Álgebra y aplicaciones:
análisis de señales
biomédicas
Marisol Gómez
Álgebra y Aplicaciones
Teoría de grupos
Estudio de autómatas finitos
Procesado de imágenes médicas
Análisis de señales bio...
Análisis de señales biomédicas. Sistemas ambulatorios de
medida
Sistema de medida bajo coste. Uso ambulatorio y domiciliar...
Bacterias reprogramadas
Íñigo Lasa
Bacterias reprogramadas
Insulina (diabetes)
Hormona de crecimiento (enanismo)
Factores de coagulación (hemofilia)
Interleu...
Bacterias reprogramadas
2. Factorías para síntesis de fármacos
Biosíntesis de fármacos en células como alternativa al
reac...
Bacterias reprogramadas
3. Bacterias y células terapeúticas
Bacterias y fagos capaces de destruir bacterias
patógenas
(EnB...
Dispositivos de detección
de sustancias pirógenas
alternativo al test LAL
Sergio Arana
UBIQUITUOUS!!
Detection of pyrogenic agents based on electrochemical techniques
MEDICAL
ISSUE
Presence of pyrogenic agents...
Electrochemical
measurements:
setups and electronics
Cuvette(6ml)Droplet(100µl)µfluidiccell
(40µl) Final
sensor
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Integration of the whole detection
system, first steps for validation
I. Fully miniaturized electrochemical
sensor
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Economía de la salud:
evaluación económica de
tecnologías sanitarias,
efectividad y costes
Juan Manuel Cabasés
Economía de la salud
Evaluación económica de tecnologías
sanitarias, efectividad y costes
BIOMED XXI
“WORKSHOP CIENCIA, CO...
EQIS 2.0 USER GUIDE
Eduardo Sanchez-Iriso
María Errea
Departamento de Economía
Departamento de Economía
Expresión génica
Ignacio Encío
Regulación de la Expresión de Genes del Metabolismo
de Esteroides
Análisis del Mecanismo de Acción de Nuevos
Compuestos co...
Estrategias de Terapia Celular para el tratamiento de
la Diabetes Tipo 1:
Terapia sustitutoria (iPS) & Inmunomodulación
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Ensayospre-clínicos
Papel de los simbióticos (Probisan®) en la prevención
y desarrollo de diabetes y enfermedades
inflamat...
Inteligencia artificial y
razonamiento aproximado
Humberto Bustince
Grupo de Inteligencia Artificial y Razonamiento Aproximado
GIARA
Departamento: Automática y Computación
Organismo: Univers...
Líneas de
Investigación
Información Conocimiento
Inteligencia Artificial. Minería de datos
Extracción de conocimiento en c...
Proyectos Desarrollados
• Elaboración de un sistema inteligente para la predicción de eventos adversos
relacionados con la...
Sensores: Optisensing
Ignacio del Villar
Carlos Ruiz Zamarreño
OPTICSENSING: UNA NUEVA
INICIATIVA EMPRESARIAL
Desarrollo de equipos fotónicos y ópticos para aplicaciones biomédicas
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Detección de anticuerpos de celiaquía
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Tecnología de THz para
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Íñigo Ederra
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mejorar la sensibili...
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Grupo de Antenas, UPNA:
Capacidades
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• Diseño, fabricación y caracterización de componentes
• Caracterizac...
Bionanoplus
Ricardo Palacios
Tecnología
patentada
Liberación
controlada
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industrial
Requisitos
regulatorios
Nanoparticulas poliméricas para la ...
Como puede la tecnología de Bionanoplus mejorar tus productos
Bionanoplus Comercial
Aumentar la solubilidad
Potenciar la r...
Condiciones favorables para la colaboración
Ricardo Palacios
rpalacios@bionanoplus.com
Desarrollo de nanoparticulas
polimé...
InnoUp Farma
Maite Agüeros
Ikan Biotech
Roberto Díez-Martínez
Servicios específicos
Primeros
estudios con
Peces cebra
Estudios preclínicos
Desarrollo
Sistema Nervioso
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económico
5 veces más
económico
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Ahorro
tiempo
7
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2-3
días
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Cantidad de molécula
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mg-μg
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Roberto Díez-Martínez, Ph.D.
CSO
roberto.diez@ikanbiotech.com
Rubén Díez Punzano, MBA.
CEO
ruben.diez@ikanbiotech.com
Prof...
LQTAI
Alfonso Baquero
Servicio de telemonitorización para el seguimiento de
pacientes crónicos
• Plug &PlayyAccesible
• Ubicuo yen Tiempo Real
•...
Serviciosde Ingeniería
 Diseño electrónico,sistemas embebidosy procesadodeseñal
 Integracióndetecnologías inalámbricas
...
DesarrollosActuales
• Servicio de monitorización electrocardiográfica HOLTIN
• Detección y diagnóstico dearritmias paroxís...
Making Genetics
Javier Campión
Pharmamodelling
Lorea Bueno
Equipo Multidisciplinar
Personal altamente cualificado
Bioequivalencia
RescateEnsayos
Clínica
Preclínica
Bioestadística
Es...
Investigación
Básica
Diseño
Prototipo
Desarrollo
Preclínico Desarrollo Clínico
Aprobación FDA
y lanzamiento
Ruta crítica
...
Desarrollo Preclínico Desarrollo Clínico
¿Qué puede hacer Pharmamodelling?
Lorea Bueno, PhD
lbuebur@Pharmamodelling.com
Na...
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  1. 1. Álgebra y aplicaciones: análisis de señales biomédicas Marisol Gómez
  2. 2. Álgebra y Aplicaciones Teoría de grupos Estudio de autómatas finitos Procesado de imágenes médicas Análisis de señales biomédicas Brain Computer Interface (BCI)
  3. 3. Análisis de señales biomédicas. Sistemas ambulatorios de medida Sistema de medida bajo coste. Uso ambulatorio y domiciliario. Promover la recuperación funcional y mejorar la calidad de vida. Análisis de datos: adquisición, recuperación, comparación y procesado de señales de acelerometría.
  4. 4. Bacterias reprogramadas Íñigo Lasa
  5. 5. Bacterias reprogramadas Insulina (diabetes) Hormona de crecimiento (enanismo) Factores de coagulación (hemofilia) Interleukinas (inmunoterapia del cancer) Interferon a (leucemias, hepatitis) Eritropoyetina (anemia) DNAse I (fibrosis cistica) Anticuerpos (inmunoterapia) 1. Factorías de producción de proteínas terapeúticas
  6. 6. Bacterias reprogramadas 2. Factorías para síntesis de fármacos Biosíntesis de fármacos en células como alternativa al reactor químico (artemisina, aspirina) (Sanofi, Codexis,….) Plataformas para la mejora de fármacos existentes (anticuerpos con mejor afinidad) (Gen9) Síntesis de nuevos fármacos (Glaxo SK)
  7. 7. Bacterias reprogramadas 3. Bacterias y células terapeúticas Bacterias y fagos capaces de destruir bacterias patógenas (EnBioTix, Bgene) Bacterias como plataformas de expresión de vacunas (Prokarium, Recombina,…..) Ingeniería de tejidos (Impresión 3D de materiales biológicos) (OxSyBio) Bacterias para tratamiento de enfermedades (Fenilcetonuria) (Synlogic)
  8. 8. Dispositivos de detección de sustancias pirógenas alternativo al test LAL Sergio Arana
  9. 9. UBIQUITUOUS!! Detection of pyrogenic agents based on electrochemical techniques MEDICAL ISSUE Presence of pyrogenic agents in implantable medical devices or parenteral drugs REGULATION AGENCIES: FDA, EMA, Pharmacopoeias Mortality rate: 30% - 50% > Prostate cancer + Breast cancer + AIDS Heart attack ̴ DEMANDING control of endotoxin Gold Standard: LAL Test Pharmacological products Medical devices Products produced in hospitals Endotoxin: pyrogen molecule embedded in the outer membrane of Gram-negative bacteria SEPSIS SEPTIC SHOCK MULTIORGAN FAILURE DEATH ENDOTOXIN CONCENTRATION PhD. Sergio Arana
  10. 10. Electrochemical measurements: setups and electronics Cuvette(6ml)Droplet(100µl)µfluidiccell (40µl) Final sensor prototype s Potentiostat/ Galvanostat PhD. Sergio Arana
  11. 11. Integration of the whole detection system, first steps for validation I. Fully miniaturized electrochemical sensor II. Specific and optimized biofunctionalization protocol III. Microfluidic chamber to homogenise assay conditions and to minimize contamination risk IV. Portable potentionstat/galvanostat INTEGRAL SOLUTION End user customable DUAL APPLICATION PORTABLE EQUIPMENT/USER CONTROL » Commercial solutions available » Main difference: OPERATINGPRINCIPLE  Sensible and robust  Portable  Flexible design  Ease for use » INNOVATIVESOLUTIONfor industrial applications » Integration into routine processes  Test routine  Cost reduction  Flexible design  No need for qualified users AUTOMATED EQUIPMENT PhD. Sergio Arana
  12. 12. Economía de la salud: evaluación económica de tecnologías sanitarias, efectividad y costes Juan Manuel Cabasés
  13. 13. Economía de la salud Evaluación económica de tecnologías sanitarias, efectividad y costes BIOMED XXI “WORKSHOP CIENCIA, CONOCIMIENTO Y EMPRENDIMIENTO” Juan M Cabasés Grupo de investigación Economía de la Salud Departamento de Economía, UPNA Departamento de Economía
  14. 14. EQIS 2.0 USER GUIDE Eduardo Sanchez-Iriso María Errea Departamento de Economía
  15. 15. Departamento de Economía
  16. 16. Expresión génica Ignacio Encío
  17. 17. Regulación de la Expresión de Genes del Metabolismo de Esteroides Análisis del Mecanismo de Acción de Nuevos Compuestos con Actividad Antitumoral Tumores Endocrinos 17β-Deshidrogenasas de Esteroides (HSD17B8, HSD17B10, HSD17B11, AKR1C3) Nuevos Compuestos con Actividad Antitumoral: Mecanismos de Acción Grupo de Investigación Expresión Génica Departamento Ciencias de la Salud Universidad Pública de Navarra HSD17B8 Hígado y Mama Derivados de Bezotiofeno 1,1 dióxido Compuestos Selenados Selenodiazoles, Selenoglicoles, Selenocarbamatos, Diseleniuros, etc. HSD17B11 AKR1C3 Próstata Neuroblastoma Diferenciación Inducidada por Ácido Retinoico
  18. 18. Estrategias de Terapia Celular para el tratamiento de la Diabetes Tipo 1: Terapia sustitutoria (iPS) & Inmunomodulación (MSCs) Terapia sustitutoria: obtención de células b a partir de iPS Terapia inmunomoduladora: células madre mesenquimales células pluripotentes inducidas (iPS) células madre Mesenquimales (MSCs) Diabetes tipo 1
  19. 19. Ensayospre-clínicos Papel de los simbióticos (Probisan®) en la prevención y desarrollo de diabetes y enfermedades inflamatorias intestinales en modelos animales de experimentación Objetivo 1. Diabetestipo1 (ratónNOD) Objetivo 2. DT2yObesidad (rataZDF) Objetivo 3. Enf.inflamatorias intestinales Caracterización Microbiota Plataforma genómica Ensayos clínicos en humanos Probisan®(PENTABIOL S.L.)
  20. 20. Inteligencia artificial y razonamiento aproximado Humberto Bustince
  21. 21. Grupo de Inteligencia Artificial y Razonamiento Aproximado GIARA Departamento: Automática y Computación Organismo: Universidad Pública de Navarra Web: http://giara.unavarra.es Responsable: Humberto Bustince bustince@unavarra.es Líneas de Investigación  Sistemas expertos (clásicos y difusos).  Aprendizaje automático y reconocimiento de patrones.  Procesamiento de imagen.  Funciones de agregación. Teoría de conjuntos difusos y sus extensiones.  BIG DATA
  22. 22. Líneas de Investigación Información Conocimiento Inteligencia Artificial. Minería de datos Extracción de conocimiento en conjuntos de datos para: Técnicas de clasificación mediante aprendizaje automático Procesamiento de imagen Sistemas de ayuda para la toma de decisiones … Base de datos Selecc ión Preproce sado Selección de caracterí sticas Extracció n de conocimi ento Evalua ción Modelo Clasificad or Conocimi ento
  23. 23. Proyectos Desarrollados • Elaboración de un sistema inteligente para la predicción de eventos adversos relacionados con la polimedicación en atención primaria. • Análisis de la base de datos Major Trauma de Navarra 2010-2012, validación como sistema de vigilancia epidemiológica, predicción de la morbi-mortalidad y calidad asistencial del Sistema de emergencia de Navarra. • Aplicación de los conjuntos intervalo-valorados fuzzy al tratamiento de imágenes de manchas en la piel para diagnosticar melanomas. • Centro de Autentificación Biométrico Multimodal.
  24. 24. Sensores: Optisensing Ignacio del Villar Carlos Ruiz Zamarreño
  25. 25. OPTICSENSING: UNA NUEVA INICIATIVA EMPRESARIAL Desarrollo de equipos fotónicos y ópticos para aplicaciones biomédicas WAVELENGTH OPTICALPOWER OPTICALPOWER WAVELENGTH INPUT LIGHT REFLECTED OUTPUT WAVELENGTH OPTICALPOWER TRANSMITTED OUTPUT ESQUEMA SENSOR
  26. 26. Detección de anticuerpos de celiaquía R E C O V E R Y R E C O V E R Y R E C O V E R Y R E C O V E R Y 728 733 738 743 748 753 0 20 40 60 80 100 120 140 Resonancewavelength(nm) Time (min) BINDING BUFFER THROMBIN 100nM BINDING BUFFER THROMBIN 100nM BINDING BUFFER APLICACIONES ESTUDIADAS Una solución integrada en el móvil Detección de VOCs, gases, … Detección de Trombina, proteínas, … Objetivo a corto-medio plazo:
  27. 27. Biacore T200 Resolution: 3x10-8 OWLS 210 Resolution: 3x10-6 EVA 2.0 Resolution: 5x10-8 EQUIPOS COMERCIALES DISPOSITIVO DESARROLLADO EN LA UPNA -34 -29 -24 -19 -14 -9 -4 1150 1250 1350 1450 1550 1650 Transmittancia(dB) Wavelength(nm) n=1.434 n=1.4357 n=1.4373 n=1.438 TM 1300 1340 1380 1420 1460 1500 1,4335 1,4345 1,4355 1,4365 1,4375 1,4385 ResonanceWavelength(nm) Wavelength (nm) Objetivo a medio-largo plazo: Equipo Comercial ultrasensible
  28. 28. Tecnología de THz para biosensado e imagen médica Íñigo Ederra
  29. 29. Grupo de Antenas, UPNA: Soluciones • Desarrollo de sensores “ad-hoc” • Basados en metamateriales para mejorar la sensibilidad THz (0.1-1THz) para sensado y toma de imágenes • Sistemas para toma de imágenes:  Detección de objetos extraños/defectos  Contenido de agua  Grosor de películas Grupo de Antenas
  30. 30. Grupo de Antenas, UPNA: Aplicaciones F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida117C.albicans_suspendidas en agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire.7 117C.albicans_suspendidas en agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire Sample form F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida220C.guillermondii_suspendidas agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire.7 220C.guillermondii_suspendidas agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire Sample form F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida232C.lipolytica_suspendidas agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire.7 232C.lipolytica_suspendidas agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire Sample form F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida168C.parapsilosis_suspendidas en agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire.7 168C.parapsilosis_suspendidas en agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire Sample form F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida223C.tropicalis_suspendidas agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire.7 223C.tropicalis_suspendidas agua_11.2MF_MIR ATR secado 45 ref aire Sample form 25/06/2015 27/08/2015 09/09/2015 03/07/2015 27/08/2015 90095010001050110011501200 Wavenumber cm-1 0.050.100.150.20 Page 1 of 1 Candida guillermondii Candida albicans Candida tropicalis Candida parapsilosis Candida lipolytica ESPECTROS DE ESPECIES DEL GÉNERO CANDIDA F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida117C.albicans_suspendidas en agua_11.2MF_MIR A F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida220C.guillermondii_suspendidas agua_11.2MF_MIR F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida232C.lipolytica_suspendidas agua_11.2MF_MIR ATR F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida168C.parapsilosis_suspendidas en agua_11.2MF_M F:EIFFEL2015Espectros levadurasMedidas aguaMedidas diluidas y secadas a 45º CON densitómetroBIBLIOTECA POR ESPECIESCandida223C.tropicalis_suspendidas agua_11.2MF_MIR ATR 25/06/2015 27/08/2015 09/09/2015 03/07/2015 27/08/2015 90095010001050110011501200 Wavenumber cm-1 0.050.100.150.20 AbsorbanceUnits Page 1 of 1 Rhodotorula mucilaginosa Candida albicans Saccharomyces cerevisiae Escherichia coli Staphyloccocus epidermidis ESPECTROS DE DIFERENTES GÉNEROS Y FAMILIAS DE MICROORGANISMOS EIFFEL: Early invasive fungal infection detection with Terahertz sensor systems, IIS14618.RI1 Grupo de Antenas CURVA REFLEXIÓN VS CURVA CRECIMIEMTO L.MONOCYTOGENES 10^2 UFC/ml -26,4 -26,3 -26,2 -26,1 -26 -25,9 -25,8 -25,7 0 5 10 15 20 25 30 35 40 horas dB 1,5 2,5 3,5 4,5 5,5 6,5 7,5 8,5 9,5 NANOSENS: Desarrollo de nuevos sensores multiaplicación VITICS: Modelo de viticultura de precisión basado en dispositivos TIC de bajo coste para la monitorización del estado hídrico
  31. 31. Grupo de Antenas, UPNA: Capacidades Sala limpia ISO7 • Diseño, fabricación y caracterización de componentes • Caracterización espectral Grupo de Antenas 0 – 0.5 THz 0.1 – 3.5 THz IR
  32. 32. Bionanoplus Ricardo Palacios
  33. 33. Tecnología patentada Liberación controlada Escalado industrial Requisitos regulatorios Nanoparticulas poliméricas para la administración de fármacos y vacunas
  34. 34. Como puede la tecnología de Bionanoplus mejorar tus productos Bionanoplus Comercial Aumentar la solubilidad Potenciar la respuesta inmune Aumentar la biodisponibilidad
  35. 35. Condiciones favorables para la colaboración Ricardo Palacios rpalacios@bionanoplus.com Desarrollo de nanoparticulas poliméricas a la carta Servicios Caída cabello Psoriasis Onicomicosis Vacunas veterinarias Productos propios
  36. 36. InnoUp Farma Maite Agüeros
  37. 37. Ikan Biotech Roberto Díez-Martínez
  38. 38. Servicios específicos Primeros estudios con Peces cebra Estudios preclínicos Desarrollo Sistema Nervioso Modelos regeneración de heridas Modelos antimicrobianos (Patente nacional) Mutantes BIOSANITARIA MEDIOAMBIENTAL
  39. 39. € Ahorro económico 5 veces más económico t Ahorro tiempo 7 días 2-3 días Q/m Cantidad de molécula por ensayo mg-μg g Directiva 2010/63/UE ------ Real Decreto 53/2013
  40. 40. Roberto Díez-Martínez, Ph.D. CSO roberto.diez@ikanbiotech.com Rubén Díez Punzano, MBA. CEO ruben.diez@ikanbiotech.com Prof. Vincent Fischetti Juan A. Ruano Ruiz, MD, Ph.D. Promotores Asesores Externos Chad W. Euler, Ph.D.
  41. 41. LQTAI Alfonso Baquero
  42. 42. Servicio de telemonitorización para el seguimiento de pacientes crónicos • Plug &PlayyAccesible • Ubicuo yen Tiempo Real • ServicioIntegral deeSalud Características Personalizable Glucosa Tensión y Ritmo SpO2 Peso Temp. PeakFlow (PEF, FEV1…) Diabetes Enfermedades Cardiacas Enfermedades Respiratorias Multipatología Punto de CuidadoInteligente
  43. 43. Serviciosde Ingeniería  Diseño electrónico,sistemas embebidosy procesadodeseñal  Integracióndetecnologías inalámbricas  Desarrollodeaplicacionesmóviles  DesarrollodeaplicacioneswebJ2EE  Desarrollode solucionesllave-en-manodeServicios Socio-Sanitarios
  44. 44. DesarrollosActuales • Servicio de monitorización electrocardiográfica HOLTIN • Detección y diagnóstico dearritmias paroxísticas y episodios deFA • Mejora delas soluciones clínicas actuales (Holter convencional yholter implantable)
  45. 45. Making Genetics Javier Campión
  46. 46. Pharmamodelling Lorea Bueno
  47. 47. Equipo Multidisciplinar Personal altamente cualificado Bioequivalencia RescateEnsayos Clínica Preclínica Bioestadística Escalado,1ªDosis IIV,ISV,cov.
  48. 48. Investigación Básica Diseño Prototipo Desarrollo Preclínico Desarrollo Clínico Aprobación FDA y lanzamiento Ruta crítica  Técnica avalada por la FDA en un informe elaborado en 20041 1Challenge and Opportunity on the Critical Path to New (FDA 2004)
  49. 49. Desarrollo Preclínico Desarrollo Clínico ¿Qué puede hacer Pharmamodelling? Lorea Bueno, PhD lbuebur@Pharmamodelling.com Nave T3 Ahorro
  50. 50. Networking lunch ¡Contacta e interactúa!

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