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EXPRESSÃO HETERÓLOGA DE
PROTEÍNAS
Ivson Cassiano
Mayla Abrahim
O que são proteínas heterólogas
heterólogo (he-te-ró-lo-go) adj (hétero+logo) 1
Que consiste em elementos diferentes.
Expressão heteróloga de proteína significa que uma
proteína é experimentalmente colocado em uma célula que
normalmente não fazem (ou seja, expressa) a proteína.
A expressão de proteínas funcionais em hospedeiros
heterólogos é um desafio da biotecnologia moderna.
Proteínas e sua importância
A sequência de aminoácidos bem como a função da
proteína, são determinadas pela sequência de pares de
bases no gene que a codifica. As proteínas são
essenciais à estrutura, à função, e ao
regulamento celular e são também responsáveis pela
homeostasia do organismo.
A expressão heteróloga de proteínas é muito
importante quando se pretende proceder ao estudo
funcional das mesmas.
A utilização de microrganismos geneticamente
modificados, capazes de sintetizar proteínas em grande
quantidade, apresenta, sob o ponto de vista econômico,
uma vantagem considerável em relação aos processos
clássicos de produção.
Os sistemas de expressão heteróloga
em proteínas têm vindo a ser
extensivamente utilizados nos dias de
hoje, nomeadamente na produção de
proteínas de interesse do ponto de
vista biotecnológico e medicinal .
EXPRESSÃO HETERÓLOGA DE PROTEÍNAS
Expansão e desafios da indústria de
biotecnologia:
 produção eficiente e controlada de proteínas
recombinantes
 diferentes sistemas de expressão: procariotos e
eucariotos
 inúmeras finalidades: diagnóstica, terapêutica e de
prevenção (vacinas)
Tecnologia de DNA recombinante:
 obter e combinar genes de uma variedade de fontes
 clonar e expressar genes em diferentes hospedeiros
 produção de grandes quantidades de proteínas
recombinantes
A clonagem de expressão permite obter o produto do gene
clonado.
O produto é utilizado para diferentes fins:
 O transcrito da sequência clonada (transcrição in vitro) pode
servir como sonda de hibridação.
•A proteína expressa pode servir para identificar o gene clonado,
numa biblioteca de expressão, por hibridação com o anticorpo
específico.
•O DNA recombinante pode servir para produzir proteínas de valor
comercial.
Relembrando:
 Clonagem gênica: isolamento, amplificação e
purificação de um gene ou de genes, a partir do
material genético de um dado organismo.
 Vetores: veículos de clonagem que permitem que os
fragmentos de DNA a serem clonados sejam
introduzidos e propagados em uma célula hospedeira
adequada.
 Célula hospedeira: células de fácil manipulação,
crescimento rápido e constituição genética bem
conhecida (ex: bactérias, leveduras, células de cultura
de tecidos de mamíferos e insetos).
Sistemas de expressão de proteínas
recombinantes:
 bactérias (Escherichia coli)
 leveduras (Pichia pastoris)
 baculovírus/células de inseto
 cultura de células de mamíferos
 células de plantas e plantas transgênicas
 animais transgênicos
Processo: Escolhendo o vetor
Aplicação da proteína expressada
Características da proteína
Solubilidade e localização celular
Tags
Preparar o vetor
Digestão ou Método
LIC
Preparar o Inserto
Plasmídeo ou DNA
PCR
Clonar o Inserto
no Vetor
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Transformação
Transformação em
célula
de expressão
Indução
Determinação tempo e
temperatura
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Cultura de
células
Extração
Detergentes
Métodos
Físicos
Purificação
Coluna afinidade
Protases - Tags
Procedimento:
Isolar e preparar o DNA;
Escolher o vetor apropriado;
O fragmento de DNA a clonar é introduzido em
vectores de clonagem, formando-se o DNA
recombinante.
O DNA recombinante é inserido na célula hospedeira
– transformação, que possui mecanismos
enzimáticos para a replicação do DNA e para a
síntese protéica;
Selecção e identificação de células que incorporam o
DNA recombinante;
Verificar se a proteína foi expressa;
Remoção e purificação das proteínas. -
Escolhendo o vetor
Organismos como plasmídeos, bacteriófagos, cosmídios, BAC (Bacterial
Artificial Chromosome) e YAC (Yeast Artificial Chromosome) utilizados
para transferir DNA/RNA para uma celular hospedeira.
Considerações importantes para escolher o melhor vetor de expressão:
- Aplicação da proteína expressada;
- Informações específicas sobre a proteína a ser expressada (sequência extra de
amina terminal)
- Estratégia de clonagem – preparo do inseto (compatibilidade entre sítio de
restrição e a região de leitura).
- Solubilidade e localização celular (citoplasma, periplasma ou corpo de inclusão)
- um local de reconhecimento onde as endonucleases o irão cortar.
Preparando o inserto de DNA
DNA de interesse
Utilizar uma enzima de alta
fidelidade;
Limitar o número de ciclos da reação;
Aumentar a concentração do DNA;
Aumentar a concentração de primers.
Células para clonagem E. coli
Vantagens:
Vasto conhecimento da genética e fisiologia
de E. coli
Diversidade de vectores de clonagem
Fácil controlo da expressão génica
Fácil crescimento com elevadas produções
Secreção do produto no meio de cultura
Desvantagens:
Não realiza modificações pós-traducionais e
tem capacidade limitada de formar pontes
dissulfídricas
Atividade biológica e imunogenicidade
podem diferir da proteína natural
Elevado conteúdo de endotoxinas
Falta de um mecanismo de secreção
Escolhendo a melhor célula
 A escolha da melhor célula competente
depende da natureza da proteína de
interesse:
Proteínas mais sensíveis a ação de
proteases;
Proteínas eucarióticas que possuem códons
próprios, também chamados de raros;
Proteínas insolúveis;
Proteínas tóxicas;
Deficiência de Protease
Linhagens B834, BL21, BLR, Origami ™B,
Rosetta™ 2, Tuner™;
São deficientes em proteases que possam
degradar as proteínas durante o processo de
purificação;
Proteínas se tornam mais estáveis nessas
linhagens;
Um pedaço de DNA pode ser inserido em
um plasmídeo, se tanto o plasmídeo circular
e a fonte de DNA têm sítios de
reconhecimento para a mesma
endonuclease de restrição.
Vetor de expressão
Clonagem num vector de expressão
plasmídico
Um pedaço de DNA pode ser
inserido em um plasmídeo, se
tanto o plasmídeo circular e a
fonte de DNA têm sítios de
reconhecimento para a mesma
endonuclease de restrição.
O plasmídeo e o DNA
estranho são cortados por
esta endonuclease de
restrição (EcoRI neste
exemplo).
Os dois intermediários
recombinar por base o
emparelhamento e estão
ligadas pela ação da DNA
ligase.
O vector de expressão tem um
promotor forte, adjacente ao
gene que codifica a proteína, que
origina grandes quantidades de
mRNA.
O DNA recombinante é
introduzido em bactérias,
leveduras, células de inserto, ou
células de mamífero, onde o gene
clonado é transcrito e traduzido
eficientemente.
Tag
O tag é uma curta sequência de nucleotídeos que codifica um
peptideo com poucos aminoácidos.
 Pode ser adicionado à extremidade N ou C do produto
do gene clonado.
 Permite a detecção e purificação de proteínas.
 Péptideos de fusão específicos conferem vantagens à
proteína alvo durante a expressão: aumentam a
solubilidade, protegem da proteólise, melhoram a
conformação, aumentam a produção.
São vários os tags utilizados nos vectores de clonagem:
His6
Glutationa-S-transferase (GST)
Proteína de ligação a maltose (MBP)
Proteína verde fluorescente (GFP)
Epítopos
Tag adicionado ao inserto
Por engenharia genética, uma tag (epítopo) pode ser
adicionado ao inserto.
Detecção de proteínas
A identificação do DNA clonado é feita por
hibridação com um anticorpo específico da
proteína expressa.
Recuperando a Proteína
Lise celular
Remoção dos Ácidos Nucléicos
Otimizar a Purificação
Remover os Tags
Armazenar as proteínas em tampão
apropriado.
Lise celular convencional
Detergentes para Extração
Buster Family
É uma mistura de detergentes, própria para o rompimento
da parede celular de E.coli e liberação das proteínas ativas.
Purificação de proteínas com tag
Após obtenção da proteína, esses resíduos devem ser
purificados;
Podem prejudicar a função / forma da proteína;
São removidos por uma protease específica e / ou
coluna cromatográfica.
Proteases de remoção
Proteases específicas promovem remoção
eficiente dos resíduos
da proteínas.
São altamente específicas e podem ser
ativadas em baixas
temperaturas
Evita desnaturação da proteína.
Fractogel
Purificação eficiente e econômica das
protéinas
Purificação de proteínas em larga
escala;
Purificação de proteínas recombinantes
obtidas da cultura celular
Purificação de vírus
Remoção de resíduos e toxinas
Alta estabilidade química
Corpos de Inclusão – Fração
Insolúvel
Corpos de inclusão: tornam a proteína
inativa devido a formação de agregados
insolúveis (ácidos nucléicos, fosfolipídios,
etc); Consequentemente a proteína deve
ser rearranjada para retomar sua atividade;
Métodos convencionais de purificação de
corpos de inclusão são empíricos e
consomem muito tempo do usuário.
iFOLD ™ Protein Refolding System
É um método rápido e
reprodutível de
identificar as condições
de rearranjo da proteína.
Gene repórter
Gene repórter é um gene que produz uma proteína
que pode ser detectada e quantificada utilizando um
teste simples.
Utilização de genes repórter na localização de proteínas
recombinantes
Ratinho transgénico com GFP em fusão com uma proteína epitelial
O ratinho contém um transgene marcado com GFP expresso no corpo; o
ratinho fluoresce quando iluminado com luz UV.
Atualmente
É possível realizar este processo (com modificações
especificas para cada célula, proteína de interesse e
genoma) em:
 Leveduras (Pichia pastoris, Saccharomyces
cerevisiae, entre outras).
 células de mamífero (células COS, células CV1,
etc)
 baculovírus/células de inseto
 células de plantas e plantas transgênicas
 animais transgênicos
A produção de insulina humana por
ENGENHARIA GENÉTICA
bactéria E. coli Biotecnologia Ciência & Desenvolvimento - nº 23 - novembro/dezembro
2001
vetor de expressão pLMT8.5 construído para a produção
da pró-insulina humana em E. coli.
Aumentando a estabilidade da
proteína
Utilize células deficientes de proteases;
Adicione inibidores de proteases durante o processo
de extração
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Bibliografia
 Como melhorar sua Expressão de Proteínas
Recombinantes em E.coli. Paola de Carvalho Braga,
2008.
 Clonagem de expressão.
 PROTEÍNAS RECOMBINANTES PRODUZIDAS EM
LEVEDURAS. Fernando Araripe Gonçalves Torres. Revista
Biotecnologia.
 A produção de insulina humana por ENGENHARIA
GENÉTICA. Beatriz Dolabela de Lima. Revista
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OBRIGADO!
Ivson Cassiano
Mayla Abrahim

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Expressão Heteróloga Proteínas

  • 2. O que são proteínas heterólogas heterólogo (he-te-ró-lo-go) adj (hétero+logo) 1 Que consiste em elementos diferentes. Expressão heteróloga de proteína significa que uma proteína é experimentalmente colocado em uma célula que normalmente não fazem (ou seja, expressa) a proteína. A expressão de proteínas funcionais em hospedeiros heterólogos é um desafio da biotecnologia moderna.
  • 3. Proteínas e sua importância A sequência de aminoácidos bem como a função da proteína, são determinadas pela sequência de pares de bases no gene que a codifica. As proteínas são essenciais à estrutura, à função, e ao regulamento celular e são também responsáveis pela homeostasia do organismo. A expressão heteróloga de proteínas é muito importante quando se pretende proceder ao estudo funcional das mesmas. A utilização de microrganismos geneticamente modificados, capazes de sintetizar proteínas em grande quantidade, apresenta, sob o ponto de vista econômico, uma vantagem considerável em relação aos processos clássicos de produção.
  • 4. Os sistemas de expressão heteróloga em proteínas têm vindo a ser extensivamente utilizados nos dias de hoje, nomeadamente na produção de proteínas de interesse do ponto de vista biotecnológico e medicinal . EXPRESSÃO HETERÓLOGA DE PROTEÍNAS
  • 5. Expansão e desafios da indústria de biotecnologia:  produção eficiente e controlada de proteínas recombinantes  diferentes sistemas de expressão: procariotos e eucariotos  inúmeras finalidades: diagnóstica, terapêutica e de prevenção (vacinas) Tecnologia de DNA recombinante:  obter e combinar genes de uma variedade de fontes  clonar e expressar genes em diferentes hospedeiros  produção de grandes quantidades de proteínas recombinantes
  • 6. A clonagem de expressão permite obter o produto do gene clonado. O produto é utilizado para diferentes fins:  O transcrito da sequência clonada (transcrição in vitro) pode servir como sonda de hibridação. •A proteína expressa pode servir para identificar o gene clonado, numa biblioteca de expressão, por hibridação com o anticorpo específico. •O DNA recombinante pode servir para produzir proteínas de valor comercial.
  • 7. Relembrando:  Clonagem gênica: isolamento, amplificação e purificação de um gene ou de genes, a partir do material genético de um dado organismo.  Vetores: veículos de clonagem que permitem que os fragmentos de DNA a serem clonados sejam introduzidos e propagados em uma célula hospedeira adequada.  Célula hospedeira: células de fácil manipulação, crescimento rápido e constituição genética bem conhecida (ex: bactérias, leveduras, células de cultura de tecidos de mamíferos e insetos).
  • 8. Sistemas de expressão de proteínas recombinantes:  bactérias (Escherichia coli)  leveduras (Pichia pastoris)  baculovírus/células de inseto  cultura de células de mamíferos  células de plantas e plantas transgênicas  animais transgênicos
  • 9. Processo: Escolhendo o vetor Aplicação da proteína expressada Características da proteína Solubilidade e localização celular Tags Preparar o vetor Digestão ou Método LIC Preparar o Inserto Plasmídeo ou DNA PCR Clonar o Inserto no Vetor Anelamento Transformação Transformação em célula de expressão Indução Determinação tempo e temperatura SDS-PAGE Cultura de células Extração Detergentes Métodos Físicos Purificação Coluna afinidade Protases - Tags
  • 10. Procedimento: Isolar e preparar o DNA; Escolher o vetor apropriado; O fragmento de DNA a clonar é introduzido em vectores de clonagem, formando-se o DNA recombinante. O DNA recombinante é inserido na célula hospedeira – transformação, que possui mecanismos enzimáticos para a replicação do DNA e para a síntese protéica; Selecção e identificação de células que incorporam o DNA recombinante; Verificar se a proteína foi expressa; Remoção e purificação das proteínas. -
  • 11. Escolhendo o vetor Organismos como plasmídeos, bacteriófagos, cosmídios, BAC (Bacterial Artificial Chromosome) e YAC (Yeast Artificial Chromosome) utilizados para transferir DNA/RNA para uma celular hospedeira. Considerações importantes para escolher o melhor vetor de expressão: - Aplicação da proteína expressada; - Informações específicas sobre a proteína a ser expressada (sequência extra de amina terminal) - Estratégia de clonagem – preparo do inseto (compatibilidade entre sítio de restrição e a região de leitura). - Solubilidade e localização celular (citoplasma, periplasma ou corpo de inclusão) - um local de reconhecimento onde as endonucleases o irão cortar.
  • 12. Preparando o inserto de DNA DNA de interesse Utilizar uma enzima de alta fidelidade; Limitar o número de ciclos da reação; Aumentar a concentração do DNA; Aumentar a concentração de primers.
  • 13. Células para clonagem E. coli Vantagens: Vasto conhecimento da genética e fisiologia de E. coli Diversidade de vectores de clonagem Fácil controlo da expressão génica Fácil crescimento com elevadas produções Secreção do produto no meio de cultura Desvantagens: Não realiza modificações pós-traducionais e tem capacidade limitada de formar pontes dissulfídricas Atividade biológica e imunogenicidade podem diferir da proteína natural Elevado conteúdo de endotoxinas Falta de um mecanismo de secreção
  • 14. Escolhendo a melhor célula  A escolha da melhor célula competente depende da natureza da proteína de interesse: Proteínas mais sensíveis a ação de proteases; Proteínas eucarióticas que possuem códons próprios, também chamados de raros; Proteínas insolúveis; Proteínas tóxicas;
  • 15. Deficiência de Protease Linhagens B834, BL21, BLR, Origami ™B, Rosetta™ 2, Tuner™; São deficientes em proteases que possam degradar as proteínas durante o processo de purificação; Proteínas se tornam mais estáveis nessas linhagens;
  • 16. Um pedaço de DNA pode ser inserido em um plasmídeo, se tanto o plasmídeo circular e a fonte de DNA têm sítios de reconhecimento para a mesma endonuclease de restrição. Vetor de expressão
  • 17. Clonagem num vector de expressão plasmídico Um pedaço de DNA pode ser inserido em um plasmídeo, se tanto o plasmídeo circular e a fonte de DNA têm sítios de reconhecimento para a mesma endonuclease de restrição. O plasmídeo e o DNA estranho são cortados por esta endonuclease de restrição (EcoRI neste exemplo). Os dois intermediários recombinar por base o emparelhamento e estão ligadas pela ação da DNA ligase.
  • 18. O vector de expressão tem um promotor forte, adjacente ao gene que codifica a proteína, que origina grandes quantidades de mRNA. O DNA recombinante é introduzido em bactérias, leveduras, células de inserto, ou células de mamífero, onde o gene clonado é transcrito e traduzido eficientemente.
  • 19.
  • 20. Tag O tag é uma curta sequência de nucleotídeos que codifica um peptideo com poucos aminoácidos.  Pode ser adicionado à extremidade N ou C do produto do gene clonado.  Permite a detecção e purificação de proteínas.  Péptideos de fusão específicos conferem vantagens à proteína alvo durante a expressão: aumentam a solubilidade, protegem da proteólise, melhoram a conformação, aumentam a produção. São vários os tags utilizados nos vectores de clonagem: His6 Glutationa-S-transferase (GST) Proteína de ligação a maltose (MBP) Proteína verde fluorescente (GFP) Epítopos
  • 21. Tag adicionado ao inserto Por engenharia genética, uma tag (epítopo) pode ser adicionado ao inserto.
  • 22. Detecção de proteínas A identificação do DNA clonado é feita por hibridação com um anticorpo específico da proteína expressa.
  • 23. Recuperando a Proteína Lise celular Remoção dos Ácidos Nucléicos Otimizar a Purificação Remover os Tags Armazenar as proteínas em tampão apropriado.
  • 26. Buster Family É uma mistura de detergentes, própria para o rompimento da parede celular de E.coli e liberação das proteínas ativas.
  • 27. Purificação de proteínas com tag Após obtenção da proteína, esses resíduos devem ser purificados; Podem prejudicar a função / forma da proteína; São removidos por uma protease específica e / ou coluna cromatográfica.
  • 28. Proteases de remoção Proteases específicas promovem remoção eficiente dos resíduos da proteínas. São altamente específicas e podem ser ativadas em baixas temperaturas Evita desnaturação da proteína.
  • 29. Fractogel Purificação eficiente e econômica das protéinas Purificação de proteínas em larga escala; Purificação de proteínas recombinantes obtidas da cultura celular Purificação de vírus Remoção de resíduos e toxinas Alta estabilidade química
  • 30. Corpos de Inclusão – Fração Insolúvel Corpos de inclusão: tornam a proteína inativa devido a formação de agregados insolúveis (ácidos nucléicos, fosfolipídios, etc); Consequentemente a proteína deve ser rearranjada para retomar sua atividade; Métodos convencionais de purificação de corpos de inclusão são empíricos e consomem muito tempo do usuário. iFOLD ™ Protein Refolding System É um método rápido e reprodutível de identificar as condições de rearranjo da proteína.
  • 31. Gene repórter Gene repórter é um gene que produz uma proteína que pode ser detectada e quantificada utilizando um teste simples. Utilização de genes repórter na localização de proteínas recombinantes Ratinho transgénico com GFP em fusão com uma proteína epitelial O ratinho contém um transgene marcado com GFP expresso no corpo; o ratinho fluoresce quando iluminado com luz UV.
  • 32. Atualmente É possível realizar este processo (com modificações especificas para cada célula, proteína de interesse e genoma) em:  Leveduras (Pichia pastoris, Saccharomyces cerevisiae, entre outras).  células de mamífero (células COS, células CV1, etc)  baculovírus/células de inseto  células de plantas e plantas transgênicas  animais transgênicos
  • 33. A produção de insulina humana por ENGENHARIA GENÉTICA bactéria E. coli Biotecnologia Ciência & Desenvolvimento - nº 23 - novembro/dezembro 2001
  • 34. vetor de expressão pLMT8.5 construído para a produção da pró-insulina humana em E. coli.
  • 35. Aumentando a estabilidade da proteína Utilize células deficientes de proteases; Adicione inibidores de proteases durante o processo de extração Encontre o melhor tampão de armazenagem
  • 36. Bibliografia  Como melhorar sua Expressão de Proteínas Recombinantes em E.coli. Paola de Carvalho Braga, 2008.  Clonagem de expressão.  PROTEÍNAS RECOMBINANTES PRODUZIDAS EM LEVEDURAS. Fernando Araripe Gonçalves Torres. Revista Biotecnologia.  A produção de insulina humana por ENGENHARIA GENÉTICA. Beatriz Dolabela de Lima. Revista Biotecnologia.