G G 20 30 40 Etiquetas con pigmentos en segmentos de ADN, copiado del molde de secuencia desconocida
  34. 34. OO – P – O – P – O – P – O – CH2 | | |  O O O O O O H H H H OHOH Base NMP NDP NTP Abreviaturas de Ribonucleósidos 5 -fosfato Abreviaturas de Desoxirribonucleósidos 5 -fosfato Base Mono- Di- Tri- Base Mono- Di- Tri- Adenina AMP ADP ATP Guanina GMP GDP GTP Citosina CMP CDP CTP Uracilo UMP UDP UTP Adenina dAMP dADP dATP Guanina dGMP dGDP dGTP Citosina dCMP dCDP dCTP Uracilo dUMP dUDP dUTP
  35. 35. OO – P – O – P – O – P – O – CH2 |  O O O O O O H H H H OHOH Adenina   | | Anhídrido Anhídrido Éster ATP CH3 – C – O – C – CH3  O O  CH3 – C – O – CH3  O Anhídrido acético, un ácido carboxílico anhidro Metil acetato, un éster de un ácido carboxílico
  36. 36. β-Mercaptoeltilamina Ácido Pantoténico 3 -Fosfoadenosina difosfato (3 -P-ADP) Riboflavina Nicotinamida Coenzima A Nicotinamida Adenina Dinucleótido (NAD+) Flavín Adenín Dinucleótido (FAD)
  37. 37. β-Mercaptoeltilamina Ácido Pantoténico 3 -Fosfoadenosina difosfato (3 -P-ADP) Coenzima A
  38. 38. Nicotinamida Nicotinamida Adenina Dinucleótido (NAD+)
  39. 39. Riboflavina Flavín Adenín Dinucleótido (FAD)
  40. 40. O O – P – O – P – O – CH2 O O O O H H H H OHO Guanina   | | | P O | P | | O O O O O – – 5 3  O H H H H OHO Guanina P | O 5 3  O – CH2 O O H H H H OHO Adenina P | O 5 3  O – CH2 O Adenosina 3 -5 -monofosfato cíclico (AMPc) Guanosina 3 -5 -monofosfato cíclico (GMPc) Guanosina 3 -difosfato,5 -difosfato (guanosina tetrafosfato) (ppGMPpp)

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