SIG et surveillance épidémiologique du paludisme en Afrique - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Martin Catherine - France - catherine.Martin-2@manchester.ac.uk

1. SIG et surveillance épidémiologique
du paludisme en Afrique
Catherine Martin
Mots clés: SIG, cartographie, indices paludométriques, indices démographiques,
indices climatologiques, géo-références, endémicité palustre, transmission
Atelier Paludisme – 7ème édition – Institut Pasteur de Madagascar
24/08/2009
EVALUATION
par les FACILITATEURS

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3. SIG et surveillance épidémiologique
du paludisme en Afrique
Catherine Martin
Mots clés: SIG, cartographie, indices paludométriques, indices démographiques,
indices climatologiques, géo-références, endémicité palustre, transmission
Atelier Paludisme – 7ème édition – Institut Pasteur de Madagascar
24/08/2009
EVALUATION
par les FACILITATEURS

4. Introduction des SIG dans la lutte contre le
paludisme
Dynamique du paludisme: distribution et intensité de transmission sont très
hétérogènes.
En Afrique, on trouve un large spectre de situations épidémiologiques allant
du paludisme instable épidémique
au paludisme pérenne de haute intensité.
Critère important pour planifier les activités de lutte à tous les niveaux:
- continental
- national
- local.

5. Introduction des SIG dans la lutte contre le
paludisme
Notre compréhension de l’endémicité palustre reste imparfaite en terme de:
- distribution Où?
- déterminants Pourquoi?
- quantification Combien?
- saisonnalité Quand?
Efforts conduits dans la cartographie de l’endémicité palustre et
l’établissement des profils du risque du paludisme pour les populations
Introduction des SIG (Systèmes d’Informations Géographiques):
programmes de cartographie électronique permettant de visualiser et
d’analyser des données spatiales

6. Cartographie du paludisme: quels outils?
Données paludométriques
prévalence des parasites
taux d’incidence et de mortalité
taux d’inoculation entomologique…
GEOREFERENCEES
(latitude, longitude)
Données climatiques
températures mensuelles min/max
précipitations mensuelles…
Données environnementales
par télédétection satellite
et/ou images radar:
Indices de croissance des végétaux
Température au sommet des nuages…
Collecte
Intégration - SIG

7. Cartographie du paludisme: quels outils?
Données paludométriques
prévalence des parasites
taux d’incidence et de mortalité
taux d’inoculation entomologique…
GEOREFERENCEES
(latitude, longitude)
Données climatiques
températures mensuelles min/max
précipitations mensuelles…
Données environnementales
par télédétection satellite
et/ou images radar:
Indices de croissance des végétaux
Température au sommet des nuages…
Collecte
CARTESIntégration - SIG

8. Cartographier le risque palustre sur le continent africain
Initié en 1996
Financé par:
Roll Back Malaria
Wellcome Trust UK
Swiss Tropical Institute…
A partir de données et d’archives collectées
au niveau de 10 000 sites de surveillance
 chaque point représente les résultats d’une étude
particulière par sa date, son lieu, ses sources, sa méthode

9. Combinées à une modélisation de facteurs climatiques, démographiques et
administratifs pour créer des cartes paludométriques intégrées
Modélisation prédictive permettant de
compléter la collecte de données dans
les zones où ces données manquent
Modèle de répartition du paludisme à
l’échelle du continent avec une
résolution de 5x5km
Cartes définissant:
durée de la saison de transmission
modélisation de la prévalence
répartition des populations à risque
 Cartes générées à l’échelle des continents et des pays

10. Cartographie au niveau national
et du district - Kenya
Omumbo et al., 1998
Résolution limitée par le manque et la
répartition hétérogène des données
Variabilité épidémiologique au niveau local

11. En intégrant des données sur:
l’abondance des anophèles
la distribution des températures
la densité des populations
la topographie (altitude)
la répartition des champs de riz (télédétection + radar)
Cartes de risque épidémique pour chaque district
9/13 sites ont eu des alertes confirmées
en accord avec les prédictions graphiques
Définir des zones prioritaires dans un programme
d’Aspersion Intra-Domicilaire d’insecticide

12. Cartographie à l’échelle mondiale des limites de la transmission du paludisme
Hay et al., 2009

13. Hay et al., 2009
Modélisation de l’incertitude
Sur les indices paludométriques
Sur les indices démographiques
 Cartes générées à l’échelle des continents et des pays

14. Cartographie du paludisme:
quelles applications?
Cartes constituent des bases de données utilisables dans le cadre des
activités de lutte à diverses échelles
- par les planificateurs, les chercheurs et les bailleurs de fonds
- définition des stratégies d’intervention les mieux adaptées à une région
ou un district (planification plus rationnelle des ressources et des
activités)
- suivi / monitorage des programmes en cours
Modélisation comme outil de veille sanitaire
Lutte contre l’émergence (ou réémergence) de foyers
 Outil de DECISION

15. Cartographie du paludisme: perspectives?
Limites :
- le taux de parasites est une mesure moins directe que le taux
d’inoculation entomologique
- irrégularité de l’échantillonnage / collecte des données non-exhaustive
- résolution
- télédétection: lourd et coûteux
- carte ‘snapshot’ alors que l’épidémiologie est un concept dynamique
- importance de l’échelle d’étude
Projet MAP prometteur car conçu pour permettre des mises à jour
évolution de l’endémicité
inclusion de la dimension temporelle
Applicable et/ou combinable avec le suivi épidémiologique d’autres
maladies à transmission vectorielle  vers une lutte plus efficace?
méthodesoutils

16. Les logiciels SIG comme outil bureautique
Logiciels de gestion de données épidémiologiques:
DIVA GIS, Map Info, Epi Map, …
Utilisation pour:
analyser et gérer des ressources
représenter un objet ou un phénomène réel et le localiser dans l’espace
produire des cartes afin d’illustrer un rapport, un article, …
La plupart de ces logiciels sont accessibles en ligne et des cartes spécifiques
des différents pays/régions/districts peuvent être téléchargées
(cartothèque) pour être ensuite « habillées » avec les données et
informations collectées

17. Les logiciels SIG comme outil bureautique
 Logiciels conviviaux permettant la visualisation, l’analyse et la
présentation des données épidémiologiques
 Destinés aux différents acteurs de la lutte antipaludique sur le terrain
(techniciens, personnels de santé, … ) et dans les structures de recherche
Exemple:
création de cartes avec
DIVA-GIS
Source: http://www.diva-gis.org/

18. Bibliographie
Hay SI, Guerra CA, Gething PW, Patil AP, Tatem AJ, Noor AM, Kabaria CW, Manh BH, Elyazar IR, Brooker S, Smith DL,
Moyeed RA, Snow RW. A world malaria map: Plasmodium falciparum endemicity in 2007. PLoS Med. 2009 Mar
24;6(3):e1000048.
Hay SI, Snow RW. The malaria Atlas Project: developing global maps of malaria risk. PLoS Med. 2006 Dec;3(12):e473
Kleinschmidt I, Bagayoko M, Clarke GP, Craig M, Le Sueur D. A spatial statistical approach to malaria mapping. Int J
Epidemiol. 2000 Apr;29(2):355-61
Omumbo J, Ouma J, Rapuoda B, Craig MH, le Sueur D, Snow RW. Mapping malaria transmission intensity using
geographical information systems (GIS): an example from Kenya. Ann Trop Med Parasitol. 1998 Jan;92(1):7-21.
Rakotomanana F, Jeanne I, Duchemin JB, Pietra V, Raharimalala L, Tombo ML, Ariey F. Approche géographique dans la
lutte contre le paludisme dans la région des Hautes Terres Centrales à Madagascar. Arch Inst Pasteur
Madagascar. 2001;67(1-2):27-30
Rakotomanana F, Randremanana RV, Rabarijaona LP, Duchemin JB, Ratovonjato J, Ariey F, Rudant JP, Jeanne I.
Determining areas that require indoor insecticide spraying using Multi Criteria Evaluation, a decision-support tool
for malaria vector control programmes in the Central Highlands of Madagascar. Int J Health Geogr. 2007 Jan
29;6:2
Vers un Atlas du Risque de la Malaria en Afrique. Premier rapport technique de la collaboration MARA/ARMA. 1999.
Centre de coordination MARA/ARMA Durban, Afrique du Sud ©MARA/ARMA (Mapping Malaria Risk in Africa /
Atlas du Risque de la Malaria en Afrique) http://www.mara.org.za/
Malaria Atlas Project
Mots clés: SIG, cartographie, indices paludométriques, indices démographiques, indices climatologiques,
géo-références, endémicité palustre, transmission