SlideShare una empresa de Scribd logo
1 de 16
Descargar para leer sin conexión
Dimitri Brosens & Bart Goossens
Informatie & Datacentrum INBO
OMGAAN MET ONDERZOEKSDATA: INBO
2
Beheer van onderzoeksinformatie: PURE
PURE is een CRIS systeem
Persoonlijk overzicht
Onderzoeksoutput (publicaties, presentaties, ….)
Dienstverlening
Projecten
Activiteiten
Adviseringsdocumenten
Personeel en expertise
Datasets
3
Beheer van onderzoeksinformatie: PURE
4
Beheer van onderzoeksinformatie: PURE
Grafiek van relaties
5
Beheer van ruwe data: Welke data
INBO onderzoeksdata
Observaties
Human observation &
Machine observation
Remote sensing
Vegetatieopnames
INBOveg
6
Beheer van ruwe data: Welke data
INBO onderzoeksdata
Verzameld materiaal
Roadkill & Afvangsten & Bevissing
Analyse data (DNA
sequenties…)
–e-DNA
–Haarstalen
–Swabstalen
– Faeces
–Bodemstalen
- Waterstalen
7
INBO Referentiedata
Checklists
Referentielijsten naar voorkomen species in een bepaald
geografisch gebied
Rode lijsten
Rode lijst van de Zoogdieren
Referentielijsten naar status en voorkomen in een bepaald
geografisch gebied
Geografische GIS data
GIS (Kaartlagen)
“Taxonomische lijsten”
Catalogue of LIFE
…
Beheer van ruwe data: Welke data
8
Beheer onderzoeksdata
Observaties
Human observation
 NBN datamodel (Recorder6)
 SQL databank (Microsoft SQL server)
 Werkblad & Access (  )
Machine observation
  Lifewatch applicaties
  SQL databank
  DATA warehouse
Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer
9
Vegetatieopnames
INBOveg
Webapplicatie met achterliggende databank
https://data.inbo.be/inboveg/ViewHome.form
Verzameld materiaal
Roadkill & Afvangsten & Bevissing
-> SQL databank (Microsoft server)
Werkblad & Access ()
Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer
10
Labo data (Analyse, laboresultaten…)
–e-DNA
–Haarstalen
–Swabstalen
– Faeces
–Bodemstalen
- Waterstalen
 Laboratory information management system (LIMS)
Beheer van ruwe data: Centraal data beheer
11
Beheer referentiedata
Checklists
Rode lijsten
Taxonomische lijsten
 INBO NAMESERVER (SQL server)
Geografische GIS data
 GIS data server (GIS team)
Beheer van ruwe data: Centraal data beheer
SD 5: Het INBO beheert gegevens en maakt ze toegankelijk.
Het INBO fungeert als draaischijf voor het gegevensbeheer. Daarbij zoekt
het INBO naar geschikte manieren om aan gegevensverzameling te doen
en om gegevens te ontsluiten en toegankelijk te maken.
12
Beheer van ruwe data: Data Publiceren
13
Data Publiceren
Onderzoeksinformatie
 Pure Portal (webservices)
Biodiversiteitsdata
• Primary Occurrence data & Checklists
• Standaardiseren
• Darwin Core
• Metadata optimaliseren
• EML
• Publiceren
• IPT (integrated publishing toolkit)
• Darwin Core Archives
14
Data Publiceren
Andere manieren
• Dryad Data Digital Repository
• Flexibel ivm het data formaat
• Past in de “manuscript indienen“workflow
• Gegevens particulier beschikbaar tijdens de peer review
• Toestaan van beperkte embargo tijd
• Gegevens zijn gekoppeld van en naar gespecialiseerde data repositories (vb. GBIF of
GenBank ) .
• Wijst Digital Object Identifiers ( DOI ) aan gegevens
• Bevordert de zichtbaarheid van gegevens
• Data gepubliceerd onder CC0, geen wettelijke belemmering om data te hergebruiken
• Inhoud wordt actief beheerd .
• Datafiles kunnen bijgewerkt worden indien nodig
• Bewaring van de data op lange termijn ...
• Webservices
• Pure webservices
• GBIF webservices
• In volle ontwikkeling
15
Data Publiceren
Data policy
Voorgestelde richtlijnen
1 Alle data verzameld in opdracht van het (EV) INBO kunnen in principe
ontsloten worden, met toepassing van de uitzonderingsgronden zoals bepaald
in het decreet betreffende openbaarheid van bestuur (2004-03-26, Artikel 15).
2 Data die geassocieerd zijn met een wetenschappelijk artikel worden
ontsloten bij publicatie.
3 Ruwe data worden ontsloten indien technisch haalbaar. Onderzoekers
kunnen gebruik maken van een embargo tot 18 maanden na het verzamelen.
Sommige projecten kunnen een versnelde (= geen embargo) of verplichte data-
ontsluiting vereisen.
4 Data worden steeds ontsloten als open data, zoals gedefinieerd door de Open
Knowledge Foundation.
INBO als data Publisher
INBO is data publisher in het GBIF netwerk
Publiceren via ITP van Darwin Core Archives
Ondersteuning door het Belgisch Biodiversiteitsplatform
(GBIF node)
• Belgische GBIF Data
Publishers
16

Más contenido relacionado

La actualidad más candente

Gis Portal Dhv (Slideshare)
Gis Portal Dhv (Slideshare)Gis Portal Dhv (Slideshare)
Gis Portal Dhv (Slideshare)HarrytSchimmel
 
Lessen uit project CARDS: ondersteunen van onderzoekers bij onderzoeksdata
Lessen uit project CARDS: ondersteunen van onderzoekers bij onderzoeksdataLessen uit project CARDS: ondersteunen van onderzoekers bij onderzoeksdata
Lessen uit project CARDS: ondersteunen van onderzoekers bij onderzoeksdataDriek Heesakkers
 
20190329 leveranciersbijeenkomst Toekomstperspectief Informatie- en archiefbe...
20190329 leveranciersbijeenkomst Toekomstperspectief Informatie- en archiefbe...20190329 leveranciersbijeenkomst Toekomstperspectief Informatie- en archiefbe...
20190329 leveranciersbijeenkomst Toekomstperspectief Informatie- en archiefbe...VNG Realisatie
 
( Dutch ) Dataverse Network : Workshop (Dutch) Dataverse Network voor 3TU.Dat...
( Dutch ) Dataverse Network : Workshop (Dutch) Dataverse Network voor 3TU.Dat...( Dutch ) Dataverse Network : Workshop (Dutch) Dataverse Network voor 3TU.Dat...
( Dutch ) Dataverse Network : Workshop (Dutch) Dataverse Network voor 3TU.Dat...Leon Osinski
 
Research data management: "Is dit nog wel des bibliotheeks"?
Research data management: "Is dit nog wel des bibliotheeks"?Research data management: "Is dit nog wel des bibliotheeks"?
Research data management: "Is dit nog wel des bibliotheeks"?Hugo Besemer
 
RDM Support: een one stop shop voor onderzoekers
RDM Support: een one stop shop voor onderzoekersRDM Support: een one stop shop voor onderzoekers
RDM Support: een one stop shop voor onderzoekersMariëtte van Selm
 
20190425 presentatie architectuur themabijeenkomst digitale informatie en inn...
20190425 presentatie architectuur themabijeenkomst digitale informatie en inn...20190425 presentatie architectuur themabijeenkomst digitale informatie en inn...
20190425 presentatie architectuur themabijeenkomst digitale informatie en inn...VNG Realisatie
 
JPIndex
JPIndexJPIndex
JPIndexingron
 

La actualidad más candente (11)

Gis Portal Dhv (Slideshare)
Gis Portal Dhv (Slideshare)Gis Portal Dhv (Slideshare)
Gis Portal Dhv (Slideshare)
 
Lessen uit project CARDS: ondersteunen van onderzoekers bij onderzoeksdata
Lessen uit project CARDS: ondersteunen van onderzoekers bij onderzoeksdataLessen uit project CARDS: ondersteunen van onderzoekers bij onderzoeksdata
Lessen uit project CARDS: ondersteunen van onderzoekers bij onderzoeksdata
 
Systeemkeuze
SysteemkeuzeSysteemkeuze
Systeemkeuze
 
20190329 leveranciersbijeenkomst Toekomstperspectief Informatie- en archiefbe...
20190329 leveranciersbijeenkomst Toekomstperspectief Informatie- en archiefbe...20190329 leveranciersbijeenkomst Toekomstperspectief Informatie- en archiefbe...
20190329 leveranciersbijeenkomst Toekomstperspectief Informatie- en archiefbe...
 
Imac dpo
Imac dpoImac dpo
Imac dpo
 
( Dutch ) Dataverse Network : Workshop (Dutch) Dataverse Network voor 3TU.Dat...
( Dutch ) Dataverse Network : Workshop (Dutch) Dataverse Network voor 3TU.Dat...( Dutch ) Dataverse Network : Workshop (Dutch) Dataverse Network voor 3TU.Dat...
( Dutch ) Dataverse Network : Workshop (Dutch) Dataverse Network voor 3TU.Dat...
 
Research data management: "Is dit nog wel des bibliotheeks"?
Research data management: "Is dit nog wel des bibliotheeks"?Research data management: "Is dit nog wel des bibliotheeks"?
Research data management: "Is dit nog wel des bibliotheeks"?
 
RDM Support: een one stop shop voor onderzoekers
RDM Support: een one stop shop voor onderzoekersRDM Support: een one stop shop voor onderzoekers
RDM Support: een one stop shop voor onderzoekers
 
20190425 presentatie architectuur themabijeenkomst digitale informatie en inn...
20190425 presentatie architectuur themabijeenkomst digitale informatie en inn...20190425 presentatie architectuur themabijeenkomst digitale informatie en inn...
20190425 presentatie architectuur themabijeenkomst digitale informatie en inn...
 
NCDD-project Verrijkte Publicaties
NCDD-project Verrijkte Publicaties NCDD-project Verrijkte Publicaties
NCDD-project Verrijkte Publicaties
 
JPIndex
JPIndexJPIndex
JPIndex
 

Destacado

Destacado (19)

LIBIS
LIBISLIBIS
LIBIS
 
Digitalisering helpt culturele schatten te ontsluiten
Digitalisering helpt culturele schatten te ontsluitenDigitalisering helpt culturele schatten te ontsluiten
Digitalisering helpt culturele schatten te ontsluiten
 
Hooimijten
HooimijtenHooimijten
Hooimijten
 
Databanken Architectuurarchieven
Databanken ArchitectuurarchievenDatabanken Architectuurarchieven
Databanken Architectuurarchieven
 
Visietraject Mediawijsheid
Visietraject MediawijsheidVisietraject Mediawijsheid
Visietraject Mediawijsheid
 
E-boeken in de bib, het aanbiedingsmodel
E-boeken in de bib, het aanbiedingsmodelE-boeken in de bib, het aanbiedingsmodel
E-boeken in de bib, het aanbiedingsmodel
 
De positie van de academische bibliotheek in hedendaags onderwijs & onderzoek
De positie van de academische bibliotheek in hedendaags onderwijs & onderzoekDe positie van de academische bibliotheek in hedendaags onderwijs & onderzoek
De positie van de academische bibliotheek in hedendaags onderwijs & onderzoek
 
Weerslag besparingen in de sector Bibliotheek, Archief en Documentatie
Weerslag besparingen in de sector Bibliotheek, Archief en DocumentatieWeerslag besparingen in de sector Bibliotheek, Archief en Documentatie
Weerslag besparingen in de sector Bibliotheek, Archief en Documentatie
 
Het geheugen van de architect: een reality check
Het geheugen van de architect: een reality checkHet geheugen van de architect: een reality check
Het geheugen van de architect: een reality check
 
FryskLab: mobiel bibliotheekfablab
FryskLab: mobiel bibliotheekfablabFryskLab: mobiel bibliotheekfablab
FryskLab: mobiel bibliotheekfablab
 
De impact van Europeana
De impact van EuropeanaDe impact van Europeana
De impact van Europeana
 
De Bibliotheek, tussen producent en consument
De Bibliotheek, tussen producent en consumentDe Bibliotheek, tussen producent en consument
De Bibliotheek, tussen producent en consument
 
Velehanden.nl, een kijkje achter de schermen van het crowdsourcingplatform
Velehanden.nl, een kijkje achter de schermen van het crowdsourcingplatformVelehanden.nl, een kijkje achter de schermen van het crowdsourcingplatform
Velehanden.nl, een kijkje achter de schermen van het crowdsourcingplatform
 
Kiezen of niet kiezen; of: Waarom bewaren we niet gewoon alles?
Kiezen of niet kiezen; of: Waarom bewaren we niet gewoon alles?Kiezen of niet kiezen; of: Waarom bewaren we niet gewoon alles?
Kiezen of niet kiezen; of: Waarom bewaren we niet gewoon alles?
 
Efficiënt collectioneren en administreren: de workflow van uw bibliotheek via...
Efficiënt collectioneren en administreren: de workflow van uw bibliotheek via...Efficiënt collectioneren en administreren: de workflow van uw bibliotheek via...
Efficiënt collectioneren en administreren: de workflow van uw bibliotheek via...
 
De nieuwe ODIS: genetwerkte contextuele metadata in internationaal perspectief
De nieuwe ODIS: genetwerkte contextuele metadata in internationaal perspectiefDe nieuwe ODIS: genetwerkte contextuele metadata in internationaal perspectief
De nieuwe ODIS: genetwerkte contextuele metadata in internationaal perspectief
 
Een schijf om U tegen te zeggen: een semi-dynamisch digitaal archiefdepot
Een schijf om U tegen te zeggen: een semi-dynamisch digitaal archiefdepotEen schijf om U tegen te zeggen: een semi-dynamisch digitaal archiefdepot
Een schijf om U tegen te zeggen: een semi-dynamisch digitaal archiefdepot
 
Elektronisch lezen op e-reader en tablet
Elektronisch lezen op e-reader en tabletElektronisch lezen op e-reader en tablet
Elektronisch lezen op e-reader en tablet
 
Live chat in de boekentoren (Paul Bastijns)
Live chat in de boekentoren (Paul Bastijns)Live chat in de boekentoren (Paul Bastijns)
Live chat in de boekentoren (Paul Bastijns)
 

Más de Vlaamse Vereniging voor Bibliotheek, Archief & Documentatie vzw (VVBAD)

Más de Vlaamse Vereniging voor Bibliotheek, Archief & Documentatie vzw (VVBAD) (20)

Presentatie AHD studiedag Leeszaalmedewerkers -
Presentatie AHD studiedag Leeszaalmedewerkers -Presentatie AHD studiedag Leeszaalmedewerkers -
Presentatie AHD studiedag Leeszaalmedewerkers -
 
ChatGPT, chatboxes en het einde van de databases
ChatGPT, chatboxes en het einde van de databasesChatGPT, chatboxes en het einde van de databases
ChatGPT, chatboxes en het einde van de databases
 
Connecting libraries to EU resources
Connecting libraries to EU resourcesConnecting libraries to EU resources
Connecting libraries to EU resources
 
Ben je klaar voor innovatie?
Ben je klaar voor innovatie?Ben je klaar voor innovatie?
Ben je klaar voor innovatie?
 
Hoe maak ik mijn project impactvol?
Hoe maak ik mijn project impactvol?Hoe maak ik mijn project impactvol?
Hoe maak ik mijn project impactvol?
 
Connecteren faciliteren in hoger onderwijs, welke rol heeft de bibliotheek?
Connecteren faciliteren in hoger onderwijs, welke rol heeft de bibliotheek?Connecteren faciliteren in hoger onderwijs, welke rol heeft de bibliotheek?
Connecteren faciliteren in hoger onderwijs, welke rol heeft de bibliotheek?
 
Netwerken bij Informatie aan Zee
Netwerken bij Informatie aan ZeeNetwerken bij Informatie aan Zee
Netwerken bij Informatie aan Zee
 
Islamtisch (religieus) erfgoed. Waar liggen de uitdagingen en kansen?
Islamtisch (religieus) erfgoed. Waar liggen de uitdagingen en kansen?Islamtisch (religieus) erfgoed. Waar liggen de uitdagingen en kansen?
Islamtisch (religieus) erfgoed. Waar liggen de uitdagingen en kansen?
 
Waarderen van archieven
Waarderen van archievenWaarderen van archieven
Waarderen van archieven
 
Okapi2-Vlaanderen een hulp richting data driven management
Okapi2-Vlaanderen een hulp richting data driven managementOkapi2-Vlaanderen een hulp richting data driven management
Okapi2-Vlaanderen een hulp richting data driven management
 
Van experiment naar structurele oplossing: gezichtsherkenning in functie van ...
Van experiment naar structurele oplossing: gezichtsherkenning in functie van ...Van experiment naar structurele oplossing: gezichtsherkenning in functie van ...
Van experiment naar structurele oplossing: gezichtsherkenning in functie van ...
 
Het gebruik van AI bij het catalogiseren van boeken in KBR
Het gebruik van AI bij het catalogiseren van boeken in KBRHet gebruik van AI bij het catalogiseren van boeken in KBR
Het gebruik van AI bij het catalogiseren van boeken in KBR
 
Data-interoperabiliteit in de praktijk
Data-interoperabiliteit in de praktijkData-interoperabiliteit in de praktijk
Data-interoperabiliteit in de praktijk
 
Droomhuis of luchtkasteel: De verbouwing van de Nederlandse informatiehuishou...
Droomhuis of luchtkasteel: De verbouwing van de Nederlandse informatiehuishou...Droomhuis of luchtkasteel: De verbouwing van de Nederlandse informatiehuishou...
Droomhuis of luchtkasteel: De verbouwing van de Nederlandse informatiehuishou...
 
Participative Registration of Intangible Cultural Heritage on immaterieelerfg...
Participative Registration of Intangible Cultural Heritage on immaterieelerfg...Participative Registration of Intangible Cultural Heritage on immaterieelerfg...
Participative Registration of Intangible Cultural Heritage on immaterieelerfg...
 
Een MaakBib voor iedereen in elke bib
Een MaakBib voor iedereen in elke bibEen MaakBib voor iedereen in elke bib
Een MaakBib voor iedereen in elke bib
 
De bib als derde plek? Ja, selvølgelig
De bib als derde plek? Ja, selvølgeligDe bib als derde plek? Ja, selvølgelig
De bib als derde plek? Ja, selvølgelig
 
ZB Bibliotheek van Zeeland maakt het verschil
ZB Bibliotheek van Zeeland maakt het verschilZB Bibliotheek van Zeeland maakt het verschil
ZB Bibliotheek van Zeeland maakt het verschil
 
Hybriditeit als uitgangspunt: de vernieuwde leeszaal van het ModeMuseum Antwe...
Hybriditeit als uitgangspunt: de vernieuwde leeszaal van het ModeMuseum Antwe...Hybriditeit als uitgangspunt: de vernieuwde leeszaal van het ModeMuseum Antwe...
Hybriditeit als uitgangspunt: de vernieuwde leeszaal van het ModeMuseum Antwe...
 
De bib is mens- en buurtversterkend
De bib is mens- en buurtversterkendDe bib is mens- en buurtversterkend
De bib is mens- en buurtversterkend
 

Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

  • 1. Dimitri Brosens & Bart Goossens Informatie & Datacentrum INBO OMGAAN MET ONDERZOEKSDATA: INBO
  • 2. 2 Beheer van onderzoeksinformatie: PURE PURE is een CRIS systeem Persoonlijk overzicht Onderzoeksoutput (publicaties, presentaties, ….) Dienstverlening Projecten Activiteiten Adviseringsdocumenten Personeel en expertise Datasets
  • 4. 4 Beheer van onderzoeksinformatie: PURE Grafiek van relaties
  • 5. 5 Beheer van ruwe data: Welke data INBO onderzoeksdata Observaties Human observation & Machine observation Remote sensing Vegetatieopnames INBOveg
  • 6. 6 Beheer van ruwe data: Welke data INBO onderzoeksdata Verzameld materiaal Roadkill & Afvangsten & Bevissing Analyse data (DNA sequenties…) –e-DNA –Haarstalen –Swabstalen – Faeces –Bodemstalen - Waterstalen
  • 7. 7 INBO Referentiedata Checklists Referentielijsten naar voorkomen species in een bepaald geografisch gebied Rode lijsten Rode lijst van de Zoogdieren Referentielijsten naar status en voorkomen in een bepaald geografisch gebied Geografische GIS data GIS (Kaartlagen) “Taxonomische lijsten” Catalogue of LIFE … Beheer van ruwe data: Welke data
  • 8. 8 Beheer onderzoeksdata Observaties Human observation  NBN datamodel (Recorder6)  SQL databank (Microsoft SQL server)  Werkblad & Access (  ) Machine observation   Lifewatch applicaties   SQL databank   DATA warehouse Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer
  • 9. 9 Vegetatieopnames INBOveg Webapplicatie met achterliggende databank https://data.inbo.be/inboveg/ViewHome.form Verzameld materiaal Roadkill & Afvangsten & Bevissing -> SQL databank (Microsoft server) Werkblad & Access () Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer
  • 10. 10 Labo data (Analyse, laboresultaten…) –e-DNA –Haarstalen –Swabstalen – Faeces –Bodemstalen - Waterstalen  Laboratory information management system (LIMS) Beheer van ruwe data: Centraal data beheer
  • 11. 11 Beheer referentiedata Checklists Rode lijsten Taxonomische lijsten  INBO NAMESERVER (SQL server) Geografische GIS data  GIS data server (GIS team) Beheer van ruwe data: Centraal data beheer
  • 12. SD 5: Het INBO beheert gegevens en maakt ze toegankelijk. Het INBO fungeert als draaischijf voor het gegevensbeheer. Daarbij zoekt het INBO naar geschikte manieren om aan gegevensverzameling te doen en om gegevens te ontsluiten en toegankelijk te maken. 12 Beheer van ruwe data: Data Publiceren
  • 13. 13 Data Publiceren Onderzoeksinformatie  Pure Portal (webservices) Biodiversiteitsdata • Primary Occurrence data & Checklists • Standaardiseren • Darwin Core • Metadata optimaliseren • EML • Publiceren • IPT (integrated publishing toolkit) • Darwin Core Archives
  • 14. 14 Data Publiceren Andere manieren • Dryad Data Digital Repository • Flexibel ivm het data formaat • Past in de “manuscript indienen“workflow • Gegevens particulier beschikbaar tijdens de peer review • Toestaan van beperkte embargo tijd • Gegevens zijn gekoppeld van en naar gespecialiseerde data repositories (vb. GBIF of GenBank ) . • Wijst Digital Object Identifiers ( DOI ) aan gegevens • Bevordert de zichtbaarheid van gegevens • Data gepubliceerd onder CC0, geen wettelijke belemmering om data te hergebruiken • Inhoud wordt actief beheerd . • Datafiles kunnen bijgewerkt worden indien nodig • Bewaring van de data op lange termijn ... • Webservices • Pure webservices • GBIF webservices • In volle ontwikkeling
  • 15. 15 Data Publiceren Data policy Voorgestelde richtlijnen 1 Alle data verzameld in opdracht van het (EV) INBO kunnen in principe ontsloten worden, met toepassing van de uitzonderingsgronden zoals bepaald in het decreet betreffende openbaarheid van bestuur (2004-03-26, Artikel 15). 2 Data die geassocieerd zijn met een wetenschappelijk artikel worden ontsloten bij publicatie. 3 Ruwe data worden ontsloten indien technisch haalbaar. Onderzoekers kunnen gebruik maken van een embargo tot 18 maanden na het verzamelen. Sommige projecten kunnen een versnelde (= geen embargo) of verplichte data- ontsluiting vereisen. 4 Data worden steeds ontsloten als open data, zoals gedefinieerd door de Open Knowledge Foundation.
  • 16. INBO als data Publisher INBO is data publisher in het GBIF netwerk Publiceren via ITP van Darwin Core Archives Ondersteuning door het Belgisch Biodiversiteitsplatform (GBIF node) • Belgische GBIF Data Publishers 16