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Epigenetics
       psiconeuroendocrinology
                 and
       lamarckian-like evolution

                            Elena Sbalchiero, phD
                           Ozzano dell’Emilia (BO)
                             13-14 ottobre 2012

martedì 27 novembre 2012
“I have hitherto sometimes spoken as if
                           the variation were due to chance. This,
                           of    course,   is   a    wholly        incorrect
                           expression,      but      it      serves      to
                           acknowledge plainly our ignorance of
                           the cause of each particular variation.
                           [The facts] lead to the conclusion that
                           variability is generally related to the
                           conditions of life to which each species
                           has    been     exposed        during    several
                           successive generations”.


                           From “The Origin of Species”




martedì 27 novembre 2012
FATTORI AMBIENTALI
      Dal genotipo…                                                  al fenotipo
                            enzimi che modificano la cromatina
                           caratterizzano l’ambiente epigenetico


                                         DNA
                                         Istoni




                                  Fattori di trascrizione
             metaboloma                                                   Somatica
                                                                    cambiamenti fenotipici
                                        trascrittoma   Long ncRNA
          Enzimi metabolici
                                                mRNA                 Espressione genica
                                     microRNA
                                                tRNA
                                        siRNA   rRNA piRNA
                                                                     Linea germinale
                                                                    cambiamenti trans
                                        proteoma
                                                                      generazionali
martedì 27 novembre 2012
cromosoma
                                                Struttura aperta della cromatina
                              cromatina        accessibile ai fattori di trascrizione

                                       mRNA



                           RNA polimerasi II
                      DNA
            con isole CpG demetilate

               Istoni
              acetilati

                                                                         metiltransferasi

                                                                         DNA
                                               Istoni deacetilati
                                                                con isole CpG metilate
   Struttura chiusa della cromatina
      non accessibile ai fattori di
              trascrizione


martedì 27 novembre 2012
Weaver et al., 2004
 Topi meno sensibili allo stress                           Topi più sensibili allo stress
 durante la vita adulta                                    durante la vita adulta
 Minore produzione di                                      Maggiore produzione di
 corticosterone                                            corticosterone
 Più recettori per ormoni steroidei                        Meno recettori per ormoni
 nell’ippocampo                                            steroidei nell’ippocampo
 Metilato ngf1-a che dovrebbe                              Non metilato ngf1-a che trascrive
 trascrivere gr                                            gr

                                      Edelmann et al., 2011
                           La madre si mostra più amorosa verso i maschi
   I maschi mostrano maggiore metilazione al promotore di ERα più metilato rispetto alle
   femmine
                               Studio condotto sull’amigdala
martedì 27 novembre 2012
McGowan et al., 2009
   Esaminato lo stato di metilazione del gene NR3C1 che codifica
                                 per
          il recettore del glucocorticoide nell’ippocampo

             1) Gruppo di suicidi che subito abusi durante l’età
             infantile
             2) Gruppo di suicidi che non hanno subito abusi in
             età infantile
             3) Gruppo di controllo composto da soggetti morti
             improvvisamente

      Il gruppo 1 ha livelli minori di recettore per il glucocorticoide
         perché il gene presenta un maggiore livello di metilazione



martedì 27 novembre 2012
metiltransferasi
    Metilazione della citosina



                           Demetilazione della citosina




                                                                  Appaiamento
                                                                con il filamento
                                                           del cromosoma omologo
                                                          sintesi del nuovo filamento




                              Mutazioni puntiformi alla successiva replicazione




martedì 27 novembre 2012
Cyp21
                                   Cyp21




martedì 27 novembre 2012
corticosterone
                                                             Aldosterone
                           colesterolo Cyp21                  (catabolici)

                                    poco attiva
                                                          ormoni sessuali
                                                            (anabolici)

   Alcuni antigeni Cyp21 - sono presentati dalla proteine MHC (DRB1) con
   carica +
                                Ambiente stressante
                                  infiammazione
   selezione delle cellule surrenali che esprimono quantità maggiori di Cyp 21

    attecchiscono gli embrioni che producono più Cyp 21 per cause
    genetiche o epigenetiche
        Molti nuovi nati ora sono “catabolici” e adattati ad un ambiente più
        stressante

                                 Seconda generazione…
           molte madri “cataboliche” riconoscono gli antigeni Cyp 21 come “self”
                 selezionano embrioni con minore produzione di Cyp 21


martedì 27 novembre 2012
martedì 27 novembre 2012
100,00

                          100,00




                                                                                                                         75,00
                           75,00




                                                                                              % of neutral (0) charge
% of neutral (0) charge




                                                                                                                         50,00
                           50,00
                                                                   f




                           25,00                                                                                         25,00




                              0
                                                                                                                            0
                                   0           17,50         35,00            52,50   70,00                                      -70,00   -52,50         -35,00          -17,50   0
                                                        latitude in degrees                                                                        latitude in degrees




A                                                                                                                   B


                                       Figure 1. A. Neutral charge distribution in the North hemisphere of the planet.
                                       The percentage of aminoacid combinations displaying the neutral (0) total electric charge at the
                                       position 70, 71 and 74 of DRB1 primary sequence is plotted
                                       against the latitude of each human population examined. An increased linear trend from the North
                                       Polus to the Equator is drawn (R2=0.0456).
                                       B. Neutral charge distribution in the South hemisphere of the planet.
                                       The percentage of aminoacid combinations displaying the neutral (0) total electric charge at the
                                       position 70, 71 and 74 of DRB1 primary sequence is plotted
                                       against the latitude of each human population examined. A decreased linear trend from the Equator
                                       to the South Pole is drawn (R2=0.0309).

                          martedì 27 novembre 2012
100,00
                                100,00




                                                                                                                                      75,00
                                 75,00
% of charged (+/-) aminoacids




                                                                                                     % of charged (+/-) aminoacids
                                 50,00                                                                                                50,00




                                 25,00
                                                                                                                                      25,00




                                    0
                                                                                                                                         0
                                         0      17,50            35,00               52,50   70,00
                                                                                                                                              -70,00   -52,50         -35,00          -17,50   0
                                                           latitude in degrees
                                                                                                                                                                latitude in degrees




                                   A                                                                                                 B


                                    Figure 2. A. Charged (+/-) aminoacids distribution in the North hemisphere of the planet.
                                    The percentage of aminoacid combinations displaying a total positive or negative electric charge (+/-) at
                                    the position 70, 71 and 74 of DRB1 primary sequence is plotted against the latitude of each human
                                    population examined. A decreased linear trend from the North Pole to the Equator is drawn (R2=0.0442).
                                    B. Charged (+/-) aminoacids distribution in the South hemisphere of the planet.
                                    The percentage of aminoacid combinations displaying a total positive or negative electric charge (+/-) at
                                    the position 70, 71 and 74 of DRB1 primary sequence is plotted against the latitude of each human
                                    population examined. An increased linear trend from the Equator to the South Pole is drawn (R2=0.0348).


                                                                                 341 popolazioni umane nei due emisferi del globo


                                martedì 27 novembre 2012
Bibliografia

  Damiani G and Della Franca P.
  Lo Yin e lo Yan dell’evoluzione biologica. 2007.

  Edelmann ME and Auger PA.
  Epigenetic impact of simulated maternal grooming on estrogen receptor alpha
  within the developing amygdala. Brain Behav Immun. 2011 Oct;25(7):1299-1304.

  Fritz EL, Papavasiliou N.
  Cytidine deaminases: AIDing DNA demethylation? Genes Dev. 2010 24:2107-2114.

  McGowan P, Sasaki A, D’Alessio AC, Dymov S, Benoit L, Szyf M, Tureki G, and Meaney M.
  Epigenetic regulation of the glucocorticoid receptor in human brain associates with
  childhood abuse.
  Nat. Neurosc. 2009 Mar;12(3):342-348.
  Miller G.
  The seductive allure of behavioral epigenetics. Science 2010 Jul;329:24-26.
  Shapiro JA.
  Mobile DNA and evolution in the 21° century. Mobile DNA 2010 1:4.

  Tsankova N, Renthal W, Kumar A, and Nestler E.
  Epigenetic regulation in psychiatric disorders. Nat. Neurosci. 2007 May;8:355-367.

  Weaver IC, Cervoni N, Champagne FA, D’Alessio AC, Sharma S, Seckl JR, Dymov S, Szyf M,
  Meaney MJ.
  Epigenetic reprogramming by maternal behavior. Nat Neurosc. 2004 Aug;7(8):847-54.
martedì 27 novembre 2012
Champagne 2006



      Topi femmine allevate da madri amorose diventano anch’esse madri
      amorose



      Chi è allevato da madri fredde ha metilato un gene per il recettore degli
      estrogeni in ipotalamo
      Regione coinvolta nel comportamento riproduttivo



      Questo recettore se espresso amplifica il segnale dell’ossitocina che
      promuove il legame madre-figlio




martedì 27 novembre 2012

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  • 1. Epigenetics psiconeuroendocrinology and lamarckian-like evolution Elena Sbalchiero, phD Ozzano dell’Emilia (BO) 13-14 ottobre 2012 martedì 27 novembre 2012
  • 2. “I have hitherto sometimes spoken as if the variation were due to chance. This, of course, is a wholly incorrect expression, but it serves to acknowledge plainly our ignorance of the cause of each particular variation. [The facts] lead to the conclusion that variability is generally related to the conditions of life to which each species has been exposed during several successive generations”. From “The Origin of Species” martedì 27 novembre 2012
  • 3. FATTORI AMBIENTALI Dal genotipo… al fenotipo enzimi che modificano la cromatina caratterizzano l’ambiente epigenetico DNA Istoni Fattori di trascrizione metaboloma Somatica cambiamenti fenotipici trascrittoma Long ncRNA Enzimi metabolici mRNA Espressione genica microRNA tRNA siRNA rRNA piRNA Linea germinale cambiamenti trans proteoma generazionali martedì 27 novembre 2012
  • 4. cromosoma Struttura aperta della cromatina cromatina accessibile ai fattori di trascrizione mRNA RNA polimerasi II DNA con isole CpG demetilate Istoni acetilati metiltransferasi DNA Istoni deacetilati con isole CpG metilate Struttura chiusa della cromatina non accessibile ai fattori di trascrizione martedì 27 novembre 2012
  • 5. Weaver et al., 2004 Topi meno sensibili allo stress Topi più sensibili allo stress durante la vita adulta durante la vita adulta Minore produzione di Maggiore produzione di corticosterone corticosterone Più recettori per ormoni steroidei Meno recettori per ormoni nell’ippocampo steroidei nell’ippocampo Metilato ngf1-a che dovrebbe Non metilato ngf1-a che trascrive trascrivere gr gr Edelmann et al., 2011 La madre si mostra più amorosa verso i maschi I maschi mostrano maggiore metilazione al promotore di ERα più metilato rispetto alle femmine Studio condotto sull’amigdala martedì 27 novembre 2012
  • 6. McGowan et al., 2009 Esaminato lo stato di metilazione del gene NR3C1 che codifica per il recettore del glucocorticoide nell’ippocampo 1) Gruppo di suicidi che subito abusi durante l’età infantile 2) Gruppo di suicidi che non hanno subito abusi in età infantile 3) Gruppo di controllo composto da soggetti morti improvvisamente Il gruppo 1 ha livelli minori di recettore per il glucocorticoide perché il gene presenta un maggiore livello di metilazione martedì 27 novembre 2012
  • 7. metiltransferasi Metilazione della citosina Demetilazione della citosina Appaiamento con il filamento del cromosoma omologo sintesi del nuovo filamento Mutazioni puntiformi alla successiva replicazione martedì 27 novembre 2012
  • 8. Cyp21 Cyp21 martedì 27 novembre 2012
  • 9. corticosterone Aldosterone colesterolo Cyp21 (catabolici) poco attiva ormoni sessuali (anabolici) Alcuni antigeni Cyp21 - sono presentati dalla proteine MHC (DRB1) con carica + Ambiente stressante infiammazione selezione delle cellule surrenali che esprimono quantità maggiori di Cyp 21 attecchiscono gli embrioni che producono più Cyp 21 per cause genetiche o epigenetiche Molti nuovi nati ora sono “catabolici” e adattati ad un ambiente più stressante Seconda generazione… molte madri “cataboliche” riconoscono gli antigeni Cyp 21 come “self” selezionano embrioni con minore produzione di Cyp 21 martedì 27 novembre 2012
  • 11. 100,00 100,00 75,00 75,00 % of neutral (0) charge % of neutral (0) charge 50,00 50,00 f 25,00 25,00 0 0 0 17,50 35,00 52,50 70,00 -70,00 -52,50 -35,00 -17,50 0 latitude in degrees latitude in degrees A B Figure 1. A. Neutral charge distribution in the North hemisphere of the planet. The percentage of aminoacid combinations displaying the neutral (0) total electric charge at the position 70, 71 and 74 of DRB1 primary sequence is plotted against the latitude of each human population examined. An increased linear trend from the North Polus to the Equator is drawn (R2=0.0456). B. Neutral charge distribution in the South hemisphere of the planet. The percentage of aminoacid combinations displaying the neutral (0) total electric charge at the position 70, 71 and 74 of DRB1 primary sequence is plotted against the latitude of each human population examined. A decreased linear trend from the Equator to the South Pole is drawn (R2=0.0309). martedì 27 novembre 2012
  • 12. 100,00 100,00 75,00 75,00 % of charged (+/-) aminoacids % of charged (+/-) aminoacids 50,00 50,00 25,00 25,00 0 0 0 17,50 35,00 52,50 70,00 -70,00 -52,50 -35,00 -17,50 0 latitude in degrees latitude in degrees A B Figure 2. A. Charged (+/-) aminoacids distribution in the North hemisphere of the planet. The percentage of aminoacid combinations displaying a total positive or negative electric charge (+/-) at the position 70, 71 and 74 of DRB1 primary sequence is plotted against the latitude of each human population examined. A decreased linear trend from the North Pole to the Equator is drawn (R2=0.0442). B. Charged (+/-) aminoacids distribution in the South hemisphere of the planet. The percentage of aminoacid combinations displaying a total positive or negative electric charge (+/-) at the position 70, 71 and 74 of DRB1 primary sequence is plotted against the latitude of each human population examined. An increased linear trend from the Equator to the South Pole is drawn (R2=0.0348). 341 popolazioni umane nei due emisferi del globo martedì 27 novembre 2012
  • 13. Bibliografia Damiani G and Della Franca P. Lo Yin e lo Yan dell’evoluzione biologica. 2007. Edelmann ME and Auger PA. Epigenetic impact of simulated maternal grooming on estrogen receptor alpha within the developing amygdala. Brain Behav Immun. 2011 Oct;25(7):1299-1304. Fritz EL, Papavasiliou N. Cytidine deaminases: AIDing DNA demethylation? Genes Dev. 2010 24:2107-2114. McGowan P, Sasaki A, D’Alessio AC, Dymov S, Benoit L, Szyf M, Tureki G, and Meaney M. Epigenetic regulation of the glucocorticoid receptor in human brain associates with childhood abuse. Nat. Neurosc. 2009 Mar;12(3):342-348. Miller G. The seductive allure of behavioral epigenetics. Science 2010 Jul;329:24-26. Shapiro JA. Mobile DNA and evolution in the 21° century. Mobile DNA 2010 1:4. Tsankova N, Renthal W, Kumar A, and Nestler E. Epigenetic regulation in psychiatric disorders. Nat. Neurosci. 2007 May;8:355-367. Weaver IC, Cervoni N, Champagne FA, D’Alessio AC, Sharma S, Seckl JR, Dymov S, Szyf M, Meaney MJ. Epigenetic reprogramming by maternal behavior. Nat Neurosc. 2004 Aug;7(8):847-54. martedì 27 novembre 2012
  • 14. Champagne 2006 Topi femmine allevate da madri amorose diventano anch’esse madri amorose Chi è allevato da madri fredde ha metilato un gene per il recettore degli estrogeni in ipotalamo Regione coinvolta nel comportamento riproduttivo Questo recettore se espresso amplifica il segnale dell’ossitocina che promuove il legame madre-figlio martedì 27 novembre 2012