Currículo do Sistema Lattes de Luiz Carlos Júnior Alcântara

16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara)
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 1/47
Endereço Profissional Fundação Oswaldo Cruz, Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz BA, Laboratório
Avançado de Saúde Pública.
Rua Waldemar Falcão, 121
Candeal
40295001 Salvador, BA Brasil
Telefone: (71) 31762255
Fax: (71) 31762300
URL da Homepage: http://www.bahia.fiocruz.br
1998 2002 Doutorado em Biologia Celular e Molecular (Conceito CAPES 7).
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
Título: Estudo do polimorfismo genético dos vírus linfotrópicos de células T
humanas do tipo 1 e 2 (HTLV1 e HTLV2) em Salvador, Bahia, Brasil e em
tribos indígenas brasileiras, Ano de obtenção: 2002.
Orientador: Bernardo Galvão Castro Filho.
Nome Luiz Carlos Júnior Alcântara
Nome em citações bibliográficas ALCANTARA, L. C. J.;Alcantara, Luiz Carlos Junior;Alcantara, Luiz Carlos
Júnior;Junior Alcântara, Luiz Carlos;Alcântara, Luiz C.J.;Alcantara, Luiz
C.J.;Alcantara, Luiz Carlos;Alcantara, Luiz Carlos J.;Alcantara, Luiz C.
J.;Alcantara, Luis;ALCANTARA, LUIZ C J;ALCANTARA, LC
Junior;ALCANTARA;ALCANTARA, LC;ALCANTARA, L. C.;LUIZ CARLOS JÚNIOR,
ALCÂNTARA
Luiz Carlos Júnior Alcântara
Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq Nível 2
Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/7428560072021675
Última atualização do currículo em 10/11/2014
Pesquisador Titular do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia Computacional (LHGB)
do Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz (CPqGM) da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) em
Salvador, Bahia, Brasil. Professor Visitante bolsista da Bioquímica e Bioinformática da Universidade
Estadual de Feira de Santana (UEFS). Possui graduação em Farmácia pela Universidade Federal de
Ouro Preto (1992), mestrado em Bioquímica pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da
Universidade de São Paulo (1994) e doutorado em Biologia Celular e Molecular pela Fundação
Oswaldo Cruz (2002). Possui também 2 pósdoutorados, sendo o último realizado no Instituto
Nacional do Cancer, no Instituto Nacional de Saúde dos EUA. Tem experiência na área de Biologia
Molecular e Bioinformática dos Retrovírus Humanos (HIV e HTLV), atuando principalmente nos
seguintes temas: Epidemiologia molecular e evolução dos retrovírus humanos, Polimorfismos nos
genes dos hospedeiros dos retrovírus humanos, Correlações clínicoepidemiológicas nas
retroviroses humanas, Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática para estudo dos
genes dos retrovírus humanos/hospedeiros. Atua também como vice coordenador do curso de Pós
Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM/FIOCRUZ. É professor
do quadro permanente deste curso, bem como do curso de Pós Graduação em Patologia Humana e
Experimental da FIOCRUZ/UFBA. PESQUISADOR EM PRODUTIVIDADE E PESQUISA DO CNPQ
NÍVEL 2 (Texto informado pelo autor)
Identificação
Endereço
Formação acadêmica/titulação

Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e
Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia
Celular e Molecular / Especialidade: Biologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética
Molecular e de Microorganismos / Especialidade: Epidemiologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética
Molecular e de Microorganismos.
1992 1994 Mestrado em Bioquímica.
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.
Título: Expressão em E. coli, purificação e caracterização parcial do domínio
ligante de calmodulina da miosinaV de cérebro de galinha,Ano de Obtenção:
1996.
Orientador: Roy Edward Larson.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível
Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia
Molecular / Especialidade: Bioquímica.
1987 1992 Graduação em Farmácia.
Universidade Federal de Ouro Preto, UFOP, Brasil.
1983 1985 Curso técnico/profissionalizante em Contabilidade.
Escola Estadual Maurício Augusto Azevedo.
2009 2011 PósDoutorado.
Vaccine Branch/National Cancer Institute/National Institutes of Health.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica
dos Microorganismos / Especialidade: Vacina.
Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz/Fundação Oswaldo Cruz /BA, FIOCRUZ,
Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia, FAPESB,
Brasil.
Nelson Mandela Medical School Durban,NMMS,África do Sul.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia, FAPESB,
Brasil.
Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea:
Epidemiologia / Especialidade: Filogenia dos Retrovírus Humanos.
2006 2006 Estagio:Desenvolver software HTLV Subtyping Tool. (Carga horária: 160h).
University of Oxford.
2005 2005 Estágio:aperfeiçoamento no Banco de dados HIVBase. (Carga horária: 96h).
Universidade da FlóridaGainesvilleFlórida.
2002 2002 Estágio: epidemiologia molecular do HTLV na África. (Carga horária: 720h).
Nelson Mandela Medical SchoolDurban.
2000 2000 Estágio:Ferramentas de bioinformática em virologia. (Carga horária: 240h).
Rega Institut Universidade Católica de Leuven.
Vínculo institucional
2013 Atual Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor e
Pósdoutorado
Formação Complementar
Atuação Profissional
Universidade Estadual de Feira de Santana, UEFS, Brasil.

Atividades
03/2006 Atual Direção e administração, Fundação Oswaldo Cruz/CPqGM, .
Cargo ou função
Pesquisador do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia
Computacional.
03/2005 Atual Ensino, Patologia Experimental, Nível: PósGraduação
Disciplinas ministradas
Bioinformática na Biologia Molecular
01/2004 Atual Treinamentos ministrados , Laboratório Avançado de Saúde Pública BA
Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz, .
Treinamentos ministrados
Estudos Avançados em Bioinformática e Análises Evolutivas Virais (14 a 19 de
Junho/2004)
Segundo Workshop Brasileiro em Evolução Viral e Epidemiologia Molecular
(HIV e HTLV) (08 a 13 de novembro/2004)
Treinamento para a Utilização da Database HIVBase (15 a 18 de
novembro/2005)
01/2004 Atual Outras atividades técnicocientíficas , Laboratório Avançado de Saúde
Pública BA Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz, .
Atividade realizada
Implantação e Coordenação do Laboratório de Bioinformática do
LASP/CPqGM/FIOCRUZ.
4/2002 Atual Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Avançado de Saúde Pública, .
Linhas de pesquisa
Bioinformática
Epidemiologia Molecular de Retrovirus Humano (HTLV1 e HIV1)
Alterações Genéticas dos Hospedeiros do HIV1 e do HTLV1
Pesquisador, Carga horária: 20
Outras informações Professor e Tutor de Bioquímica e Bioinformática (cursos de Farmácia e
Medicina)
2009 2011 Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Posdoctoral Fellow, Carga
horária: 40
2008 Atual Vínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisador Titular, Carga horária: 40
Outras informações Pesquisador ViceChefe do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia
Computacional (LHGB) do CPqGM/FIOCRUZ
2002 2007 Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40
Outras informações Atua como pesquisador em Biologia molecular, Bioquímica, Epidemiologia
molecular e Bioinformática aplicada aos retrovírus humanos (HIV1, HTLV1,
HTLV2). Atua também como professor/orientador colaborador no Curso de
PósGraduação Strictu Senso em Biotecologia em Saúde e Medicina
Investigativa.
2002 2007 Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto,
Carga horária: 20
National Institute Of Health, NIH, Estados Unidos.
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
Laboratório Avançado de Saúde PúblicaCentro de Pesq. Gonçalo Moniz FIOCRUZ, LASP,
Brasil.
Faculdade de Tecnologia e Ciências, FTC, Brasil.

Atividades
2/2002 7/2007 Ensino, Farmacia, Nível: Graduação
Bioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, Bioquímica Clínica e Bioinformática
Atividades
01/2002 1/2013 Ensino, Medicina, Nível: Graduação
Bioinformática
Bioquímica
01/2002 1/2013 Ensino, Medicina e saúde humana, Nível: PósGraduação
Seminários em retrovirologia
Outras informações Professor de Bioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, bioquímica Clínica e
Bioinformática no Curso de Farmácia.
2000 2013 Vínculo: Professor, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga
horária: 40
Outras informações Atuou como professor nas disciplinas, Bioquímica Básica, Bioquímica
Metabólica, Bioinformática, Seminários Interdisciplinares, Bioquímica Médica
e Biofunção 1 nos cursos de Odontologia, Biomedicina e Medicina, nos
sistemas de ensino clássico e PBL. Atuou também como orientador
colaborador do curso de pósgraduação strictu senso em Medicina e Saúde
Humana.
1994 1995 Vínculo: Empregatício, Enquadramento Funcional: Farmacêutico Hospitalar do
Hospital do Aparel, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações Trabalhou durante os seis primeiros meses no Hospital do Aparelho
Locomotor Sarah em Brasília e posteriormente foi transferido para a filial de
SalvadorBahia
Atividades
9/1994 12/1995 Direção e administração, Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de
Salvador, Lider do Serviço de Farmácia Hospitalar.
Cargo ou função
Lider do Setor de Farmácia Hospitalar e Clínica.
9/1994 12/1995 Serviços técnicos especializados , Rede Sarah de Hospitais do Aparelho
Locomotor de Salvador, Setor de Farmácia Hospitalar.
Serviço realizado
Implantação do Serviço de Farmácia Hospitalar e Farmácia Clínica.
9/1994 12/1995 Conselhos, Comissões e Consultoria, Rede Sarah de Hospitais do Aparelho
Locomotor de Salvador, Laboratório de Análises Clínicas do Hospital Sarah
Salvador.
Cargo ou função
Membro da Comissão de Controle das Infecções Hospitalares.
1/1995 3/1995 Treinamentos ministrados , Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor
de Salvador, Enfermarias do Hospital Sarah Salvador.
Treinamentos ministrados
Treinamento ao Corpo de Enfermagem e Médico sobre a Biologia Molecular,
Imunologia e Patogenia do HTLVI; Treinamento em Prevenção das interações
Medicamentosas no Hospital.
1. Bioinformática
Objetivo: Estudar a evolução dos retrovírus humanos (HIV1 e HTLV1):
Escola Baiana de Medicina e Saúde Pública, EBMSP, Brasil.
Associação das Pioneiras Sociais, APS, Brasil.
Linhas de pesquisa

utilizando técnicas de biologia molecular, bioquímica e bioinformática;
Desenvolver programas de bioinformática dando suporte aos estudos das
infecções virais. .
2. Epidemiologia Molecular de Retrovirus Humano (HTLV1 e HIV1)
Objetivo: Monitorar a infecção do HIV e do HTLV1 nos estudos sobre
polimorfismo viral e do hospedeiro, infecção recente, resistência aos
antirretrovirais e transmissão maternofetal; 2) Desenvolver projetos de
vacinas antiHIV1 e antiHTLV1; 3) Elaborar um algoritmo de resgate
terapêutico para subsidiar a terapia antirretroviral a ser estabelecida nos
serviços clínicos do SUS..
3. Alterações Genéticas dos Hospedeiros do HIV1 e do HTLV1
Objetivo: Monitoramento da infecção do HIV e do HTLV1 nos estudos sobre
polimorfismo viral e do hospedeiro, infecção recente, resistência aos
antirretrovirais e transmissão maternofetal; Desenvolvimento de vacinas
antiHIV1 e antiHTLV1; 3) Eelaboração de um algoritmo de resgate
terapêutico para subsidiar a terapia antirretroviral a ser estabelecida nos
serviços clínicos do SUS..
2014 2014 2o Workshop Internacional de Bioinformática sobre Evolução Viral e
Epidemiologia Molecular 2014
Descrição: A Filogenia molecular e genética populacional são técnicas
estabelecidas com importância para a compreensão de epidemias e dinâmicas
virais. Por exemplo, a análise filogenética tem sido utilizada até o momento
para explicar a origem do HIV1 e HIV2 e suas epidemias em humanos, para
estudar a epidemiologia molecular da gripe em aves selvagens e suas
conexões com pandemias humanas, assim como estudar a epidemiologia
molecular de muitos outros vírus. Muitos dos trabalhos envolvendo estas
técnicas estão sendo publicados em revistas internacionais de alto impacto.
Novos métodos de mineração de dados estão se tornando cada vez mais
importantes para organizar e explorar a enorme quantidade de dados de
sequências de vírus que foi gerado nos últimos anos. Por exemplo, a
mineração de dados é extremamente importante para o estudo das respostas
às terapias antivirais. Além disso, a combinação da mineração de dados com
análises filogenéticas permitem uma melhor compreensão do comportamento
dos diversos vírus. A utilização destes métodos já foi aplicada ao estudo de
mutações de resistência às drogas e tais técnicas podem ser aplicadas a
muitos outros campos de pesquisa de vírus. 2. Detalhes sobre o Workshop O
Workshop Internacional sobre a utilização da Bioinformática para estudos de
Evolução e Epidemiologia Molecular dos vírus foi organizado nos últimos 17
anos pela Profa. AnneMieke Vandamme, do Laboratório de Virologia Clínica e
Epidemiologia da Katholieke Universiteit Leuven (Rega Institut), Bélgica, e
desde 2003 viaja ao redor do globo
(http://regaweb.med.kuleuven.be/workshop). Este workshop está dividido em
três módulos: Básico, análises filogenéticas avançadas e Mineração de Dados.
Os módulos serão realizados simultaneamente e os alunos (máximo de 20 por
módulo) só poderão candidatarse a um dos módulos. Todos os módulos
conterão aulas teóricas e práticas (cerca de 50/50). Haverá também tempo
reservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão de
pôster, pa.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / AnneMieke
Vandamme Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e
Tecnológico Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de
Pessoal de Nível Superior Auxílio financeiro.
2014 Atual Desenvolvimento de ferramenta didática para avaliação de fatores de risco e
prevenção de agentes causadores de doenças sexualmente transmissíveis
(HIV1/HTLV1)
Descrição: EDITAL PPSUS: Este estudo objetiva desenvolver uma ferramenta
Projetos de pesquisa

web para avaliar a evolução do conhecimento de jovens e adolescentes
residentes em áreas de risco para as infecções causadas pelo HIV1 e HTLV1
na cidade. O estudo caracterizarseá por ser uma coorte de intervenção
prospectiva, composta por 25 educadores, que irão participar das etapas de
identificação dos fatores de risco e avaliação do nível de conhecimento acerca
da infecção pelo HIV/HTLV. A execução do mesmo se dará no Centro de
Pesquisas Gonçalo Moniz (CPqGM) da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) e na
sedes do projeto parceiro Adolescente Aprendiz, situadas nos bairros do Pau
Miúdo e Rio Vermelho. Este estudo trará como contribuição no
desenvolvimento de um banco de dados e de um algoritmo capaz de
contabilizar o número de acessos ao conteúdo disponibilizado pela
ferramenta; e a organização estatística das informações provenientes do
mesmo. Além disso, prevêse a elaboração de material lúdico/didático
(impressos e audiovisuais) a ser disponibilizado para ações de promoção da
saúde do Serviço Único de Saúde (SUS) e caracterização do nível de
conhecimento acerca da infecção por retrovírus humanos em áreas de risco.
Esperase também, propor novas medidas de promoção da saúde mais
específicas para jovens e adolescentes residentes nessas áreas.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Carlos Brites
Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo Integrante / Marilda Souza
Gonçalves Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxílio
financeiro.
2014 Atual INTERAÇÃO ENTRE OS PRODUTOS DAS ORFs I E IV DO HTLV1 COM AS
PROTEÍNAS DO CITOESQUELETO MIOSINA Va E PAXILINA RESPECTIVAMENTE
Descrição: Pela análise das estruturas primarias de p12I/p8I e da Paxilina,
hipotetizase que não há interação física entre elas, entretanto a presença de
regiões ricas em prolina em ambas as proteínas, e pelo fato da Paxilina ser
um dos componentes das adesões focais, sugere que elas participem do
complexo de polarização do citoesqueleto no momento do contato e
transmissão do HTLV1 célulacélula. Como a Paxilina está mais expressa em
indivíduos TSP/HAM, é possível que a expressão da proteína Tax, transativador
viral, interfira na expressão de Paxilina. Assim o estudo inicial da possível
interação entre essas proteínas é importante para melhor compreensão da
significância do aumento de expressão da Paxilina em indivíduos com
TSP/HAM. Por outro lado, acreditase que a miosina Va esteja envolvida no
tráfego de p8I partindo de Golgi até a membrana plasmática. Considerando
que p8I exerce importante função na transmissibilidade viral, participando
ativamente da sinapse virológica e da formação dos conduítes celulares, o
estudo das interações proteicas que contemplam o mecanismo de transporte
desta proteína, desde sua formação até seu sítio de atuação, pode
estabelecer um ponto inicial para a elucidação desta via, além de sugerir
possíveis alvos terapêuticos para redução da infectividade, e
transmissibilidade viral, e consequentemente, um controle da disseminação
do vírus nos indivíduos infectados. Assim, pretendemos avaliar a interação
entre os produtos das ORFs I e IV do HTLV1 com as proteínas do
citoesqueleto Paxilina e Miosina Va, respectivamente. .
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Simone Kashima
Integrante / Maria Fernanda CastroAmarante Integrante / Jaqueline Goes
de Jesus Integrante / Marilda Souza Gonçalves Integrante / Maria Enilza
Espreafico Integrante.
2013 2013 WORKSHOP INTERNACIONAL DE BIOINFORMÁTICA SOBRE EVOLUÇÃO VIRAL
E EPIDEMIOLOGIA
Descrição: O workshop está dividido em dois módulos: Análises Básicas de
Bioinformática, Análises filogenéticas Avançadas. Os módulos serão
realizados simultaneamente e os alunos (máximo de 25 por módulo) só
podem candidatarse a um dos módulos. Todos os módulos contem aulas
teóricas e práticas (cerca de 50 alunos num total). Possui também um tempo

reservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão de
pôster, para discutir e analisar os seus conjuntos de dados com os professores
e discutir possíveis colaborações entre os alunos e professores. O curso terá a
duração de cinco dias. Para nosso conhecimento, nenhum outro curso
semelhante é organizado mundialmente, contendo teoria e aplicações
práticas de técnicas de bioinformática, aplicados aos estudos de evolução
viral, e aberto a um fórum internacional de estudantes de mestrado e
doutorado, jovens pesquisadores, e até mesmo aos pesquisadores seniores.
Salientamos que não haverá custo de inscrição no Workshop, e das 50 vagas,
80% serão destinadas preferencialmente a brasileiros e as vagas restantes
para estrangeiros, tendo preferência inscritos da América Latina. Os alunos
que participam deste workshop são convidados a submeter um resumo, e
apresentam o seus trabalhos na forma de poster. Assim, estes alunos terão a
oportunidade de discutir o trabalho de pesquisa que eles apresentaram com
os professores e outros alunos. Depois da oficina, e tendo em consideração os
comentários e discussões recebidos no workshop sobre o seu trabalho, cada
aluno terá o seu resumo publicado na IGE (Infection, Genetics and Evolution,
uma revista do grupo Elsevier que tem a Dra. AnneMieke Vandamme no
Editorial Board) numa edição regular, mas inteiramente dedicado ao
Workshop, e também terá um tempo para melhorar a qualidade do seu
trabalho, sendo então convidado a submeter um artigo, a esta mesma revista
científica, que sempre publicou (dos workshops anteriores) e os trabalhos dos
alunos apresentados na forma de poster durante o works.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / AnneMieke
Vandamme Integrante / Tulio de Oliveira Integrante / Joana Paixão
Monteiro Cunha Integrante / Paula Carvalhal Lage von B. Ristow
Integrante.
Tecnológico Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado
da Bahia Auxílio financeiro.
2013 Atual The tale of two interlinked epidemics: The origin and clinical relationship of
the African and Brazilian HIV1 and HTLV1 epidemics
Descrição: This project will use genomics and bioinformatics to further study
the origin of the Brazilian and South African Human Immunodeficiency virus
type 1 (HIV1) and Human Tcell lymphotropic virus type 1 (HTLV1). In
addition, it will study coinfected individuals, as there is growing evidence
that HIV1 and HTLV1 coinfection affects the course of the AIDS disease.
This project is built on a longstanding collaboration between two Brazilian
researchers, Dr. Luiz Carlos Junior Alcantara from F CPqGM/FIOCRUZ
Foundation and Dr. Tulio de Oliveira from the Africa Centre for Health and
Population Studies, Nelson Mandela School of Medicine. This partnership has
already given rise to a number of peerreviewed publications, the graduation
of postgraduate students and training workshops in Brazil. At present, the
two researchers are cosupervising a PhD student from Brazil. This project, if
funded, will allow this successful collaboration to continue and a Brazilian
researcher (Dr. Tulio de Oliveira) living outside the country to continue to
contribute to local research and the training of postgraduate students in
Brazil. Previous results of this collaboration: One of the reasons why we
believe that this exchange project will be successful is due to the previous
results that have been produced by this collaboration. The collaborators have
been working together since 2001. During this time, Dr. Tulio de Oliveira has
been based in Durban and Cape Town, South Africa and in Oxford, the U.K.,
whereas Dr. Luiz Carlos Alcantara has been based in Salvador, Brazil and in
Washington, the U.S.A. They have made many exchange visits. They have also
produced many collaborative publications on the study of the origin of the
HIV1 and HTLV1 epidemics in Brazil, which will be one of the topics to be
studied in this project. For example, they have shown that HTLV1 strains from
South Africa (sampled and produced during a visit by Dr. Alcantara to the Dr.
de Oliveira group in 2005) are directe.

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Tulio de Oliveira
Integrante / Rego, Filipe Ferreira de Almeida Integrante.
Tecnológico Auxílio financeiro.
2012 2014 Avaliação da história epidemiológica da infecção pelo HIV1 no estado da
Bahia Brasil
Descrição: Estudo de coorte transversal com amostragem de conveniência que
avaliará amostras sanguíneas de pacientes, no período de 1 de Março de 2012
à 31 de Setembro de 2012. A população do estudo será formado por pacientes
com idade igual ou superior à 18 anos, sororeagentes para HIV1 sem uso de
Terapia Antirretroviral (TARV), que após assinarem termo de consentimento
livre, respondam a questionário epidemiológico e permita a coleta de 10 ml
de sangue para o estudo. A amostra para o estudo será obtida durante coleta
sanguínea, no Laboratório de Retrovírus do Hospital Universitário Prof. Edgard
Santos e no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa,
para realização de carga viral do HIV ou estudo das subpopulações
linfocitárias. O questionário epidemiológico será preenchido pelo pesquisador
e equipe, esse o documento conterá informações sobre identificação, data de
nascimento, gênero, data do diagnóstico do HIV1, uso de TARV, provável
forma de aquisição, orientação sexual e discordância sorológico dos parceiros
atuais. Será descartado aleatoriamente 1 das amostras de pacientes com
concordância sorológica entre parceiros ou transmissão vertical. O projeto e o
termo de consentimento livre e esclarecido será submetido, previamente a
qualquer fase do estudo, ao Comitê de Ética em Pesquisa da Fundação
Gonçalo Muniz, do Hospital Universitário Prof. Edgard Santos e no Centro
Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa.A extração do DNA das
amostras usará o kit de extração QIAmp Blood Kit (Qiagen Inc., Valencia, CA,
USA) segundo protocolo do fabricante. Os genes pol e env serão amplificados
através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Os produtos das PCR
serão purificados e posteriormente sequenciados. Os objetivos são:
Caracterizar a epidemiologia molecular do HIV1 na Bahia através de estudos
evolutivos nos genótipos B, F e formas recombinantes BF, buscando inferir a
história evolutiva deste retrovírus na nossa população. Estimar a taxa
evolutiv.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrante / Genoveffa Franchini Integrante / Erika Andrade Integrante /
Marcio Oliveira Silva Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha Integrante.
2012 2013 Banco de Dados sobre o HTLV1/paciente infectado
Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Tulio de Oliveira
Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo Integrante / Antonio Eduardo de
AlbuquerqueJunior Integrante.
2012 Atual Implantação e Consolidação do Centro Integrado de Biodesenvolvimento da
Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública no Parque Tecnológico da Bahia
Descrição: Luiz Alcantara coordena um subprojeto, especificamente Utilização
do HTLV2 Pseudotipado como Vetor Vacinal contra a Infecção pelo HTLV1 .
O presente projeto faz parte do esforço da Secretaria de Ciência, Tecnologia
e Inovação do Estado da Bahia SECTI, através do Parque Tecnológico da
Bahia, para implantação dos Laboratórios Compartilhados dos Equipamentos
Dinamizadores, que serão consolidados na segunda etapa do Parque. Neste
esforço, composto por dez plataformas agregadas que integram parceiros
públicos e privados operando em conjunto, tem como objetivo comum o
fortalecimento da rede de pesquisa nas áreas de Biotecnologia e Saúde do
Estado..
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Maria Luisa Carvalho
Soliani Coordenador / Luiz Erlon Araujo Rodrigues Integrante.

2012 Atual Utilização do HTLV2 pseudotipado como vetor vacinal contra a infecção pelo
HTLV1
Descrição: O Vírus Linfotrópico de Células T Humanas do tipo 1 (HTLV1) é
conhecido por ser o agente etiológico de doenças de natureza neoplásica,
como a Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL) (Yoshida et al.,
1982). Além disso, a infecção pelo HTLV1 é endêmica em diferentes regiões
geográficas do mundo, sendo Salvador a cidade brasileira com a mais alta
prevalência entre a população geral, atingindo valores próximos a 1,8%
(Dourado et al., 2003). As glicoproteínas do envelope viral são reconhecidas
de maneira específica pelos receptores de linfócitos B (anticorpos de
membrana), por anticorpos neutralizantes e por receptores de células T (TCR)
de linfócitosT citotóxicos (CTL), o que proporciona posteriormente uma
resposta imune protetora. Estas glicoproteínas poderiam representar
importantes . Para explorar as propriedades imunológicas em potencial do
envelope viral como candidato à vacina, pretendemos utilizar as
glicoproteínas gp46 e gp21 do HTLV1, como um imunógeno. Há três anos
firmamos uma colaboração internacional com o grupo de vacinas do Instituto
Nacional do Câncer, do Instituto Nacional de Saúde do Governo dos EUA
(Vaccine Branch NCI/NIH), liderado pela Dra. Genoveffa Franchini, resultando
no desenvolvimento de um vetor vacinal antiHTLV1. Este vetor foi baseado
no HTLV2 atenuado, sendo desenhado por mim e construído pela GeneArt
(USA). Este vetor foi cedido pela Dra Franchini para o CPqGM/FIOCRUZ, para
montagem do vetor recombinante, ensaios in vitro e exvivo e testes
bioquímicos e imunológicos (a serem realizados no CPqGM/FIOCRUZ). Após
estes experimentos, os testes em modelo animal, utilizando coelhos serão
realizados utilizando coelhos e macacos no NCINIH. .
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1)
.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Genoveffa Franchini
Integrante / Maria Fernanda CastroAmarante Integrante / Fernanda
Khouri Barreto Integrante / Loianna Mascarenhas Integrante.
financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Auxílio financeiro.
2012 Atual Caracterização de genomas completos do vírus da Leucemia de células T do
adulto do tipo 1 (HTLV1) provenientes de pacientes com diferentes perfis
clínicos
Descrição: Embora o HTLV1 tenha sido convincentemente associado à
Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL), é observado que a grande
maioria dos indivíduos infectados permanece assintomática (9598%). Ainda
não se sabe por que isto ocorre, assim como não é conhecido os motivos pelos
quais alguns indivíduos desenvolvem algum tipo de doença, seja ela de
natureza neoplásica ou inflamatória, bem como os fatores que direcionam o
curso clínico ao longo da infecção. Acreditase que as diversas manifestações
clínicas possam ser influenciadas pelo tipo e magnitude da resposta imune do
hospedeiro para os antígenos do HTLV1, bem como pelo local ou órgão no
qual a reação inflamatória predominantemente acontece. Fatores
relacionados às variantes genéticas do vírus e fatores referentes ao
hospedeiro também têm sido sugeridos. Alguns trabalhos ainda apontam que
fatores ambientais, como idade, modo de transmissão e características
étnicas (Gadelha et al., 2005; Miller et al., 1994; Vine et al., 2002; Sabouri et
al., 2005) podem contribuir para a manifestação de doença em indivíduos
infectados. A análise de indivíduos, com diferentes status clínicos da doença,
porém apresentando níveis semelhantes de carga proviral, demonstrou que
células de pacientes assintomáticos produzem menores níveis das citocinas
inflamatórias: TNF (Fator de necrose tumoral ) e IFN (Interferon )
(Nishimura et al., 2000), sugerindo que esta baixa produção seria importante
para a manutenção do estado assintomático, e que outros fatores, além da
carga proviral, também devem influenciar a sintomatologia da infecção
(Furukawa et al, 2003). Visto isto, pretendemos estudar a diversidade
genética no genoma total do HTLV1 mais prevalente em cada grupo de
indivíduos infectados: 10 com TSP/HAM, ATLL, 10 com dermatite infecciosa,

10 com dermatite infecciosa e TSP/HAM e 10 assintomáticos. Todos os
indivíduos com idade superior a 45 anos e mediana da carga proviral de 1.500
copias/106 PBMC..
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Bernardo Galvao
Castro Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo Integrante / Marcio
Roberto T Nunes Integrante / Luis Felipe Ivanoff de Menezes Integrante.
2012 Atual IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR
SUPORTE AO CURSO DE PÓSGRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E
MEDICINA INTERNA DO CPQGM
Descrição: Bioinformática é a coleção, organização e análise de grandes
quantidades de dados biológicos utilizando uma rede de computadores e
bancos de dados. Implica na análise de seqüências de genes e seus produtos
(proteínas), mas o campo tem sido expandido para a gerência,
processamento, análise e visualização de grandes quantidades de dados
genômicos, proteômicos, triagem de drogas e química medicinal. Hoje a
bioinformática já é considerada uma ciência, que além de ser indispensável
ao melhor entendimento da genética, da bioquímica, da imunologia, da
biologia celular e molecular e das outras ciências, vem se tornando uma área
cada vez mais independente. Procuramos, com a implantação de um
laboratório de bioinformática, criar uma infraestrutura que permita ao aluno
de mestrado e doutorado, do curso de pósgraduação em Biotecnologia em
Saúde e Medicina Investigativa, ter a possibilidade de conhecer melhor esta
ciência, não só na disciplina Bioinformática, mas também nas outras
disciplinas, podendo também contar com a estrutura necessária para procurar
desenvolver ferramentas de bioinformática que lhes possam auxiliar em
responder questões importantes dos seus projetos. Será também possível,
ensinando uma bioinformática mais completa a estes estudantes, fornecer
recursos e o treinamento em banco de dados e programas relacionados à
estrutura macromolecular, permitindo a estes cientistas da área biológica o
acesso a esta rica fonte de informações, desenho de tutoriais, etc. .
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador.
financeiro.
2011 Atual Identificação de SNPs no genoma da Leptospira interrogans sorovar
Copenhageni e possível associados ao desfecho clínico e Síndrome
Hemorrágica Pulmonar
Descrição: O estudo molecular de sequências do genoma completo da L.
interrogans sorovar Copenhageni possibilita testar a hipótese de que
mutações estejam associadas a diferentes desfechos e fenótipos clínicos.
Além disso, é possível ainda identificar grupamentos filogenéticos de isolados
com características epidemiológicas, como tempo e espaço, que tenham
associação com um maior sucesso na transmissão de um determinado clone.
Objetivo: Identificar polimorfismos genéticos associados ao desfecho clínicos
da leptospirose e ao sucesso de transmissão em determinado tempo e espaço
.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Luciane Amorim
Santos Integrante / Albert Ko Integrante / Mitermayer Galvão dos Reis
Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha Integrante.
Financiador(es): National Institutes of Health Auxílio financeiro.
2010 2011 Identificação in silico de Retrovírus Endógenos Humanos usando a região LTR
de PTLV1, PTLV2 e PTLV3
Descrição: O HTLV1 foi o primeiro retrovírus humano descrito, seguido pelo
HTLV2 e HTLV3. Acreditase que HTLV1, HTLV2 e HTLV3 se originaram
independentemente e teriam emergido do contato entre humanos e primatas
nãohumanos infectados com STLV. Durante o ciclo de replicação desses
retrovírus pode ocorrer a formação de retroelementos, os elementos com

repetições terminais longas. Estimase que mais de 40% do genoma humano
seja composto de retroelementos, sendo 8% de elementos LTR. Sugerese
ainda que os HERVs estão no genoma humano por um período de
aproximadamente 30 milhões de anos, e alguns eventos de transposição
envolvendoos podem ter modificado a expressão gênica celular, conferindo
ao hospedeiro uma vantagem seletiva. Esse estudo tem como objetivo
identificar a presença de isolados de HTLV1, HTLV2, HTLV3, STLV1, STLV2
e STLV3 como retrovírus internos humanos.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Costa, Giselle
Calasans Souza Integrante / Fernanda Khouri Barreto Integrante /
Jaqueline Goes de Jesus Integrante / Aline Cristina Mota Miranda
Integrante.
2010 2011 ESTUDO DA DIVERSIDADE DO HIV1 NA BAHIA BUSCA E ANÁLISE DE NOVAS
FORMAS RECOMBINANTES CIRCULANTES (CRF) DO HIV
Descrição: Após quase três décadas do início da epidemia de AIDS, inúmeros
esforços vêm sendo feitos no combate ao HIV, porém até o momento não se
chegou à uma vacina capaz de prevenir a infecção ou medicamentos capazes
de eliminar o vírus. A intensa variabilidade genética do HIV1 refletese no
surgimento de isolados virais com comportamentos biológicos diversos e esta
característica representa o principal obstáculo para a eficiência do
funcionamento do sistema imune humano e para o desenvolvimento de
vacinas e terapias universais. Estudos anteriores realizados pelo nosso grupo
indicaram uma grande diversidade de genótipos de HIV1 na Bahia e a
prevalência de uma forma recombinante ainda não identificada, apresentando
o mesmo padrão genético, em cerca de 6% da população infectada. O
objetivo deste trabalho é investigar a existência de uma nova forma
recombinante circulante (CRF) do HIV1 na Bahia e a identificação de
propriedades moleculares relacionadas com a adaptação e dispersão destas
variantes. Para tanto, será realizado o seqüenciamento do genoma total de
isolados previamente caracterizados em dois genes virais: gag e env. Estas
seqüências de DNA serão então submetidas às análises filogenéticas e de
recombinação através de ferramentas de Bioinformática. Este estudo poderá
contribuir para o melhor entendimento a respeito das propriedades evolutivas
do HIV, para vigilância da epidemia local de AIDS e para a escolha adequada
de medidas de controle..
Castro Integrante / Luciane Amorim Santos Integrante / joana Paixão
Monteiro Integrante / Adriano Fernando Araujo Integrante.
2009 2014 O reverso genetico de pacientes infectados pelo HTLV1
Descrição: As proteinas da ORF1 do HTLV1 (p12 e p8) provenientes de 140
pacientes infectados pelo HTLV1 com diferentes status clinicos foram
analisadas quanto ao padrao mutagenico. As mutacoes estatisticamente
significantes quanto a carga proviral e status clinicos foram criadas in vitro
utilizando o vetor de expressao pMEp12p8. Estes vetores (mutantes e WT)
foram utilizados para transfeccao de celulas 293TN (ensaios de expressao) e
HeLa (ensaios de colocalizacao por microscopia confocal). Estas mutacoes
foram utilizadas para criacao de lentivirus mutantes para ensaios de
infectividade e modelo animal utilizando macaco Rhesus..
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Rego, Filipe
Ferreira de Almeida Integrante / Genoveffa Franchini Integrante / Maria
Fernanda CastroAmarante Integrante / Fernanda Khouri Integrante.
Financiador(es): National Institutes of Health Auxílio financeiro.
2009 2013 Soroprevalência e subtipagem do vírus linfotrópico de células T humanas
(HTLV) e avaliação da transmissão maternofetal em gestantes da região sul
da Bahia
Descrição: o projeto pretende: (1) conhecer a prevalência dos vírus HTLV e

CMV em gestantes na nossa região, a fim de conhecer o perfil da infecção
nessa população; (2) informar, conscientizar e alertar aos profissionais de
saúde sobre a importância da realização da pesquisa dos vírus nas gestantes;
(3) minimizar os riscos de infecção maternofetal, possibilitando que
intervenções e medidas de educação em saúde sejam implementadas; (4)
fornecer dados para elaborar projetos e políticas de saúde para essa
população vulnerável..
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo Galvao
Castro Integrante / Sandra Rocha Gadelha Coordenador / Filipe F A Rêgo
Integrante / Melo, Marco Antônio Gomes Integrante.
financeiro.
2009 Atual Desenvolvimento de vacina antiHIV1 utilizando modelo animal e vetor
contendo regioes LTR do HTLV1
Descrição: Os genes pol, gag e env do SIV1 foram inseridos no vetor pMA
contendo o gene GFP e as regioes 3' e 5' do HTLV1. A insercao foi realizada
de maneira que os gene da GFP ficou sobre controle do LTR 5' e os genes do
SIV sobre controle da regiao LTR 3' contendo o sinal de hipermetilacao. Este
vetor foi utilizado para transfeccao de celulas 293T, 293TN e HeLa. Foram
medidas a expressao de GFP, expressao dos produtos genicos gagpro e env
do SIV. Este vetor expressando porcoes conservadas de varios genes do SIV
HIV sera utilizado em testes utilizando modelo animal (SIVmac251 macaque
model)..
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) .
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Genoveffa Franchini
Coordenador.
Financiador(es): National Institute Of Health Outra.
2008 2013 Contribuição de polimorfismos nas proteínas gp46, gp21 e HBZ, para a
manifestação da HAM/TSP.
Descrição: Embora o HTLV1 tenha sido convincentemente associado a
doenças, a grande maioria dos indivíduos infectados permanece
assintomática (9598%). Ainda não se sabe por que isto ocorre, assim como,
não é conhecido o motivo pelo qual alguns indivíduos desenvolvem uma
síndrome neurológica, enquanto outros desenvolvem uma leucemia ou outras
patologias inflamatórias. Assim, as diversas manifestações clínicas podem
depender do tipo e magnitude da resposta imune do hospedeiro para os
antígenos do HTLV1, bem como do local ou órgão no qual a reação
inflamatória predominantemente acontece. A avaliação das proteínas gp46,
gp21 e HBZ, de isolados do HTLV1 provenientes de indivíduos com diversos
estados de sintomatologia, neste estudo, poderá contribuir para o
conhecimento da presença de polimorfismos nestas proteínas. Estas
investigações interhospedeiros permitirão avaliar a dinâmica das variantes
virais correlacionando com o perfil clínico de cada paciente. Além disso, ao
avaliar o mesmo indivíduo infectado, em diferentes tempos, é possível
analisar o movimento das cepas do HTLV1 e o curso da infecção, além de
estimar mudanças no tamanho da população viral efetiva, ao longo do tempo.
Também é possível obter um maior entendimento HTLV1 quando comparando
a dinâmica da evolução do vírus com os dados clínicos do paciente. Justifica
se assim, a análise de proteínas virais e o estudo filodinâmico do vírus para
contribuir para o melhor entendimento do HTLV1 e sua relação com as
manifestações clinicas e progressão do paciente..
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1)
.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Viviana Galazzi
Integrante / Rego, Filipe Ferreira de Almeida Integrante / Miranda, Aline
Cristina Andrade Mota Integrante / GalvaoCastro, Bernardo Integrante /
Fernanda Khouri Barreto Integrante.

2008 2012 Avaliação filodinâmica de isolados do HIV1 na transmissão maternofetal
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Marco Salemi
Integrante / Luciane Amorim Santos Integrante / Adriano Fernando Araujo
Integrante / Santos, Edson Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha
Integrante.
2008 2011 EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DO HTLV EM MULHERES PORTADORAS DE HIV1
E ANÁLISE DAS VARIAÇÕES GENÉTICAS DO HTLV1 EM DIFERENTES
COMPARTIMENTOS DO HOSPEDEIRO
Descrição: O HTLV1 é o agente etiológico da ATL, HAM/TSP e outras
perturbações inflamatórias. Alguns estudos tentam analisar as variações do
HTLV1 em diferentes fluidos corpóreos e seu impacto sobre a infecção pelo
HTLV. A coinfecção HTLV/HIV1 é associada com graves manifestações
clínicas, imunodeficiência marcante e infecções oportunistas, bem como
comportamento de risco. Salvador, capital do Estado da Bahia, Brasil, tem a
maior prevalência para o HTLV1 (1,74%) encontrada no país. Poucos estudos
descrevem esta coinfecção em Salvador e áreas vizinhas, e muito menos
investigam como estes vírus circulam ou avaliam a relação entre eles. Para
descrever a epidemiologia molecular do HTLV1 e as características da
coinfecção HTLV/HIV1 em mulheres, nós realizamos um corte transversal
envolvendo 107 mulheres infectadas com HIV1 do centro de referência da
DST/HIV/AIDS, localizado na cidade de Feira de Santana. Amostras das
pacientes foram testadas por ELISA e a infecção pelo HTLV confirmada
usando o WB e PCR. A análise filogenética foi realizada nas seqüências LTR
do HTLV para obter mais informações sobre a epidemiologia molecular e a
origem deste vírus na Bahia. Quatro das cinco amostras reativas no ELISA
foram confirmadas como HTLV1 no WB e PCR e uma amostra confirmada
como HTLV2. A soroprevalência da infecção pelo HTLV nestas mulheres foi de
4,7%, menor que o esperado, provavelmente pela baixa prevalência da
infecção pelo HTLV esta área ou devido a medidas de controle de DST/AIDS
implementadas desde a realização do estudo anterior. A análise filogenética
da região LTR das quatro seqüências do HTLV1 revelou que todos os isolados
foram classificados como subgrupo Transcontinental do subtipo Cosmopolita
e se agrupam no principal grupo latinoamericano, que possui um ancestral
comum com isolados da África do Sul, sugerindo uma introdução pós
Colombiana deste vírus na Bahia. A seqüência de HTLV2 foi classificada como
subtipo c, a variante brasileira do subtipo 2a. Também foi obs.
Castro Integrante / Filipe F A Rêgo Integrante / Vitor Uchoa Carvalho
Integrante / Liliane Lins Integrante.
financeiro.
2008 2009 Desenvolvimento de uma ferramenta de rastreamento de mutações em
árvores filogenéticas, para o estudo da evolução dos isolados do HIV1
Descrição: O projeto de pesquisa tem como objetivo o desenvolvimento de
uma nova ferramenta de bioinformática para auxiliar os pesquisadores e
clínicos nos projetos de pesquisa visando um melhor conhecimento das
seqüências dos isolados do HIV1, podendo ser estendida posteriormente
para o estudo das seqüências de outros patógenos de importância
epidemiológica no Brasil como o HTLV1, HCV, HBV, HPV, HHV8, vírus da
dengue, Leishmania, Tripanossoma, etc. A nova ferramenta permitirá, de uma
forma intuitiva e simples, rastrear mutações presentes nas seqüências destes
patógenos (inicialmente, do HIV1) representandoas graficamente nos
grupamentos monofiléticos das árvores filogenéticas, reconstruídas conforme
o protocolo de pesquisa do LASP. Cada mutação identificada nas seqüências
será avaliada quanto a sua relação com a resistência às drogas antiHIV/AIDS
e procurarseá na estrutura da árvore, quando esta mutação ocorreu, a partir
do processo de especiação. Desta forma os pesquisadores e clínicos poderão
responder várias questões importantes que não podem ser facilmente

inferidas com as ferramentas de bioinformática existentes, como por
exemplo: (a) Quais mutações são responsáveis pela diferenciação entre duas
seqüências ou entre um grupo delas, sejam de um mesmo cluster ou de
clusters diferentes; (b) Quais dessas mutações podem estar relacionadas com
resistência a antiretrovirais, e quando (onde) essas mutações apareceram;
(c) Quais dessas mutações induzem sítios de modificações póstraducionais,
principalmente glicosilação, fosforilação e miristilação; (d) Quais das
mutações presentes numa seqüência estão em sítios com pressão seletiva
positiva; (e) Se as mutações observadas na seqüência em estudo ocorreram
freqüentemente em outros clusters ou predominantemente apenas no seu
próprio cluster. Assim, esta ferramenta permitirá rastrear uma mutação de
interesse ao longo da árvore filogenética de forma gráfica interativa,
permitindo a extração de informações essenciais de forma r.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Castro Integrante / Diego Gervásio Frias Integrante.
2008 2009 Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática para seleção de
regiões protéicas potenciais, dos isolados brasileiros do HIV1, para dar
suporte aos projetos de desenvolvimento de protótipos vacinais vinculados ao
PNDST/AIDS, Ministério da Saúde
Descrição: Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática de fácil
manuseio, gerando novos dados sobre as nossas sequências do HIV1, e
treinamento dos investigadores que atuam na área de resistência do HIV1 às
drogas antiretrovirais e na pesquisa de vacinas contra HIV1/AIDS,
capacitandoos nos diversos aspectos teóricos e práticos de data
management e data mining das seqüências dos isolados brasileiros deste
retrovírus, bem como nos aspectos práticos de designer , armazenamento,
recuperação e análise dos dados genéticos, epidemiológicos e clínicos
provenientes dos bancos de dados locais e públicos.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Joana Paixão
Monteiro Cunha Integrante.
2007 2010 variabilidade genética dos isolados do HIV1 num grupo de mulheres e
crianças infectadas do Município de Feira de Santana/Bahia/ Brasil
Descrição: A intensa variabilidade genética do HIV1 ao longo do tempo exige
estudos para compreender a dinâmica do seu advento em determinada
comunidade, seu padrão de transmissão e evolução, que permitam
estabelecer uma estratégia eficaz de combate a tão sério problema de saúde
publica. No Brasil, os trabalhos com o genoma do HIV1 vêm sendo
desenvolvidos desde a década passada para mapear a sua epidemiologia
molecular, nas diversas regiões do país, constatando a maior prevalência do
subtipo B, do C, do F e dos recombinantes B/F e outros. Estudos mais recentes
na Bahia mostram um alto grau de diversidade genotípica neste Estado,
decorrente da circulação de diversas formas de recombinantes. Constatase
também uma elevada taxa de resistência aos antirretrovirais o que pode
facilitar a difusão destas cepas para outras localidades. A difusão do HIV1
para as cidades de médio e pequeno porte, o aumento da transmissão
heterossexual, afetando cada vez mais as mulheres mais jovens e pobres
justificaram este trabalho na cidade de Feira de Santana. Ela é a segunda
cidade mais importante do estado, abrangendo uma região de mais de
1.000.000 de habitantes. É um entroncamento de três grandes rodovias
federais, constituindose na porta de entrada de um grande fluxo migratório
de várias partes do país, tornandoa vulnerável a surtos de doenças
transmissíveis. Já foram registrados no Centro de Referência para DST/AIDS,
791 casos de pacientes soropositivos, sendo que 180 foram mulheres e 32
foram crianças. Não há relato de nenhum estudo sobre a diversidade genética
do HIV1 nesta população, porém os resultados oriundos da população de
Salvador podem refletir a realidade do Município de Feira de Santana, pois
este se localiza a 110 km de distância da capital. Assim, pretendemos com
este projeto: Verificar a freqüência e distribuição dos subtipos do HIV1, em

relação ao gene pol, na população estudada. Descrever a variabilidade
genética do gene pol dos novos isolados do HIV1 relacionada.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Luciane Amorim
Santos Integrante / Adriano Fernando Araujo Integrante / Santos, Edson de
Souza Integrante / Joana Paixão MonteiroCunha Integrante.
2007 2010 Utilização de códons pelos retrovírus humanos 'in silico"
Descrição: Desenvolver uma nova ferramenta para analisar o comportamento
dos diferentes transcritos dos genes do HIV1 e HTLV1, provenientes do
GenBank, em relação a utilização de códons e disponibilidade de tRNA da
célula hospedeira. Considerando que as informações sobre o codon usage e
número de cópias de genes para tRNA do Homo sapiens é conhecido, é
possível inferir sobre a dinâmica evolutiva intracelular do HIV1. Assim, estas
análises contribuirão para o melhor entendimento a respeito da dinâmica e da
adaptação viral.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Diego Gervásio
Frias Integrante / joana Paixão Monteiro Integrante.
2007 2009 Correlação entre Polimorfismos nas Regiões Promotora e Regulatórias do
Gene da GLUT1, Expressão e Exposição da Proteína na Membrana e o
Desenvolvimento de TSP/HAM em Indivíduos infectados pelo HTLV1
Descrição: A infecção pelo HTLV1 é endêmica em Salvador, onde a
prevalência é de 1,8%. O desenvolvimento de manifestações clínicas
associadas ao HTLV1, como a doença neurológica paraparesia espástica
tropical/mielopatia associada ao HTLV1 (TSP/HAM) ocorre em 24% da
população infectada e ainda não se sabe porque esta infecção permanece
assintomática na maioria dos portadores. Recentemente foi demonstrado que
a glicoproteína transportadora de glicose do tipo 1 (GLUT1) funciona como
receptor para a infecção do linfócitoT CD4+ e que sua expressão aumenta a
susceptibilidade ao HTLV1. Tem sido demonstrado que polimorfismos em um
único nucleotídeo (SNPs) nas regiões promotora e regulatórias do gene da
GLUT1 estão associados à susceptibilidade a nefropatia diabética em
diferentes populações. Estes polimorfismos poderiam influenciar a expressão
da proteína GLUT1 na membrana celular e, no caso da infecção pelo HTLV1,
poderiam facilitar a entrada do vírus na célula e a transmissão célulacélula
do mesmo, levando a um aumento na carga proviral e, posteriormente, ao
desenvolvimento de TSP/HAM. Entretanto, não existem estudos que avaliem a
associação entre os polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias do
gene da GLUT1 e a infecção pelo HTVL1. O objetivo deste projeto é verificar
possíveis correlações entre polimorfismos nas regiões promotora e
regulatórias do gene humano da GLUT1 com o desenvolvimento de TSP/HAM..
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Bernardo
GalvaoCastro Integrante / Sandra Rocha Gadelha Integrante / Gisele
Calazans Costa Integrante / Gabriel Muricy Integrante.
financeiro.
2006 2011 Perfil da Saúde Bucal em pacientes infectados pelo HTLV1: Análise clínica,
carga proviral e analise molecular do vírus na saliva.
Descrição: Este estudo objetiva descrever o perfil bucal de carreadores
assintomáticos do HTLV1 e pacientes infectados e com HAM/TSP, para
investigar a associação entre carga proviral na saliva e severidade de doença
periodontal. Também pretendemos analisar as variações intrahospedeiro, de
PBMCs e células na saliva destes indivíduos infectados..
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Simone Kashima

Integrante / Bernardo Galvao Castro Integrante / Rochele Azevedo
Integrante / Filipe F A Rêgo Integrante / Vitor Uchoa Carvalho Integrante /
Liliane Lins Integrante.
financeiro.
2006 2010 Analise dos polimorfismos genotípicos do HIV1 e estudo in silico de como
estas mutações podem interferir na maquinaria de tradução da célula
hospedeira
Descrição: A utilização do HMA como técnica de subtipagem tem sido eficaz
em áreas com índices elevados de infecção pelo HIV, pois além de ser rápida
é economicamente mais viável. Além disso, o estudo de duas regiões
genômicas, tais como env e gag tem auxiliado na identificação de formas
recombinantes64. Entretanto, dado o crescente numero de formas
recombinantes circulantes e únicas sendo reportadas no país, se faz
necessária uma reavaliação na eficiência deste método em detectar estas
variantes virais. Ainda que não seja completamente esclarecido que os vários
grupos, subtipos e CRFs de HIV1 tenham diferenças biológicas, ao menos no
que diz respeito à transmissibilidade e ao curso de progressão para AIDS,
tornase claro que o conhecimento da prevalência e das mudanças temporais
na incidência dessas variantes em diferentes áreas geográficas, seja
importante para auxiliar na avaliação da dinâmica de propagação da epidemia
na região, podendo também ser útil para o desenho de vacinas adaptadas
especificamente para variantes do HIV circulantes em cada área e na
atualização dos teste sorológicos de triagem. O alto polimorfismo do HIV
representa um dos principais obstáculos para o desenvolvimento de terapias e
vacinas antiHIV. O principal mecanismo de escape viral é a grande
quantidade de substituições sinônimas, quando comparadas com as
substituições nãosinônimas (pressão seletiva positiva), nos diferentes genes
do HIV1, contribuindo para a alta diversidade viral no
hospedeiro65Pretendemos assim, estimar a prevalência de subtipos genéticos
de HIV1 no estado da Bahia; investigar a existência de eventos de
recombinação entre isolados de HIV1 de diferentes subtipos com base na
caracterização dos genes gag e env e sua importância nesta população;
verificar a existência de possíveis associações entre os subtipos de HIV1 e
variáveis clínicas e sóciodemográficas; vvaliar a eficiência do Ensaio de
Mobilidade de Heteroduplexes (HMA) na determinação dos subtipos de HIV1
em compar.
Castro Coordenador / joana Paixão Monteiro Integrante.
financeiro.
2006 2010 DIVERSIDADE MOLECULAR DO VÍRUS DA IMUNODEFICIENCIA HUMANA TIPO
1 NO ESTADO DA BAHIA
Descrição: A análise de sequências genômicas é uma forma poderosa de se
estudar a diversidade do HIV1 e sua expansão nas populações, além de ser
crucial para dar suporte à vigilância epidemiológica e ao desenvolvimento de
terapias e vacinas eficazes. Neste estudo foram geradas sequências dos
genes gag e env de 61 pacientes infectados em Salvador e do pol de 58 em
Feira de Santana, Bahia, Brasil. A bioinformática foi utilizada para subtipar,
genotipar as mutações de resistência, determinar a pressão seletiva e
predizer o uso de coreceptor. Em Salvador, 92,6% das amostras foram do
subtipo B e 7,4% foram recombinantes BF1. Em Feira de Santana, 67,2%
foram do subtipo B, 6,9% F1, 1,7% C e 24,1% BF1. Onze (19,0%) destes
isolados apresentaram mutações de resistência. Pacientes infectados pelo B
tinham em média 0,4 mutações de resistência e nenhuma mutação deste tipo
foi observada em BF1. Com base na caracterização da alça V3 do B de 43
amostras de Salvador, foram encontradas 18,2% de variantes brasileiras (B
GWGR), 46,5% de GPGR e 34,9% de GXGX. O grupo de sequencias GPGR
mostrou passar por maior pressão seletiva. O tempo médio de diagnóstico
positivo foi de 13 anos para o B' e 9 anos para o B (GPGR + GXGX). Setenta e
seis por cento destes vírus fazem uso do coreceptor CCR5, enquanto 24%

foram classificados como capazes de usar o CXCR4. Encontramos uma
associação entre o B e um maior tempo desde o diagnóstico. As prevalências
de B' e de B/F1 em Salvador foram menores do que as encontradas em
estudos anteriores na Bahia e no Brasil, por outro lado, em Feira de Santana
foi encontrada uma alta prevalência de B/F1..
Integrante / Bernardo Galvao Castro Integrante / Luciane Amorim Santos
Integrante / joana Paixão Monteiro Integrante / Adriano Fernando Araujo
Integrante.
Financiador(es): Ministério da Saúde Auxílio financeiro.
2006 2009 Caracterização Étnica/geográfica da população de Salvador e de Portadores
do HIV1 e a Correlação entre o Índice de Ancestralidade Africana e
Vulnerabilidade ao HIV/AIDS
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Inês Dourado
Integrante / Bernardo Galvão Castro Filho Coordenador / Flora Maria
Fernandes Integrante / Angelina Xavier Acosta Integrante / Geraldo Argolo
Ferraro Integrante / Taís Bomfim Integrante / Kyoko Abe Sandes
Integrante.
2005 2007 Avaliação das alterações no metabolismo ósseo e mineral de indivíduos
portadores de retrovírus (HIV/HTLV) e correlações destas alterações com
polimorfismos no promotor de IL6 e nos níveis de osteocalcina
Descrição: Visa avaliar as alterações do metabolismo ósseo e mineral de
individuos portadores de retrovírus e correlações dessas alterações com
polimorfismos no promotor de IL6 e nos níveis de osteocalcina.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) .
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo Galvão
Castro Filho Coordenador / Sandra Rocha Gadelha Integrante.
financeiro.
2003 2006 ESTUDO DOS DETERMINANTES DE RISCO PARA INFECÇÃO PELO HTLV EM
DOADORES DE SANGUE DO ESTADO DA BAHIA E CARACTERIZAÇÃO
GENOTÍPICA DOS ISOLADOS VIRAIS
Descrição: Objetivo: Caracterizar epidemiologicamente a infecção pelo HTLV
em doadores de sangue do Estado da Bahia e analisar filogeneticamente os
isolados virais. Material e métodos: entre 01/2000 e 12/2003 foram
entrevistados 91 doadores infectados pelo HTLVI (casos) e 195 doadores não
infectados (controles), dos quais foram obtidas informações de ordem
demográfica, sócioeconômica, educacional, bem como relativas ao
comportamento sexual, através de um questionário padronizado aplicado por
um único entrevistador. Isolados virais de 25 doadores foram seqüenciados e
analisados filogeneticamente. Resultados: Na análise multivariada foram
identificados como fatores de risco independentes para infecção pelo HTLV
sexo feminino, baixa renda familiar, DST prévia, uso inconsistente de
preservativos e número de parceiros sexuais durante a vida. Observamos
diferenças significativas de comportamento sexual entre homens e mulheres
infectados. Todos os isolados virais analisados pertenciam ao subgrupo
transcontinental, subgrupo cosmopolita. Pela primeira vez foi observado um
isolado da África do Sul inserido no grupamento latinoamericano. Conclusão:
Os resultados deste estudo revelam uma associação entre baixo nível sócio
econômico e práticas sexuais não seguras e infecção pelo HTLV. A menor
prevalência observada confirma dados epidemiológicos recentes e pode ser
decorrente de uma melhor triagem clínica, da redução da prevalência de
infecção pelo HTLV na população geral, ou de um efeito dilucional no universo
de doadores ocasionado pela exclusão definitiva ao longo dos anos dos
doadores infectados. Os dados da comparação entre homens e mulheres

reforçam a tese de que a principal via de transmissão de HTLVI no nosso
meio seja a sexual. A análise filogenética demonstrou pela primeira vez que a
África do Sul pode ter contribuído na introdução do HTLVI no Brasil..
Castro Coordenador / Sergio Araujo Pereira Integrante / Artur Trancoso
Lopo Queiróz Integrante / Flora Maria Fernandes Integrante / Augusto
Cesar Andrade Mota Integrante.
financeiro.
2003 2005 Correlações dos Polimorfismos Genéticos do HTLVI/II e da Resposta Imune
do Hospedeiro com a Infecção e/ou Patogênese
Descrição: Avaliar o genoma do HTLV1 e do hospedeiro,bem como da
resposta imune,para melhor compreensão dos mecanismos biológicos
envolvidos na infecção e/ou patogenia viral.
Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Especialização: (1) / Mestrado
acadêmico: (5) .
Castro Coordenador / Angelina Xavier Acosta Integrante / Fernada Grazzi
Integrante.
Tecnológico Auxílio financeiro.
2002 2005 Correlações do Polimorfismo Genético do HTLVI/II com o Polimorfismo dos
genes do Hospedeiro envolvidos no Desenvolvimento de Paraparesia Espática
Tropical/Mielopatia Associada (TSP/HAM) em Salvador
Descrição: Transferência de tecnologia para um núcleo emergente no
Nordeste do país; Estabelecer as correlações entre fatores virais e do
hospedeiro assintomático e sintomático com TSP/HAM; Caracterização
molecular do genoma proviral (TAX) dos indivíduos infectados; Anáilise dos
polimorfismos destas regiões,relacionando os mesmos com a sintomatologia
TSP/HAM;Caracterização molecular dos genes do hospedeiro envolvido no
mecanismo de transativação por Tax (NFKB,IKB,CREB,SRFp50,p65,p52,c
Rel,p16) em indivíduos infectados assintomáticos e com TSP/HAM,
correlacionando estes resultados com as alterações genotípicas do
hospedeiro..
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (1) / Doutorado: (2) .
Castro Coordenador / Marilda Gonçalves Integrante.
2013 Atual Formação de uma rede de discussão e disseminação do conhecimento sobre
as infecções pelo HIV1 e HTLV1, utilizando a educação como ferramenta de
redução de novos casos
Descrição: De acordo com Ministério da Saúde, em 2012, (Brasil, 2012) a faixa
etária entre 1524 anos mantém uma tendência de aumento da prevalência
da infecção pelo HIV1, o que evidencia a vulnerabilidade desse grupo. Alguns
aspectos da vulnerabilidade os atingem de maneira especial, dentre eles a
falta de informação eficaz e barreiras materiais e culturais que limitam o seu
acesso aos meios de proteção (AYRES,J. 1996). De acordo com o MS, tanto a
infecção pelo HIV quanto pelo HTLV devem ser considerados problema de
saúde pública, sendo a educação o melhor caminho para prevenção e
promoção da saúde. Objetivo Geral: Formar e capacitar uma rede de
adolescentes e jovens vulneráveis, da região metropolitana de Salvador, para
atuarem como disseminadores do conhecimento sobre a infecção pelo HIV1 e
HTLV1, visando a redução da incidência destas epidemias entre seus pares.
Objetivos Específicos: 1. Habilitar educadores de escolas públicas e
Projetos de extensão

organizações sociais sobre os conhecimentos básicos das infecções pelo HIV
1 e HTLVI; 2. Orientar na elaboração de um plano de ação, a ser executado
pelos educadores, para a formação/capacitação de adolescentes e jovens
multiplicadores de informações sobre a prevenção das infecções pelo HIV1 e
HTLV1; 3. Capacitar adolescentes e jovens em situação de vulnerabilidade,
através da rede de educadores previamente habilitados (objetivo 1); 4.
Difundir os conhecimentos sobre a prevenção destas infecções pelos jovens
multiplicadores entre seus pares; 5. Acompanhar periodicamente o
aprendizado dos jovens e adolescentes sobre a infecção pelo HIV e HTLV1; 6.
Estimular o desenvolvimento de um material lúdico/didático, por parte dos
adolescentes/jovens, que foram alvo da formação educativa, para ser aplicado
a adolescentes e jovens em diferentes instituições/eventos voltados para esse
público; 7. Proporcionar certificação profissionalizante da rede de
multiplicadores em informações sobre prevenção das infecções pelo HIV
1/HTLV1; 8. Desenvolver vídeos de todas as atividades teóricas de
capacitação dos educadores, para serem disponibilizados no site do
CPqGM/FIOCRUZ, pasra que estes possam fazer uso durante o processo de
treinamento dos jovens e adolescentes; 9. Desenvolver vídeos de todas as
atividades praticas laboratoriais que posteriormente serão utilizados no
processo de capacitação dos educadores. 10. Disponibilizar estes vídeos no
sitio do CPqGM/FIOCRUZ, para serem utilizados pelos educadores durante o
processo de capacitação dos jovens e adolescentes. .
Situação: Em andamento; Natureza: Extensão.
Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado profissional: (5) / Doutorado:
(4) .
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / de Oliveira, Tulio
Integrante / Kashima, Simone Haddad Integrante / Marcio Oliveira Silva
Integrante / Marilda Souza Gonçalves Integrante / Gilson Carlos Soares
Integrante / Sandra do Valle Integrante / Alfredo Dorea Integrante.
2005 2008 Promoção de saúde por meio da pesquisa e educação em Monte Gordo: Uma
comunidade carente da área rural do Estado da Bahia
Descrição: Implantação de um laboratório de informática numa escola pública
de área rural carente, visando fornecer fundamentos da informática a
escolares de uma área rural com a finalidade de inclusão digital..
Situação: Em andamento; Natureza: Extensão.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo Galvão
Castro Filho Coordenador.
Financiador(es): Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz Fundação Instituto
Oswaldo Cruz Cooperação / Fundação de apoio à pesquisa e extensão do
estado da Bahia Auxílio financeiro.
2012 2014 IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR
SUPORTE AO CURSO DE PÓSGRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E
MEDICINA INTERNA DO CPQGM
Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no
CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em
Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância
molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e
consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de
pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia.
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador.
2010 Atual Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV1
Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público
para as sequências do HTLV1, similar à iniciativa do Banco de Dados de
Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e
de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes
Projetos de desenvolvimento

de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em
estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos,
caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso
Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo
do HTLV1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de
informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores
ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre
infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma
em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management
Environment, que constituise como um banco de dados com ferramentas, que
pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e
epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu
trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação,
estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do
LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em
bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos
vacinais, não só em relação ao HIV1/AIDS, mas também em relação ao HTLV
1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a
metodologia de análise .
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
Castro Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo Integrante / Dustin
Edwards Integrante / Leandro I SouzaBrito Integrante.
2007 2010 LASPHIV1ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática
para análise de resistência do HIV1 aos antirretrovirais
Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de
bioinformática para análise de resistência do HIV1 aos antirretrovirais. Esta
ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de
bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para
domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV1.
Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas
previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos
antirretrovirais, comparar seqüências de HIV1 dos bancos de dados públicos,
identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a
protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado
nas terapias antiHIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará
localizar sitios póstraducionais e traçar um perfil de distribuição das
seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência,
quanto por sítios póstraducionais, para servirem de parâmetro de
comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta.
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Domingos Ramon
Moreau Integrante / José Carlos Couto Fernandez Integrante / Joana
Paixão MonteiroCunha Integrante.
2005 2006 Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em
Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos
pelo PNDST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases)
Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do
LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência
em bioinformática para dar suporte ao PNDST/AIDS do Ministério da Saúde
na criação de um repositório de sequências genétias do HIV1;Ministrar
treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e
transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática
no Brasil.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) .
Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Domingos Ramon
Moreau Integrante / Filipe F A Rêgo Integrante / Luciane Amorim Santos
Integrante / Saul Vislei Integrante / Aline Cristina Andrade MotaMiranda
Integrante / Queiroz, Artur TL Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho

Integrante / Carvalho, Chandra Mara Integrante / Joana Paixão Monteiro
Cunha Integrante.
2003 2005 Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao
Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e
Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de
Vacinas
Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e
EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do
polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de
HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e
resistência antiretroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os
isolados de HTLVI e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações
polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV1 que poderiam influenciar no
desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e
evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV1 e HTLV1. 3.Avaliar a
taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências
dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo
indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das
sequências dos genes env e gag do HIV1 circulantes na cidade de Salvador.
5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV1 dos subtipos não
B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e
relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil
epidemiológico desses variantes na população. .
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado
acadêmico: (1) .
Castro Integrante / Domingos Ramon Moreau Integrante / Aline Cristina
Andrade MotaMiranda Integrante / de Oliveira, Tulio Integrante / Queiroz,
Artur TL Integrante / Carvalho, Chandra Mara Integrante / Joana Paixão
Monteiro Cunha Integrante.
2009 Atual Periódico: The Scientific World Journal
2002 Atual Periódico: Memórias do Instituto Oswaldo Cruz
2007 Atual Periódico: The Journal of Medical Virology
2007 Atual Periódico: Emerging Infectious Diseases
2008 Atual Periódico: AIDS Research and Human Retroviruses
2008 Atual Periódico: Retrovirology Research and Treatment
2011 Atual Periódico: PLoS Neglected Tropical Diseases (Online)
2011 Atual Periódico: Plos One
2010 Atual Periódico: Nucleic Acids Research
2014 Atual Periódico: Journal of Virology (Print)
2008 Atual Periódico: Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes (1999)
2014 Atual Periódico: Journal of General Virology
2014 Atual Periódico: PLoS Pathogens
2009 Atual Periódico: Retrovirology (Auckland)
2013 Atual Periódico: Bioinformatics
2010 Atual Periódico: Virology Journal
2009 Atual Periódico: AIDS (London)
Membro de corpo editorial
Revisor de periódico
Revisor de projeto de fomento

2008 Atual Projeto: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
2008 Atual
Projeto: Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia 2009 Atual
Projeto: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
1. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea:
Epidemiologia/Especialidade: Filogenia dos Retrovírus Humanos.
2. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Medicina
Preventiva.
3. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Saúde
Pública.
4. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica
Básica e Metabólica.
5. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea:
Bioinformática.
6. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea:
Bioinformática/Especialidade: Epidemiologia Molecular de Retrovirus.
Inglês Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
2005 HTLV1 Travel Scholar, 12th International Conference on Human Retrovirology
Montego Bay (Jamaica).
2005 Prêmio da IX Jornada Científica de Pósgraduação, FIOCRUZ.
2005 (Melhor Painel) The Genetic Characteristic Study of the Brazilian HTLV1
Isolates Suggests the Pre and PostColumbian Origin of the Virus in this
Country, 8º Simpósio Internacional Sobre HTLV.
2002 (Melhor Tese de Doutorado em Virologia no Brasil em 2002) Prêmio Helio Gelli
Pereira no XIII Encontro Nacional de Virologia Setembro/2002., Sociedade
Brasileira de Virologia Águas de Lindóia (SP).
1999 Fellowship Award, Nineth International Conference on Human Retrovirology:
HTLV and Related Viruses Kagoshima Japão.
Áreas de atuação
Idiomas
Prêmios e títulos
Produções
Produção bibliográfica
Citações
SCOPUS
Artigos completos publicados em periódicos

Currículo do Sistema Lattes de Luiz Carlos Júnior Alcântara

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