El documento presenta varias aplicaciones de XML como DocBook, Chemical Markup Language, Keyhole Markup Language, Mathematical Markup Language, Open Document, Open XML Format, Scalable Vector Graphics y Systems Biology Markup Language. Brevemente describe cada una y proporciona ejemplos de código XML para representar información química, matemática, geoespacial y biológica.

1. XML:
Ejemplos de uso
Sergio Luján Mora
sergio.lujan@ua.es
XML-02

2. Vídeo de esta presentación
Puedes ver esta presentación en vídeo:
http://www.youtube.com/watch?v=-7HttBJnk9g

5. XHTML

6. Aplicación XML

7. Aplicación no significa un programa
que utilice XML.
Aplicación significa el uso de XML
para un dominio específico.

8. Aplicación XML
=
Lenguaje de marcado
=
Vocabulario

9. DocBook
Chemical Markup Language
Keyhole Markup Language
Mathematical Markup Language
Open Document
Open XML Format
Scalable Vector Graphics
Systems Byology Markup Language

11. Chemical Markup Language
• Estructura química de moléculas
• Reacciones químicas
• Información de espectros y análisis
• Datos de química computacional
• Datos cristalografía y materiales

12. <?xml version="1.0" ?>
<cml xmlns="http://www.xml-cml.org/schema/cml2/core"
xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-
instance"
xsi:schemaLocation="http://www.xml-
cml.org/schema/cml2/core/cmlCore.xsd">
<molecule title="Water">
<atomArray>
<atom id="a1" elementType="H" hydrogenCount="0" />
<atom id="a2" elementType="O" hydrogenCount="2" />
<atom id="a3" elementType="H" hydrogenCount="0" />
</atomArray>
<bondArray>
<bond atomRefs2="a1 a2" order="1" />
<bond atomRefs2="a2 a3" order="1" />
</bondArray>
</molecule>
</cml>

15. <?xml version="1.0" standalone="no"?>
<!DOCTYPE book PUBLIC "-//OASIS//DTD DocBook XML V4.2//EN"
"http://www.oasis-open.org/docbook/xml/4.2/docbookx.dtd">
<book lang="es" id="simple_libro">
<title>Un libro muy simple</title>
<chapter id="capitulo_1">
<title>Capitulo 1</title>
<para>Hola mundo!</para>
<para>¡Yo espero que tu día sea bueno!</para>
</chapter>
<chapter id="capitulo_2">
<title>Capitulo 2</title>
<para>Hola otra vez, mundo!</para>
</chapter>
</book>

16. <?xml version="1.0" standalone="no"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//OASIS//DTD DocBook XML V4.2//EN"
"http://www.oasis-open.org/docbook/xml/4.2/docbookx.dtd">
<article lang="es">
<title>Creando Documentación Técnica con DocBook</title>
<articleinfo>
<author>
<firstname>Leonardo</firstname>
<surname>Caballero</surname>
</author>
</articleinfo>
<section id="art-intro">
<title>Introducción</title>
<para>DocBook es un aplicación del estándar SGML/XML e incluye
una DTD propia y que se utiliza de manera más destacada el área
de la documentación técnica.
</para>
</section>
</article>

21. <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<kml xmlns="http://www.opengis.net/kml/2.2">
<Document>
<Placemark>
<name>New York City</name>
<description>New York City</description>
<Point>
<coordinates>-74.006393,40.714172,0</coordinates>
</Point>
</Placemark>
</Document>
</kml>

23. Mathematical Markup Language
• XHTML + MathML
• Intercambio de información:
Maple, Matlab, etc.

25. <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <!DOCTYPE math PUBLIC "-//W3C//DTD
MathML 2.0//EN" "http://www.w3.org/Math/DTD/mathml2/mathml2.dtd">
<math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML">
<mrow>
<mi>x</mi>
<mo>=</mo>
<mfrac>
<mrow>
<mo form="prefix">&#x2212;<!-- &minus; --></mo>
<mi>b</mi>
<mo>&#x00B1;<!-- &PlusMinus; --></mo>
<msqrt>
<msup>
<mi>b</mi>
<mn>2</mn>
</msup>

26. <mo>&#x2212;<!-- &minus; --></mo>
<mn>4</mn>
<mo>&#x2062;<!-- &InvisibleTimes; --></mo>
<mi>a</mi>
<mo>&#x2062;<!-- &InvisibleTimes; --></mo>
<mi>c</mi>
</msqrt>
</mrow>
<mrow>
<mn>2</mn>
<mo>&#x2062;<!-- &InvisibleTimes; --></mo>
<mi>a</mi>
</mrow>
</mfrac>
</mrow>
</math>

28. http://www.w3.org/Math/XSL/pmathml2.xml

29. <p>Below you should see an <mml:msub>
equation inlined within some <mml:mfenced open="{" close="}">
text</p> <mml:mrow>
<mml:mi>a</mml:mi>
<p>some text, some text, <mml:mo>+</mml:mo>
<mml:math> <mml:mi>b</mml:mi>
<mml:mrow> </mml:mrow>
<mml:msup> </mml:mfenced>
<mml:mfenced open="[" close="]"> <mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mrow> </mml:msub>
<mml:mi>a</mml:mi> </mml:mrow>
<mml:mo>+</mml:mo> </mml:math>
<mml:mi>b</mml:mi> some text.</p>
</mml:mrow>
</mml:mfenced>
<mml:mn>260</mml:mn>
</mml:msup>
<mml:mo>+</mml:mo>

30. <p>Below is an equation with a radical:</p>
<p>
<mml:math>
<mml:msup>
<mml:msqrt>
<mml:mrow>
<mml:mi>a</mml:mi>
<mml:mo>+</mml:mo>
<mml:mi>b</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msqrt>
<mml:mn>27</mml:mn>
</mml:msup>
</mml:math>
</p>

35. OpenDocument

44. Office Open XML

53. <?xml version="1.0"?>
<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg"
width="12cm" height="8cm">
<title>The pink triangle!!!</title>
<text x="10" y="15">This is SVG!</text>
<polygon style="fill: pink"
points="0,311 180,0 360,311" />
</svg>

56. Systems Biology Markup Language
• Redes metabólicas
• Rutas de señalización celular
• Redes de regulación génicas

58. <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<sbml level="2" version="3" xmlns="http://www.sbml.org/sbml/level2/version3">
<model name="EnzymaticReaction">
<listOfUnitDefinitions>
<unitDefinition id="per_second">
<listOfUnits>
<unit kind="second" exponent="-1"/>
</listOfUnits>
</unitDefinition>
<unitDefinition id="litre_per_mole_per_second">
<listOfUnits>
<unit kind="mole" exponent="-1"/>
<unit kind="litre" exponent="1"/>
<unit kind="second" exponent="-1"/>
</listOfUnits>
</unitDefinition>
</listOfUnitDefinitions>
<listOfCompartments>

59. DocBook
Chemical Markup Language
Keyhole Markup Language
Mathematical Markup Language
Open Document
Open XML Format
Scalable Vector Graphics
Systems Byology Markup Language

60. Más información:
http://accesibilidadweb.dlsi.ua.es/
http://desarrolloweb.dlsi.ua.es/
sergio.lujan@ua.es

62. Créditos de fotografías e imágenes:
http://www.w3.org/Consortium/Legal/logo-usage-20000308
http://es.wikipedia.org/wiki/Archivo:Newgooglelogo.png
http://www.opengeospatial.org/ogc/policies/logo
http://es.wikipedia.org/wiki/Open_Document
http://thenetworkisthecomputer.com/files/so51_packaging.png
http://en.wikipedia.org/wiki/File:Sun_Microsystems_logo.svg
http://en.wikipedia.org/wiki/File:Oracle_logo.svg
http://www.sxc.hu/photo/1238327
http://en.wikipedia.org/wiki/File:Microsoft_wordmark.svg