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Laboratoire de Biotechnologie  et Amélioration des Plantes Variabilité génétique et identification des QTLs  liés à la qualité des semences chez le tournesol  ( Helianthus annuus  L.) Ghias RACHID ALCHAARANI Directeur de thèse : Ahmad SARRAFI
Qualité de semences Résistances  aux maladies Caractères  agronomiques Germination et développement  des plantules Teneur des  graines en huile
Objectifs Etude génétique et identification des QTLs pour : 3-  des paramètres de germination et de développement des plantules 1-  la résistance aux maladies (mildiou et phoma)  2-  des caractères agronomiques
Matériels et méthodes ,[object Object],[object Object],PAC2 :  INRA { H. petiolaris  restorer x lignée d’USDA (HA61)} RHA266  : USDA { H. annuus  sauvage x Peredovik}
Résistance aux maladies  (mildiou et phoma) ,[object Object],2-  Résistance au phoma ( Phoma macdonaldii ) : ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Plante attaquée par le mildiou
Contamination artificielle (conditions contrôlées) Echelle de notation
Gain génétique pour  la résistance au mildiou Gain génétique pour  la résistance au phoma Héritabilité = 81.32% (au sens étroit)  Héritabilité = 58.23% (au sens étroit)  * ns ns * % des plantes malades  ns ns * * Echelle de sensibilité
Combinaison  d’amorces Nombre de  marqueurs Combinaison  d’amorces Nombre de  marqueurs E32M49 E40M62 E41M62 E38M50 E33M48 E40M47 E35M60 E37M47 E40M50 E35M48 E36M59 E38M48 E32M61 E35M61 27 22 22 21 20 20 18 17 16 15 15 14 12 12 E38M60 E35M62 E40M59 E41M48 E41M50 E41M59 E32M47 E33M60 E35M49 E33M50 E33M62 E37M49 E37M61 12 11 11 11 11 11 9 8 7 6 6 6 1 Combinaison des amorces AFLP et  nombre de marqueurs
Combinaison  d’amorces Nombre de  marqueurs Combinaison  d’amorces Nombre de  marqueurs ORS5 ORS8 ORS31 ORS53 ORS78 IUB6 SSL3 SSL20 SSL22 SSL27 SSL29 SSL30 SSL33 SSL49 SSL66 1 1 3 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 SSU6 SSU11 SSU21 SSU25 SSU39 SSU41 SSU100 SSU123 SSU129 SSU139 SSU195 SSU217 SSU223 SSU227 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 Combinaison des amorces SSR
Groupe de  liaison Nombre de  marqueurs Longueur (cM) Distance  Moyenne (cM) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 21 16 16 16 16 17 20 24 52 28 25 6 165.9 105.1 132.0 114.2 181.8 132.3 161.2 210.1 329.9 190.3 242.8 49.6 7.9 6.6 8.3 7.1 11.4 7.8 8.1 8.8 6.3 6.8 9.7 8.3 Distribution des marqueurs dans  la carte génétique
Groupe de  liaison Nombre de  marqueurs Longueur (cM) Distance  Moyenne (cM) 13 14 15 16 17 18 19 20 21  non liés Totale 20 14 27 7 19 7 7 5 4 42 409 176.3 143.2 269.6  36.7 154.5 35.1 38.3 20.9 26.1 - 2915.9 8.8 10.2 10.0 5.2 8.1 5.0 5.5 4.2 6.5 - 7.9 Distribution des marqueurs dans  la carte génétique
E35M60_6 0,0 E40M59_13 11,0 E40M47_10 40,3 E32M49_3 55,2 E38M50_18 59,8 E33M62_6 65,8 E38M60_9 72,5 E40M50_2 80,5 E41M48_11 84,3 E41M50_13 86,2 E33M48_8 89,8 E32M49_1 91,5 E40M50_10 95,4 E37M47_25 110,1 E37M61_5 130,5 SSU129_2 134,9 SSU129_1 140,2 E35M62_13 145,6 SSU123_2 151,7 E33M48_15 154,5 E40M59_11 165,9 RIL-group 1 E33M50_2 0,0 E38M50_2 8,7 E32M49_11 13,8 E35M48_1 19,5 E38M60_8 22,3 E41M62_29 26,6 E33M60_7 30,1 E33M48_1 35,0 E36M59_14 36,1 E35M60_10 38,4 E40M62_21 43,0 E40M62_1 49,0 E35M60_22 61,8 E35M49_9 71,0 E38M50_1 87,1 E38M60_7 114,3 RIL-group 4 E40M62_18 0,0 E33M50_6 12,8 E35M48_3 22,1 ORS5 28,8 E41M50_6 31,3 E32M49_2 34,4 E35M60_21 38,8 E32M49_5 47,5 E35M48_10 60,9 E41M50_11 68,9 SSL27 73,4 E41M62_4 78,6 E38M50_15 84,8 E36M59_9 90,9 E38M50_17 104,2 E38M50_24 105,3 RIL-group 2 E32M49_8 0,0 ORS53 4,9 E32M61_10 16,2 E33M62_11 21,8 E33M60_3 26,7 E35M60_11 31,3 E40M62_4 40,1 E40M50_15 49,6 E33M48_16 54,2 E33M48_2 56,9 E37M47_15 62,3 E38M48_3 67,6 E40M50_18 78,7 E40M62_19 93,4 E35M61_3 104,9 E32M47_10 132,0 RIL-group 3 E33M48_26 0,0 E35M48_17 17,5 SSL66_1 31,3 E32M49_24 44,7 E32M49_19 51,9 E32M49_33 56,5 E41M62_11 68,3 E40M50_5 105,0 E40M59_3 119,0 E40M59_9 123,5 E32M49_21 126,4 E41M48_2 132,2 E35M49_5 138,2 E33M60_1 146,8 E32M47_14 161,2 E38M60_13 181,7 RIL-group 5 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 E41M62_6 0,0 E38M50_9 16,2 E33M60_8 22,6 E37M47_8 31,5 E35M49_4 36,2 E35M62_12 41,1 E40M59_7 44,8 E40M59_12 47,2 E41M62_12 67,5 E38M60_3 82,5 E38M50_16 87,9 E40M50_13 94,2 E40M59_6 100,0 E40M59_5 108,1 E35M62_1 114,9 E32M49_28 123,9 E41M62_24 130,3 E41M59_3 139,8 E40M62_11 154,3 E40M62_10 161,2 RIL-group 7 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8
RIL-group 13 RIL-group 14 RIL-group 15 Carte  génétique  d’AFLP  et  de  SSR  de  tournesol  basée  sur  une  population de 123 lignées recombinantes E32M47_2 0,0 E40M62_7 20,5 E37M61_2 30,1 E37M61_7 39,1 E35M62_11 46,7 SSL30 50,0 E33M48_5 53,4 E38M48_10 58,5 E38M48_9 62,3 E38M48_8 72,6 E33M48_18 81,0 E36M59_13 87,6 E37M47_19 93,4 E41M48_7 97,0 E41M48_9 110,5 E38M48_12 126,0 E41M48_8 141,2 E33M48_14 144,9 E37M47_3 154,3 RIL-group 17 E32M47_8 0,0 E37M47_18 8,3 E38M48_5 11,3 E32M61_6 18,0 E33M60_5 24,3 E32M49_20 30,5 E35M48_14 35,8 E38M50_14 38,5 E38M50_13 39,5 E41M59_5 40,5 E32M49_7 42,4 E33M62_8 45,0 E36M59_17 49,3 E41M62_2 55,1 E40M62_22 66,0 E40M62_23 71,8 E37M49_7 79,4 E37M61_11 84,4 E33M48_9 96,0 E40M50_19 107,6 E40M47_11 124,2 E40M47_7 130,6 E40M47_13 143,3 E38M60_4 161,3 E38M60_6 181,1 SSL29 182,4 SSL13 185,7 E38M60_5 190,2 RIL-group 10 E40M47_2 0,0 E35M61_8 32,3 E38M50_22 52,3 E38M50_8 57,8 E33M48_24 61,7 SSU227 66,7 SSU123_1 67,8 SSL20_1 70,3 E37M61_4 74,2 E41M50_9 81,7 E32M61_13 91,8 SSL33 97,9 E40M62_12 105,6 E36M59_3 117,5 E35M61_10 123,3 E37M47_24 130,7 SSU6_1 136,8 E33M62_9 147,9 E41M48_12 156,9 E37M61_3 164,2 E41M62_9 171,9 E36M59_8 183,8 E41M62_26 192,0 E32M49_12 205,4 E40M50_6 242,9 RIL-group 11 E33M48_20 0,0 E40M50_12 10,2 E40M62_25 24,7 E36M59_18 33,6 E41M50_5 40,0 E40M47_21 49,6 RIL-group 12 E40M50_9 0,0 E35M61_2 9,9 E38M50_4 24,0 E38M48_6 28,8 E37M47_16 40,8 E38M50_6 46,6 E40M62_14 60,7 E40M62_13 64,5 E33M48_22 76,7 E37M47_22 85,0 E37M49_6 90,7 E40M59_8 102,5 E32M61_9 114,6 E35M60_16 121,6 SSU62 127,4 SSU100 129,0 SSU41 132,9 E32M49_26 148,0 E40M50_14 153,2 E35M49_7 176,3 E32M47_9 0,0 E35M60_23 16,8 E37M61_9 28,7 E36M59_7 33,7 E41M50_12 36,8 E38M50_3 41,5 E38M60_10 45,6 E41M62_28 50,5 E40M47_23 66,0 E40M47_3 90,4 E41M50_2 103,5 E38M50_26 112,3 E40M62_17 121,2 E32M61_2 143,1 E32M61_14 0,0 E35M48_13 18,0 E38M50_7 27,2 E41M50_10 32,9 E35M62_8 43,5 E38M50_5 49,2 E41M62_21 52,9 E41M48_3 59,5 E40M62_16 66,9 E36M59_12 72,7 E41M62_18 77,0 E41M62_19 82,8 E33M50_4 92,7 E35M48_7 101,8 E38M48_1 119,3 E40M47_20 155,8 E35M62_5 174,2 SSL22_2 184,9 E33M50_3 196,8 E35M48_9 212,2 SSU139 217,7 E38M50_21 228,6 E33M48_3 231,1 E41M62_23 235,7 E41M59_7 252,2 E41M59_8 260,6 ORS31_3 269,5 E32M49_25 0,0 E33M60_6 4,3 E38M48_4 9,4 E37M49_9 15,3 E33M48_6 19,2 E35M48_4 23,8 E33M50_5 36,7 RIL-group 16 E35M60_19 0,0 E38M48_14 3,1 E38M60_12 6,1 E35M48_18 10,2 E36M59_5 16,8 E32M61_16 27,9 E32M61_15 35,1 RIL-group 18 E32M49_27 0,0 ORS8 11,4 E35M60_17 18,9 SSU223 23,1 SSU25 25,2 E35M61_5 33,8 E38M60_2 38,1 RIL-group 19 E35M49_10 0,0 SSU39 4,0 E40M59_10 8,4 E38M48_11 12,3 E35M62_2 20,8 RIL-group 20 E40M62_20 0,0 E36M59_15 6,9 E41M59_4 11,2 E35M48_6 26,0 RIL-group 21
QTLs de la résistance au mildiou QTL Groupe  de liaison Position LOD R² Effet  additif rm- 3 rm -5 rm -13 rm -15 rm -17 III V XIII XV XVII 103.46 44.71 121.70 52.89 18.01 6.98 11.83 8.98 5.67 10.28 -8.38 -10.62 9.95 7.37 11.64 11.40 17.17 14.06 6.80 16.42 PAC-2 RHA-266
QTLs de la résistance au phoma QTL Groupe  de liaison Position LOD R² Effet  additif rph- 1 rph -8 rph -9 rph -13 rph -15 I VIII IX XIII XV 55.25 168.21 163.91 24.05 49.21 6.98 6.14 11.75 6.76 14.20 -0.66 -0.78 0.89 0.66 1.27 10.41 10.15 19.51 9.81 25.57 PAC-2 RHA-266
0 2 4 6 8 10 12 14 0.2 0.4 0.6 0.8 1 1.2 1.4 1.6 1.8 2 LOD Score Position en Morgans Un seul QTL lié à la résistance au mildiou  dans le groupe de liaison 5 rm -5
0 2 4 6 8 10 12 14 0.5 1 1.5 2 2.5 3 LOD Score Position en Morgans rph -15 rm -15 Deux QTLs liés à la résistance au mildiou  et au phoma dans le groupe de liaison 15
2 4 6 8 10 12 14 0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 LOD Score Position en Morgans rph -9 Un seul QTL lié à la résistance au phoma  dans le groupe de liaison 9
Caractères d’intérêt  agronomique Rendement en graines par  plante Poids de mille grains Teneur des graines en huile  Caractères étudiés : Précocité de floraison Diamètre du capitule Longueur de la tige Diamètre de la tige
Précocité de floraison Longueur de la tige Gain génétique pour Diamètre de la tige Diamètre du capitule ns ns ns * Longueur de la tige (cm) * ns ns ns Nombre de Jours ns ns * * Diamètre de la tige (cm) ns ns * * Diamètre du capitule (cm)
Gain génétique pour Rendement en graines par plante Poids de mille grains Teneur des graines en huile * ns ns ns % de l’huile en graines * * ns ns Rendement par plante (g) * * * ns Poids de mille grains (g)
Préc. Flor. Diam. Tige Diam. Cap. Long. Tige Rend. Gr. PMG Long. Tige Diam. Tige Diam. Cap. Rend. Gr. PMG Ten. Huile -0.515 *** -0.065 -0.149 -0.034 0.200 -0.076 0.290 ** 0.474 *** 0.406 *** 0.170 -0.102 0.652 *** 0.429 *** 0.348 ** -0.024 0.632 *** 0.536 *** -0.057 0.545 *** 0.176 -0.226 * Corrélations phénotypiques entre  les caractères agronomiques
Précocité  de floraison Rendement  en graines Poids de  1000-grains Teneur en  huile Caractères pf (3) rgp (4) pmg (3) th (4) Nombre  de QTLs Groupe  de liaison LOD R² 4, 9 et 14 4, 6, 9 et 21 4, 6 et  9 8, 11, 13 et 21 7.5-10.5 5.6-12.3 4.8- 13.5 4.0-8.5 13-20 5-15 7- 37 8-13 QTLs liés aux caractères agronomiques
pmg -4  E33M50_2 0,0 E38M50_2 8,7 E32M49_11 13,8 E35M48_1 19,5 E38M60_8 22,3 E41M62_29 26,6 E33M60_7 30,1 E33M48_1 35,0 E36M59_14 36,1 E35M60_10 38,4 E40M62_21 43,0 E40M62_1 49,0 E35M60_22 61,8 E35M49_9 71,0 E38M50_1 87,1 E38M60_7 114,3 RIL-group 4 pf -4  lt -4-1 lt -4-2 dt -4-2 dt -4-1 dc -4  rgp -4  E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 rgp -6  pmg -6  rgp -9  pmg -9  E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 pf -9  dc -9  dt -8  E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 th -8  E40M47_2 0,0 E35M61_8 32,3 E38M50_22 52,3 E38M50_8 57,8 E33M48_24 61,7 SSU227 66,7 SSU123_1 67,8 SSL20_1 70,3 E37M61_4 74,2 E41M50_9 81,7 E32M61_13 91,8 SSL33 97,9 E40M62_12 105,6 E36M59_3 117,5 E35M61_10 123,3 E37M47_24 130,7 SSU6_1 136,8 E33M62_9 147,9 E41M48_12 156,9 E37M61_3 164,2 E41M62_9 171,9 E36M59_8 183,8 E41M62_26 192,0 E32M49_12 205,4 E40M50_6 242,9 RIL-group 11 lt -11-1 lt -11-2 th -11  E40M50_9 0,0 E35M61_2 9,9 E38M50_4 24,0 E38M48_6 28,8 E37M47_16 40,8 E38M50_6 46,6 E40M62_14 60,7 E40M62_13 64,5 E33M48_22 76,7 E37M47_22 85,0 E37M49_6 90,7 E40M59_8 102,5 E32M61_9 114,6 E35M60_16 121,6 SSU62 127,4 SSU100 129,0 SSU41 132,9 E32M49_26 148,0 E40M50_14 153,2 E35M49_7 176,3 RIL-group 13 th -13  rgp -9   pmg -9   E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 pf -9   dc -9
Localisation des QTLs liés aux caractères agronomiques étudiés sur la carte génétique établie.   E32M61_14 0,0 E35M48_13 18,0 E38M50_7 27,2 E41M50_10 32,9 E35M62_8 43,5 E38M50_5 49,2 E41M62_21 52,9 E41M48_3 59,5 E40M62_16 66,9 E36M59_12 72,7 E41M62_18 77,0 E41M62_19 82,8 E33M50_4 92,7 E35M48_7 101,8 E38M48_1 119,3 E40M47_20 155,8 E35M62_5 174,2 SSL22_2 184,9 E33M50_3 196,8 E35M48_9 212,2 SSU139 217,7 E38M50_21 228,6 E33M48_3 231,1 E41M62_23 235,7 E41M59_7 252,2 E41M59_8 260,6 ORS31_3 269,5 RIL-group 15 lt -15  dt -15  E35M60_19 0,0 E38M48_14 3,1 E38M60_12 6,1 E35M48_18 10,2 E36M59_5 16,8 E32M61_16 27,9 E32M61_15 35,1 RIL-group 18 dc -18 E32M49_27 0,0 ORS8 11,4 E35M60_17 18,9 SSU223 23,1 SSU25 25,2 E35M61_5 33,8 E38M60_2 38,1 RIL-group 19 dc -19  th -21  E40M62_20 0,0 E36M59_15 6,9 E41M59_4 11,2 E35M48_6 26,0 RIL-group 21 rgp -21  E32M47_9 0,0 E35M60_23 16,8 E37M61_9 28,7 E36M59_7 33,7 E41M50_12 36,8 E38M50_3 41,5 E38M60_10 45,6 E41M62_28 50,5 E40M47_23 66,0 E40M47_3 90,4 E41M50_2 103,5 E38M50_26 112,3 E40M62_17 121,2 E32M61_2 143,1 RIL-group 14 pf -14 dt -14
Mesure de la vitesse et du  pourcentage de germination Mesure des différents paramètres Paramètres de germination  et de développement des plantules
Paramètres de germination  et de développement des plantules Longueur de l’hypocotyle (cm) Poids frais et sec de la partie aérienne (g) Poids frais et sec de la racine (g) Longueur de la racine (cm)
Pourcentage de plantules normales
RHA-266 PAC-2 Distribution des LIRs pour LR   9 8 7 6 5 4 3 2 1 5 1 0 5 0 L o n g u e u r d e l a r a c i n e ( c m ) N o m b r e d e L I R s
T50PG PPN PGG C153 C56 C38 LR11 C142 LR64 LR45 LR18 C114 RHA266 C104 C124 PAC2 LR52 C100 LR35 Pourcentage de germination Vitesse de germination Analyses en composantes principales
VG PGG LH LR PFA PFR PPN Nombre  de QTLs Groupe  de liaison LOD R² 2 4 5 4 3 8 6 Paramètres 4.1-4.3 4.4-7.4 4.6-10.8 3.9-4.6 7.6-14.5 3.9-9.4 5.0-8.8 1 et 8 3, 6 et 9 5, 8, 9, 11 et 15 8, 18 et 21 9 et 12 6, 7, 9, 12 et 15 6, 8, 9 et 12 13-18 8-16 6-20 8-13 23-33 7-19 8-16 QTLs liés aux paramètres de germination  et de développement des plantules
E35M60_6 0,0 E40M59_13 11,0 E40M47_10 40,3 E32M49_3 55,2 E38M50_18 59,8 E33M62_6 65,8 E38M60_9 72,5 E40M50_2 80,5 E41M48_11 84,3 E41M50_13 86,2 E33M48_8 89,8 E32M49_1 91,5 E40M50_10 95,4 E37M47_25 110,1 E37M61_5 130,5 SSU129_2 134,9 SSU129_1 140,2 E35M62_13 145,6 SSU123_2 151,7 E33M48_15 154,5 E40M59_11 165,9 RIL-group 1 vg -1  E33M48_26 0,0 E35M48_17 17,5 SSL66_1 31,3 E32M49_24 44,7 E32M49_19 51,9 E32M49_33 56,5 E41M62_11 68,3 E40M50_5 105,0 E40M59_3 119,0 E40M59_9 123,5 E32M49_21 126,4 E41M48_2 132,2 E35M49_5 138,2 E33M60_1 146,8 E32M47_14 161,2 E38M60_13 181,7 RIL-group 5 lh -5   E41M62_6 0,0 E38M50_9 16,2 E33M60_8 22,6 E37M47_8 31,5 E35M49_4 36,2 E35M62_12 41,1 E40M59_7 44,8 E40M59_12 47,2 E41M62_12 67,5 E38M60_3 82,5 E38M50_16 87,9 E40M50_13 94,2 E40M59_6 100,0 E40M59_5 108,1 E35M62_1 114,9 E32M49_28 123,9 E41M62_24 130,3 E41M59_3 139,8 E40M62_11 154,3 E40M62_10 161,2 RIL-group 7 pfr -7  E32M49_8 0,0 ORS53 4,9 E32M61_10 16,2 E33M62_11 21,8 E33M60_3 26,7 E35M60_11 31,3 E40M62_4 40,1 E40M50_15 49,6 E33M48_16 54,2 E33M48_2 56,9 E37M47_15 62,3 E38M48_3 67,6 E40M50_18 78,7 E40M62_19 93,4 E35M61_3 104,9 E32M47_10 132,0 RIL-group 3 psa -3-1 psa -3-2 pgg -3  E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 pfr -6-1 pfr -6-2 psr -6  pgg -6-1 pgg -6-2 ppn -6 E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 lh -9  pfa -9-1 pfa -9-2 pfr -9-1 pfr -9-2 pfr -9-3 psr -9  pgg -9-1 ppn -9-1 ppn -9-2 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 vg -8  lh -8  lr -8  ppn -8-1 ppn -8-2 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 pfr -6-1 pfr -6-2 psr -6   pgg -6-1 pgg -6-2 ppn -6
Localisation  des  QTLs  liés  aux  paramètres  de  germination  et de développement des plantules étudiés sur la carte génétique établie.   E40M47_2 0,0 E35M61_8 32,3 E38M50_22 52,3 E38M50_8 57,8 E33M48_24 61,7 SSU227 66,7 SSU123_1 67,8 SSL20_1 70,3 E37M61_4 74,2 E41M50_9 81,7 E32M61_13 91,8 SSL33 97,9 E40M62_12 105,6 E36M59_3 117,5 E35M61_10 123,3 E37M47_24 130,7 SSU6_1 136,8 E33M62_9 147,9 E41M48_12 156,9 E37M61_3 164,2 E41M62_9 171,9 E36M59_8 183,8 E41M62_26 192,0 E32M49_12 205,4 E40M50_6 242,9 RIL-group 11 lh -11   E35M60_19 0,0 E38M48_14 3,1 E38M60_12 6,1 E35M48_18 10,2 E36M59_5 16,8 E32M61_16 27,9 E32M61_15 35,1 RIL-group 18 lr -18   E32M47_9 0,0 E35M60_23 16,8 E37M61_9 28,7 E36M59_7 33,7 E41M50_12 36,8 E38M50_3 41,5 E38M60_10 45,6 E41M62_28 50,5 E40M47_23 66,0 E40M47_3 90,4 E41M50_2 103,5 E38M50_26 112,3 E40M62_17 121,2 E32M61_2 143,1 RIL-group 14 pfr -14   E40M62_20 0,0 E36M59_15 6,9 E41M59_4 11,2 E35M48_6 26,0 RIL-group 21 lr -21-2 lr -21-1 E32M61_14 0,0 E35M48_13 18,0 E38M50_7 27,2 E41M50_10 32,9 E35M62_8 43,5 E38M50_5 49,2 E41M62_21 52,9 E41M48_3 59,5 E40M62_16 66,9 E36M59_12 72,7 E41M62_18 77,0 E41M62_19 82,8 E33M50_4 92,7 E35M48_7 101,8 E38M48_1 119,3 E40M47_20 155,8 E35M62_5 174,2 SSL22_2 184,9 E33M50_3 196,8 E35M48_9 212,2 SSU139 217,7 E38M50_21 228,6 E33M48_3 231,1 E41M62_23 235,7 E41M59_7 252,2 E41M59_8 260,6 ORS31_3 269,5 RIL-group 15 lh -15   psa -15   psr -15  E33M48_20 0,0 E40M50_12 10,2 E40M62_25 24,7 E36M59_18 33,6 E41M50_5 40,0 E40M47_21 49,6 RIL-group 12 pfa -12   pfr -12   psa -12   ppn -12
Synthèse de résultats 1-  Différence  significative  entre  les deux  parents pour la résistance  partielle au mildiou. 2-  Gain génétique chez 10%  de lignées recombinantes sélectionnées  pour les deux maladies. 3-  Héritabilité importante pour la résistance au mildiou et au phoma  (0.81 et 0.58 respectivement). 4-  Cinq  QTLs  détectés  pour la résistance  au  mildiou (6.8% < R² <  17.2%)  et  six  QTLs  pour  la  résistance  au  phoma (9.8% < R² <  25.6%).  a- Résistance aux maladies
1-   Différence significative entre les deux parents pour la précocité de floraison,  le  rendement  en  graines  par  plante,  le poids de mille  grains et la teneur des graines en huile. 2-   Gain génétique chez la meilleure lignée recombinante pour tous les caractères  exceptées  la  précocité  de  floraison  et  la  teneur  des  graines en huile. 3-   Identification  de  28  QTLs  pour  l’ensemble  des  caractères  agronomiques  étudiés  (5% < R² < 37%), appartenant  parfois  au  même groupe de liaison.  4-   Des   corrélations significatives entre les caractères.   b- Caractères agronomiques
2-   Détection de 39 QTLs impliqués aux paramètres étudiés (6% < R²  < 33%). 3-   Des QTLs   appartenant parfois au même groupe de liaison.  4-   Des corrélations significatives entre les paramètres étudiés.   c- Paramètres de germination et de développement  des plantules 1-  Distribution  normale  pour  les  84  LIRs  utilisées  et  leurs  deux  parents pour l’ensemble des paramètres étudiés.
RHA-266 PAC-2 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 pfr -6-1 pfr -6-2 psr -6   pgg -6-1 pgg -6-2 ppn -6 rgp -6   pmg -6   E35M60_6 0,0 E40M59_13 11,0 E40M47_10 40,3 E32M49_3 55,2 E38M50_18 59,8 E33M62_6 65,8 E38M60_9 72,5 E40M50_2 80,5 E41M48_11 84,3 E41M50_13 86,2 E33M48_8 89,8 E32M49_1 91,5 E40M50_10 95,4 E37M47_25 110,1 E37M61_5 130,5 SSU129_2 134,9 SSU129_1 140,2 E35M62_13 145,6 SSU123_2 151,7 E33M48_15 154,5 E40M59_11 165,9 RIL-group 1 vg -1  rph -1-1   rph -1-2   E41M62_6 0,0 E38M50_9 16,2 E33M60_8 22,6 E37M47_8 31,5 E35M49_4 36,2 E35M62_12 41,1 E40M59_7 44,8 E40M59_12 47,2 E41M62_12 67,5 E38M60_3 82,5 E38M50_16 87,9 E40M50_13 94,2 E40M59_6 100,0 E40M59_5 108,1 E35M62_1 114,9 E32M49_28 123,9 E41M62_24 130,3 E41M59_3 139,8 E40M62_11 154,3 E40M62_10 161,2 RIL-group 7 pfr -7   rph -7 E32M49_8 0,0 ORS53 4,9 E32M61_10 16,2 E33M62_11 21,8 E33M60_3 26,7 E35M60_11 31,3 E40M62_4 40,1 E40M50_15 49,6 E33M48_16 54,2 E33M48_2 56,9 E37M47_15 62,3 E38M48_3 67,6 E40M50_18 78,7 E40M62_19 93,4 E35M61_3 104,9 E32M47_10 132,0 RIL-group 3 psa -3-1  psa -3-2 pgg -3  rph -3  rm -3  E33M50_2 0,0 E38M50_2 8,7 E32M49_11 13,8 E35M48_1 19,5 E38M60_8 22,3 E41M62_29 26,6 E33M60_7 30,1 E33M48_1 35,0 E36M59_14 36,1 E35M60_10 38,4 E40M62_21 43,0 E40M62_1 49,0 E35M60_22 61,8 E35M49_9 71,0 E38M50_1 87,1 E38M60_7 114,3 RIL-group 4 pf -4 lt -4-1 lt -4-2 dt -4-2 dt -4-1  dc -4 rgp -4 pmg -4 rph -4  E33M48_26 0,0 E35M48_17 17,5 SSL66_1 31,3 E32M49_24 44,7 E32M49_19 51,9 E32M49_33 56,5 E41M62_11 68,3 E40M50_5 105,0 E40M59_3 119,0 E40M59_9 123,5 E32M49_21 126,4 E41M48_2 132,2 E35M49_5 138,2 E33M60_1 146,8 E32M47_14 161,2 E38M60_13 181,7 RIL-group 5 lh -5   rm -5
RHA-266 PAC-2 E33M48_20 0,0 E40M50_12 10,2 E40M62_25 24,7 E36M59_18 33,6 E41M50_5 40,0 E40M47_21 49,6 RIL-group 12 pfa -12   pfr -12   psa -12   ppn -12   E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 vg -8 lh -8   lr -8   ppn -8-1 ppn -8-2   dt -8 th -8 rph -8-3   rph -8-1   rph -8-2   rm -8-2   rm -8-1 E40M50_9 0,0 E35M61_2 9,9 E38M50_4 24,0 E38M48_6 28,8 E37M47_16 40,8 E38M50_6 46,6 E40M62_14 60,7 E40M62_13 64,5 E33M48_22 76,7 E37M47_22 85,0 E37M49_6 90,7 E40M59_8 102,5 E32M61_9 114,6 E35M60_16 121,6 SSU62 127,4 SSU100 129,0 SSU41 132,9 E32M49_26 148,0 E40M50_14 153,2 E35M49_7 176,3 RIL-group 13 th -13  rph -13 rm -13  E40M47_2 0,0 E35M61_8 32,3 E38M50_22 52,3 E38M50_8 57,8 E33M48_24 61,7 SSU227 66,7 SSU123_1 67,8 SSL20_1 70,3 E37M61_4 74,2 E41M50_9 81,7 E32M61_13 91,8 SSL33 97,9 E40M62_12 105,6 E36M59_3 117,5 E35M61_10 123,3 E37M47_24 130,7 SSU6_1 136,8 E33M62_9 147,9 E41M48_12 156,9 E37M61_3 164,2 E41M62_9 171,9 E36M59_8 183,8 E41M62_26 192,0 E32M49_12 205,4 E40M50_6 242,9 RIL-group 11 lt -11-1 lt -11-2 th -11 lh -11   E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 lh -9  pfa -9-1 pfa -9-2 pfr -9-1 pfr -9-2 pfr -9-3  psr -9  pgg -9 ppn -9-1 ppn -9-2  rph -9  rgp -9 pmg -9 pf -9  dc -9
Localisation  des  QTLs  liés  à l'ensemble des caractères étudiés  sur la carte génétique établie.   RHA-266 PAC-2 E35M60_19 0,0 E38M48_14 3,1 E38M60_12 6,1 E35M48_18 10,2 E36M59_5 16,8 E32M61_16 27,9 E32M61_15 35,1 RIL-group 18 lr -18   dc -18   E32M49_27 0,0 ORS8 11,4 E35M60_17 18,9 SSU223 23,1 SSU25 25,2 E35M61_5 33,8 E38M60_2 38,1 RIL-group 19 dc -19 lr -21-2 lr -21-1 th -21  E40M62_20 0,0 E36M59_15 6,9 E41M59_4 11,2 E35M48_6 26,0 RIL-group 21 rgp -21 E32M61_14 0,0 E35M48_13 18,0 E38M50_7 27,2 E41M50_10 32,9 E35M62_8 43,5 E38M50_5 49,2 E41M62_21 52,9 E41M48_3 59,5 E40M62_16 66,9 E36M59_12 72,7 E41M62_18 77,0 E41M62_19 82,8 E33M50_4 92,7 E35M48_7 101,8 E38M48_1 119,3 E40M47_20 155,8 E35M62_5 174,2 SSL22_2 184,9 E33M50_3 196,8 E35M48_9 212,2 SSU139 217,7 E38M50_21 228,6 E33M48_3 231,1 E41M62_23 235,7 E41M59_7 252,2 E41M59_8 260,6 ORS31_3 269,5 RIL-group 15 lh -15   psa -15   psr -15  lt -15 dt -15 rph -15 rm -15  E32M47_2 0,0 E40M62_7 20,5 E37M61_2 30,1 E37M61_7 39,1 E35M62_11 46,7 SSL30 50,0 E33M48_5 53,4 E38M48_10 58,5 E38M48_9 62,3 E38M48_8 72,6 E33M48_18 81,0 E36M59_13 87,6 E37M47_19 93,4 E41M48_7 97,0 E41M48_9 110,5 E38M48_12 126,0 E41M48_8 141,2 E33M48_14 144,9 E37M47_3 154,3 RIL-group 17 rm -17-1 rm -17-2 rm -17-3 E32M47_9 0,0 E35M60_23 16,8 E37M61_9 28,7 E36M59_7 33,7 E41M50_12 36,8 E38M50_3 41,5 E38M60_10 45,6 E41M62_28 50,5 E40M47_23 66,0 E40M47_3 90,4 E41M50_2 103,5 E38M50_26 112,3 E40M62_17 121,2 E32M61_2 143,1 RIL-group 14 pf -14   dc -14   pfr -14
LIR C81 C91 C138 LR64 LR67 - - + + + - + + - - + + + - - + + - + + Phénotypes et génotypes des LIRs  rph -15 rm -15 psr -15 dt -15 lh -15 P P R R R Allèle
Groupe 15 RHA266 PAC2 C138 LR64 et LR67 C81 et C91 Indéfini
LIR C37 C54 C91 C84 C142 LR19 - - - + + + - - - + + + - + + + + - + + Phénotypes et génotypes des LIRs  rgp -9 pmg -9 pf -9 lh -9 P P P R R R Allèle
RHA266 PAC2 Groupe 9 C37 C54 et C91 C84 C142 et LR19 Indéfini
Ten. Hui. th -8 LIR E41592 SSL20_2 th -11 SSL20_1 SSU100 th -13 SSU41 th -21 E406220 C37 C120 C84 LR46 C115 C101 29.84 33.18 33.58 34.67 45.42 45.66 R R R R P P R R R R P P P P P P R R P P P P - R P P P P R R P P - P - - Phénotypes et génotypes des LIRs  riches et pauvres en huile PAC2:   37.73 RHA266:   44.38
LIRs pauvres en huile LIRs riches en huile LIRs pauvres en huile LIRs riches en huile Groupe 11 Groupe 8 RHA266 PAC2 Indéfini
LIRs pauvres en huile LIRs riches en huile LIRs pauvres en huile LIRs riches en huile Groupe 21 Groupe 13 RHA266 PAC2 Indéfini
E40M62_18 0,0 E33M50_6 12,8 E35M48_3 22,1 ORS5 28,8 E41M50_6 31,3 E32M49_2 34,4 E35M60_21 38,8 E32M49_5 47,5 E35M48_10 60,9 E41M50_11 68,9 SSL27 73,4 E41M62_4 78,6 E38M50_15 84,8 E36M59_9 90,9 E38M50_17 104,2 E38M50_24 105,3 RIL-group 2 ORS5  61.5
16 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 ORS31  16.1  ORS 310   ORS 126  13.2   CRT22-16   ORS1017   13.8
10 E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 ORS78  59.9 ORS591  ORS78 240,7
15 E32M49_27 0,0 ORS8 11,4 E35M60_17 18,9 SSU223 23,1 SSU25 25,2 E35M61_5 33,8 E38M60_2 38,1 RIL-group 19 ORS7   8.8 ORS8
Conclusions 2-  Identification  de  QTLs  contrôlant  différents  caractères  et  liés  positivement aux même marqueurs.  3-  Détections de liaisons défavorables entre différents caractères. 4-  Existence  de  cinq  marqueurs  SSRs  communs  avec  les cartes  présentées par (Tang  et al ., 2002) et (Yu  et al ., 2003). 1-  Détection de  10 QTLs  liés à différents marqueurs SSRs
Perspectives 1-  Etablissement  d’une  carte  génétique  dense  par l’intégration des  résultats de cartographie de différentes populations.  2-  Recherche  de QTLs  sur cette carte et réalisation  des croisements  entre LIRs. 3-  Sélection  assistée  par  marqueurs  pour  des caractères  ayant des  QTLs liés aux marqueurs SSRs.
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  • 1. Laboratoire de Biotechnologie et Amélioration des Plantes Variabilité génétique et identification des QTLs liés à la qualité des semences chez le tournesol ( Helianthus annuus L.) Ghias RACHID ALCHAARANI Directeur de thèse : Ahmad SARRAFI
  • 2. Qualité de semences Résistances aux maladies Caractères agronomiques Germination et développement des plantules Teneur des graines en huile
  • 3. Objectifs Etude génétique et identification des QTLs pour : 3- des paramètres de germination et de développement des plantules 1- la résistance aux maladies (mildiou et phoma) 2- des caractères agronomiques
  • 4.
  • 5.
  • 6. Plante attaquée par le mildiou
  • 7. Contamination artificielle (conditions contrôlées) Echelle de notation
  • 8. Gain génétique pour la résistance au mildiou Gain génétique pour la résistance au phoma Héritabilité = 81.32% (au sens étroit) Héritabilité = 58.23% (au sens étroit) * ns ns * % des plantes malades ns ns * * Echelle de sensibilité
  • 9. Combinaison d’amorces Nombre de marqueurs Combinaison d’amorces Nombre de marqueurs E32M49 E40M62 E41M62 E38M50 E33M48 E40M47 E35M60 E37M47 E40M50 E35M48 E36M59 E38M48 E32M61 E35M61 27 22 22 21 20 20 18 17 16 15 15 14 12 12 E38M60 E35M62 E40M59 E41M48 E41M50 E41M59 E32M47 E33M60 E35M49 E33M50 E33M62 E37M49 E37M61 12 11 11 11 11 11 9 8 7 6 6 6 1 Combinaison des amorces AFLP et nombre de marqueurs
  • 10. Combinaison d’amorces Nombre de marqueurs Combinaison d’amorces Nombre de marqueurs ORS5 ORS8 ORS31 ORS53 ORS78 IUB6 SSL3 SSL20 SSL22 SSL27 SSL29 SSL30 SSL33 SSL49 SSL66 1 1 3 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 SSU6 SSU11 SSU21 SSU25 SSU39 SSU41 SSU100 SSU123 SSU129 SSU139 SSU195 SSU217 SSU223 SSU227 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 Combinaison des amorces SSR
  • 11. Groupe de liaison Nombre de marqueurs Longueur (cM) Distance Moyenne (cM) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 21 16 16 16 16 17 20 24 52 28 25 6 165.9 105.1 132.0 114.2 181.8 132.3 161.2 210.1 329.9 190.3 242.8 49.6 7.9 6.6 8.3 7.1 11.4 7.8 8.1 8.8 6.3 6.8 9.7 8.3 Distribution des marqueurs dans la carte génétique
  • 12. Groupe de liaison Nombre de marqueurs Longueur (cM) Distance Moyenne (cM) 13 14 15 16 17 18 19 20 21 non liés Totale 20 14 27 7 19 7 7 5 4 42 409 176.3 143.2 269.6 36.7 154.5 35.1 38.3 20.9 26.1 - 2915.9 8.8 10.2 10.0 5.2 8.1 5.0 5.5 4.2 6.5 - 7.9 Distribution des marqueurs dans la carte génétique
  • 13. E35M60_6 0,0 E40M59_13 11,0 E40M47_10 40,3 E32M49_3 55,2 E38M50_18 59,8 E33M62_6 65,8 E38M60_9 72,5 E40M50_2 80,5 E41M48_11 84,3 E41M50_13 86,2 E33M48_8 89,8 E32M49_1 91,5 E40M50_10 95,4 E37M47_25 110,1 E37M61_5 130,5 SSU129_2 134,9 SSU129_1 140,2 E35M62_13 145,6 SSU123_2 151,7 E33M48_15 154,5 E40M59_11 165,9 RIL-group 1 E33M50_2 0,0 E38M50_2 8,7 E32M49_11 13,8 E35M48_1 19,5 E38M60_8 22,3 E41M62_29 26,6 E33M60_7 30,1 E33M48_1 35,0 E36M59_14 36,1 E35M60_10 38,4 E40M62_21 43,0 E40M62_1 49,0 E35M60_22 61,8 E35M49_9 71,0 E38M50_1 87,1 E38M60_7 114,3 RIL-group 4 E40M62_18 0,0 E33M50_6 12,8 E35M48_3 22,1 ORS5 28,8 E41M50_6 31,3 E32M49_2 34,4 E35M60_21 38,8 E32M49_5 47,5 E35M48_10 60,9 E41M50_11 68,9 SSL27 73,4 E41M62_4 78,6 E38M50_15 84,8 E36M59_9 90,9 E38M50_17 104,2 E38M50_24 105,3 RIL-group 2 E32M49_8 0,0 ORS53 4,9 E32M61_10 16,2 E33M62_11 21,8 E33M60_3 26,7 E35M60_11 31,3 E40M62_4 40,1 E40M50_15 49,6 E33M48_16 54,2 E33M48_2 56,9 E37M47_15 62,3 E38M48_3 67,6 E40M50_18 78,7 E40M62_19 93,4 E35M61_3 104,9 E32M47_10 132,0 RIL-group 3 E33M48_26 0,0 E35M48_17 17,5 SSL66_1 31,3 E32M49_24 44,7 E32M49_19 51,9 E32M49_33 56,5 E41M62_11 68,3 E40M50_5 105,0 E40M59_3 119,0 E40M59_9 123,5 E32M49_21 126,4 E41M48_2 132,2 E35M49_5 138,2 E33M60_1 146,8 E32M47_14 161,2 E38M60_13 181,7 RIL-group 5 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 E41M62_6 0,0 E38M50_9 16,2 E33M60_8 22,6 E37M47_8 31,5 E35M49_4 36,2 E35M62_12 41,1 E40M59_7 44,8 E40M59_12 47,2 E41M62_12 67,5 E38M60_3 82,5 E38M50_16 87,9 E40M50_13 94,2 E40M59_6 100,0 E40M59_5 108,1 E35M62_1 114,9 E32M49_28 123,9 E41M62_24 130,3 E41M59_3 139,8 E40M62_11 154,3 E40M62_10 161,2 RIL-group 7 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8
  • 14. RIL-group 13 RIL-group 14 RIL-group 15 Carte génétique d’AFLP et de SSR de tournesol basée sur une population de 123 lignées recombinantes E32M47_2 0,0 E40M62_7 20,5 E37M61_2 30,1 E37M61_7 39,1 E35M62_11 46,7 SSL30 50,0 E33M48_5 53,4 E38M48_10 58,5 E38M48_9 62,3 E38M48_8 72,6 E33M48_18 81,0 E36M59_13 87,6 E37M47_19 93,4 E41M48_7 97,0 E41M48_9 110,5 E38M48_12 126,0 E41M48_8 141,2 E33M48_14 144,9 E37M47_3 154,3 RIL-group 17 E32M47_8 0,0 E37M47_18 8,3 E38M48_5 11,3 E32M61_6 18,0 E33M60_5 24,3 E32M49_20 30,5 E35M48_14 35,8 E38M50_14 38,5 E38M50_13 39,5 E41M59_5 40,5 E32M49_7 42,4 E33M62_8 45,0 E36M59_17 49,3 E41M62_2 55,1 E40M62_22 66,0 E40M62_23 71,8 E37M49_7 79,4 E37M61_11 84,4 E33M48_9 96,0 E40M50_19 107,6 E40M47_11 124,2 E40M47_7 130,6 E40M47_13 143,3 E38M60_4 161,3 E38M60_6 181,1 SSL29 182,4 SSL13 185,7 E38M60_5 190,2 RIL-group 10 E40M47_2 0,0 E35M61_8 32,3 E38M50_22 52,3 E38M50_8 57,8 E33M48_24 61,7 SSU227 66,7 SSU123_1 67,8 SSL20_1 70,3 E37M61_4 74,2 E41M50_9 81,7 E32M61_13 91,8 SSL33 97,9 E40M62_12 105,6 E36M59_3 117,5 E35M61_10 123,3 E37M47_24 130,7 SSU6_1 136,8 E33M62_9 147,9 E41M48_12 156,9 E37M61_3 164,2 E41M62_9 171,9 E36M59_8 183,8 E41M62_26 192,0 E32M49_12 205,4 E40M50_6 242,9 RIL-group 11 E33M48_20 0,0 E40M50_12 10,2 E40M62_25 24,7 E36M59_18 33,6 E41M50_5 40,0 E40M47_21 49,6 RIL-group 12 E40M50_9 0,0 E35M61_2 9,9 E38M50_4 24,0 E38M48_6 28,8 E37M47_16 40,8 E38M50_6 46,6 E40M62_14 60,7 E40M62_13 64,5 E33M48_22 76,7 E37M47_22 85,0 E37M49_6 90,7 E40M59_8 102,5 E32M61_9 114,6 E35M60_16 121,6 SSU62 127,4 SSU100 129,0 SSU41 132,9 E32M49_26 148,0 E40M50_14 153,2 E35M49_7 176,3 E32M47_9 0,0 E35M60_23 16,8 E37M61_9 28,7 E36M59_7 33,7 E41M50_12 36,8 E38M50_3 41,5 E38M60_10 45,6 E41M62_28 50,5 E40M47_23 66,0 E40M47_3 90,4 E41M50_2 103,5 E38M50_26 112,3 E40M62_17 121,2 E32M61_2 143,1 E32M61_14 0,0 E35M48_13 18,0 E38M50_7 27,2 E41M50_10 32,9 E35M62_8 43,5 E38M50_5 49,2 E41M62_21 52,9 E41M48_3 59,5 E40M62_16 66,9 E36M59_12 72,7 E41M62_18 77,0 E41M62_19 82,8 E33M50_4 92,7 E35M48_7 101,8 E38M48_1 119,3 E40M47_20 155,8 E35M62_5 174,2 SSL22_2 184,9 E33M50_3 196,8 E35M48_9 212,2 SSU139 217,7 E38M50_21 228,6 E33M48_3 231,1 E41M62_23 235,7 E41M59_7 252,2 E41M59_8 260,6 ORS31_3 269,5 E32M49_25 0,0 E33M60_6 4,3 E38M48_4 9,4 E37M49_9 15,3 E33M48_6 19,2 E35M48_4 23,8 E33M50_5 36,7 RIL-group 16 E35M60_19 0,0 E38M48_14 3,1 E38M60_12 6,1 E35M48_18 10,2 E36M59_5 16,8 E32M61_16 27,9 E32M61_15 35,1 RIL-group 18 E32M49_27 0,0 ORS8 11,4 E35M60_17 18,9 SSU223 23,1 SSU25 25,2 E35M61_5 33,8 E38M60_2 38,1 RIL-group 19 E35M49_10 0,0 SSU39 4,0 E40M59_10 8,4 E38M48_11 12,3 E35M62_2 20,8 RIL-group 20 E40M62_20 0,0 E36M59_15 6,9 E41M59_4 11,2 E35M48_6 26,0 RIL-group 21
  • 15. QTLs de la résistance au mildiou QTL Groupe de liaison Position LOD R² Effet additif rm- 3 rm -5 rm -13 rm -15 rm -17 III V XIII XV XVII 103.46 44.71 121.70 52.89 18.01 6.98 11.83 8.98 5.67 10.28 -8.38 -10.62 9.95 7.37 11.64 11.40 17.17 14.06 6.80 16.42 PAC-2 RHA-266
  • 16. QTLs de la résistance au phoma QTL Groupe de liaison Position LOD R² Effet additif rph- 1 rph -8 rph -9 rph -13 rph -15 I VIII IX XIII XV 55.25 168.21 163.91 24.05 49.21 6.98 6.14 11.75 6.76 14.20 -0.66 -0.78 0.89 0.66 1.27 10.41 10.15 19.51 9.81 25.57 PAC-2 RHA-266
  • 17. 0 2 4 6 8 10 12 14 0.2 0.4 0.6 0.8 1 1.2 1.4 1.6 1.8 2 LOD Score Position en Morgans Un seul QTL lié à la résistance au mildiou dans le groupe de liaison 5 rm -5
  • 18. 0 2 4 6 8 10 12 14 0.5 1 1.5 2 2.5 3 LOD Score Position en Morgans rph -15 rm -15 Deux QTLs liés à la résistance au mildiou et au phoma dans le groupe de liaison 15
  • 19. 2 4 6 8 10 12 14 0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 LOD Score Position en Morgans rph -9 Un seul QTL lié à la résistance au phoma dans le groupe de liaison 9
  • 20. Caractères d’intérêt agronomique Rendement en graines par plante Poids de mille grains Teneur des graines en huile Caractères étudiés : Précocité de floraison Diamètre du capitule Longueur de la tige Diamètre de la tige
  • 21. Précocité de floraison Longueur de la tige Gain génétique pour Diamètre de la tige Diamètre du capitule ns ns ns * Longueur de la tige (cm) * ns ns ns Nombre de Jours ns ns * * Diamètre de la tige (cm) ns ns * * Diamètre du capitule (cm)
  • 22. Gain génétique pour Rendement en graines par plante Poids de mille grains Teneur des graines en huile * ns ns ns % de l’huile en graines * * ns ns Rendement par plante (g) * * * ns Poids de mille grains (g)
  • 23. Préc. Flor. Diam. Tige Diam. Cap. Long. Tige Rend. Gr. PMG Long. Tige Diam. Tige Diam. Cap. Rend. Gr. PMG Ten. Huile -0.515 *** -0.065 -0.149 -0.034 0.200 -0.076 0.290 ** 0.474 *** 0.406 *** 0.170 -0.102 0.652 *** 0.429 *** 0.348 ** -0.024 0.632 *** 0.536 *** -0.057 0.545 *** 0.176 -0.226 * Corrélations phénotypiques entre les caractères agronomiques
  • 24. Précocité de floraison Rendement en graines Poids de 1000-grains Teneur en huile Caractères pf (3) rgp (4) pmg (3) th (4) Nombre de QTLs Groupe de liaison LOD R² 4, 9 et 14 4, 6, 9 et 21 4, 6 et 9 8, 11, 13 et 21 7.5-10.5 5.6-12.3 4.8- 13.5 4.0-8.5 13-20 5-15 7- 37 8-13 QTLs liés aux caractères agronomiques
  • 25. pmg -4 E33M50_2 0,0 E38M50_2 8,7 E32M49_11 13,8 E35M48_1 19,5 E38M60_8 22,3 E41M62_29 26,6 E33M60_7 30,1 E33M48_1 35,0 E36M59_14 36,1 E35M60_10 38,4 E40M62_21 43,0 E40M62_1 49,0 E35M60_22 61,8 E35M49_9 71,0 E38M50_1 87,1 E38M60_7 114,3 RIL-group 4 pf -4 lt -4-1 lt -4-2 dt -4-2 dt -4-1 dc -4 rgp -4 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 rgp -6 pmg -6 rgp -9 pmg -9 E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 pf -9 dc -9 dt -8 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 th -8 E40M47_2 0,0 E35M61_8 32,3 E38M50_22 52,3 E38M50_8 57,8 E33M48_24 61,7 SSU227 66,7 SSU123_1 67,8 SSL20_1 70,3 E37M61_4 74,2 E41M50_9 81,7 E32M61_13 91,8 SSL33 97,9 E40M62_12 105,6 E36M59_3 117,5 E35M61_10 123,3 E37M47_24 130,7 SSU6_1 136,8 E33M62_9 147,9 E41M48_12 156,9 E37M61_3 164,2 E41M62_9 171,9 E36M59_8 183,8 E41M62_26 192,0 E32M49_12 205,4 E40M50_6 242,9 RIL-group 11 lt -11-1 lt -11-2 th -11 E40M50_9 0,0 E35M61_2 9,9 E38M50_4 24,0 E38M48_6 28,8 E37M47_16 40,8 E38M50_6 46,6 E40M62_14 60,7 E40M62_13 64,5 E33M48_22 76,7 E37M47_22 85,0 E37M49_6 90,7 E40M59_8 102,5 E32M61_9 114,6 E35M60_16 121,6 SSU62 127,4 SSU100 129,0 SSU41 132,9 E32M49_26 148,0 E40M50_14 153,2 E35M49_7 176,3 RIL-group 13 th -13 rgp -9 pmg -9 E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 pf -9 dc -9
  • 26. Localisation des QTLs liés aux caractères agronomiques étudiés sur la carte génétique établie. E32M61_14 0,0 E35M48_13 18,0 E38M50_7 27,2 E41M50_10 32,9 E35M62_8 43,5 E38M50_5 49,2 E41M62_21 52,9 E41M48_3 59,5 E40M62_16 66,9 E36M59_12 72,7 E41M62_18 77,0 E41M62_19 82,8 E33M50_4 92,7 E35M48_7 101,8 E38M48_1 119,3 E40M47_20 155,8 E35M62_5 174,2 SSL22_2 184,9 E33M50_3 196,8 E35M48_9 212,2 SSU139 217,7 E38M50_21 228,6 E33M48_3 231,1 E41M62_23 235,7 E41M59_7 252,2 E41M59_8 260,6 ORS31_3 269,5 RIL-group 15 lt -15 dt -15 E35M60_19 0,0 E38M48_14 3,1 E38M60_12 6,1 E35M48_18 10,2 E36M59_5 16,8 E32M61_16 27,9 E32M61_15 35,1 RIL-group 18 dc -18 E32M49_27 0,0 ORS8 11,4 E35M60_17 18,9 SSU223 23,1 SSU25 25,2 E35M61_5 33,8 E38M60_2 38,1 RIL-group 19 dc -19 th -21 E40M62_20 0,0 E36M59_15 6,9 E41M59_4 11,2 E35M48_6 26,0 RIL-group 21 rgp -21 E32M47_9 0,0 E35M60_23 16,8 E37M61_9 28,7 E36M59_7 33,7 E41M50_12 36,8 E38M50_3 41,5 E38M60_10 45,6 E41M62_28 50,5 E40M47_23 66,0 E40M47_3 90,4 E41M50_2 103,5 E38M50_26 112,3 E40M62_17 121,2 E32M61_2 143,1 RIL-group 14 pf -14 dt -14
  • 27. Mesure de la vitesse et du pourcentage de germination Mesure des différents paramètres Paramètres de germination et de développement des plantules
  • 28. Paramètres de germination et de développement des plantules Longueur de l’hypocotyle (cm) Poids frais et sec de la partie aérienne (g) Poids frais et sec de la racine (g) Longueur de la racine (cm)
  • 30. RHA-266 PAC-2 Distribution des LIRs pour LR 9 8 7 6 5 4 3 2 1 5 1 0 5 0 L o n g u e u r d e l a r a c i n e ( c m ) N o m b r e d e L I R s
  • 31. T50PG PPN PGG C153 C56 C38 LR11 C142 LR64 LR45 LR18 C114 RHA266 C104 C124 PAC2 LR52 C100 LR35 Pourcentage de germination Vitesse de germination Analyses en composantes principales
  • 32. VG PGG LH LR PFA PFR PPN Nombre de QTLs Groupe de liaison LOD R² 2 4 5 4 3 8 6 Paramètres 4.1-4.3 4.4-7.4 4.6-10.8 3.9-4.6 7.6-14.5 3.9-9.4 5.0-8.8 1 et 8 3, 6 et 9 5, 8, 9, 11 et 15 8, 18 et 21 9 et 12 6, 7, 9, 12 et 15 6, 8, 9 et 12 13-18 8-16 6-20 8-13 23-33 7-19 8-16 QTLs liés aux paramètres de germination et de développement des plantules
  • 33. E35M60_6 0,0 E40M59_13 11,0 E40M47_10 40,3 E32M49_3 55,2 E38M50_18 59,8 E33M62_6 65,8 E38M60_9 72,5 E40M50_2 80,5 E41M48_11 84,3 E41M50_13 86,2 E33M48_8 89,8 E32M49_1 91,5 E40M50_10 95,4 E37M47_25 110,1 E37M61_5 130,5 SSU129_2 134,9 SSU129_1 140,2 E35M62_13 145,6 SSU123_2 151,7 E33M48_15 154,5 E40M59_11 165,9 RIL-group 1 vg -1 E33M48_26 0,0 E35M48_17 17,5 SSL66_1 31,3 E32M49_24 44,7 E32M49_19 51,9 E32M49_33 56,5 E41M62_11 68,3 E40M50_5 105,0 E40M59_3 119,0 E40M59_9 123,5 E32M49_21 126,4 E41M48_2 132,2 E35M49_5 138,2 E33M60_1 146,8 E32M47_14 161,2 E38M60_13 181,7 RIL-group 5 lh -5 E41M62_6 0,0 E38M50_9 16,2 E33M60_8 22,6 E37M47_8 31,5 E35M49_4 36,2 E35M62_12 41,1 E40M59_7 44,8 E40M59_12 47,2 E41M62_12 67,5 E38M60_3 82,5 E38M50_16 87,9 E40M50_13 94,2 E40M59_6 100,0 E40M59_5 108,1 E35M62_1 114,9 E32M49_28 123,9 E41M62_24 130,3 E41M59_3 139,8 E40M62_11 154,3 E40M62_10 161,2 RIL-group 7 pfr -7 E32M49_8 0,0 ORS53 4,9 E32M61_10 16,2 E33M62_11 21,8 E33M60_3 26,7 E35M60_11 31,3 E40M62_4 40,1 E40M50_15 49,6 E33M48_16 54,2 E33M48_2 56,9 E37M47_15 62,3 E38M48_3 67,6 E40M50_18 78,7 E40M62_19 93,4 E35M61_3 104,9 E32M47_10 132,0 RIL-group 3 psa -3-1 psa -3-2 pgg -3 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 pfr -6-1 pfr -6-2 psr -6 pgg -6-1 pgg -6-2 ppn -6 E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 lh -9 pfa -9-1 pfa -9-2 pfr -9-1 pfr -9-2 pfr -9-3 psr -9 pgg -9-1 ppn -9-1 ppn -9-2 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 vg -8 lh -8 lr -8 ppn -8-1 ppn -8-2 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 pfr -6-1 pfr -6-2 psr -6 pgg -6-1 pgg -6-2 ppn -6
  • 34. Localisation des QTLs liés aux paramètres de germination et de développement des plantules étudiés sur la carte génétique établie. E40M47_2 0,0 E35M61_8 32,3 E38M50_22 52,3 E38M50_8 57,8 E33M48_24 61,7 SSU227 66,7 SSU123_1 67,8 SSL20_1 70,3 E37M61_4 74,2 E41M50_9 81,7 E32M61_13 91,8 SSL33 97,9 E40M62_12 105,6 E36M59_3 117,5 E35M61_10 123,3 E37M47_24 130,7 SSU6_1 136,8 E33M62_9 147,9 E41M48_12 156,9 E37M61_3 164,2 E41M62_9 171,9 E36M59_8 183,8 E41M62_26 192,0 E32M49_12 205,4 E40M50_6 242,9 RIL-group 11 lh -11 E35M60_19 0,0 E38M48_14 3,1 E38M60_12 6,1 E35M48_18 10,2 E36M59_5 16,8 E32M61_16 27,9 E32M61_15 35,1 RIL-group 18 lr -18 E32M47_9 0,0 E35M60_23 16,8 E37M61_9 28,7 E36M59_7 33,7 E41M50_12 36,8 E38M50_3 41,5 E38M60_10 45,6 E41M62_28 50,5 E40M47_23 66,0 E40M47_3 90,4 E41M50_2 103,5 E38M50_26 112,3 E40M62_17 121,2 E32M61_2 143,1 RIL-group 14 pfr -14 E40M62_20 0,0 E36M59_15 6,9 E41M59_4 11,2 E35M48_6 26,0 RIL-group 21 lr -21-2 lr -21-1 E32M61_14 0,0 E35M48_13 18,0 E38M50_7 27,2 E41M50_10 32,9 E35M62_8 43,5 E38M50_5 49,2 E41M62_21 52,9 E41M48_3 59,5 E40M62_16 66,9 E36M59_12 72,7 E41M62_18 77,0 E41M62_19 82,8 E33M50_4 92,7 E35M48_7 101,8 E38M48_1 119,3 E40M47_20 155,8 E35M62_5 174,2 SSL22_2 184,9 E33M50_3 196,8 E35M48_9 212,2 SSU139 217,7 E38M50_21 228,6 E33M48_3 231,1 E41M62_23 235,7 E41M59_7 252,2 E41M59_8 260,6 ORS31_3 269,5 RIL-group 15 lh -15 psa -15 psr -15 E33M48_20 0,0 E40M50_12 10,2 E40M62_25 24,7 E36M59_18 33,6 E41M50_5 40,0 E40M47_21 49,6 RIL-group 12 pfa -12 pfr -12 psa -12 ppn -12
  • 35. Synthèse de résultats 1- Différence significative entre les deux parents pour la résistance partielle au mildiou. 2- Gain génétique chez 10% de lignées recombinantes sélectionnées pour les deux maladies. 3- Héritabilité importante pour la résistance au mildiou et au phoma (0.81 et 0.58 respectivement). 4- Cinq QTLs détectés pour la résistance au mildiou (6.8% < R² < 17.2%) et six QTLs pour la résistance au phoma (9.8% < R² < 25.6%). a- Résistance aux maladies
  • 36. 1- Différence significative entre les deux parents pour la précocité de floraison, le rendement en graines par plante, le poids de mille grains et la teneur des graines en huile. 2- Gain génétique chez la meilleure lignée recombinante pour tous les caractères exceptées la précocité de floraison et la teneur des graines en huile. 3- Identification de 28 QTLs pour l’ensemble des caractères agronomiques étudiés (5% < R² < 37%), appartenant parfois au même groupe de liaison. 4- Des corrélations significatives entre les caractères. b- Caractères agronomiques
  • 37. 2- Détection de 39 QTLs impliqués aux paramètres étudiés (6% < R² < 33%). 3- Des QTLs appartenant parfois au même groupe de liaison. 4- Des corrélations significatives entre les paramètres étudiés. c- Paramètres de germination et de développement des plantules 1- Distribution normale pour les 84 LIRs utilisées et leurs deux parents pour l’ensemble des paramètres étudiés.
  • 38. RHA-266 PAC-2 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 pfr -6-1 pfr -6-2 psr -6 pgg -6-1 pgg -6-2 ppn -6 rgp -6 pmg -6 E35M60_6 0,0 E40M59_13 11,0 E40M47_10 40,3 E32M49_3 55,2 E38M50_18 59,8 E33M62_6 65,8 E38M60_9 72,5 E40M50_2 80,5 E41M48_11 84,3 E41M50_13 86,2 E33M48_8 89,8 E32M49_1 91,5 E40M50_10 95,4 E37M47_25 110,1 E37M61_5 130,5 SSU129_2 134,9 SSU129_1 140,2 E35M62_13 145,6 SSU123_2 151,7 E33M48_15 154,5 E40M59_11 165,9 RIL-group 1 vg -1 rph -1-1 rph -1-2 E41M62_6 0,0 E38M50_9 16,2 E33M60_8 22,6 E37M47_8 31,5 E35M49_4 36,2 E35M62_12 41,1 E40M59_7 44,8 E40M59_12 47,2 E41M62_12 67,5 E38M60_3 82,5 E38M50_16 87,9 E40M50_13 94,2 E40M59_6 100,0 E40M59_5 108,1 E35M62_1 114,9 E32M49_28 123,9 E41M62_24 130,3 E41M59_3 139,8 E40M62_11 154,3 E40M62_10 161,2 RIL-group 7 pfr -7 rph -7 E32M49_8 0,0 ORS53 4,9 E32M61_10 16,2 E33M62_11 21,8 E33M60_3 26,7 E35M60_11 31,3 E40M62_4 40,1 E40M50_15 49,6 E33M48_16 54,2 E33M48_2 56,9 E37M47_15 62,3 E38M48_3 67,6 E40M50_18 78,7 E40M62_19 93,4 E35M61_3 104,9 E32M47_10 132,0 RIL-group 3 psa -3-1 psa -3-2 pgg -3 rph -3 rm -3 E33M50_2 0,0 E38M50_2 8,7 E32M49_11 13,8 E35M48_1 19,5 E38M60_8 22,3 E41M62_29 26,6 E33M60_7 30,1 E33M48_1 35,0 E36M59_14 36,1 E35M60_10 38,4 E40M62_21 43,0 E40M62_1 49,0 E35M60_22 61,8 E35M49_9 71,0 E38M50_1 87,1 E38M60_7 114,3 RIL-group 4 pf -4 lt -4-1 lt -4-2 dt -4-2 dt -4-1 dc -4 rgp -4 pmg -4 rph -4 E33M48_26 0,0 E35M48_17 17,5 SSL66_1 31,3 E32M49_24 44,7 E32M49_19 51,9 E32M49_33 56,5 E41M62_11 68,3 E40M50_5 105,0 E40M59_3 119,0 E40M59_9 123,5 E32M49_21 126,4 E41M48_2 132,2 E35M49_5 138,2 E33M60_1 146,8 E32M47_14 161,2 E38M60_13 181,7 RIL-group 5 lh -5 rm -5
  • 39. RHA-266 PAC-2 E33M48_20 0,0 E40M50_12 10,2 E40M62_25 24,7 E36M59_18 33,6 E41M50_5 40,0 E40M47_21 49,6 RIL-group 12 pfa -12 pfr -12 psa -12 ppn -12 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 vg -8 lh -8 lr -8 ppn -8-1 ppn -8-2 dt -8 th -8 rph -8-3 rph -8-1 rph -8-2 rm -8-2 rm -8-1 E40M50_9 0,0 E35M61_2 9,9 E38M50_4 24,0 E38M48_6 28,8 E37M47_16 40,8 E38M50_6 46,6 E40M62_14 60,7 E40M62_13 64,5 E33M48_22 76,7 E37M47_22 85,0 E37M49_6 90,7 E40M59_8 102,5 E32M61_9 114,6 E35M60_16 121,6 SSU62 127,4 SSU100 129,0 SSU41 132,9 E32M49_26 148,0 E40M50_14 153,2 E35M49_7 176,3 RIL-group 13 th -13 rph -13 rm -13 E40M47_2 0,0 E35M61_8 32,3 E38M50_22 52,3 E38M50_8 57,8 E33M48_24 61,7 SSU227 66,7 SSU123_1 67,8 SSL20_1 70,3 E37M61_4 74,2 E41M50_9 81,7 E32M61_13 91,8 SSL33 97,9 E40M62_12 105,6 E36M59_3 117,5 E35M61_10 123,3 E37M47_24 130,7 SSU6_1 136,8 E33M62_9 147,9 E41M48_12 156,9 E37M61_3 164,2 E41M62_9 171,9 E36M59_8 183,8 E41M62_26 192,0 E32M49_12 205,4 E40M50_6 242,9 RIL-group 11 lt -11-1 lt -11-2 th -11 lh -11 E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 lh -9 pfa -9-1 pfa -9-2 pfr -9-1 pfr -9-2 pfr -9-3 psr -9 pgg -9 ppn -9-1 ppn -9-2 rph -9 rgp -9 pmg -9 pf -9 dc -9
  • 40. Localisation des QTLs liés à l'ensemble des caractères étudiés sur la carte génétique établie. RHA-266 PAC-2 E35M60_19 0,0 E38M48_14 3,1 E38M60_12 6,1 E35M48_18 10,2 E36M59_5 16,8 E32M61_16 27,9 E32M61_15 35,1 RIL-group 18 lr -18 dc -18 E32M49_27 0,0 ORS8 11,4 E35M60_17 18,9 SSU223 23,1 SSU25 25,2 E35M61_5 33,8 E38M60_2 38,1 RIL-group 19 dc -19 lr -21-2 lr -21-1 th -21 E40M62_20 0,0 E36M59_15 6,9 E41M59_4 11,2 E35M48_6 26,0 RIL-group 21 rgp -21 E32M61_14 0,0 E35M48_13 18,0 E38M50_7 27,2 E41M50_10 32,9 E35M62_8 43,5 E38M50_5 49,2 E41M62_21 52,9 E41M48_3 59,5 E40M62_16 66,9 E36M59_12 72,7 E41M62_18 77,0 E41M62_19 82,8 E33M50_4 92,7 E35M48_7 101,8 E38M48_1 119,3 E40M47_20 155,8 E35M62_5 174,2 SSL22_2 184,9 E33M50_3 196,8 E35M48_9 212,2 SSU139 217,7 E38M50_21 228,6 E33M48_3 231,1 E41M62_23 235,7 E41M59_7 252,2 E41M59_8 260,6 ORS31_3 269,5 RIL-group 15 lh -15 psa -15 psr -15 lt -15 dt -15 rph -15 rm -15 E32M47_2 0,0 E40M62_7 20,5 E37M61_2 30,1 E37M61_7 39,1 E35M62_11 46,7 SSL30 50,0 E33M48_5 53,4 E38M48_10 58,5 E38M48_9 62,3 E38M48_8 72,6 E33M48_18 81,0 E36M59_13 87,6 E37M47_19 93,4 E41M48_7 97,0 E41M48_9 110,5 E38M48_12 126,0 E41M48_8 141,2 E33M48_14 144,9 E37M47_3 154,3 RIL-group 17 rm -17-1 rm -17-2 rm -17-3 E32M47_9 0,0 E35M60_23 16,8 E37M61_9 28,7 E36M59_7 33,7 E41M50_12 36,8 E38M50_3 41,5 E38M60_10 45,6 E41M62_28 50,5 E40M47_23 66,0 E40M47_3 90,4 E41M50_2 103,5 E38M50_26 112,3 E40M62_17 121,2 E32M61_2 143,1 RIL-group 14 pf -14 dc -14 pfr -14
  • 41. LIR C81 C91 C138 LR64 LR67 - - + + + - + + - - + + + - - + + - + + Phénotypes et génotypes des LIRs rph -15 rm -15 psr -15 dt -15 lh -15 P P R R R Allèle
  • 42. Groupe 15 RHA266 PAC2 C138 LR64 et LR67 C81 et C91 Indéfini
  • 43. LIR C37 C54 C91 C84 C142 LR19 - - - + + + - - - + + + - + + + + - + + Phénotypes et génotypes des LIRs rgp -9 pmg -9 pf -9 lh -9 P P P R R R Allèle
  • 44. RHA266 PAC2 Groupe 9 C37 C54 et C91 C84 C142 et LR19 Indéfini
  • 45. Ten. Hui. th -8 LIR E41592 SSL20_2 th -11 SSL20_1 SSU100 th -13 SSU41 th -21 E406220 C37 C120 C84 LR46 C115 C101 29.84 33.18 33.58 34.67 45.42 45.66 R R R R P P R R R R P P P P P P R R P P P P - R P P P P R R P P - P - - Phénotypes et génotypes des LIRs riches et pauvres en huile PAC2: 37.73 RHA266: 44.38
  • 46. LIRs pauvres en huile LIRs riches en huile LIRs pauvres en huile LIRs riches en huile Groupe 11 Groupe 8 RHA266 PAC2 Indéfini
  • 47. LIRs pauvres en huile LIRs riches en huile LIRs pauvres en huile LIRs riches en huile Groupe 21 Groupe 13 RHA266 PAC2 Indéfini
  • 48. E40M62_18 0,0 E33M50_6 12,8 E35M48_3 22,1 ORS5 28,8 E41M50_6 31,3 E32M49_2 34,4 E35M60_21 38,8 E32M49_5 47,5 E35M48_10 60,9 E41M50_11 68,9 SSL27 73,4 E41M62_4 78,6 E38M50_15 84,8 E36M59_9 90,9 E38M50_17 104,2 E38M50_24 105,3 RIL-group 2 ORS5 61.5
  • 49. 16 E32M49_23 0,0 E41M62_25 11,3 E41M62_7 25,7 E40M62_8 37,0 E37M61_10 50,5 E33M48_21 57,6 E41M62_30 60,8 E35M60_1 69,2 E41M59_10 82,7 E35M60_18 90,2 E41M48_13 95,3 ORS31_2 99,0 E33M48_19 104,6 E33M48_23 113,0 E35M49_6 120,6 E35M48_16 124,8 E35M61_7 132,2 RIL-group 6 E41M59_2 0,0 SSL20_2 4,0 E37M47_26 19,4 E41M48_6 29,0 E35M61_4 45,1 E32M47_1 60,5 E33M48_25 69,4 E38M60_11 85,6 IUB-6 94,3 E40M62_5 114,0 E32M49_29 125,3 E40M50_1 133,8 E37M47_10 142,7 E37M47_9 146,7 E37M61_8 152,3 E37M47_5 160,3 E37M61_1 169,4 E38M48_2 178,4 ORS128 185,1 ORS31_1 186,2 SSL22_1 188,0 ORS126 189,8 E41M48_4 195,1 E32M61_5 210,2 RIL-group 8 ORS31 16.1 ORS 310 ORS 126 13.2 CRT22-16 ORS1017 13.8
  • 50. 10 E40M50_11 0,0 E33M62_7 12,8 E35M60_7 29,6 SSL49 46,6 SSL3 52,4 SSL66_2 57,9 E35M61_9 59,6 E41M59_11 79,5 E32M49_32 87,2 E35M62_4 97,2 E35M61_11 104,1 E35M62_9 109,8 E32M49_34 112,8 E41M59_9 114,7 E41M50_3 116,0 E35M61_12 118,1 E41M50_4 120,4 E41M50_7 123,1 E40M50_16 127,6 E40M62_24 133,6 E40M62_15 139,2 E40M62_2 145,1 E37M61_6 156,0 E32M61_7 163,9 E36M59_2 170,7 E37M47_2 174,7 E35M60_13 179,1 E35M60_12 183,2 E35M60_20 185,9 E37M49_5 191,1 E36M59_6 196,0 E35M48_8 205,0 E41M62_1 211,7 E37M49_4 218,1 E32M49_30 222,5 E32M49_17 224,9 E37M47_4 228,9 E35M62_3 232,5 E41M59_1 234,1 E33M50_1 237,5 E41M59_6 239,6 ORS78 240,7 E35M62_7 242,3 E32M49_35 244,8 E33M60_2 249,5 E35M61_6 253,4 E35M48_5 258,7 E35M60_5 268,8 E37M49_3 278,4 E40M50_8 295,8 E40M47_22 321,3 E40M47_12 329,7 RIL-group 9 ORS78 59.9 ORS591 ORS78 240,7
  • 51. 15 E32M49_27 0,0 ORS8 11,4 E35M60_17 18,9 SSU223 23,1 SSU25 25,2 E35M61_5 33,8 E38M60_2 38,1 RIL-group 19 ORS7 8.8 ORS8
  • 52. Conclusions 2- Identification de QTLs contrôlant différents caractères et liés positivement aux même marqueurs. 3- Détections de liaisons défavorables entre différents caractères. 4- Existence de cinq marqueurs SSRs communs avec les cartes présentées par (Tang et al ., 2002) et (Yu et al ., 2003). 1- Détection de 10 QTLs liés à différents marqueurs SSRs
  • 53. Perspectives 1- Etablissement d’une carte génétique dense par l’intégration des résultats de cartographie de différentes populations. 2- Recherche de QTLs sur cette carte et réalisation des croisements entre LIRs. 3- Sélection assistée par marqueurs pour des caractères ayant des QTLs liés aux marqueurs SSRs.
  • 54. Merci à tout le personnel et tous les étudiants du BAP …