Sessão de Apresentação do Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional, dia 6 de Maio de 2014 às 16h30 no Anfiteatro da FFCUL

1. Mestrado em
Bioinformática e
Biologia Computacional
Francisco Couto
Maio 6, 2014
Sessão de apresentação do Mestrado em Bioinformática e
Biologia Computacional

2. Objetivos
• Formação complementar nas áreas de
interface entre as Ciências da Vida e das
Tecnologias de Informação e Computação
• Destina-se a alunos do 1º ciclo das áreas
– da Biologia, Bioquímica, Farmácia, Medicina,
Veterinária, Agronomia, Ciências da Saúde e afins
– da Informática, Tecnologias da Informação,
Estatística, Matemática e afins

3. Acesso
• 20 vagas por ano
• Avaliação:
–Grau académico
–Curriculum académico, científico e técnico
–Experiência profissional em áreas
relacionadas

4. Coordenação conjunta
• Informática
– Francisco Couto (atual coordenador)
• Biologia Animal
– Octávio Paulo
• Biologia Vegetal
– Francisco Dionísio
• Com a participação dos departamentos
– Estatística e Investigação Operacional
– Química e Bioquímica
– Matemática

5. Plano Curricular
• 18 ECTS obrigatórios
• restantes 12+30 ECTS opcionais
• 60 ECTS na disciplina de dissertação
– Bioinformática
– Ou Biologia Computacional
Perfil Entrada Informática Estatística Biologia Biologia/
Bioquímica
Biologia 6 ECTS 6 ECTS 6 ECTS
Informática 6 ECTS 6 ECTS 6 ECTS
Física e Matemática 6 ECTS 6 ECTS 6 ECTS

6. Disciplinas
• Fundamentos de Programação
• Introdução às Bases de Dados
• Aprendizagem Automática em Ciências
• Programação por Objetos
• Vida artificial
• Visualização de Dados Científicos
• Bioestatística para a Bioinformática
• Fundamentos de Bioestatística
• Análise de Dados Multivariados
• Genética Molecular
• Biologia Molecular
• Genética Populacional
• Dinâmica Populacional
• Métodos Computacionais em Evolução e
Ecologia
• Filogenética
• Biologia Computacional e Genómica
• Evolução Experimental
• Deteção Remota e Sistemas de Informação
Geográfica
• Introdução aos Modelos Biomatemáticos
• Modelos e Métodos Computacionais em
Biologia
• Data Warehousing e Data Mining
• Integração e processamento Analitico de
informação
• Ontologias Aplicadas às Ciências
• Sistemas Interativos em Ciências
• Inteligência Artificial em Ciências
• Complementos de programação
• Bioinformática
• Aplicações na Web
• Métodos Estatísticos em Bioinformática
• Regulação de Sistemas Bioquímicos
• Regulação Bioquímica
• Simulação Bioquímica
• Evolução Molecular
• Computação na Medição de Fenómenos
Biológicos
• Epidemiologia e Doenças Transmissíveis
• Biologia Computacional na Prática
Biomédica
• Perspetivas em Biologia Computacional
• Investigação em Bioinformática
• Aplicações Avançadas em Biologia
• Análise Computacional da Morfologia e
Dinâmica de Material Biológico

7. Candidaturas 2014/15
(sexta edição)
• 1ª Fase
– 2 de Junho a 16 de Julho
http://www.fc.ul.pt/pt/pagina/5461/candidaturas
• Mais informação
– http://bbc.fc.ul.pt/

8. Bioinformática
na
FCUL
Francisco Couto
Maio 6, 2014
Sessão de apresentação do Mestrado em Bioinformática e
Biologia Computacional

9. 9
Biology is changing…
Genomes Nucleotide sequence
Gene expression
Systems
Literature and ontologies
Protein families, motifs
and domains
Interactions
Protein sequence
Protein structure
Pathways
Chemical entities
Source: Introduction to the EBI by James Watson, 2010

10. Importância da Bioinformática
• Enorme quantidade e variedade de
informação a analisar
• Desde 2010, mais de 2.600.000 artigos
foram adicionados à MEDLINE
• A ler 10 artigos por dia
• demoraria mais de 700 anos
• Gestão só possível usando
tecnologias de informação

11. Disciplinas
• Fundamentos de Programação
– Python
• Introdução às Bases de Dados
– Bases de dados relacionais (MySQL)
• Mais avançadas
– Data Warehousing e Data Mining
– Aplicações na web
– Ontologias aplicadas às ciências
– …

12. Teses mais recentes

13. Após o mestrado
• Ambas aceites em programas de doutoramento
internacionais
– Vera Carvalho
• Technical University of Denmark
– Beatriz Gomes
• Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and
Genetics

14. Prémio Inovação Jovem Engenheiro 2004
Ordem dos Engenheiros