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Introdução a Tecnologia do
rDNA e Produção de Plantas
        Transgênicas
Caracterização do Transgene
     e Estrutura do locus
       Andréa A. Carneiro
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacterium




 Biobalística
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacteria




Biobalística
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacteria




Biobalística
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacteria




Biobalística
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacteria




Biobalística
Agrobacterium tumefaciens      TRANSFORMAÇÃO DE PLANTAS



plasmídeo “Ti”
(tumor inducer)

        célula transformada
         TRANSGÊNICA !
                                                  célula da planta




     crescimento acelerado e
                               TUMORIZAÇÃO
     desordenado do tecido                   “GALHA DA COROA”
Transformação Genética de Plantas
                Agrobacterium tumefaciens
                             Agrobacterium 4.Transferência do
                                                  T-DNA para a célula
                                                  vegetal
     Plasmídeo Ti          2.Ativação dos
                           genes vir
     EE             ED
                                                    Ti
                                 Genes vir                    3.Cópia e
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                                                              excisão
Genes Vir
                                                              do T-DNA
                                             att, chvA, B, E, pscA

                                    CROMOSSOMA BACTERIANO
Transformação por
                            Agrobacterium spp.

                             Casa de
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co-cultivo




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plaqueamento
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Transformação Genética de Plantas
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Transformação Genética de Plantas
        Transferência Direta de DNA

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                 aceleração
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                               Disco de
                               ruptura

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           disparo dos
      microcarreadores



                                 Tela de
         Microcarreadores        anteparo
                 cobertos
                com DNA

Tecido alvo
Transformação Genética de Plantas
             CONSTRUÇÃO GÊNICA
• Genes – Uma região de DNA que
  codifica para a produção de uma
  proteína ou característica
• Rede interativa - DNA, RNA e proteínas
Transformação Genética de Plantas
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• Transgenes – genes manipulados através das técnicas
  de DNA recombinante (rDNA)
   – Obtidos de organismos doadores (vírus, bactérias,
     fungos, vegetais e animais)
   – Sintetizados “in vitro”
   – Genes provenientes do mesmo organismo (cisgênico)
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   – Transgênico pode ser produzido pela adição,
     deleção, iRNA.
Evento                              Características
T25         Tolerância ao herbicida glufosinato de amônio
MON 810     Resistência a insetos da ordem Lepidóptera
BT11        Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao
            herbicida glufosinato de amônio
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Transformação Genética de Plantas
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Estágio de Desenvolvimento                       Final do Processo
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    35S; Ubiquitina; Actina                       NOS; polyA 35S

                                     Proteína


                               cry; vip; epsps
Transformação Genética de Plantas
   CONSTRUÇÃO GÊNICA - Promotor
         Promotor   uidA (GUS)   NOS
NcoI                          BamH
                            1.893 kb
                                                 I
                        cry1C (codon
                         optimized)

HindIII         BglII                            EcoRI
      d35S            AMV              NOS-Ter
    promoter
Transformação Genética de Plantas
        CONSTRUÇÃO GÊNICA
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Transformação Genética de Plantas
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Transformação Genética de Plantas
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Transformação Genética de Plantas
 Biossegurança – Análises Moleculares
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores

 Qual o método de transformação foi utilizado?
   – Foi considerado os riscos de cada método?
   – Foi utilizado todo o vetor ou apenas partes?
 Quais são os principais transgenes presentes no
  evento?
    Resistência a insetos / Genes cry
    Tolerância a herbicidas / Genes epsps
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores

 Quais os organismos foram os doadores de genes?
    Organismo diferente?
    Mesmo organismo?
    Removido do seu contexto fisiológico, o gene se torna
     um rDNA com todos os riscos associados de qualquer
     rDNA.
Biossegurança – Análise Moleculares
              Transgene e vetores

 Os genes foram manipulados criando fusões entre diferentes genes
  ou tiveram alguma parte sintetizadas in vitro?
    Transgene pode ter sido modificado para ser expresso de
      maneira mais eficiente (codon usage)
    Recodificados ao nível dos nucleotídeos para ter um codon
      preferido pelo organismo recipiente.
    Ex: genes cry de Bacillus foram recodificados resultando em um
      aumento de 100X de expressão (Trends Biotechnol. 2004. 22, 346-353)


                    Milho AGG – Arginina (14,8%)
                    Milho CGA - Arginina (4,3%)
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores
 Quais os genes foram utilizados para a seleção das
  células modificadas?
    Resistência a antibióticos – nptII –kan; bla - amp
    Tolerância a Herbicida epsps –glifosato; pat e bar -
     glifosinato
 O gene de seleção foi retirado? Como?
    Seleção de progênie
    Recombinase
 Como foi confirmado a remoção?
    Southern blot, PCR
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores
 A sequência do transgene e o mapa de restrição são
  equivalentes?
 Dados de sequenciamento mostrando:
    O sítio de inserção do transgene no cromossomo
    A sequência que foi inserida
    As sequências flanqueando o transgene
 Foi verificado a ausência de outras integrações,
  completa ou parcial?
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores
 Foi verificado rearranjamentos nos cromossomos?
 Qual o número de cópias do transgene presente no
  evento gerado?
 Houve integração de sequências estruturais do vetor?
Transformação Genética de Plantas
 Biossegurança – Análises Moleculares




         EcoRI              AluI EcoRI


   GAATTCCGTAATCGCCATGGTAGCTGGCGAATTCGGGAATG
Biossegurança – Análise Moleculares
          Southern Blot
Biossegurança – Análise Moleculares
  Polymerase chain reaction- PCR
Biossegurança – Análise Moleculares
         Sequenciamento
Mapa de Restrição
Biossegurança
Genoma
Transcriptoma, Proteoma e Metaboloma
Saúde humana e animal
Meio ambiente

         Biosafety Assessment Tool
         https://bat.genok.or/bat/
OBRIGADA!
    Andréa A. Carneiro
andreac@cnpms.embrapa.br

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Andrea a. carneiro introdução da tecnologia do dna recombinante e producao de plantas transgênicas, caracterização do transgene e estrutrura do locus

  • 1. Introdução a Tecnologia do rDNA e Produção de Plantas Transgênicas Caracterização do Transgene e Estrutura do locus Andréa A. Carneiro
  • 2. PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS Agrobacterium Biobalística
  • 3. PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS Agrobacteria Biobalística
  • 4. PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS Agrobacteria Biobalística
  • 5. PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS Agrobacteria Biobalística
  • 6. PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS Agrobacteria Biobalística
  • 7. Agrobacterium tumefaciens TRANSFORMAÇÃO DE PLANTAS plasmídeo “Ti” (tumor inducer) célula transformada TRANSGÊNICA ! célula da planta crescimento acelerado e TUMORIZAÇÃO desordenado do tecido “GALHA DA COROA”
  • 8. Transformação Genética de Plantas Agrobacterium tumefaciens Agrobacterium 4.Transferência do T-DNA para a célula vegetal Plasmídeo Ti 2.Ativação dos genes vir EE ED Ti Genes vir 3.Cópia e T-DNA excisão Genes Vir do T-DNA att, chvA, B, E, pscA CROMOSSOMA BACTERIANO
  • 9. Transformação por Agrobacterium spp. Casa de vegetação co-cultivo calo plaqueamento (eliminação Agrobacterium) indução e regeneração seleção
  • 10. Transformação Genética de Plantas Transferência Direta de DNA • Microinjeção • Transformação de protoplastos via polietileno glicol • Eletroporação • Fibrilas de carboneto de silício • Bombardeamento de Partículas Ponto comum: Fatores físicos ou químicos facilitam a entrada do DNA na célula vegetal
  • 11. Transformação Genética de Plantas Transferência Direta de DNA Bombardeamento de Partículas Microcarreador Material Genético Célula
  • 12. BIOBALÍSTICA (“gene gun”) Tubo de aceleração de gás Disco de ruptura Aparato para Macrocarreador disparo dos microcarreadores Tela de Microcarreadores anteparo cobertos com DNA Tecido alvo
  • 13. Transformação Genética de Plantas CONSTRUÇÃO GÊNICA • Genes – Uma região de DNA que codifica para a produção de uma proteína ou característica • Rede interativa - DNA, RNA e proteínas
  • 14. Transformação Genética de Plantas CONSTRUÇÃO GÊNICA • Transgenes – genes manipulados através das técnicas de DNA recombinante (rDNA) – Obtidos de organismos doadores (vírus, bactérias, fungos, vegetais e animais) – Sintetizados “in vitro” – Genes provenientes do mesmo organismo (cisgênico) ou de organismos diferentes (transgênico) – Transgênico pode ser produzido pela adição, deleção, iRNA.
  • 15. Evento Características T25 Tolerância ao herbicida glufosinato de amônio MON 810 Resistência a insetos da ordem Lepidóptera BT11 Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao herbicida glufosinato de amônio NK 603 Tolerância ao herbicida glifosato GA21 Tolerância ao herbicida glufosinato de amônio HERCULEX Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao herbicida glufosinato de amônio MIR162 Resistência a insetos da ordem Lepidóptera MON 810 x Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao NK603 herbicida glifosato BT11 x Resistência a insetos da ordem Lepidóptera, tolerância aos GA21 herbicidas glifosato e glufosinato de amônio MON89034 Resistência a insetos da ordem Lepidóptera TC1507 x Resistência a insetos da ordem Lepidóptera, tolerância aos NK603 herbicidas glifosato e glufosinato de amônio
  • 16. Transformação Genética de Plantas CONSTRUÇÃO GÊNICA PROMOTOR REGIÃO CODIFICADORA TERMINADOR Localização: Célula, tecido, órgão Estágio de Desenvolvimento Final do Processo Quantidade produzida 35S; Ubiquitina; Actina NOS; polyA 35S Proteína cry; vip; epsps
  • 17. Transformação Genética de Plantas CONSTRUÇÃO GÊNICA - Promotor Promotor uidA (GUS) NOS
  • 18. NcoI BamH 1.893 kb I cry1C (codon optimized) HindIII BglII EcoRI d35S AMV NOS-Ter promoter
  • 19. Transformação Genética de Plantas CONSTRUÇÃO GÊNICA
  • 20. Transformação Genética de Plantas CONSTRUÇÃO GÊNICA
  • 21. Transformação Genética de Plantas CONSTRUÇÃO GÊNICA
  • 22. Transformação Genética de Plantas CONSTRUÇÃO GÊNICA
  • 23. Transformação Genética de Plantas Biossegurança – Análises Moleculares
  • 24. Biossegurança – Análise Moleculares Transgene e vetores  Qual o método de transformação foi utilizado? – Foi considerado os riscos de cada método? – Foi utilizado todo o vetor ou apenas partes?  Quais são os principais transgenes presentes no evento?  Resistência a insetos / Genes cry  Tolerância a herbicidas / Genes epsps
  • 25. Biossegurança – Análise Moleculares Transgene e vetores  Quais os organismos foram os doadores de genes?  Organismo diferente?  Mesmo organismo?  Removido do seu contexto fisiológico, o gene se torna um rDNA com todos os riscos associados de qualquer rDNA.
  • 26. Biossegurança – Análise Moleculares Transgene e vetores  Os genes foram manipulados criando fusões entre diferentes genes ou tiveram alguma parte sintetizadas in vitro?  Transgene pode ter sido modificado para ser expresso de maneira mais eficiente (codon usage)  Recodificados ao nível dos nucleotídeos para ter um codon preferido pelo organismo recipiente.  Ex: genes cry de Bacillus foram recodificados resultando em um aumento de 100X de expressão (Trends Biotechnol. 2004. 22, 346-353) Milho AGG – Arginina (14,8%) Milho CGA - Arginina (4,3%)
  • 27. Biossegurança – Análise Moleculares Transgene e vetores  Quais os genes foram utilizados para a seleção das células modificadas?  Resistência a antibióticos – nptII –kan; bla - amp  Tolerância a Herbicida epsps –glifosato; pat e bar - glifosinato  O gene de seleção foi retirado? Como?  Seleção de progênie  Recombinase  Como foi confirmado a remoção?  Southern blot, PCR
  • 28. Biossegurança – Análise Moleculares Transgene e vetores  A sequência do transgene e o mapa de restrição são equivalentes?  Dados de sequenciamento mostrando:  O sítio de inserção do transgene no cromossomo  A sequência que foi inserida  As sequências flanqueando o transgene  Foi verificado a ausência de outras integrações, completa ou parcial?
  • 29. Biossegurança – Análise Moleculares Transgene e vetores  Foi verificado rearranjamentos nos cromossomos?  Qual o número de cópias do transgene presente no evento gerado?  Houve integração de sequências estruturais do vetor?
  • 30. Transformação Genética de Plantas Biossegurança – Análises Moleculares EcoRI AluI EcoRI GAATTCCGTAATCGCCATGGTAGCTGGCGAATTCGGGAATG
  • 31. Biossegurança – Análise Moleculares Southern Blot
  • 32. Biossegurança – Análise Moleculares Polymerase chain reaction- PCR
  • 33. Biossegurança – Análise Moleculares Sequenciamento
  • 34.
  • 36. Biossegurança Genoma Transcriptoma, Proteoma e Metaboloma Saúde humana e animal Meio ambiente Biosafety Assessment Tool https://bat.genok.or/bat/
  • 37. OBRIGADA! Andréa A. Carneiro andreac@cnpms.embrapa.br