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Genomica cardiovascular
A glie a 1 a io g
 neS r R C r l ia
       r        d o
Irdcio
                    n o uc n
                     t


•   Enfermedades Coronarias e Infartos al Miocardio son
    altamente asociados a herencia

•   Es uno de los factores de riesgo no modificables mas
    dominantes que existen
Irdcio
                     n o uc n
                      t

•   Normalmente se
    identifican los factores
    ambientales y los
    geneticos como cosas
    separadas

•   Los factores ambientales
    actuan sobre los factores
    geneticos para iniciar la
    enfermedad
Irdcio
                      n o uc n
                       t

•   La mejor forma de estudiar los riesgos geneticos para
    enfermedades cardiovasculares:

    •   Analisis genetico de union

    •   Estudios de asociacion genetica

    •   Estudios en gemelos
A a is ee od uio
            nl gnt e n n
              is    ic
•   Este utiliza multiples pedigrees familiares en donde se identifican patrones de herencia
    en ciertas caracteristicas.

•   Se pueden utilizar marcadores de ADN en ciertas posiciones en el genoma y asi poder
    identificar patrones geneticos que estan ligados a ciertas caracteristicas de la persona

•   Las ventajas son que se estudian 2 o 3 generaciones de una familia las cuales son
    similares geneticamente y por lo tanto se pueden identificar las caracteristicas
    facilmente

•   Las desventajas son que puede ser dificil obtener DNA e informacion clinica en 3 o mas
    generaciones

•   Las enfermedades coronarias se presentan en etapas tardias de la vida. Pueden tener
    las caracteristicas geneticas sin expresarse en los niños e incluso los adultos de edad
    media
Et io d a cc n ee a
      s d s e s iaio gnt
       u      o        ic

•   No requieren de informacion vertical de las familias

•   Adquieren informacion horizontal de las personas con o sin la enfermedad
    a una edad en la cual la enfermedad es relevante

•   La desventaja es que las variaciones entre personas fuera de la familia es
    tan grande que se requiere de estudios de cohorte grandes para eliminar
    la posibilidad de correlacion al azar

•   Las enfermedades cardiovasculares sin duda son hereditarias sin embargo
    aun no se conocen los genes que conllevan este riesgo
Et io e gml
              S d sn e e s
               u        o

•   Son los estudios mas poderosos porque los gemelos
    son geneticamente identicos

•   En teoria si se separan los gemelos y son criados en
    diferentes ambientes se puede atribuir una enfermedad
    a factores geneticos.

•   Es dificil descartar presencia de factores que modifican
    los factores geneticos
Mcnm s e n r eae
         eais o d ef mdds
                     e
              gnta
               ee s
                  ic
•   Hereditario contra Adquirido

    •   Cuando es hereditario se encuentran en el genoma
        de todas las celulas del cuerpo

    •   Cuando es adquirido se encuentran en el genoma de
        las celulas que pertenecen al tejido afectado

    •   Existen variaciones en los genes que ocurren en la
        embriogenesis y pueden parecer enfermedades
        hereditarias sin embargo los padres se encuentran
        sin alteraciones geneticas
Mcnm s e n r eae
 eais o d ef mdds
             e
      gnta
       ee s
          ic
Mcnm s e n r eae
         eais o d ef mdds
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               ee s
                  ic
•   De las alteraciones geneticas las mas prevalentes pero inocuas
    son los polimorfismos de un solo nucleotido

    •   De estos por lo general se requiere de por lo menos que 1% de
        la poblacion lo tenga para que se pueda denominar como una
        variante normal

    •   Si menos del 1% lo tienen se interpreta como una mutacion, en
        especial cuando se asocia a un fenotipo en particular

    •   Por lo general dichas mutaciones no tienen alteraciones puesto
        a que multiples codones codifican para el mismo aminoacido
Mcnm s e n r eae
         eais o d ef mdds
                     e
              gnta
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                  ic
•   Las mutaciones pueden ocurrir en posiciones de una sola base (point mutations) o en
    combinacion con otras bases

    •   Estas pueden ser “dinucleotidos, tri-nucleotido.”

        •   Pueden cambiar las bases, insertarlas o borrarlas

•   Hay regiones grandes que son insertadas y/o borradas en regiones que no codifican y
    su efecto no se manifiesta. Aun no se puede identificar por completo que influye que no
    se manifiesten las alteraciones

•   Hay regiones pequeñas que se pueden cambiar o reacomodar y esto ocasionan
    defectos severos. Se observa en el sindrome de DiGeorge en donde donde hay
    delecion de cromosoma 22q11 provocan fenotipos cardiacos clasicos
Mcnm s e n r eae
 eais o d ef mdds
             e
      gnta
       ee s
          ic

•   Los cambios epigeneticos son cambios que no ocurren en la
    base par primaria pero ocurren en zonas reguladoras que se
    encuentran por encima de la secuencia

•   Ejemplo clasico de regulación epigenética es la metilacion de
    citosinas, en “islas” ricas en citosina y guanina.
A odjgnm od
              b ra eo ic e
                  e
                ef mdds
                 n r eae
                  e
•   Para poder leer e interpretar el genoma humano se utiliza una
    tecnica llamada “Secuencias paralelas masivas” en donde se
    “parte” el ADN en multiples regiones pequeñas las cuales se
    comparan unas con otras

•   Perfilando ARN- este se utiliza transcribiendo ARN a ADN y asi
    poder determinar que secuencia provoca las manifestaciones

•   Estrategias proteomicas- se pueden analizar proteinas y se
    pueden rastrear de forma retrograda para identificar el ADN que
    las produje. Sin embargo este metodo es dificil de realizar porque
    las proteinas tienen muchas variaciones
o jivs e eo ic
              b to d gnm a
               e
                crioa u r
                a vs l
                  d ca
•   Mj cs aio d gota
     e rlif c n ians
      o a ic        ic

    •   p r eiod ea inr s o p nn s e da se se p dr
         o md e xm al cmoet hr it io s epr o e
                       o         e e r       a
        idn icr l pc n s e l- ieg. D etmnrs pee eicr
          et aao aiet d aors e s ae e ud dd a
           if    s    e    t    o     a  a
        myr r uss peeir obm r lae e ets aiet
          aoe e r a r n m ri- otidds n s pc n s
             s c o    v            a     o    e

    •   U e mlqe s e poeod inetaio e pridn icr
         n j p u et n rcs e vs c n s a et a
            e o     a             ig      a   if
        pc n s o ef mdd ooa , r is nia la ira fl
         aiet cn n r ea crnr e t c aa s in ya
             e    e          ia s e      p     la
        criaa dc a o qim t aia
        a c inuid p r u ioe p
          d               r

    •   A t let s u izn s sen a pridn icr aiet e rs
         c a n e t a et t ics a et apc n s n ieg
          um e     il     a c      a   if    e     o
        d IMaerm ar afr c n uicl y inrme lg
         eA , nuis a ot , ibilio aru r sdo d QTa o
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o jivs e eo ic
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                  a vs l
                    d ca
•   Mejor informacion pronostica para guiar la terapia

    •   se puede identificar pacientes que requieren cierto tipo de
        tratamiento o los que se van a beneficiar mas

    •   ejemplo seria en pacientes que tuvieron un IAM y que esten en
        riesgo de desarrollar insuficiencia cardiaca

    •   se observa mayor utilizacion de estas tecnicas empleandose
        en farmacoterapia. Un ejemplo seria el uso de warfarina y los
        efectos que tiene en los pacientes. Tambien en el uso de
        antiagregantes plaquetarios por medio de los citocromos
        p450s.
o jivs e eo ic
                b to d gnm a
                 e
                  crioa u r
                  a vs l
                    d ca


•   Se pueden identificar nuevos tratamientos

    •   analizando de manera adecuada la patofisiologia molecular de
        las enfermedades cardiovasculares pueden ayudar a identificar
        terapias especificas para los padecimientos
G nm a e n r eae
         eo ic d ef mdds
                  e
             pl n a
              o eics
               ig
•   Hay evidencia de mayor riesgo de eventas cardiovasculares en
    pacientes con familiares que hayan tenido dichos eventos

•   Hay mayor riesgo de enfermedad coronaria en pacientes que
    tienen un familiar de primer grado que haya tenido un IAM antes
    de los 55 años de edad, hasta de 7 veces mas

•   Se ha tenido exito identificando enfermedades monogenicas
    como lo son Sd Wolf-Parkinson-White, Sd QT prolongado o
    cardiomiopatia hipertrofica.

•   No se ha logrado obtener informacion sobre enfermedades
    poligenicas
G nm a e n r eae
         eo ic d ef mdds
                  e
             pl n a
              o eics
               ig
•   Se utilizan estudios denominados estudios asociados al genoma
    en donde se utilizan marcadores de alta densidad en todo el
    genoma para identificar zonas que producen enfermedad

•   Se utilizan poblaciones de pacientes de mayor cantidad y se
    utilizan computadoras para analizar los hallazgos a nivel
    genomico

•   Actualmente se esta ulizando esta tecnica para analizar grandes
    poblaciones y encontrar variantes normales en el genoma

•   Se estima que se podran encontrar la mayoria de las variantes
    normales en los siguientes 5 a 10 años
G nm a a ioa u rc a
     eo ic cr vs l at l
            d ca u



•   Los siguientes son
    conceptos basicos que
    debe de saber un
    Cardiologo
G nm a a ioa u rc a
     eo ic cr vs l at l
            d ca u

•   Enfermedades Monogenicas

    •   El mas comun es el sindrome de QT largo con sus variantes
        geneticas conocidas

    •   Se observan mutaciones en 5 genes de los canales cardiacos
        los cuales son responsables hasta de un 75% de los casos de
        QT largo familiar

    •   Dependiendo de la alteracion genetica es el canal cardiaco que
        se afecta (potasio, sodio, etc.)
S do e lg
inrm QTa o
        r
G nm a a ioa u rc a
     eo ic cr vs l at l
            d ca u
•   Cardiomiopatia Hipertrofica
    •   Desorden comun encontrandose en 0.2% de la poblacion
    •   Por lo general es hereditario cmo autosomico dominante como
        una enfermedad del sarcomero; se han identificado mas de
        450 mutaciones diferentes
    •   Las mutaciones mas comunes son en la cadena pesada de
        beta-miosina (44% de los casos)
        •   Protiena C unida a miosina (35%)
        •   Troponina T cardiaca tipo 2 (7%) de los casos
    •   Marcadores de mal pronostico: factores morfologicos, clinicos y
        geneticos
G nm a a ioa u rc a
 eo ic cr vs l at l
        d ca u
•   Cardiomiopatia hipertrofica
•   Se ha asociado mayor incidencia de muerte subita en
    mutaciones de la cadena pesada de beta-miosina
•   Mutaciones en la Troponina T cardiaca se asocia a muerte
    subita aun cuando hay poca hipertrofia del ventriculo izquierdo
•   Hay pacientes que tienen mas de una mutacion
•   Aprox 50% de los pacientes con hipertrofia cardiaca sin causa
    identificable no tienen alteraciones geneticas que sugieren
    dicho padecimiento
G nm a a ioa u rc a
 eo ic cr vs l at l
        d ca u

•   Enfermedad Coronaria
•   Hay multiples genes que contribuyen al riesgo del paciente
•   El 9p21 es un marcador nuevo identificado para que implica
    mayor riesgo para desarrollar IAM en poblacion Europea
•   Pacientes homocigotos tienen un riesgo atribuible para IAM en
    21% a cualquier edad y 31% para IAM prematuro
•   Heterocigotos tienen un aumento de riesgo del 15 a 20% de
    IAM
G nm a a ioa u rc a
 eo ic cr vs l at l
        d ca u
•   Farmacogenomica cardiovascular
•   Se utiliza principalmente para el tratamiento personalizado
    identificando pacientes que no son respondedores o
    respondedores toxicos al tratamiento y evitarlo
•   Puede variar en el metabolismo de ciertas drogas incluyendo
    su eliminacion
•   Ejemplo clasico son las variantes del citocromo p450 y el uso
    de Warfarina
•   Las pruebas farmacologicas se pueden utilizar para establecer
    una dosis adecuada y asi disminuir los riesgos y la cantidad de
    estudios de laboratorio que se hagan
Problemas eticos
Ft od lgnm a n n r eae
    u r ea eo ic e ef mdds
     u               e
           crioa u r
           a vs le
            d ca s


•   Los objetivos principales son identificar pacientes de
    alto riesgo para enfermedades cardiovasculares y sus
    complicaciones

•   Desarrollar terapia farmacologica especifica para
    personalizar tratamiento con los pacientes

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Genomica

  • 1. Genomica cardiovascular A glie a 1 a io g neS r R C r l ia r d o
  • 2. Irdcio n o uc n t • Enfermedades Coronarias e Infartos al Miocardio son altamente asociados a herencia • Es uno de los factores de riesgo no modificables mas dominantes que existen
  • 3. Irdcio n o uc n t • Normalmente se identifican los factores ambientales y los geneticos como cosas separadas • Los factores ambientales actuan sobre los factores geneticos para iniciar la enfermedad
  • 4. Irdcio n o uc n t • La mejor forma de estudiar los riesgos geneticos para enfermedades cardiovasculares: • Analisis genetico de union • Estudios de asociacion genetica • Estudios en gemelos
  • 5. A a is ee od uio nl gnt e n n is ic • Este utiliza multiples pedigrees familiares en donde se identifican patrones de herencia en ciertas caracteristicas. • Se pueden utilizar marcadores de ADN en ciertas posiciones en el genoma y asi poder identificar patrones geneticos que estan ligados a ciertas caracteristicas de la persona • Las ventajas son que se estudian 2 o 3 generaciones de una familia las cuales son similares geneticamente y por lo tanto se pueden identificar las caracteristicas facilmente • Las desventajas son que puede ser dificil obtener DNA e informacion clinica en 3 o mas generaciones • Las enfermedades coronarias se presentan en etapas tardias de la vida. Pueden tener las caracteristicas geneticas sin expresarse en los niños e incluso los adultos de edad media
  • 6. Et io d a cc n ee a s d s e s iaio gnt u o ic • No requieren de informacion vertical de las familias • Adquieren informacion horizontal de las personas con o sin la enfermedad a una edad en la cual la enfermedad es relevante • La desventaja es que las variaciones entre personas fuera de la familia es tan grande que se requiere de estudios de cohorte grandes para eliminar la posibilidad de correlacion al azar • Las enfermedades cardiovasculares sin duda son hereditarias sin embargo aun no se conocen los genes que conllevan este riesgo
  • 7. Et io e gml S d sn e e s u o • Son los estudios mas poderosos porque los gemelos son geneticamente identicos • En teoria si se separan los gemelos y son criados en diferentes ambientes se puede atribuir una enfermedad a factores geneticos. • Es dificil descartar presencia de factores que modifican los factores geneticos
  • 8.
  • 9. Mcnm s e n r eae eais o d ef mdds e gnta ee s ic • Hereditario contra Adquirido • Cuando es hereditario se encuentran en el genoma de todas las celulas del cuerpo • Cuando es adquirido se encuentran en el genoma de las celulas que pertenecen al tejido afectado • Existen variaciones en los genes que ocurren en la embriogenesis y pueden parecer enfermedades hereditarias sin embargo los padres se encuentran sin alteraciones geneticas
  • 10.
  • 11. Mcnm s e n r eae eais o d ef mdds e gnta ee s ic
  • 12. Mcnm s e n r eae eais o d ef mdds e gnta ee s ic • De las alteraciones geneticas las mas prevalentes pero inocuas son los polimorfismos de un solo nucleotido • De estos por lo general se requiere de por lo menos que 1% de la poblacion lo tenga para que se pueda denominar como una variante normal • Si menos del 1% lo tienen se interpreta como una mutacion, en especial cuando se asocia a un fenotipo en particular • Por lo general dichas mutaciones no tienen alteraciones puesto a que multiples codones codifican para el mismo aminoacido
  • 13. Mcnm s e n r eae eais o d ef mdds e gnta ee s ic • Las mutaciones pueden ocurrir en posiciones de una sola base (point mutations) o en combinacion con otras bases • Estas pueden ser “dinucleotidos, tri-nucleotido.” • Pueden cambiar las bases, insertarlas o borrarlas • Hay regiones grandes que son insertadas y/o borradas en regiones que no codifican y su efecto no se manifiesta. Aun no se puede identificar por completo que influye que no se manifiesten las alteraciones • Hay regiones pequeñas que se pueden cambiar o reacomodar y esto ocasionan defectos severos. Se observa en el sindrome de DiGeorge en donde donde hay delecion de cromosoma 22q11 provocan fenotipos cardiacos clasicos
  • 14. Mcnm s e n r eae eais o d ef mdds e gnta ee s ic • Los cambios epigeneticos son cambios que no ocurren en la base par primaria pero ocurren en zonas reguladoras que se encuentran por encima de la secuencia • Ejemplo clasico de regulación epigenética es la metilacion de citosinas, en “islas” ricas en citosina y guanina.
  • 15. A odjgnm od b ra eo ic e e ef mdds n r eae e • Para poder leer e interpretar el genoma humano se utiliza una tecnica llamada “Secuencias paralelas masivas” en donde se “parte” el ADN en multiples regiones pequeñas las cuales se comparan unas con otras • Perfilando ARN- este se utiliza transcribiendo ARN a ADN y asi poder determinar que secuencia provoca las manifestaciones • Estrategias proteomicas- se pueden analizar proteinas y se pueden rastrear de forma retrograda para identificar el ADN que las produje. Sin embargo este metodo es dificil de realizar porque las proteinas tienen muchas variaciones
  • 16. o jivs e eo ic b to d gnm a e crioa u r a vs l d ca • Mj cs aio d gota e rlif c n ians o a ic ic • p r eiod ea inr s o p nn s e da se se p dr o md e xm al cmoet hr it io s epr o e o e e r a idn icr l pc n s e l- ieg. D etmnrs pee eicr et aao aiet d aors e s ae e ud dd a if s e t o a a myr r uss peeir obm r lae e ets aiet aoe e r a r n m ri- otidds n s pc n s s c o v a o e • U e mlqe s e poeod inetaio e pridn icr n j p u et n rcs e vs c n s a et a e o a ig a if pc n s o ef mdd ooa , r is nia la ira fl aiet cn n r ea crnr e t c aa s in ya e e ia s e p la criaa dc a o qim t aia a c inuid p r u ioe p d r • A t let s u izn s sen a pridn icr aiet e rs c a n e t a et t ics a et apc n s n ieg um e il a c a if e o d IMaerm ar afr c n uicl y inrme lg eA , nuis a ot , ibilio aru r sdo d QTa o ic a a r
  • 17. o jivs e eo ic b to d gnm a e crioa u r a vs l d ca • Mejor informacion pronostica para guiar la terapia • se puede identificar pacientes que requieren cierto tipo de tratamiento o los que se van a beneficiar mas • ejemplo seria en pacientes que tuvieron un IAM y que esten en riesgo de desarrollar insuficiencia cardiaca • se observa mayor utilizacion de estas tecnicas empleandose en farmacoterapia. Un ejemplo seria el uso de warfarina y los efectos que tiene en los pacientes. Tambien en el uso de antiagregantes plaquetarios por medio de los citocromos p450s.
  • 18. o jivs e eo ic b to d gnm a e crioa u r a vs l d ca • Se pueden identificar nuevos tratamientos • analizando de manera adecuada la patofisiologia molecular de las enfermedades cardiovasculares pueden ayudar a identificar terapias especificas para los padecimientos
  • 19. G nm a e n r eae eo ic d ef mdds e pl n a o eics ig • Hay evidencia de mayor riesgo de eventas cardiovasculares en pacientes con familiares que hayan tenido dichos eventos • Hay mayor riesgo de enfermedad coronaria en pacientes que tienen un familiar de primer grado que haya tenido un IAM antes de los 55 años de edad, hasta de 7 veces mas • Se ha tenido exito identificando enfermedades monogenicas como lo son Sd Wolf-Parkinson-White, Sd QT prolongado o cardiomiopatia hipertrofica. • No se ha logrado obtener informacion sobre enfermedades poligenicas
  • 20. G nm a e n r eae eo ic d ef mdds e pl n a o eics ig • Se utilizan estudios denominados estudios asociados al genoma en donde se utilizan marcadores de alta densidad en todo el genoma para identificar zonas que producen enfermedad • Se utilizan poblaciones de pacientes de mayor cantidad y se utilizan computadoras para analizar los hallazgos a nivel genomico • Actualmente se esta ulizando esta tecnica para analizar grandes poblaciones y encontrar variantes normales en el genoma • Se estima que se podran encontrar la mayoria de las variantes normales en los siguientes 5 a 10 años
  • 21. G nm a a ioa u rc a eo ic cr vs l at l d ca u • Los siguientes son conceptos basicos que debe de saber un Cardiologo
  • 22. G nm a a ioa u rc a eo ic cr vs l at l d ca u • Enfermedades Monogenicas • El mas comun es el sindrome de QT largo con sus variantes geneticas conocidas • Se observan mutaciones en 5 genes de los canales cardiacos los cuales son responsables hasta de un 75% de los casos de QT largo familiar • Dependiendo de la alteracion genetica es el canal cardiaco que se afecta (potasio, sodio, etc.)
  • 23. S do e lg inrm QTa o r
  • 24. G nm a a ioa u rc a eo ic cr vs l at l d ca u • Cardiomiopatia Hipertrofica • Desorden comun encontrandose en 0.2% de la poblacion • Por lo general es hereditario cmo autosomico dominante como una enfermedad del sarcomero; se han identificado mas de 450 mutaciones diferentes • Las mutaciones mas comunes son en la cadena pesada de beta-miosina (44% de los casos) • Protiena C unida a miosina (35%) • Troponina T cardiaca tipo 2 (7%) de los casos • Marcadores de mal pronostico: factores morfologicos, clinicos y geneticos
  • 25. G nm a a ioa u rc a eo ic cr vs l at l d ca u • Cardiomiopatia hipertrofica • Se ha asociado mayor incidencia de muerte subita en mutaciones de la cadena pesada de beta-miosina • Mutaciones en la Troponina T cardiaca se asocia a muerte subita aun cuando hay poca hipertrofia del ventriculo izquierdo • Hay pacientes que tienen mas de una mutacion • Aprox 50% de los pacientes con hipertrofia cardiaca sin causa identificable no tienen alteraciones geneticas que sugieren dicho padecimiento
  • 26.
  • 27. G nm a a ioa u rc a eo ic cr vs l at l d ca u • Enfermedad Coronaria • Hay multiples genes que contribuyen al riesgo del paciente • El 9p21 es un marcador nuevo identificado para que implica mayor riesgo para desarrollar IAM en poblacion Europea • Pacientes homocigotos tienen un riesgo atribuible para IAM en 21% a cualquier edad y 31% para IAM prematuro • Heterocigotos tienen un aumento de riesgo del 15 a 20% de IAM
  • 28. G nm a a ioa u rc a eo ic cr vs l at l d ca u • Farmacogenomica cardiovascular • Se utiliza principalmente para el tratamiento personalizado identificando pacientes que no son respondedores o respondedores toxicos al tratamiento y evitarlo • Puede variar en el metabolismo de ciertas drogas incluyendo su eliminacion • Ejemplo clasico son las variantes del citocromo p450 y el uso de Warfarina • Las pruebas farmacologicas se pueden utilizar para establecer una dosis adecuada y asi disminuir los riesgos y la cantidad de estudios de laboratorio que se hagan
  • 29.
  • 31. Ft od lgnm a n n r eae u r ea eo ic e ef mdds u e crioa u r a vs le d ca s • Los objetivos principales son identificar pacientes de alto riesgo para enfermedades cardiovasculares y sus complicaciones • Desarrollar terapia farmacologica especifica para personalizar tratamiento con los pacientes

Notas del editor

  1. Mutacion MyHC se asocia a mayor riesgo de muerte subita.