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Uso de la información genética para
entender la historia evolutiva de las
         aves de Galápagos


                    Jaime A. Chaves
               jaimechaves76@gmail.com

               Centro de Estudios Tropicales
          Universidad de California Los Ángeles
         Barrick Museum of Natural History-UNLV
Estructura de la charla
• Métodos de estudio molecular
  –   ADN
  –   Filogenias
  –   Flujo genético
  –   Especiación
• Respuestas sobre historia evolutiva
  – Historias evolutivas de aves en Galápagos
  –   Pinzones de Darwin (Geospiza)
  –   Canario (Dendroica)
  –   Cucubes (Nesomimus)
  –   Atrapamoscas (Myarchus)
Tecnicas moleculares
• ADN y sus diferentes historias evolutivas
    – Mitocondrial (haploide: madre a hijo)
    – Nuclear (diploide)
•   Extraccion de material (tejido, sangre, plumas,…)
•   PCR (Reaccion en cadena de la Polimerasa)-primers
•   Secuenciamiento de marcadores moleculares
•   Genes conservados y acumulacion de mutaciones
•   Resultado final secuencia de pares de bases AGCT
Tecnicas moleculares
• Comparar secuencias entre individuos y especies
  Filogenia
• Alineamiento de secuencias
• Comparacion de bases
   – 1) ACGGTCTCTTGACATCCTGATTAGCCTAT
   – 2) ACAGTCTCTAGACATCCTGATTAGCCTAT
   – 3) ACGGTTTCTTGACATCCTGATTAGCCTAT
                    2    3     1
Tecnicas moleculares
• Cada “no par” se computa como diferencia (ramifica) de
  una base y el tamano de la rama depende del numero
  de bases que sean diferentes
• Resultado final arbol filogenetico, ramas relacionadas
  con el numero de diferencias, especies emparentadas
  mas cercanas (grupo monofiletico) y especies menos
  emparentadas mas basales en el arbol
                   2     3     1
Tecnicas moleculares




• Resultado final arbol filogenetico, ramas relacionadas
  con el numero de diferencias, especies emparentadas
  mas cercanas (grupo monofiletico) y especies menos
  emparentadas mas basales en el arbol
Tecnicas moleculares
• Marcador molecular
• La acumulacion de mutaciones es constante
  (debatible) en el tiempo (marcadores neutrales)
• Regla del 2% (0.0105 substituciones/sitio/linaje/1Ma
• Calibrar las secuencias obteniendo una estimacion
  temporal de los procesos de divergencia
• Árbol ultramétrico
• Monofilia
• Rama es proporcional
al tiempo
Tecnicas moleculares
• Efecto de flujo genetico (genes se mueven de una
  poblacion a la otra) homogenizar
Tecnicas moleculares
• Modos de especiacion:
• Alopatrica: Especies se
  diferencian en sitios aislados
  (barreras geograficas), sin
  flujo genetico y no se
  reconocen (aislamiento
  reproductivo en contacto
  secundario)
Tecnicas moleculares
• Simpatrica: Especies se
  diferencian en el mismo
  sitio, aislamiento por
  seleccion (natural-sexual), no
  hay flujo genetico (completo
  aislamiento reproductivo)
Tecnicas moleculares
• Parapatrica: En contacto parcial geografico, zona de
  contacto, aislamiento en los extremos.
Historia Evolutiva de aves de
                   Galapagos
• Importancia a nivel mundial de las islas
• Son islas oceanicas (no conexion con el continente)
• Como es que estas especies llegaron, se adaptaron y que
  cambios han sufrido en el transcurso desde la
  colonizacion de las islas.
• Hipotesis mas sencilla es origen continental (Ecuador)
   –   Pinzones de Darwin (Geospiza)
   –   Canario Maria (Dendroica)
   –   Cucubes (Nesomimus)
   –   Atrapamoscas (Myarchus)
• Pinzones de Darwin
  – 14 especies  Resultado de una radiacion adaptativa
  – Ancestro comun llego a las islas y de diversifico
  – Origen en Caribe




                                                          Burns et al. 2002
• Pinzones de Darwin
  –   Alta especializacion alimenticia en relacion al uso de semillas
  –   Relacion intrinsica entre la morfologia del pico y el tipo de semillas
  –   Se estima una llegada del ancestro comun al rededor de ~ 2-3 Ma.
  –   Y la mayoria de la especiacion se cree que paso en alopatria, aunque
      hay indicios de especiacion simpatrica (bimodalismo)




                                                                   Huber et al. 2007
Pinzones de Darwin
Filogenia (ADN mt y microsatelites)
Monofilia de Geospiza
Radiación rápida




               Sato et al. 1999


                                      Grant & Grant 2003
• Canario Maria
  – 1 especie (subespecie de Galapagos y Cocos)
  – Origen 150 y 300 mil años
  – Origen America Central


                                                  Chaves et al. 2011
• Canario Maria
  – Poca diferenciacion genetica en ciertas islas (4 grupos
    geneticos)
  – Patron de viento influyen en la diferenciacion
  – No hay diferenciacion morfologica
     • Flujo genetico/Poco tiempo para acumular diferencias
                                                              Chaves et al. 2011
• Cucubes (Nesomimus)
  – 4 especies
  – Origen 1.6 Ma
  – Ancestros emparentados
    América del Norte y norte de
    América del Sur.




                                   Arbogast 2006
• Cucubes (Nesomimus)
  – 4 species
  – Origen 1.6 Ma
  – Ancestors emparentados
    America del Norte y norte de
    America del Sur.




  Dentro de N. parvulus cada isla tiene un linaje único (importante en
  proyectos de conservación-reintroducción)
                                                             Arbogast 2006
• Atrapamoscas (Myiarchus)
  – 1 especie
  – Estudio moleculares sugieren dos clados
  – No hay diferenciacion morfologica
  – Ancestro comun mas cercano es un Myiarchus de Mexico y
    C. America.
  – Origen ~ 800 mil años.




           Sari and Parker 2012
Historia Evolutiva de aves de Galapagos

• Conclusiones
  – Todas parecen ser invasiones únicas (monofileticas)
  – Diferentes tiempos de llegada
     • 2.5Ma (Pinzones)-1.6Ma (Nesomimus)-3ka (Dendroica)-8ka
       (Myiarchus)
  – Diferentes orígenes de las colonizaciones
     • Caribe, Continente (Centro-Norte-Sur)
  – Cambios morfológicos y genéticos no tienen mucho que ver
    con el tiempo de llegada.
     • Drásticos en Pinzones, Medianos en Nesomimus y Nulos en Dendroica
       y Myiarchus
Historia Evolutiva de aves de Galapagos

• Conclusiones
  – Otros factores intrinsicos podrían ser responsables de
    dichas diferencias.
     • Genéticamente mas moldeables?
  – Todas representas especies (o subespecies) endémicas
     • No se encuentran en ninguna otra parte del planeta
  – Muchos clados no representados como especies son tan
    únicas como estas (grupos genéticos)
     • Importante par ala conservación y reintroducción de especies.

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Uso de la información genética para entender la historia evolutiva de las aves de Galápagos

  • 1. Uso de la información genética para entender la historia evolutiva de las aves de Galápagos Jaime A. Chaves jaimechaves76@gmail.com Centro de Estudios Tropicales Universidad de California Los Ángeles Barrick Museum of Natural History-UNLV
  • 2. Estructura de la charla • Métodos de estudio molecular – ADN – Filogenias – Flujo genético – Especiación • Respuestas sobre historia evolutiva – Historias evolutivas de aves en Galápagos – Pinzones de Darwin (Geospiza) – Canario (Dendroica) – Cucubes (Nesomimus) – Atrapamoscas (Myarchus)
  • 3. Tecnicas moleculares • ADN y sus diferentes historias evolutivas – Mitocondrial (haploide: madre a hijo) – Nuclear (diploide) • Extraccion de material (tejido, sangre, plumas,…) • PCR (Reaccion en cadena de la Polimerasa)-primers • Secuenciamiento de marcadores moleculares • Genes conservados y acumulacion de mutaciones • Resultado final secuencia de pares de bases AGCT
  • 4. Tecnicas moleculares • Comparar secuencias entre individuos y especies Filogenia • Alineamiento de secuencias • Comparacion de bases – 1) ACGGTCTCTTGACATCCTGATTAGCCTAT – 2) ACAGTCTCTAGACATCCTGATTAGCCTAT – 3) ACGGTTTCTTGACATCCTGATTAGCCTAT 2 3 1
  • 5. Tecnicas moleculares • Cada “no par” se computa como diferencia (ramifica) de una base y el tamano de la rama depende del numero de bases que sean diferentes • Resultado final arbol filogenetico, ramas relacionadas con el numero de diferencias, especies emparentadas mas cercanas (grupo monofiletico) y especies menos emparentadas mas basales en el arbol 2 3 1
  • 6. Tecnicas moleculares • Resultado final arbol filogenetico, ramas relacionadas con el numero de diferencias, especies emparentadas mas cercanas (grupo monofiletico) y especies menos emparentadas mas basales en el arbol
  • 7. Tecnicas moleculares • Marcador molecular • La acumulacion de mutaciones es constante (debatible) en el tiempo (marcadores neutrales) • Regla del 2% (0.0105 substituciones/sitio/linaje/1Ma • Calibrar las secuencias obteniendo una estimacion temporal de los procesos de divergencia
  • 8. • Árbol ultramétrico • Monofilia • Rama es proporcional al tiempo
  • 9. Tecnicas moleculares • Efecto de flujo genetico (genes se mueven de una poblacion a la otra) homogenizar
  • 10. Tecnicas moleculares • Modos de especiacion: • Alopatrica: Especies se diferencian en sitios aislados (barreras geograficas), sin flujo genetico y no se reconocen (aislamiento reproductivo en contacto secundario)
  • 11. Tecnicas moleculares • Simpatrica: Especies se diferencian en el mismo sitio, aislamiento por seleccion (natural-sexual), no hay flujo genetico (completo aislamiento reproductivo)
  • 12. Tecnicas moleculares • Parapatrica: En contacto parcial geografico, zona de contacto, aislamiento en los extremos.
  • 13. Historia Evolutiva de aves de Galapagos • Importancia a nivel mundial de las islas • Son islas oceanicas (no conexion con el continente) • Como es que estas especies llegaron, se adaptaron y que cambios han sufrido en el transcurso desde la colonizacion de las islas. • Hipotesis mas sencilla es origen continental (Ecuador) – Pinzones de Darwin (Geospiza) – Canario Maria (Dendroica) – Cucubes (Nesomimus) – Atrapamoscas (Myarchus)
  • 14. • Pinzones de Darwin – 14 especies  Resultado de una radiacion adaptativa – Ancestro comun llego a las islas y de diversifico – Origen en Caribe Burns et al. 2002
  • 15. • Pinzones de Darwin – Alta especializacion alimenticia en relacion al uso de semillas – Relacion intrinsica entre la morfologia del pico y el tipo de semillas – Se estima una llegada del ancestro comun al rededor de ~ 2-3 Ma. – Y la mayoria de la especiacion se cree que paso en alopatria, aunque hay indicios de especiacion simpatrica (bimodalismo) Huber et al. 2007
  • 16. Pinzones de Darwin Filogenia (ADN mt y microsatelites) Monofilia de Geospiza Radiación rápida Sato et al. 1999 Grant & Grant 2003
  • 17. • Canario Maria – 1 especie (subespecie de Galapagos y Cocos) – Origen 150 y 300 mil años – Origen America Central Chaves et al. 2011
  • 18. • Canario Maria – Poca diferenciacion genetica en ciertas islas (4 grupos geneticos) – Patron de viento influyen en la diferenciacion – No hay diferenciacion morfologica • Flujo genetico/Poco tiempo para acumular diferencias Chaves et al. 2011
  • 19. • Cucubes (Nesomimus) – 4 especies – Origen 1.6 Ma – Ancestros emparentados América del Norte y norte de América del Sur. Arbogast 2006
  • 20. • Cucubes (Nesomimus) – 4 species – Origen 1.6 Ma – Ancestors emparentados America del Norte y norte de America del Sur. Dentro de N. parvulus cada isla tiene un linaje único (importante en proyectos de conservación-reintroducción) Arbogast 2006
  • 21. • Atrapamoscas (Myiarchus) – 1 especie – Estudio moleculares sugieren dos clados – No hay diferenciacion morfologica – Ancestro comun mas cercano es un Myiarchus de Mexico y C. America. – Origen ~ 800 mil años. Sari and Parker 2012
  • 22. Historia Evolutiva de aves de Galapagos • Conclusiones – Todas parecen ser invasiones únicas (monofileticas) – Diferentes tiempos de llegada • 2.5Ma (Pinzones)-1.6Ma (Nesomimus)-3ka (Dendroica)-8ka (Myiarchus) – Diferentes orígenes de las colonizaciones • Caribe, Continente (Centro-Norte-Sur) – Cambios morfológicos y genéticos no tienen mucho que ver con el tiempo de llegada. • Drásticos en Pinzones, Medianos en Nesomimus y Nulos en Dendroica y Myiarchus
  • 23. Historia Evolutiva de aves de Galapagos • Conclusiones – Otros factores intrinsicos podrían ser responsables de dichas diferencias. • Genéticamente mas moldeables? – Todas representas especies (o subespecies) endémicas • No se encuentran en ninguna otra parte del planeta – Muchos clados no representados como especies son tan únicas como estas (grupos genéticos) • Importante par ala conservación y reintroducción de especies.