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INTRODUCCION

ENZIMAS                                           Historia:
                                                    1700: estudios de la digestión de carnes
                                                    mediante secreciones del estómago.
                                                    1800: convertir almidón en azúcar mediante
     CAPITULO 4                                     la saliva.
                                                    1810: comienzan estudios sobre
                                                    fermentación.
                                                    1850: Louis Pasteur concluyó estudios sobre
                                                    fermentación de azúcares en alcoholes por
                                                    levadura y catalizado por fermentos.




INTRODUCCION                                      AGENTES CATALITICOS
   Historia:
      1897: Buchner descubrió que los extractos     Cambian la velocidad de una reacción
      de levadura podían convertir el azúcar en     química.
      alcohol. Fermentación se llevaba a cabo
      por la presencia de moléculas.                Aceleran la reacción en ambas direcciones
      Kühne llamó las moléculas enzimas.            disminuyendo la energía de activación.
      1926: ureasa fue aislada y cristalizada.      Funcionan en reacciones que pueden
      1930: pepsina, tripsina, y otras enzimas      ocurrir sin su presencia (exergónica).
      digestivas fueron cristalizadas.              Permanecen inalterados al final de la
                                                    reacción.
ESPECIFICIDAD
ENZIMAS                                          ENZIMATICA
                                                 La especificidad enzimática puede
  CATALISIS ENZIMATICA
                                                 variar.
    Las enzimas son los agentes catalíticos de
    los sistemas biológicos.                     Pasos que ocurren durante la acción
    Todas las enzimas son proteínas excepto      enzimática:
    las riboenzimas.
                                                   Sustrato se enlaza a la enzima.
    Aumentan la velocidad de una reacción
    hasta por un factor de 1014 .                  Ocurren alteraciones químicas que
    Son altamente específicas.                     incluyen rompimiento y formación de
    La acción enzimática es regulada.              enlaces.
                                                   La enzima libera el producto de la
                                                   reacción.




Teorías que explican la
actividad enzimática:

  Llave y cerradura: específica; un sustrato y
  una enzima.
  Adaptación inducida: menos específica, el
  centro activo se ajusta al sustrato que
  interviene.
  Teoría de poliafinidad: enzima y sustrato
  poseen por lo menos tres puntos de
  contacto, sólo uno de dos grupos idénticos
  del carbono proquiral es orientado
  correctamente.
Clasificación enzimática
                                                           1. Oxidoreductasas: transferencia de
                                                           electrones
                                                           2. Transferasas: transferencia de grupos
                                                           3. Hidrolasas: reacciones de hidrólisis
                                                           4. Liasas: adición de grupos a dobles
                                                           enlaces
                                                           5. Isomerasas: transferencia de grupos
                                                           en la molécula
                                                           6. Ligasas: formación de enlaces




Clasificación enzimática
  De acuerdo al número de la Comisión
  Enzimática (Enzyme Commission number)
    Primer #: tipo de reacción catalizada.
    Segundo #: indica la subclase; dice el tipo de
    sustrato o el enlace que se rompe en forma mas
    precisa.
    Tercer #: indica la sub-subclase; nos dice el tipo
    de aceptador de electrones (oxidoreductasas) o
    el tipo de grupo que se remueve (liasas), etc.
    Cuarto #: indica el número de serie de la enzima
    en su sub-subclase.
Mecanismos de acción                           Mecanismos de acción

 Estado de transición: forma activa de una       Energía de activación: cantidad de
 molécula en la cual la molécula realiza una     energía necesaria para convertir todas
 reacción química parcial.                       las moléculas de un mol de sustancia
 Energía libre: componente de la energía         reaccionando de su estado raso a su
 total de un sistema que puede realizar          estado de transición.
 trabajo a temperatura y presión constante.      Las enzimas aumentan la velocidad de
   ΔG reacción = G productos – G reactivos       la reacción disminuyendo la energía de
   Reacción endergónica: ΔG es negativo          activación, pero no afectan los
   ΔG = ΔH - TΔS                                 aspectos termidinámicos de las
                                                 reacciones.
Eficiencia enzimática

                                                  Se describe con el “turnover number”:
                                                  número de moles de sustrato
                                                  transformado en producto por mol de
                                                  enzima por segundo.
                                                    Mayor el “turnover number” mayor la
                                                    eficiencia.
                                                    Equivale a: Vmax/[Et]




                                                Factores que determinan la
Unidades enzimáticas                            catálisis (eficiencia)

  La concentración de las enzimas se            Proximidad y orientación: debe existir una
  expresa en términos de su actividad:          interacción entre el sustrato y el centro
    Unidad enzimática: cantidad de enzima       activo.
    que produce la transformación de un
    micromol de sustrato por minuto bajo        Efectos electrostáticos: constante
    condiciones definidas.                      dieléctrica baja lo que permite estabilizar
    Actividad específica: número de unidades    estados de transición polares; mejor
    por miligramo de proteína total.            interacción.
    Actividad total: número total de unidades
    enzimáticas.
Factores que determinan la                        Factores que determinan la
catálisis (eficiencia)                            catálisis (eficiencia)

Factores de entropía: la pérdida en entropía es    Catálisis ácido-base: interacción entre
más pequeña que la de las reacciones en            grupos ácidos y básicos.
solución porque los reactivos, los estados de
transición y los productos están enlazados a la
                                                   Catálisis covalente: interacción entre
enzima.                                            la enzima y el sustrato es inestable;
Distorciones: cambios en la conformación           sustrato se convierte en producto con
cuando se enlaza la enzima. Hay distorción del     más rápidez.
sustrato, se destabilizan los enlaces y se
forman o rompen con más facilidad los enlaces.




  Regulación actividad
  enzimática

 Puede llevarse a cabo por:
    Control de la cantidad de enzima:
    número actual de moléculas de enzima
    por célula en un tiempo dado.
    Control de la actividad enzimática:
    efectividad actual de las moléculas de
    enzima en una célula determinada.
Control de la actividad enzimática:
propiedades de las enzimas
 Velocidad de la reacción: rapidez con la que
 procede una reacción. Cambio en
 concentración de producto (aparece) o
 reactivo ( desaparece) por unidad de
 tiempo.
 Concentración: hipérbola; mayor
 concentración de sustrato la enzima se
 satura y la velocidad de reacción es
 máxima.
 Tiempo de reacción: la velocidad disminuye
 con el tiempo.
Control de la actividad enzimática:
propiedades de las enzimas

  pH: óptimo

  Temperatura: óptima




                                      Control de la actividad enzimática:
                                      propiedades de las enzimas

                                        Cofactores, vitaminas y hormonas:
                                          Enzimas conjugadas: apoenzima y
                                          cofactor forma la holoenzima.
                                             Cofactores: grupo prostético
                                             Vitaminas: solubles en agua
                                             Hormonas: pueden afectar la cantidad o la
                                             actividad de las enzimas.
Ejemplos de metales usados
                                                                 como cofactores

                        ENZYMES                                          Cu+2                      oxidasa de citocromo
                       (holoenzyme)                                                                catalasa, peroxidasa
                                                                         Fe+2 o Fe+3
                                                                         K+                        quinasa de piruvato
   Apoenzyme             Chemical component                                                        hexoquinasa
(amino acid portion)   (non-amino acid portion)
                                                                         Mg+2
                                                                         Mn+2                      arginasa
                                                                         Mo                        dinitrogenasa
                               Cofactor
                                                                         Ni+2                      ureasa
                                                                         Se                        peroxidasa de glutationa
              metals         coenzymes        prosthetic group
                                                                                                   dehidrogenasa de alcohol
                                                                         Zn+2




                                                                 Control de la actividad enzimática:
COENZIMAS                                                        propiedades de las enzimas

 Coenzima              Reacción             Vitamina
 Biocitina             CO2                  Biotina              Inhibidores
                                                                   Reversibles
 Coenzima A            Grupo acil           Ac. Pantotenico
                                                                      Competitivo: Compite con el sustrato por el centro activo. Se
 Coenz. B12            H y alquilos         Vitamina B12              parecen al sustrato. E + I    EI (no catálisis)
                                                                      No competitivo: el inhibidor no compite con el sustrato.
 FAD, FMN              Electrones           Riboflavin                Inhibidor tiene un punto diferente de enlace. Puede enlazar la
                                                                      E o el complejo ES. E + I     EI + S   EIS or E + S    ES + I
 NAD, NADP             Electrones           Niacina                      EIS
 Fosfato de         Grupos aminos           Piridoxina                De incompetencia: el inhibidor se enlaza directamente al
 piridoxal                                                            complejo enzima-sustrato y no a la enzima libre. E + S     ES
Pirofosfato Tiamina Aldehidos                Tiamina                  + I ---> EIS (no reaccion).
Tetrahidrofolato    Un carbono               Ac. folico
Inhibidor competitivo   Inhibidor competitivo




                        Inhibidor no-competitivo
Inhibidor no-competitivo




Inhibidor de incompetencia
Control de la actividad enzimática:                             Control de la actividad enzimática:
propiedades de las enzimas                                      cinética de las enzimas

  Inhibidores                                                     Estado raso (steady state):
    Irreversibles: se combina con o destruye un                     Velocidad de formación = Velocidad de
    grupo funcional necesario para la actividad                     desaparición
    enzimática. Se forma un enlace covalente.                     Ecuación Michaelis-Menten
       Ejemplo: Inhibidores de acetilcolinesterasa.Interfiere       El modelo de Michaelis-Menten presenta la
       con la secuencia del impulso nervioso.                       formación del complejo enzima-sustrato.
          Diisopropylphosphofluoridate, tabun y sarin               La concentración del complejo es baja, pero
          (nerve gases)                                             permanece constante durante la reacción.
          Parathion and malathion                                   El sustrato se convierte en producto.
                                                                    E+S         ES    E+P
Control de la actividad enzimática:     Control de la actividad enzimática:
cinética de las enzimas                 cinética de las enzimas

  Ecuación Michaelis-Menten               Ecuación Michaelis-Menten
                                            KM es igual a la concentración de
       V max [S ]                           sustrato cuando 50% de los centros
                                            activos de la enzima están ocupados.
 V =
       K M + [S ]                           También representa cuán fuerte la
                                            enzima se enlaza al sustrato.
                                            VMAX está relacionado con el turnover
                              V   max
  Km = [ S ], cuandoVo =                    number
                                  2         Gráfica Lineweaver-Burk




                                        Control de la actividad enzimática:
                                        cinética de las enzimas

                                          Medidas de la actividad enzimática
                                            Ks: mayor la afinidad de la enzima por el
                                            sustrato, mayor la concentración [ES] y
                                            menor el Ks.
                                            Constante de velocidad catalítica:
                                            Vmax/[E], mide la eficiencia de la enzima
                                            cuando la enzima está saturada con
                                            sustrato.
                                            Constante de especificidad: kcat/Km,
                                            ayuda a medir la eficiencia de la enzima.
Control de la actividad enzimática:
                                              cinética de las enzimas

                                                Inhibición enzimática
                                                  Inhibidor competitivo
                                                  Inhibidor no-competitivo
                                                  Inhibidor de incompetencia




Control de la actividad enzimática:
tipos de enzimas

  Formas inactivas
    Zimógeno
  Isoenzimas
    Catalizan la misma reacción pero varían
    en estructura y propiedades
  Sistemas multienzimáticos
    Grupo de enzimas que catalizan una
    reacción en secuencia
Control de la actividad enzimática:
tipos de enzimas

  Enzimas reguladoras
    Son clave en la regulación de una ruta
    metabólica.
  Mecanismos de retroalimentación
    Una enzima actúa sobre un paso determinado.
  Modificación covalente
    Formación o rompimiento de un enlace
    covalente.
  Modificación alostérica
    Enlace de un efector positivo o negativo.




                                                  Control de la actividad enzimática:
                                                  tipos de enzimas

                                                    Enzimas alostéricas
                                                      Sufren cambios conformacionales en
                                                      respuesta a enlace de efectores o
                                                      moduladores.
                                                      Ejemplos:
                                                         inhibidores
                                                         activadores
Acción de las enzimas alostéricas

  Modelo secuencial
    La enzima contiene subunidades.
    Cuando se enlaza el sustrato cambia la
    conformación de la subunidad.
    Enlace cooperativo




Acción de las enzimas alostéricas

  Modelo concertado
    La enzima existe en equilibrio entre dos
    conformaciones o estados: relajado (R) o
    tenso (T).
    En el estado R se enlaza el sustrato y el
    activador.
    En el estado T se enlaza el inhibidor.
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  • 1. INTRODUCCION ENZIMAS Historia: 1700: estudios de la digestión de carnes mediante secreciones del estómago. 1800: convertir almidón en azúcar mediante CAPITULO 4 la saliva. 1810: comienzan estudios sobre fermentación. 1850: Louis Pasteur concluyó estudios sobre fermentación de azúcares en alcoholes por levadura y catalizado por fermentos. INTRODUCCION AGENTES CATALITICOS Historia: 1897: Buchner descubrió que los extractos Cambian la velocidad de una reacción de levadura podían convertir el azúcar en química. alcohol. Fermentación se llevaba a cabo por la presencia de moléculas. Aceleran la reacción en ambas direcciones Kühne llamó las moléculas enzimas. disminuyendo la energía de activación. 1926: ureasa fue aislada y cristalizada. Funcionan en reacciones que pueden 1930: pepsina, tripsina, y otras enzimas ocurrir sin su presencia (exergónica). digestivas fueron cristalizadas. Permanecen inalterados al final de la reacción.
  • 2. ESPECIFICIDAD ENZIMAS ENZIMATICA La especificidad enzimática puede CATALISIS ENZIMATICA variar. Las enzimas son los agentes catalíticos de los sistemas biológicos. Pasos que ocurren durante la acción Todas las enzimas son proteínas excepto enzimática: las riboenzimas. Sustrato se enlaza a la enzima. Aumentan la velocidad de una reacción hasta por un factor de 1014 . Ocurren alteraciones químicas que Son altamente específicas. incluyen rompimiento y formación de La acción enzimática es regulada. enlaces. La enzima libera el producto de la reacción. Teorías que explican la actividad enzimática: Llave y cerradura: específica; un sustrato y una enzima. Adaptación inducida: menos específica, el centro activo se ajusta al sustrato que interviene. Teoría de poliafinidad: enzima y sustrato poseen por lo menos tres puntos de contacto, sólo uno de dos grupos idénticos del carbono proquiral es orientado correctamente.
  • 3. Clasificación enzimática 1. Oxidoreductasas: transferencia de electrones 2. Transferasas: transferencia de grupos 3. Hidrolasas: reacciones de hidrólisis 4. Liasas: adición de grupos a dobles enlaces 5. Isomerasas: transferencia de grupos en la molécula 6. Ligasas: formación de enlaces Clasificación enzimática De acuerdo al número de la Comisión Enzimática (Enzyme Commission number) Primer #: tipo de reacción catalizada. Segundo #: indica la subclase; dice el tipo de sustrato o el enlace que se rompe en forma mas precisa. Tercer #: indica la sub-subclase; nos dice el tipo de aceptador de electrones (oxidoreductasas) o el tipo de grupo que se remueve (liasas), etc. Cuarto #: indica el número de serie de la enzima en su sub-subclase.
  • 4. Mecanismos de acción Mecanismos de acción Estado de transición: forma activa de una Energía de activación: cantidad de molécula en la cual la molécula realiza una energía necesaria para convertir todas reacción química parcial. las moléculas de un mol de sustancia Energía libre: componente de la energía reaccionando de su estado raso a su total de un sistema que puede realizar estado de transición. trabajo a temperatura y presión constante. Las enzimas aumentan la velocidad de ΔG reacción = G productos – G reactivos la reacción disminuyendo la energía de Reacción endergónica: ΔG es negativo activación, pero no afectan los ΔG = ΔH - TΔS aspectos termidinámicos de las reacciones.
  • 5. Eficiencia enzimática Se describe con el “turnover number”: número de moles de sustrato transformado en producto por mol de enzima por segundo. Mayor el “turnover number” mayor la eficiencia. Equivale a: Vmax/[Et] Factores que determinan la Unidades enzimáticas catálisis (eficiencia) La concentración de las enzimas se Proximidad y orientación: debe existir una expresa en términos de su actividad: interacción entre el sustrato y el centro Unidad enzimática: cantidad de enzima activo. que produce la transformación de un micromol de sustrato por minuto bajo Efectos electrostáticos: constante condiciones definidas. dieléctrica baja lo que permite estabilizar Actividad específica: número de unidades estados de transición polares; mejor por miligramo de proteína total. interacción. Actividad total: número total de unidades enzimáticas.
  • 6. Factores que determinan la Factores que determinan la catálisis (eficiencia) catálisis (eficiencia) Factores de entropía: la pérdida en entropía es Catálisis ácido-base: interacción entre más pequeña que la de las reacciones en grupos ácidos y básicos. solución porque los reactivos, los estados de transición y los productos están enlazados a la Catálisis covalente: interacción entre enzima. la enzima y el sustrato es inestable; Distorciones: cambios en la conformación sustrato se convierte en producto con cuando se enlaza la enzima. Hay distorción del más rápidez. sustrato, se destabilizan los enlaces y se forman o rompen con más facilidad los enlaces. Regulación actividad enzimática Puede llevarse a cabo por: Control de la cantidad de enzima: número actual de moléculas de enzima por célula en un tiempo dado. Control de la actividad enzimática: efectividad actual de las moléculas de enzima en una célula determinada.
  • 7. Control de la actividad enzimática: propiedades de las enzimas Velocidad de la reacción: rapidez con la que procede una reacción. Cambio en concentración de producto (aparece) o reactivo ( desaparece) por unidad de tiempo. Concentración: hipérbola; mayor concentración de sustrato la enzima se satura y la velocidad de reacción es máxima. Tiempo de reacción: la velocidad disminuye con el tiempo.
  • 8. Control de la actividad enzimática: propiedades de las enzimas pH: óptimo Temperatura: óptima Control de la actividad enzimática: propiedades de las enzimas Cofactores, vitaminas y hormonas: Enzimas conjugadas: apoenzima y cofactor forma la holoenzima. Cofactores: grupo prostético Vitaminas: solubles en agua Hormonas: pueden afectar la cantidad o la actividad de las enzimas.
  • 9. Ejemplos de metales usados como cofactores ENZYMES Cu+2 oxidasa de citocromo (holoenzyme) catalasa, peroxidasa Fe+2 o Fe+3 K+ quinasa de piruvato Apoenzyme Chemical component hexoquinasa (amino acid portion) (non-amino acid portion) Mg+2 Mn+2 arginasa Mo dinitrogenasa Cofactor Ni+2 ureasa Se peroxidasa de glutationa metals coenzymes prosthetic group dehidrogenasa de alcohol Zn+2 Control de la actividad enzimática: COENZIMAS propiedades de las enzimas Coenzima Reacción Vitamina Biocitina CO2 Biotina Inhibidores Reversibles Coenzima A Grupo acil Ac. Pantotenico Competitivo: Compite con el sustrato por el centro activo. Se Coenz. B12 H y alquilos Vitamina B12 parecen al sustrato. E + I EI (no catálisis) No competitivo: el inhibidor no compite con el sustrato. FAD, FMN Electrones Riboflavin Inhibidor tiene un punto diferente de enlace. Puede enlazar la E o el complejo ES. E + I EI + S EIS or E + S ES + I NAD, NADP Electrones Niacina EIS Fosfato de Grupos aminos Piridoxina De incompetencia: el inhibidor se enlaza directamente al piridoxal complejo enzima-sustrato y no a la enzima libre. E + S ES Pirofosfato Tiamina Aldehidos Tiamina + I ---> EIS (no reaccion). Tetrahidrofolato Un carbono Ac. folico
  • 10. Inhibidor competitivo Inhibidor competitivo Inhibidor no-competitivo
  • 12. Control de la actividad enzimática: Control de la actividad enzimática: propiedades de las enzimas cinética de las enzimas Inhibidores Estado raso (steady state): Irreversibles: se combina con o destruye un Velocidad de formación = Velocidad de grupo funcional necesario para la actividad desaparición enzimática. Se forma un enlace covalente. Ecuación Michaelis-Menten Ejemplo: Inhibidores de acetilcolinesterasa.Interfiere El modelo de Michaelis-Menten presenta la con la secuencia del impulso nervioso. formación del complejo enzima-sustrato. Diisopropylphosphofluoridate, tabun y sarin La concentración del complejo es baja, pero (nerve gases) permanece constante durante la reacción. Parathion and malathion El sustrato se convierte en producto. E+S ES E+P
  • 13. Control de la actividad enzimática: Control de la actividad enzimática: cinética de las enzimas cinética de las enzimas Ecuación Michaelis-Menten Ecuación Michaelis-Menten KM es igual a la concentración de V max [S ] sustrato cuando 50% de los centros activos de la enzima están ocupados. V = K M + [S ] También representa cuán fuerte la enzima se enlaza al sustrato. VMAX está relacionado con el turnover V max Km = [ S ], cuandoVo = number 2 Gráfica Lineweaver-Burk Control de la actividad enzimática: cinética de las enzimas Medidas de la actividad enzimática Ks: mayor la afinidad de la enzima por el sustrato, mayor la concentración [ES] y menor el Ks. Constante de velocidad catalítica: Vmax/[E], mide la eficiencia de la enzima cuando la enzima está saturada con sustrato. Constante de especificidad: kcat/Km, ayuda a medir la eficiencia de la enzima.
  • 14. Control de la actividad enzimática: cinética de las enzimas Inhibición enzimática Inhibidor competitivo Inhibidor no-competitivo Inhibidor de incompetencia Control de la actividad enzimática: tipos de enzimas Formas inactivas Zimógeno Isoenzimas Catalizan la misma reacción pero varían en estructura y propiedades Sistemas multienzimáticos Grupo de enzimas que catalizan una reacción en secuencia
  • 15. Control de la actividad enzimática: tipos de enzimas Enzimas reguladoras Son clave en la regulación de una ruta metabólica. Mecanismos de retroalimentación Una enzima actúa sobre un paso determinado. Modificación covalente Formación o rompimiento de un enlace covalente. Modificación alostérica Enlace de un efector positivo o negativo. Control de la actividad enzimática: tipos de enzimas Enzimas alostéricas Sufren cambios conformacionales en respuesta a enlace de efectores o moduladores. Ejemplos: inhibidores activadores
  • 16. Acción de las enzimas alostéricas Modelo secuencial La enzima contiene subunidades. Cuando se enlaza el sustrato cambia la conformación de la subunidad. Enlace cooperativo Acción de las enzimas alostéricas Modelo concertado La enzima existe en equilibrio entre dos conformaciones o estados: relajado (R) o tenso (T). En el estado R se enlaza el sustrato y el activador. En el estado T se enlaza el inhibidor.