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Asignatura:
Laboratorio Clínico en Microbiología (Curso 2007 – 2008)
Facultad de Biología (Licenciatura en Bioquímica)




                                TEMA 15
                     LA INFORMÁTICA EN EL
             LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA.
            RECURSOS INFORMÁTICOS PARA LA
             ORGANIZACIÓN DEL LABORATORIO
                Y EMISIÓN DE RESULTADOS
CONCEPTOS
Informática:
Conjunto de conocimientos científicos y técnicas que hacen posible el tratamiento
automático de la información mediante ordenadores. (R.A.E.)

  Ordenador:
  Máquina electrónica, dotada de memoria de gran capacidad y de métodos de
  tratamiento de la información, que puede resolver problemas aritméticos y
  lógicos gracias a la utilización de software registrado en ella. (R.A.E.)

    Software:
    Conjunto de programas, instrucciones y reglas informáticas para ejecutar
    ciertas tareas en una computadora. (R.A.E.)

       Programa:
       Conjunto unitario de instrucciones que permite a un ordenador realizar
       funciones diversas, como el tratamiento de textos, el diseño gráfico, la
       resolución de problemas matemáticos, el manejo de bancos de datos, etc.
       (R.A.E.)
Microbiología e Informática:
          RECURSOS
►  Aplicaciones informáticas de uso general

►  Redes de comunicación. Internet y sus
   aplicaciones

►  Aplicaciones específicas en microbiología
   clínica: Gestión de la información

►  Otros recursos de interés
APLICACIONES INFORMÁTICAS DE
               USO GENERAL

►    Procesadores de texto        ►  Lectores de archivos
►    Hojas de cálculo             ►  Reconocimiento óptico de
►    Gestores de bases de datos      caracteres (OCR)
►    Editores de páginas “web”    ►  Reconocimiento de voz
►    Programas de presentación    ►  Paquetes estadísticos
►    Editores de imágenes         ►  Otras ..........
PROCESADORES DE TEXTO
   CARACTERÍSTICAS:
  Crear, editar, componer, almacenar, modificar e imprimir textos
   digitales: Cortar, copiar, pegar, vincular, buscar, reemplazar, etc.
  Diferentes formatos: Párrafo, fuentes, bordes y sombreados,
   tabulaciones, columnas, tablas, etc.
  Visualización de páginas: Diferentes diseños, marcas, presen-
   taciones preliminares, etc.
  Inserción de elementos: Campos, imágenes, símbolos, objetos,
   etc.
  Otras herramientas: Correctores ortográficos y/o gramaticales, dic-
   cionarios multilingües y/o de sinónimos etc.
    Ejemplos: Word (Microsoft); Wordperfect (Corel); Wordpro (Lotus
    Smartsuite); Write (OpenOffice); ….
HOJAS DE CÁLCULO

   CARACTERÍSTICAS:
  Manejar, números y textos, en forma de tablas y en campos de
  información: Establece relaciones entre ellos.
  Campos de información: Celdas, (intersección de filas y columnas),
  que componen la hoja.
  Pueden realizar cálculos con funciones y/o fórmulas: Matemá-
  ticas, estadísticas, de búsqueda, lógicas, etc.
  Crear gráficas: Con los datos almacenados o calculados, así como
  rectas de regresión y/o ajuste, etc.
  Otras herramientas: Muchas de las de los procesadores de texto.
   Ejemplos: Excel (Microsoft); Lotus 1, 2 3 (Lotus Smartsuite); QuatroPro (Corel);
   Calc (OpenOffice); …
GESTORES DE BASES DE DATOS
  CARACTERÍSTICAS:
  Gestionar datos: Administrar conjuntos de información relacionada
   (base de datos), almacenada, actualizada y estructurada, pudiendo
   ser manipulada y analizada por el propio programa o por otros.
  Datos: Almacenados en tablas de diferentes tipos y, cada tabla se
   compone de registros y cada registro de campos.
  Formato: Gráfico en pantalla; impreso y digital en salida.
  Búsquedas: Existe la posibilidad de filtros.
  Cálculos: Existe la posibilidad de cálculos sencillos.
  Otros herramientas: Muchas de los procesadores de textos y de las
   hojas electrónicas.
  Tipos de bases de datos : Según variabilidad, contenido y modelo.
  Ejemplos: Oracle (Oracle); Acces (Microsoft); File Maker (File maker);
  Progress (Progress software); End Note (Thomson); ….
TIPOS DE BASES DE DATOS
Según variabilidad:
 Estáticas: De sólo lectura.
 Dinámicas: Permite ser actualizada en el tiempo.
Según contenido:
 Bibliográficas: Contiene representación de fuente primaria.
 De texto completo: Almacena fuentes primarias.
 Directorios: Como las guías telefónicas.
 Multimedia: Imágenes, audios, videos, etc.
 De información biológica: Información de ciencias biológicas o médicas
Según modelo:
 Jerárquicas: Organizadas en forma de árbol (nodos primarios y secundarios)
 De red: Un mismo nodo primario puede tener varios primarios.
 Relacional: Utiliza relaciones entre campos de datos.
 Orientadas a objetos: Almacena los objetos completos.
 Documentales: Indexación a texto completo.
 Deductivas: Permite hacer deducciones a través de inferencias.
 Distribuidas: Almacenan datos en diferentes computadores en red.
PROGRAMAS DE PRESENTACIONES

 CARACTERÍSTICAS:
  Organizar, ilustrar y distribuir ideas de forma clara y sen-
   cilla: En pantalla o en forma de diapositivas, transparencias,
   carteles o pósters.
  Posibilita: Animaciones, autoformatos, autoajustes de texto, di-
   seños de tablas, publicaciones en “web”, combinaciones de
   colores etc.
  Otras herramientas: Muchas de las propias de los procesa-
   dores de textos, hojas electrónicas y editores de imagen.

   Ejemplos: Powerpoint (Microsoft); Freelance Graphics (Lotus); Corel
   Presentations (Corel); Harvard Graphics (Harvard Graphics); ….
EDITORES DE PÁGINAS “WEB”

CARACTERÍSTICAS:
  Crear y editar documentos de hipertexto: Utilizan lenguaje
  HTML (HyperText Markup Language) visible en internet.
  Lenguaje HTML: Lenguaje que estructura documentos en
  forma de etiquetas, compatible y de fácil aprendizaje que crea
  docu-mentos atractivos con hiperenlaces, imágenes, etc.
  Tecnología: WYSIWYG (“What You See Is What You Get” ó “Lo
  que ves es lo que obtienes”)
  Otras herramientas: Correctores ortográficos, gramaticales, y
  otras propias de procesadores de textos.
   Ejemplos: Frontpage (Microsoft); Dreamweawer (Macromedia); Hot Metal
   (Softquad); ….
EDICIÓN DE IMÁGENES

CARACTERÍSTICAS:

  Visualización y edición de imágenes, cambiar formatos de
  éstas, hacer composiciones, retoques, etc.

  Recursos gráficos: Añadir texto a las composiciones, herra-
  mientas de dibujo, seleccionar y editar partes de una imagen,
  cambiar de posición una imagen, cambiar tamaño de imagen,
  cambiar colores, creación de diferentes formatos, etc.

  Otras herramientas: Creación y superposición de capas y
  máscaras de capa, .

    Ejemplos: Photoshop (Adobe); Gimp (Gimp); ….
LECTORES DE ARCHIVOS
CARACTERÍSTICAS:
  Visualizar, imprimir y navegar por textos e imágenes:
  Ficheros en formato PDF (Portable Document Format) que se
  presentan en pantalla de manera idéntica que en el documento
  impreso.
     Cualquier persona en cualquier lugar puede abrir un archivo PDF. Sólo es
      necesario tener el software gratuito Adobe Reader. Pueden firmarse
      digitalmente.
     El formato PDF de Adobe permite la redistribución del texto y/o imágenes
      para que se muestre correctamente en plataformas portátiles, como los
      dispositivos Palm OS, Symbian y Pocket PC.
  Se pueden descargar: Artículos de revistas, impresos, libros
   electrónicos y formularios de solicitudes y proyectos..
  Otras herramientas: Algunos programas admiten también la
   edición de archivos en PDF , crear formularios, etc.
     Ejemplos: Acrobat Reader (Adobe) que es sólo lector; Acrobat (Adobe)
     que es también editor.
RECONOCEDORES ÓPTICOS DE
           CARACTERES (OCR)
CARACTERÍSTICAS:
  Extraer: De una imagen escaneada los caracteres que
   componen un texto para almacenarlos en un formato (ASCII o
   Unicode) con el que puedan interactuar procesadores de textos.
   Transforma documentos impresos en digitales.
  Los OCR (Optical Character Recognition): En la actualidad,
   junto al texto, registran y almacenan el formato en el que se
   escribió el texto.
  Otras herramientas: Algunos programas (OCR) admiten
   también la edición de archivos en PDF y buen reconocimiento
   de tablas y los OMR (Optical Mark Recognition) útiles para el
   reconocimiento de marcas.
     Ejemplos: OmniPage (Scan Soft); TextBrige (Scan Soft) ABBYY Fine
     Reader (Abbyy); ….
RECONOCEDORES DE VOZ
CARACTERÍSTICAS:
  Comunicar, mediante la voz, directamente al usuario con el
  ordenador sin necesidad de ningún soporte intermedio de
  comunicación.
  Niveles de reconocimiento: Después de entrenamiento llega
  a ser superior al 95%, llega a reconocer cerca de 160 palabras
  por minuto.
  Otras herramientas: Control de sistemas operativos y diversos
  programas de utilidad.
  Son prácticos para: Los que no saben escribir bien a máquina
  o los que tienen algún impedimento físico y porque deja libres
  las manos para utilizarlas en otra cosa.
   Ejemplos: Dragon Naturally Speakimg (Scan Soft); Via Voice (IBM); Free
   Speech (Philips); ….
PAQUETES ESTADÍSTICOS

CARACTERÍSTICAS:
  Definición: Son un conjunto de programas informáticos
  específicamente diseñados para el análisis estadístico de datos
  con el objetivo de resolver problemas de estadística descriptiva,
  inferencial o ambos
  Permiten: Aplicar a un mismo fichero de datos un conjunto
  ilimitado de procedimientos estadísticos                de       manera
  sincronizada, sin salir del programa.
  Otras características: Requieren un cierto nivel de conoci-
  mientos de estadística.

    Ejemplos: SPSS (SPSS); Gauss (Aptech); Mathematica (Wolfrand
    Research); ….
OTRAS


 PROGRAMAS PARA LA CREACIÓN DE
 ETIQUETAS. De código de barras, de
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 PROTOCOLOS DE COMUNICACIONES.
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  • 1. Asignatura: Laboratorio Clínico en Microbiología (Curso 2007 – 2008) Facultad de Biología (Licenciatura en Bioquímica) TEMA 15 LA INFORMÁTICA EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA. RECURSOS INFORMÁTICOS PARA LA ORGANIZACIÓN DEL LABORATORIO Y EMISIÓN DE RESULTADOS
  • 2. CONCEPTOS Informática: Conjunto de conocimientos científicos y técnicas que hacen posible el tratamiento automático de la información mediante ordenadores. (R.A.E.) Ordenador: Máquina electrónica, dotada de memoria de gran capacidad y de métodos de tratamiento de la información, que puede resolver problemas aritméticos y lógicos gracias a la utilización de software registrado en ella. (R.A.E.) Software: Conjunto de programas, instrucciones y reglas informáticas para ejecutar ciertas tareas en una computadora. (R.A.E.) Programa: Conjunto unitario de instrucciones que permite a un ordenador realizar funciones diversas, como el tratamiento de textos, el diseño gráfico, la resolución de problemas matemáticos, el manejo de bancos de datos, etc. (R.A.E.)
  • 3. Microbiología e Informática: RECURSOS ►  Aplicaciones informáticas de uso general ►  Redes de comunicación. Internet y sus aplicaciones ►  Aplicaciones específicas en microbiología clínica: Gestión de la información ►  Otros recursos de interés
  • 4. APLICACIONES INFORMÁTICAS DE USO GENERAL ►  Procesadores de texto ►  Lectores de archivos ►  Hojas de cálculo ►  Reconocimiento óptico de ►  Gestores de bases de datos caracteres (OCR) ►  Editores de páginas “web” ►  Reconocimiento de voz ►  Programas de presentación ►  Paquetes estadísticos ►  Editores de imágenes ►  Otras ..........
  • 5. PROCESADORES DE TEXTO CARACTERÍSTICAS:   Crear, editar, componer, almacenar, modificar e imprimir textos digitales: Cortar, copiar, pegar, vincular, buscar, reemplazar, etc.   Diferentes formatos: Párrafo, fuentes, bordes y sombreados, tabulaciones, columnas, tablas, etc.   Visualización de páginas: Diferentes diseños, marcas, presen- taciones preliminares, etc.   Inserción de elementos: Campos, imágenes, símbolos, objetos, etc.   Otras herramientas: Correctores ortográficos y/o gramaticales, dic- cionarios multilingües y/o de sinónimos etc. Ejemplos: Word (Microsoft); Wordperfect (Corel); Wordpro (Lotus Smartsuite); Write (OpenOffice); ….
  • 6. HOJAS DE CÁLCULO CARACTERÍSTICAS:   Manejar, números y textos, en forma de tablas y en campos de información: Establece relaciones entre ellos.   Campos de información: Celdas, (intersección de filas y columnas), que componen la hoja.   Pueden realizar cálculos con funciones y/o fórmulas: Matemá- ticas, estadísticas, de búsqueda, lógicas, etc.   Crear gráficas: Con los datos almacenados o calculados, así como rectas de regresión y/o ajuste, etc.   Otras herramientas: Muchas de las de los procesadores de texto. Ejemplos: Excel (Microsoft); Lotus 1, 2 3 (Lotus Smartsuite); QuatroPro (Corel); Calc (OpenOffice); …
  • 7. GESTORES DE BASES DE DATOS CARACTERÍSTICAS:   Gestionar datos: Administrar conjuntos de información relacionada (base de datos), almacenada, actualizada y estructurada, pudiendo ser manipulada y analizada por el propio programa o por otros.   Datos: Almacenados en tablas de diferentes tipos y, cada tabla se compone de registros y cada registro de campos.   Formato: Gráfico en pantalla; impreso y digital en salida.   Búsquedas: Existe la posibilidad de filtros.   Cálculos: Existe la posibilidad de cálculos sencillos.   Otros herramientas: Muchas de los procesadores de textos y de las hojas electrónicas.   Tipos de bases de datos : Según variabilidad, contenido y modelo. Ejemplos: Oracle (Oracle); Acces (Microsoft); File Maker (File maker); Progress (Progress software); End Note (Thomson); ….
  • 8. TIPOS DE BASES DE DATOS Según variabilidad: Estáticas: De sólo lectura. Dinámicas: Permite ser actualizada en el tiempo. Según contenido: Bibliográficas: Contiene representación de fuente primaria. De texto completo: Almacena fuentes primarias. Directorios: Como las guías telefónicas. Multimedia: Imágenes, audios, videos, etc. De información biológica: Información de ciencias biológicas o médicas Según modelo: Jerárquicas: Organizadas en forma de árbol (nodos primarios y secundarios) De red: Un mismo nodo primario puede tener varios primarios. Relacional: Utiliza relaciones entre campos de datos. Orientadas a objetos: Almacena los objetos completos. Documentales: Indexación a texto completo. Deductivas: Permite hacer deducciones a través de inferencias. Distribuidas: Almacenan datos en diferentes computadores en red.
  • 9. PROGRAMAS DE PRESENTACIONES CARACTERÍSTICAS:   Organizar, ilustrar y distribuir ideas de forma clara y sen- cilla: En pantalla o en forma de diapositivas, transparencias, carteles o pósters.   Posibilita: Animaciones, autoformatos, autoajustes de texto, di- seños de tablas, publicaciones en “web”, combinaciones de colores etc.   Otras herramientas: Muchas de las propias de los procesa- dores de textos, hojas electrónicas y editores de imagen. Ejemplos: Powerpoint (Microsoft); Freelance Graphics (Lotus); Corel Presentations (Corel); Harvard Graphics (Harvard Graphics); ….
  • 10. EDITORES DE PÁGINAS “WEB” CARACTERÍSTICAS:   Crear y editar documentos de hipertexto: Utilizan lenguaje HTML (HyperText Markup Language) visible en internet.   Lenguaje HTML: Lenguaje que estructura documentos en forma de etiquetas, compatible y de fácil aprendizaje que crea docu-mentos atractivos con hiperenlaces, imágenes, etc.   Tecnología: WYSIWYG (“What You See Is What You Get” ó “Lo que ves es lo que obtienes”)   Otras herramientas: Correctores ortográficos, gramaticales, y otras propias de procesadores de textos. Ejemplos: Frontpage (Microsoft); Dreamweawer (Macromedia); Hot Metal (Softquad); ….
  • 11. EDICIÓN DE IMÁGENES CARACTERÍSTICAS:   Visualización y edición de imágenes, cambiar formatos de éstas, hacer composiciones, retoques, etc.   Recursos gráficos: Añadir texto a las composiciones, herra- mientas de dibujo, seleccionar y editar partes de una imagen, cambiar de posición una imagen, cambiar tamaño de imagen, cambiar colores, creación de diferentes formatos, etc.   Otras herramientas: Creación y superposición de capas y máscaras de capa, . Ejemplos: Photoshop (Adobe); Gimp (Gimp); ….
  • 12. LECTORES DE ARCHIVOS CARACTERÍSTICAS:   Visualizar, imprimir y navegar por textos e imágenes: Ficheros en formato PDF (Portable Document Format) que se presentan en pantalla de manera idéntica que en el documento impreso.   Cualquier persona en cualquier lugar puede abrir un archivo PDF. Sólo es necesario tener el software gratuito Adobe Reader. Pueden firmarse digitalmente.   El formato PDF de Adobe permite la redistribución del texto y/o imágenes para que se muestre correctamente en plataformas portátiles, como los dispositivos Palm OS, Symbian y Pocket PC.   Se pueden descargar: Artículos de revistas, impresos, libros electrónicos y formularios de solicitudes y proyectos..   Otras herramientas: Algunos programas admiten también la edición de archivos en PDF , crear formularios, etc. Ejemplos: Acrobat Reader (Adobe) que es sólo lector; Acrobat (Adobe) que es también editor.
  • 13. RECONOCEDORES ÓPTICOS DE CARACTERES (OCR) CARACTERÍSTICAS:   Extraer: De una imagen escaneada los caracteres que componen un texto para almacenarlos en un formato (ASCII o Unicode) con el que puedan interactuar procesadores de textos. Transforma documentos impresos en digitales.   Los OCR (Optical Character Recognition): En la actualidad, junto al texto, registran y almacenan el formato en el que se escribió el texto.   Otras herramientas: Algunos programas (OCR) admiten también la edición de archivos en PDF y buen reconocimiento de tablas y los OMR (Optical Mark Recognition) útiles para el reconocimiento de marcas. Ejemplos: OmniPage (Scan Soft); TextBrige (Scan Soft) ABBYY Fine Reader (Abbyy); ….
  • 14. RECONOCEDORES DE VOZ CARACTERÍSTICAS:   Comunicar, mediante la voz, directamente al usuario con el ordenador sin necesidad de ningún soporte intermedio de comunicación.   Niveles de reconocimiento: Después de entrenamiento llega a ser superior al 95%, llega a reconocer cerca de 160 palabras por minuto.   Otras herramientas: Control de sistemas operativos y diversos programas de utilidad.   Son prácticos para: Los que no saben escribir bien a máquina o los que tienen algún impedimento físico y porque deja libres las manos para utilizarlas en otra cosa. Ejemplos: Dragon Naturally Speakimg (Scan Soft); Via Voice (IBM); Free Speech (Philips); ….
  • 15. PAQUETES ESTADÍSTICOS CARACTERÍSTICAS:   Definición: Son un conjunto de programas informáticos específicamente diseñados para el análisis estadístico de datos con el objetivo de resolver problemas de estadística descriptiva, inferencial o ambos   Permiten: Aplicar a un mismo fichero de datos un conjunto ilimitado de procedimientos estadísticos de manera sincronizada, sin salir del programa.   Otras características: Requieren un cierto nivel de conoci- mientos de estadística. Ejemplos: SPSS (SPSS); Gauss (Aptech); Mathematica (Wolfrand Research); ….
  • 16. OTRAS  PROGRAMAS PARA LA CREACIÓN DE ETIQUETAS. De código de barras, de código difuso…..  PROTOCOLOS DE COMUNICACIONES. Ponen en contacto los autoanalizadores con el servidor central y vuelcan en este los datos generados por aquellos.  ETC. ……..