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Año 5, Número 25. Diciembre 2009.


                              Sección: Revisión bibliográfica

      Bacterias que devoran contaminantes en los
                   mantos acuíferos.
                                          Autor: Arturo Aburto Medina

                   Investigador Postdoctoral en la Universidad Autónoma Metropolitana, México.
                                 Correo electrónico: aburto@correo.cua.uam.mx



    La limpieza de sitios contaminados (suelo y mantos acuíferos) con sustancias tóxicas puede
    realizarse mediante bacterias adaptadas que utilizan a los contaminantes como fuente de energía y
    los convierten en sustancias menos tóxicas.


Introducción                                                 Unidos ha estimado que 40% de los tanques de
                                                             almacenamiento en ese país han tenido fugas y que
El agua del subsuelo es la que existe debajo de la           hasta 30,000 nuevas fugas se registran cada año.
superficie en espacios porosos del suelo y fracturas
de formaciones geológicas. Se origina como agua              Otros estudios indican que de los 2 millones de
de lluvia, nieve, ríos y se mueve a través del suelo         tanques de almacenamiento de gasolina, mas de
hasta que se almacena en los acuíferos. Un acuífero          60.000 presentan fugas en ese país (Rudolph,
es un área subterránea que puede incluir varias              1996). Además, una vez que el acuífero esta
capas de material permeable como arena, grava y              contaminado, la remoción del contaminante es
arcilla que permite el flujo del agua del subsuelo y         difícil porque el flujo en los acuíferos puede ser tan
su almacenamiento. El agua del subsuelo forma                lenta como 1 cm/día.
parte del ciclo hidrológico y puede eventualmente
surgir en la superficie naturalmente en la forma de          Atenuación Natural Monitoreada
manantiales y ríos.
                                                             Por lo tanto, una gran alternativa para la
Los acuíferos son una importante fuente de agua              remediación de sitios contaminados es la
potable para las comunidades y muchas veces                  Atenuación Natural Monitoreada (ANM) ya que no
proveen más del 50% del consumo en grandes                   se requiere de equipo especial, lo cual reduce en
ciudades. Sin embargo, hay muchas formas en las              gran medida los costos.
que los acuíferos se pueden contaminar, ya sea
directamente por la descarga industrial de                   La ANM depende de las actividades catabólicas de
desperdicios químicos o indirectamente por                   los microorganismos          nativos     y procesos
efluentes de agricultura, urbanos e industriales.            fisicoquímicos      como      dilución,    dispersión,
Una gran fuente de contaminación son los millones            volatilización, precipitación, intercambio de iones y
de tanques de almacenamiento de combustibles                 foto oxidación para degradar o detoxificar los
como gasolina y diesel que presentan fugas en todo           contaminantes. Esta alternativa tiene varias
el mundo.                                                    ventajas, en particular que no es intrusiva, reduce el
La Agencia de protección Ambiental de Estados                uso de energía, pero sobre todo, reduce los costos.


                                                                                                 www.infarmate.org
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Otras alternativas pueden ser muy costosas y            contaminantes. Tales incrementos no son inusuales
destructivas. Por ejemplo en el Reino Unido, más        considerando que la atenuación natural es una
de 120 millones de libras son destinadas para la        alternativa a largo plazo que podría durar hasta 50
remoción de pesticidas del agua potable cada año        años y el proceso puede no ser sostenible durante
(www.environment-agency.gov.uk/).                       ese periodo de tiempo.

  Así, la opción de ANM para remediar sitios            La sustentabilidad del proceso debe comparar
contaminados se ha incrementado en años                 conocimiento sobre la liberación del contaminante
recientes. El consejo de recursos nacionales de los     y conocimiento sobre los mecanismos protectores.
Estados Unidos ha escogido este método para la          También se tiene que considerar si hay suficientes
remediación de agua de subsuelo contaminada por         aceptores y donadores de electrones para la
tanques     de almacenamiento        desde 1997         mineralización de contaminantes por el tiempo
(Macdonald, 2000). Además, la agencia ambiental         suficiente para su remoción.       Pero la mas
del Reino Unido ha aceptado este método como            importante, debe haber conocimiento si las
una alternativa viable para la remediación de           reacciones microbianas se mantendrán durante el
acuíferos     contaminados     (www.environment-        considerado periodo de tiempo (Smets et al., 2002).
agency.gov.uk/).
                                                        Caso exitoso de ANM
Sin embargo, para implementar esta alternativa,         El siguiente estudio se basa en un acuífero
debe haber una evaluación completa de las               contaminado con hidrocarburos que se encuentra
circunstancias técnicas y sobre todo, viabilidad para   bajo el ANM.
la atenuación natural. Debe haber evidencia que
los procesos naturales ocurren a tal velocidad que      Se investigó específicamente el potencial de
no afecte a las personas o al ambiente y se logren      biodegradación de benceno (cancerigeno soluble en
determinados objetivos dentro de un periodo de          agua y que ingerido a altas concentraciones puede
tiempo razonable, de ahí que se le llame atenuación     ser fatal) in situ y se realizo el muestreo (Fig. 1) y
natural monitoreada. Para evaluar la eficacia del       la identificación de bacterias que degradan
proceso se deben cumplir los siguientes criterios:      benceno, además, se confirmo que la alcalinidad
(i) Un decremento de contaminantes registrado en        extrema y anaerobiosis inhiben la degradación del
el sitio (ii) experimentos de laboratorio que           contaminante.
demuestren que los microorganismos tienen el
potencial de degradar los contaminantes y               Degradación aeróbica de benceno
evidencia que la biodegradación esta ocurriendo in      A pesar de que el acuífero tiene un rango de
situ (Roling and Van Verseveld, 2002). También,         concentraciones de oxigeno disuelto de 0 a 2.57
el diseño de un programa de monitoreo tiene que         ppm, se registro degradación aeróbica en 11 de 12
ser especifico para cada sitio y los elementos          microcosmos preparados en el laboratorio mientras
básicos incluyen tipo, numero y localización de los     que no se observó degradación alguna en
pozos de monitoreo, diseño del pozo de monitoreo        condiciones anaeróbicas.
y el numero y tipo de muestras así como la
frecuencia de muestreo.
                                                        Bacterias que degradan benceno
Estas características deben permitir al científico el   La caracterización de comunidades microbianas se
monitoreo, determinar cambios en la calidad del         realizo mediante técnicas de biología molecular
agua y proveer una advertencia temprana de              como librerías de clones y la mayoría de esos
cualquier incremento en los niveles de                  clones fueron relacionados con bacterias


                                                                                            www.infarmate.org
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pertenecientes a los géneros Polaromonas,              biodegradación del contaminante en condiciones
Pseudomonas y Acidovorax las cuales se sabe que        microaerofilicas lo cual es apoyado por una
realizan su respiración con oxigeno y reducción de     disminución continua de los niveles del
nitrato respectivamente. Además de encontrar           contaminante in situ a través del tiempo. Así
bacterias aeróbicas y reductoras de nitrato, también   mismo, estos resultados confirman que la
se detectaron microorganismos generadores de           atenuación natural monitoreada es una alternativa
metano que son anaerobios estrictos en las mismas      viable para este sitio contaminado.
muestras, lo que sugiere que la degradación se lleva
a cabo por los dos grupos de microorganismos.

Hay una gran evidencia que la mayoría de
microorganismos aeróbicos detectados en las
librerías de clones están activos y se encuentran
degradando el benceno, lo cual es apoyado porque
1) pertenecen a un genero típicamente asociado con
la degradación de hidrocarburos aromáticos en
agua dulce, 2) las secuencias de clones están
relacionadas con Polaromonas naphthalenivorans
(Fig. 2) fueron idénticas a las de un
microorganismo degradador de naftaleno, 3) el
benceno fue la principal fuente de carbono y
energía, 4) los clones detectados in situ fueron muy
similares a microorganismos degradadores de
benceno aislados en el laboratorio previamente.

Por lo tanto, los resultados sugieren que al menos
un porcentaje de la degradación ocurre en serie, con
micro aerófilos facultativos responsables del primer
ataque sobre los compuestos aromáticos y la
ruptura del anillo de benceno para que la
degradación continúe de manera anaeróbica y
                                                       Fig. 1. Recolección de microorganismos en el sitio
finalmente con la generación de metano. Esto no
                                                       para posterior identificación
solo es posible en un ambiente heterogéneo como
el de un acuífero, si no que también se ha
demostrado previamente en cultivos líquidos.

Conclusión

La degradación de benceno en medios aeróbicos ha
sido demostrada en numerosas ocasiones, sin
embargo, la mayoría de los acuíferos presentan
condiciones anaeróbicas, lo que favorece la
persistencia del contaminante en los acuíferos. El
presente estudio logro confirmar la degradación
aeróbica de benceno en el laboratorio y sugiere la


                                                                                         www.infarmate.org
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                                                 attenuation for groundwater cleanup.
                                                 Environmental Science & Technology 34:
                                                 346A-353A.

                                                 Roling, W.F.M. and Van Verseveld H.W. (2002)
                                                 Natural attenuation: What does the subsurface have
                                                 in store? Biodegradation 13: 53-64

                                                 Rudolph, B.F., L. McIntire (1996) Biotechnology,
                                                 Science, Engineering and Ethical Challenges.
                                                 Washington D.C.: Joseph Henry Press.

                                                 Watanabe K, Kodama Y, Hamamura N & Kaku N
                                                 (2002) Diversity, abundance, and activity of
                                                 archaeal populations in oil contaminated
                                                 groundwater accumulated at the bottom of an
                                                 underground crude oil storage cavity.Appl Environ
                                                 Microbiol 68: 3899-3907.

                                                 Yerushalmi L, Lascourreges JF, Rhofir C & Guiot
Fig. 2. Polaromonas naphthalenivorans            SR (2001) Detection of intermediate metabolites of
                                                 benzene biodegradation under microaerophilic
                                                 conditions. Biodegradation 12: 379-391
Lecturas sugerida

Arturo Aburto, Anne Fahy, Fred Coulon,           Arturo Aburto Medina
Gordon Lethbridge, Kenneth N. Timmis,            Universidad Autónoma Metropolitana-Cuajimalpa
Andrew S. Ball and Terry J. McGenity (2009)      26363800 ext 3827
Mixed aerobic and anaerobic microbial            aaburto@correo.cua.uam.mx
communities     in      benzene-contaminated
groundwaters Journal of Applied Microbiology.
ISSN 1364-5072

Fahy A, Lethbridge G, Earle R, Ball AS, Timmis
KN & McGenity TJ (2005) Effects of long-term
benzene pollution on bacterial diversity and
community structure in groundwater. Environ
Microbiol 7: 1192-1199.

Fahy A, McGenity TJ, Timmis KN & Ball AS
(2006) Heterogeneous aerobic benzene-degrading
communities in oxygen-depleted groundwaters.
FEMS Microbiol Ecol 58: 260-270.

Macdonald, J.A. (2000) Evaluating natural


                                                                                   www.infarmate.org

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17 Bacterias Degradadoras

  • 1. Año 5, Número 25. Diciembre 2009. Sección: Revisión bibliográfica Bacterias que devoran contaminantes en los mantos acuíferos. Autor: Arturo Aburto Medina Investigador Postdoctoral en la Universidad Autónoma Metropolitana, México. Correo electrónico: aburto@correo.cua.uam.mx La limpieza de sitios contaminados (suelo y mantos acuíferos) con sustancias tóxicas puede realizarse mediante bacterias adaptadas que utilizan a los contaminantes como fuente de energía y los convierten en sustancias menos tóxicas. Introducción Unidos ha estimado que 40% de los tanques de almacenamiento en ese país han tenido fugas y que El agua del subsuelo es la que existe debajo de la hasta 30,000 nuevas fugas se registran cada año. superficie en espacios porosos del suelo y fracturas de formaciones geológicas. Se origina como agua Otros estudios indican que de los 2 millones de de lluvia, nieve, ríos y se mueve a través del suelo tanques de almacenamiento de gasolina, mas de hasta que se almacena en los acuíferos. Un acuífero 60.000 presentan fugas en ese país (Rudolph, es un área subterránea que puede incluir varias 1996). Además, una vez que el acuífero esta capas de material permeable como arena, grava y contaminado, la remoción del contaminante es arcilla que permite el flujo del agua del subsuelo y difícil porque el flujo en los acuíferos puede ser tan su almacenamiento. El agua del subsuelo forma lenta como 1 cm/día. parte del ciclo hidrológico y puede eventualmente surgir en la superficie naturalmente en la forma de Atenuación Natural Monitoreada manantiales y ríos. Por lo tanto, una gran alternativa para la Los acuíferos son una importante fuente de agua remediación de sitios contaminados es la potable para las comunidades y muchas veces Atenuación Natural Monitoreada (ANM) ya que no proveen más del 50% del consumo en grandes se requiere de equipo especial, lo cual reduce en ciudades. Sin embargo, hay muchas formas en las gran medida los costos. que los acuíferos se pueden contaminar, ya sea directamente por la descarga industrial de La ANM depende de las actividades catabólicas de desperdicios químicos o indirectamente por los microorganismos nativos y procesos efluentes de agricultura, urbanos e industriales. fisicoquímicos como dilución, dispersión, Una gran fuente de contaminación son los millones volatilización, precipitación, intercambio de iones y de tanques de almacenamiento de combustibles foto oxidación para degradar o detoxificar los como gasolina y diesel que presentan fugas en todo contaminantes. Esta alternativa tiene varias el mundo. ventajas, en particular que no es intrusiva, reduce el La Agencia de protección Ambiental de Estados uso de energía, pero sobre todo, reduce los costos. www.infarmate.org
  • 2. Año 5, Número 25. Diciembre 2009. Otras alternativas pueden ser muy costosas y contaminantes. Tales incrementos no son inusuales destructivas. Por ejemplo en el Reino Unido, más considerando que la atenuación natural es una de 120 millones de libras son destinadas para la alternativa a largo plazo que podría durar hasta 50 remoción de pesticidas del agua potable cada año años y el proceso puede no ser sostenible durante (www.environment-agency.gov.uk/). ese periodo de tiempo. Así, la opción de ANM para remediar sitios La sustentabilidad del proceso debe comparar contaminados se ha incrementado en años conocimiento sobre la liberación del contaminante recientes. El consejo de recursos nacionales de los y conocimiento sobre los mecanismos protectores. Estados Unidos ha escogido este método para la También se tiene que considerar si hay suficientes remediación de agua de subsuelo contaminada por aceptores y donadores de electrones para la tanques de almacenamiento desde 1997 mineralización de contaminantes por el tiempo (Macdonald, 2000). Además, la agencia ambiental suficiente para su remoción. Pero la mas del Reino Unido ha aceptado este método como importante, debe haber conocimiento si las una alternativa viable para la remediación de reacciones microbianas se mantendrán durante el acuíferos contaminados (www.environment- considerado periodo de tiempo (Smets et al., 2002). agency.gov.uk/). Caso exitoso de ANM Sin embargo, para implementar esta alternativa, El siguiente estudio se basa en un acuífero debe haber una evaluación completa de las contaminado con hidrocarburos que se encuentra circunstancias técnicas y sobre todo, viabilidad para bajo el ANM. la atenuación natural. Debe haber evidencia que los procesos naturales ocurren a tal velocidad que Se investigó específicamente el potencial de no afecte a las personas o al ambiente y se logren biodegradación de benceno (cancerigeno soluble en determinados objetivos dentro de un periodo de agua y que ingerido a altas concentraciones puede tiempo razonable, de ahí que se le llame atenuación ser fatal) in situ y se realizo el muestreo (Fig. 1) y natural monitoreada. Para evaluar la eficacia del la identificación de bacterias que degradan proceso se deben cumplir los siguientes criterios: benceno, además, se confirmo que la alcalinidad (i) Un decremento de contaminantes registrado en extrema y anaerobiosis inhiben la degradación del el sitio (ii) experimentos de laboratorio que contaminante. demuestren que los microorganismos tienen el potencial de degradar los contaminantes y Degradación aeróbica de benceno evidencia que la biodegradación esta ocurriendo in A pesar de que el acuífero tiene un rango de situ (Roling and Van Verseveld, 2002). También, concentraciones de oxigeno disuelto de 0 a 2.57 el diseño de un programa de monitoreo tiene que ppm, se registro degradación aeróbica en 11 de 12 ser especifico para cada sitio y los elementos microcosmos preparados en el laboratorio mientras básicos incluyen tipo, numero y localización de los que no se observó degradación alguna en pozos de monitoreo, diseño del pozo de monitoreo condiciones anaeróbicas. y el numero y tipo de muestras así como la frecuencia de muestreo. Bacterias que degradan benceno Estas características deben permitir al científico el La caracterización de comunidades microbianas se monitoreo, determinar cambios en la calidad del realizo mediante técnicas de biología molecular agua y proveer una advertencia temprana de como librerías de clones y la mayoría de esos cualquier incremento en los niveles de clones fueron relacionados con bacterias www.infarmate.org
  • 3. Año 5, Número 25. Diciembre 2009. pertenecientes a los géneros Polaromonas, biodegradación del contaminante en condiciones Pseudomonas y Acidovorax las cuales se sabe que microaerofilicas lo cual es apoyado por una realizan su respiración con oxigeno y reducción de disminución continua de los niveles del nitrato respectivamente. Además de encontrar contaminante in situ a través del tiempo. Así bacterias aeróbicas y reductoras de nitrato, también mismo, estos resultados confirman que la se detectaron microorganismos generadores de atenuación natural monitoreada es una alternativa metano que son anaerobios estrictos en las mismas viable para este sitio contaminado. muestras, lo que sugiere que la degradación se lleva a cabo por los dos grupos de microorganismos. Hay una gran evidencia que la mayoría de microorganismos aeróbicos detectados en las librerías de clones están activos y se encuentran degradando el benceno, lo cual es apoyado porque 1) pertenecen a un genero típicamente asociado con la degradación de hidrocarburos aromáticos en agua dulce, 2) las secuencias de clones están relacionadas con Polaromonas naphthalenivorans (Fig. 2) fueron idénticas a las de un microorganismo degradador de naftaleno, 3) el benceno fue la principal fuente de carbono y energía, 4) los clones detectados in situ fueron muy similares a microorganismos degradadores de benceno aislados en el laboratorio previamente. Por lo tanto, los resultados sugieren que al menos un porcentaje de la degradación ocurre en serie, con micro aerófilos facultativos responsables del primer ataque sobre los compuestos aromáticos y la ruptura del anillo de benceno para que la degradación continúe de manera anaeróbica y Fig. 1. Recolección de microorganismos en el sitio finalmente con la generación de metano. Esto no para posterior identificación solo es posible en un ambiente heterogéneo como el de un acuífero, si no que también se ha demostrado previamente en cultivos líquidos. Conclusión La degradación de benceno en medios aeróbicos ha sido demostrada en numerosas ocasiones, sin embargo, la mayoría de los acuíferos presentan condiciones anaeróbicas, lo que favorece la persistencia del contaminante en los acuíferos. El presente estudio logro confirmar la degradación aeróbica de benceno en el laboratorio y sugiere la www.infarmate.org
  • 4. Año 5, Número 25. Diciembre 2009. attenuation for groundwater cleanup. Environmental Science & Technology 34: 346A-353A. Roling, W.F.M. and Van Verseveld H.W. (2002) Natural attenuation: What does the subsurface have in store? Biodegradation 13: 53-64 Rudolph, B.F., L. McIntire (1996) Biotechnology, Science, Engineering and Ethical Challenges. Washington D.C.: Joseph Henry Press. Watanabe K, Kodama Y, Hamamura N & Kaku N (2002) Diversity, abundance, and activity of archaeal populations in oil contaminated groundwater accumulated at the bottom of an underground crude oil storage cavity.Appl Environ Microbiol 68: 3899-3907. Yerushalmi L, Lascourreges JF, Rhofir C & Guiot Fig. 2. Polaromonas naphthalenivorans SR (2001) Detection of intermediate metabolites of benzene biodegradation under microaerophilic conditions. Biodegradation 12: 379-391 Lecturas sugerida Arturo Aburto, Anne Fahy, Fred Coulon, Arturo Aburto Medina Gordon Lethbridge, Kenneth N. Timmis, Universidad Autónoma Metropolitana-Cuajimalpa Andrew S. Ball and Terry J. McGenity (2009) 26363800 ext 3827 Mixed aerobic and anaerobic microbial aaburto@correo.cua.uam.mx communities in benzene-contaminated groundwaters Journal of Applied Microbiology. ISSN 1364-5072 Fahy A, Lethbridge G, Earle R, Ball AS, Timmis KN & McGenity TJ (2005) Effects of long-term benzene pollution on bacterial diversity and community structure in groundwater. Environ Microbiol 7: 1192-1199. Fahy A, McGenity TJ, Timmis KN & Ball AS (2006) Heterogeneous aerobic benzene-degrading communities in oxygen-depleted groundwaters. FEMS Microbiol Ecol 58: 260-270. Macdonald, J.A. (2000) Evaluating natural www.infarmate.org