El documento discute los retos que enfrentan los países en desarrollo debido a virus que afectan el cultivo de papa. Estos virus disminuyen los rendimientos agrícolas en climas cálidos donde hay más presión de infección. Se necesitan métodos sensibles y económicos como la hibridación de ácidos nucleicos y la reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa para detectar virus latentes y desarrollar semillas resistentes que mejoren la producción agrícola.
Desarrollo de métodos moleculares para la detección y Para La Detección Y Prevensción De Virus De La Papa Y Viroides.
1.
2. • La papa es el 4to cultivo alimenticio más importante en los países
en desarrollo.
• Esta siendo afectado por enfermedades de virus de papa y esto
disminuye en rendimiento en estos paises.
• Para su control= Desarrollo de técnicas de detección apropiada de
los virus + Tecnología de producción de semillas en estas
regiones.
• Se plantean métodos para la deteccion de virus y viroides en
tubérculos de semillas latentes y los insectos vectores.
-Hibridación de ácidos nucleicos (NASH)
-La reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa
(RT-PCR)
3. Paises en desarrollo estan en
las zonas tropicales del mundo.
En Climas mas calidos
-Gran # de huésped alternativos
para los virus
-Sus vectores estan presente
durante todo el año.
= Mayor presión de la infección en
climas Templados.
• Métodos de Control de virus
necesita de:
-Protocolos de detección
*Simples
*Económicos
*Sensibles
• Virus de Interés
1.
2.
3.
4.
5.
PLR (enrollamiento de la hoja de papa)
PVY
PVX
PVA
PSTVd (la deformación fusiforme del
tubérculo de papa)
4. • En 1980 la tecnología de detección de virus dio un salto
gracias a:
-Técnicas de clonación de genomas
-Secuenciación
-Amplificación in vitro
• Enfoques
*Utilizacion de la totalidad de genomas viral para la
detección de virus.
*Utilización de multiples segmentos de genoma para
fabricación de sondas de detección específicas o
generales.
5. • Se basa en:
El principio de la formación
de un dupex (hibridación)
entre un “mensajero”, ácidos
nucleicos (sonda) y el ácido
nucleico del virus o viroide
(objetivo).
• Sonda lleva una etiqueta
(radioactiva o no
radioactiva)
• Hibridación se puede
realizar en una solución o
un soporte solido
(membrana de nitrocelulosa
Protocolo típico para NASH
1- Preparación de las muestras y la
aplicación a las membranas
2- La inmovilización de la muestra y la
prehibridación
3- Hibridación con una sonda
4- La eliminación de exceso de sonda a
través del lavado
5- La detección de la sonda hibridada por
agentes colorimétricos o
quimioluminiscentes
6. tiene una cadena extra de RNA
• Para la preparación de sondas de ADNc de cadena sencilla, el
ARN es transcripto de forma inversa con la RNA dependiente de
ADN polimerasa. (transcriptasa inversa).
*El ADNc se inserto en un plásmido de ADN bacteriano y se clonó
fuente ilimitada de sondas de ADN caracterizado.
7. NASH
1- Un medio de soporte sólido fue desarrollado para la
detección a gran escala de PSTVd.
PSTVd.
-Tiene ARN Circular de 341 a 361 nt.
-Provoca síntomas leves y graves o dependiendo de la
variedad de papa.
Modificaciones de la NASH para PSTVd.
2- se han desarrollo utilizando ARN monomerico de PSTVd
con cadenas para la sintesis de sondas de cDNA o cRNA.
8. • PVY
- Es la especie tipo del genero
Potyvirus, familia Potyviridae es el
grupo de los virus de plantas más
grande y económicamente más
importantes.
- Tiene una particula en forma de
vara flexuosa y un genoma de ARN
de cadena simple en sentido
positivo de aproximadamente 9,7 kb
con una proteina ligada al genoma
(VPg) en su extremo 5´y una cola
de poli A en su extremo 3´.
• Se determino las
secuencia completa de
tres aismlamientos.
1. PVYN Una cepa de
necrosis venal en
tabaco 9704 nt
2. PVYNTN una cepa
de necrosis mancha
anular en tuberculo de
papa9703 nt
3. PVYO una cepa
común 9698 nt
9. • PLRV
Pertenece la grupo de Luteovirus,
contiene una molecula de ARN
de cadena simple en sentido
positivo de 5882 o 5883 nt y tiene
un VPg en el extremo 5´.
Tiene superposición de al menos
4 marcos de lectura.
10. 1. Cuando se utilizaron sondas de 0.56, 1.2, 2.5 y 3.25 kb
clonado a partir del extremo 3´del genoma PVYN la
sensibilidad con una sonda de mayor tamaño de 3.25
kb fue suficiente para detectar 5 pg de ARN.
2. La sonda mas pequeña de 0.56 kb necesita 1.000 pg
de ARN o mpas. Para mayor sensibilidad sondas de
gran tamaño.