1. +
Bioinformática
Anotação funcional de genomas
Gabriel da Rocha Fernandes
Universidade Católica de Brasília
gabrielf@ucb.br - fernandes.gabriel@gmail.com

2. +
Após a montagem...
2
nOs contigs são apenas uma sequência de nucleotídeos.
nEncontrar informação biológica dentro dos contigs.
nGenes
nIntrons/Exons
nPromotores

3. +
Predição gênica
3
nIdenticar genes.
nATG + ORF + Stop condon na mesma fase de leitura.
nPredição ab initio, redes neurais...
nIdentificação de introns e exons.
nLocalização dos genes dentro do contexto dos contigs.

4. +
GeneMark
4
nUsa a informação de codon usage para fazer a predição.

5. +
Promotores
nIdentifica padrões de sequência de promotores.
nhttp://pepper.molgenrug.nl/
5

6. +
Arquivo GFF
nGeneral Feature Format
nIndica as posições no contig de cada item identificado.
6

7. +
No GenBank file
7

8. +
No EMBL
8

9. +
Visualização
nArtemis - Sanger Institute
9