SlideShare una empresa de Scribd logo
1 de 29
Descargar para leer sin conexión
Биология за 1 пару
                                         Николай Вяххи
                                  vyahhi@bioinformaticsinstitute.ru

                                      Computer Science Club
                                      Санкт-Петербург, 2013




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Формат обучения




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Формат обучения

                       12 лекций по воскресеньям
                       Квизы для самопроверки


                       Домашние задания и вопросы онлайн
                                http://rosalind.info/classes/enroll/ff45302de4/




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Сегодня
                       ДНК
                       РНК
                       Белки
                       Геномика
                       Протеомика



воскресенье, 24 февраля 13 г.
ДНК
                       Двойная спираль
                       Нуклеотиды:

                                A = T
                                C ≡ G

                        Мера длины: bp (base pair)
воскресенье, 24 февраля 13 г.
ДНК




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Направление ДНК


         ➡ CCCAGAACTGAGATCAAT ➡




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Направление ДНК


         ➡ CCCAGAACTGAGATCAAT ➡
                          ATTGATCTCAGTTCTGGG



воскресенье, 24 февраля 13 г.
Репликация




                                ДНК → 2 x ДНК
воскресенье, 24 февраля 13 г.
РНК

                       Одна цепь
                       Рибонуклеотиды:

                                A = U
                                C ≡ G


воскресенье, 24 февраля 13 г.
Транскрипция



                                   ДНК → РНК

                                    T→U

воскресенье, 24 февраля 13 г.
Белки / Протеины
                       Аминокислоты (20):
                                ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY


                       Функции: структурная,
                       ферментативная, рецепторная,
                       гормональная, транспортная,
                       сократительная, защитная.


воскресенье, 24 февраля 13 г.
Структура
                            белка
               1. Последовательность
               2. α-спираль / β-лист
               3. Трёхмерная структура
               4. Комплекс




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Трансляция




                                    РНК → Белок
                      3 нуклеотида (кодон) → 1 аминокислота (aa)
воскресенье, 24 февраля 13 г.
Центральная Догма




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Омики
                                 Геном — все ДНК организма.
                           Транскриптом — все РНК организма.
                                Протеом — все белки организма.




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Геном человека




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Геномы




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Чтение геномов




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Геномика
                       AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGC
                       AGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTT
                       AACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATT
                       AGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAA
                       CACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAAC
                       CATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGTGTTGCCGAT
                       ATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCA
                       ACCACCTGGTGGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGCCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGC
                       CGAACGTATTTTTGCCGAACTTTTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGGTTCCCGCTGGCGCAA
                       TTGAAAACTTTCGTCGATCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATTAGTTTGTTGG
                       GGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAT
                       GGCCGGCGTATTAGAAGCGCGCGGTCACAACGTTACTGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCA
                       GTGGGGCATTACCTCGAATCTACCGTCGATATTGCTGAGTCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCA
                       TTCCGGCTGATCACATGGTGCTGATGGCAGGTTTCACCGCCGGTAATGAAAAAGGCGAACTGGTGGT
                       GCTTGGACGCAACGGTTCCGACTACTCTGCTGCGGTGCTGGCTGCCTGTTTACGCGCCGATTGTTGC
                       GAGATTTGGACGGACGTTGACGGGGTCTATACCTGCGACCCGCGTCAGGTGCCCGATGCGAGGTTGT
                       TGAAGTCGATGTCCTACCAGGAAGCGATGGAGCTTTCCTACTTCGGCGCTAAAGTTCTTCACCCCCG
                       CACCATTACCCCCATCGCCCAGTTCCAGATCCCTTGCCTGATTAAAAATACCGGAAATCCTCAAGCA
                       CCAGGTACGCTCATTGGTGCCAGCCGTGATGAAGACGAATTACCGGTCAAGGGCCGGGACTCGCCCG




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Аннотации




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Геном человека




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Сравнительная геномика




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Филогения




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Протеомика




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Масс-спектрометрия




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Pathways




воскресенье, 24 февраля 13 г.
Сегодня
                       ДНК
                       РНК
                       Белки
                       Геномика
                       Протеомика



воскресенье, 24 февраля 13 г.
Формат обучения

                       12 лекций по воскресеньям
                       Квизы для самопроверки


                       Домашние задания и вопросы онлайн
                                http://rosalind.info/classes/enroll/ff45302de4/




воскресенье, 24 февраля 13 г.

Más contenido relacionado

Más de Computer Science Club

20140420 parallel programming_kalishenko_lecture10
20140420 parallel programming_kalishenko_lecture1020140420 parallel programming_kalishenko_lecture10
20140420 parallel programming_kalishenko_lecture10Computer Science Club
 
20140413 parallel programming_kalishenko_lecture09
20140413 parallel programming_kalishenko_lecture0920140413 parallel programming_kalishenko_lecture09
20140413 parallel programming_kalishenko_lecture09Computer Science Club
 
20140329 graph drawing_dainiak_lecture02
20140329 graph drawing_dainiak_lecture0220140329 graph drawing_dainiak_lecture02
20140329 graph drawing_dainiak_lecture02Computer Science Club
 
20140329 graph drawing_dainiak_lecture01
20140329 graph drawing_dainiak_lecture0120140329 graph drawing_dainiak_lecture01
20140329 graph drawing_dainiak_lecture01Computer Science Club
 
20140310 parallel programming_kalishenko_lecture03-04
20140310 parallel programming_kalishenko_lecture03-0420140310 parallel programming_kalishenko_lecture03-04
20140310 parallel programming_kalishenko_lecture03-04Computer Science Club
 
20140216 parallel programming_kalishenko_lecture01
20140216 parallel programming_kalishenko_lecture0120140216 parallel programming_kalishenko_lecture01
20140216 parallel programming_kalishenko_lecture01Computer Science Club
 
20130928 automated theorem_proving_harrison
20130928 automated theorem_proving_harrison20130928 automated theorem_proving_harrison
20130928 automated theorem_proving_harrisonComputer Science Club
 
20130915 lecture1 2-tarski_matiyasevich
20130915 lecture1 2-tarski_matiyasevich20130915 lecture1 2-tarski_matiyasevich
20130915 lecture1 2-tarski_matiyasevichComputer Science Club
 
20130420 mathematics and_internet-advertizing_in_internet-viktor_lobachev
20130420 mathematics and_internet-advertizing_in_internet-viktor_lobachev20130420 mathematics and_internet-advertizing_in_internet-viktor_lobachev
20130420 mathematics and_internet-advertizing_in_internet-viktor_lobachevComputer Science Club
 
20130429 dynamic c_c++_program_analysis-alexey_samsonov
20130429 dynamic c_c++_program_analysis-alexey_samsonov20130429 dynamic c_c++_program_analysis-alexey_samsonov
20130429 dynamic c_c++_program_analysis-alexey_samsonovComputer Science Club
 

Más de Computer Science Club (20)

20140420 parallel programming_kalishenko_lecture10
20140420 parallel programming_kalishenko_lecture1020140420 parallel programming_kalishenko_lecture10
20140420 parallel programming_kalishenko_lecture10
 
20140413 parallel programming_kalishenko_lecture09
20140413 parallel programming_kalishenko_lecture0920140413 parallel programming_kalishenko_lecture09
20140413 parallel programming_kalishenko_lecture09
 
20140329 graph drawing_dainiak_lecture02
20140329 graph drawing_dainiak_lecture0220140329 graph drawing_dainiak_lecture02
20140329 graph drawing_dainiak_lecture02
 
20140329 graph drawing_dainiak_lecture01
20140329 graph drawing_dainiak_lecture0120140329 graph drawing_dainiak_lecture01
20140329 graph drawing_dainiak_lecture01
 
20140310 parallel programming_kalishenko_lecture03-04
20140310 parallel programming_kalishenko_lecture03-0420140310 parallel programming_kalishenko_lecture03-04
20140310 parallel programming_kalishenko_lecture03-04
 
20140223-SuffixTrees-lecture01-03
20140223-SuffixTrees-lecture01-0320140223-SuffixTrees-lecture01-03
20140223-SuffixTrees-lecture01-03
 
20140216 parallel programming_kalishenko_lecture01
20140216 parallel programming_kalishenko_lecture0120140216 parallel programming_kalishenko_lecture01
20140216 parallel programming_kalishenko_lecture01
 
20131106 h10 lecture6_matiyasevich
20131106 h10 lecture6_matiyasevich20131106 h10 lecture6_matiyasevich
20131106 h10 lecture6_matiyasevich
 
20131027 h10 lecture5_matiyasevich
20131027 h10 lecture5_matiyasevich20131027 h10 lecture5_matiyasevich
20131027 h10 lecture5_matiyasevich
 
20131027 h10 lecture5_matiyasevich
20131027 h10 lecture5_matiyasevich20131027 h10 lecture5_matiyasevich
20131027 h10 lecture5_matiyasevich
 
20131013 h10 lecture4_matiyasevich
20131013 h10 lecture4_matiyasevich20131013 h10 lecture4_matiyasevich
20131013 h10 lecture4_matiyasevich
 
20131006 h10 lecture3_matiyasevich
20131006 h10 lecture3_matiyasevich20131006 h10 lecture3_matiyasevich
20131006 h10 lecture3_matiyasevich
 
20131006 h10 lecture3_matiyasevich
20131006 h10 lecture3_matiyasevich20131006 h10 lecture3_matiyasevich
20131006 h10 lecture3_matiyasevich
 
20131006 h10 lecture2_matiyasevich
20131006 h10 lecture2_matiyasevich20131006 h10 lecture2_matiyasevich
20131006 h10 lecture2_matiyasevich
 
20130922 h10 lecture1_matiyasevich
20130922 h10 lecture1_matiyasevich20130922 h10 lecture1_matiyasevich
20130922 h10 lecture1_matiyasevich
 
20130928 automated theorem_proving_harrison
20130928 automated theorem_proving_harrison20130928 automated theorem_proving_harrison
20130928 automated theorem_proving_harrison
 
20130922 lecture3 matiyasevich
20130922 lecture3 matiyasevich20130922 lecture3 matiyasevich
20130922 lecture3 matiyasevich
 
20130915 lecture1 2-tarski_matiyasevich
20130915 lecture1 2-tarski_matiyasevich20130915 lecture1 2-tarski_matiyasevich
20130915 lecture1 2-tarski_matiyasevich
 
20130420 mathematics and_internet-advertizing_in_internet-viktor_lobachev
20130420 mathematics and_internet-advertizing_in_internet-viktor_lobachev20130420 mathematics and_internet-advertizing_in_internet-viktor_lobachev
20130420 mathematics and_internet-advertizing_in_internet-viktor_lobachev
 
20130429 dynamic c_c++_program_analysis-alexey_samsonov
20130429 dynamic c_c++_program_analysis-alexey_samsonov20130429 dynamic c_c++_program_analysis-alexey_samsonov
20130429 dynamic c_c++_program_analysis-alexey_samsonov
 

Bioinf lecture1