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Mesure locale de la vitesse de
l’onde de pression artérielle
par l’IRM dynamique




UMR 6600 – GE            UTC – Master 2 STS
Hôpital Necker               Hassan Nasser
Plan
• Introduction.
• Etat de l’art:
   – Biologie des artères carotides.
   – Le VOP dans la littérature.
• Matériels et Méthodes:
   –   Acquisition des images.
   –   Segmentation et courbes de surfaces.
   –   Calcul de la VOP.
   –   Interface graphique.
• Résultats et Discussion.
• Perspectives.
INTRODUCTION
Environnement du travail
• UTC – UMR 6600
  (Encadrement – Mr. F.
  Langevin) – CIMA.
• Hôpital Necker
  (Acquisitions des Images
  – Suivi pas Mr. F.
  Brunelle)
• GE (Machine IRM – Ing.
  M. Perrin)
Vitesse de l’onde de pression
• Imagerie -/-/- hémodynamique sanguin.


               Ultrasons       IRM




• Propriétés   biomécaniques   -/-/-   Signe
  clinique.
ETAT DE L’ART
Artères carotides
VOP – Bibliographie (1)
• Méthode Multicoupes [J. M. Boese et al.,
  2000].




  (a) Localisation de plusieurs coupes dans une artère. (b) Profil des vitesses au niveau des   Relation temps-position dans la méthode multicoupes
  trois coupes, tangentes et calcul du temps de passage de l’onde afin d’établir une relation
                                         temps-position
VOP – Bibliographie (2)
• Méthode QA / Ultrasons [Rabben, S.I. et
  Stergiopulos, N., 2004]




   (A) Diamètre du vaisseau (continue), Vitesse maximale (--) dans l’artère carotide commune gauche. (B) flux sanguin.
                                    (C) le flux en fonction de la section de l’artère.
VOP – Bibliographie (3)
• Méthode de correlation [A. Qasem et A.
  Avolio, 2008]




                      La décomposition de l’onde artérielle en onde directe et rétrograde

Site de   Site de
mesure    Réflexion
MATÉRIELS ET MÉTHODES
Principe de mesure
• Calcul du Délai entre deux               Interne    Externe
  courbes de surfaces au niveau de
  deux coupes distantes de 4 cm
  environ.



• Le Passage de l’onde est reliée à
  la variation de la section de l’artère


                                            Artère Carotide primitive
Matériels
• IRM 1.5 T (CIMA –
  Necker).
• IRM 3 T ( CHU
  Amiens).
• Antenne:
  – Carotide
    (Surfacique).
  – Neurovasculaire
    (Volumique).
Acquisition des images
• Séquence FCGRE
 – Séquence dynamique / Lumière de l’artère =
   Blanc.




    Chronogramme de la séquence FCGRE

                                        Image axiale au niveau des carotides
Dynamique?
Optimisation de séquences
              selon l’antenne
                                Antenne Carotides             Antenne neurovasculaire

          SNR                     Grand (800 u.a)                  Petit (250 u.a)
         Volume                        Petit                           Grand
                             Paramètres de la séquence
        TR (ms)                       5/minimum (Déterminé par l’appareil)
        Tck (mm)                        4                                5
        TD (ms)                                          10
          ARW                                         20 %
     FOV (cm x cm)                    14 x 14                         16 x 16
           TE                          Minimum (Déterminé par l’appareil)
          BWD                          62.5                              50
        Flip Angle                      50                               50
Dimensions (Pixel x Pixel)                          256 x 256
Extraction des courbes de
                surfaces
• Segmentation adaptative [Darwich, M.,
  Capellino, S., Langevin, F. , 2008].
Segmentation
Image
Référence


Image
turbulence


             Selection    Interpolation   Seuillage   Sélection    Erosion –      Calcul de
             de la        - Filtrage                  de l’objet   dilatation     la surface
             region                                   ayant la
             d’ intérêt                               plus         Adaptation
                                                      grande       du contour
                                                      surface      avec l’image
                                                                   reference
Image: 31 / Area= 32.6653 mm² /
                                  Courbes de surface
                                   Segmented image number: 31   Image: 32 / Area= 32.8315 mm² /   Segmented image number: 32




Image: 33 / Area= 32.8315 mm² /    Segmented image number: 33   Image: 34 / Area= 32.4327 mm² /   Segmented image number: 34




Image: 35 / Area= 31.7681 mm² /    Segmented image number: 35   Image: 36 / Area= 31.469 mm² /    Segmented image number: 36




Image: 37 / Area= 31.8014 mm² /    Segmented image number: 37   Image: 38 / Area= 31.5687 mm² /   Segmented image number: 38




Image: 39 / Area= 31.3361 mm² /    Segmented image number: 39   Image: 40 / Area= 30.5386 mm² /   Segmented image number: 40
Deux coupes …
Là … on peut mesure la VOP
• En calculant le délai entre les deux courbes …

• 3 méthodes:

   – Inter corrélation.
   – Point d’inflexion.
   – Distance moyenne.


• La pente.
Inter corrélation
Point d’inflexion
• Hypothèse : le passage de l’onde de pression peut être caractérisé
  comme le moment de variation maximale de surface de l’artère
  (dilatation la plus importante).
Distance moyenne
       -Lissage.

       -Interpolation.

       -Normalisation.

       -Détermination de la
       zone d’intérêt (pente).

       -Calcul la moyenne du
       décalage      entre les
       points de la pente.
Interfaçage graphique GUI

-Créer un outil capable de:

   -Faire toutes les étapes de la mesure dans une seule
   interface.

   -Montrer tous les résultats dans une seule fenêtre.

   -Créer et gérer les fichiers des patients.

   -D’être utilisé par quelqu’un qui ne maitrise pas la
   programmation Matlab.
Coupe Inferieure   Coupe supérieure   Courbes de surfaces




       Images segmentées
Message

             SNR




Paramètres
de la
séquence



                   Surface
RÉSULTATS ET DISCUSSION
Calcul de la VOP avec les différentes
    méthodes de calcul de délai
  Patient                        M1                        M2                       M3
                         D             G           D            G            D                G
            1            2.5           2.3         2.4          2.8          2.4             2.7
            2            ---           2.2         ----         2.2          ---             2.7
            3            3.5           2.3         3.6          3.2          3.3             2.7
            4            4.5           ----        4.7          ---          4.6             ---


                       Valeurs moyennes de la VOP avec les 3 méthodes de calcul de délai

            Patient               M1                       M2                       M3

                             D           G           D           G            D               G

                1         0.24          0.18       0.32         0.56         0.39            0.33

                2          ---          0.19        ----        0.23          ---            0.24
                3          0.8          0.13       0.75          0.9         1.17            0.29
                4         0.85          0.56        0.6          ---                         ---


                      Déviation standards de la VOP avec les 3 méthodes de calcul de délai
Calcul de la VOP avec différents paramètres
              de segmentation
                                            VOP

        h                      min   M1     M2    M3

       0.7                      6    3.2    3.5   3.4
                                8    4.0    4.0   3.9
                               10    3.5    2.9   3.2

       0.75                     6    5.7    4.9   5.1

                                8    3.2    2.6   3.3
                               10    4.45   3.8   4.1

       0.8                      6    3.2    3.4   3.1

                                8    3.3    3.1   3.1
                               10    3.3    3.3   3.1
       0.85                     6    3.5    3.2   3.3

                                8    3.3    2.9   3.2

                               10     3     2.8   3.1
       0.9                      6    2.3    2.2   2.3
                                8    3.3    3.3   3.1

                               10    3.8    2.8   3.5

                Moyenne              3.5    3.3   3.4
              Dérivation St.         0.7    0.6   0.6
Discussion - Influence des
            différents paramètres
• Au niveau des acquisitions : (STD 0.3 m/s)
   –   La grandeur du champ magnétique.
   –   L’antenne utilisée.
   –   Le temps de répétition.
   –   L’épaisseur de la coupe.
   –   Distance entre les deux coupes.
• Au niveau de segmentation : (STD – 0.2 m/s)
   – Le facteur de seuillage.
   – Le facteur de correction de l’effet de la turbulence.
• Au niveau du calcul du délai : (STD – 0.5 m/s)
   – La méthode avec laquelle on calcul le délai
Conclusion
• Optimisation de la séquence avec une                       antenne
  volumique.
• Méthodes de calcul de délai.
• Etude de la reproductibilité de la mesure.
• Avantages:
   –   Mesure locale.
   –   Non-invasif.
   –   Temps d’examen relativement court ( 7 – 10 min).
   –   Non operateur dépendante
• Inconvénient:
  •    Dépend des paramètres de segmentation, antenne, Machine  Erreur
       qui ne dépasse pas le 10 %)
Perspectives (1)
• Corrélation entre la
  pression intracrânienne et
  la VOP.

  – VOP = ft (PA). [Mitchell,
    G.F et al., 2007]
  – PIC = ft (PA).
   PIC = ft (VOP).

           [Otahal, J., Stephanik, Z., 2006]
Perspectives (2)
• Mesure de la pression artérielle dans
  l’artère pulmonaire:
  – Pression est en fonction linéaire avec la
    rigidités de l’artère (dépend seulement de la
    rigidité)
  – Calibration pression-VOP.
Au niveau personnel
• Expérience en IRM.
   – Maitrise de la machine.
   – Optimisation des séquences.


• Contact avec       des   chercheurs,   médecins,   cadres
  scientifique.

• Plus de connaissance et des compétences scientifiques.

• Motivation pour continuer dans le domaine de recherche.
Merci pour votre attention

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Presentation of local estimation of pressure wave velocity from dynamic MR images

  • 1. Mesure locale de la vitesse de l’onde de pression artérielle par l’IRM dynamique UMR 6600 – GE UTC – Master 2 STS Hôpital Necker Hassan Nasser
  • 2. Plan • Introduction. • Etat de l’art: – Biologie des artères carotides. – Le VOP dans la littérature. • Matériels et Méthodes: – Acquisition des images. – Segmentation et courbes de surfaces. – Calcul de la VOP. – Interface graphique. • Résultats et Discussion. • Perspectives.
  • 4. Environnement du travail • UTC – UMR 6600 (Encadrement – Mr. F. Langevin) – CIMA. • Hôpital Necker (Acquisitions des Images – Suivi pas Mr. F. Brunelle) • GE (Machine IRM – Ing. M. Perrin)
  • 5. Vitesse de l’onde de pression • Imagerie -/-/- hémodynamique sanguin. Ultrasons IRM • Propriétés biomécaniques -/-/- Signe clinique.
  • 8. VOP – Bibliographie (1) • Méthode Multicoupes [J. M. Boese et al., 2000]. (a) Localisation de plusieurs coupes dans une artère. (b) Profil des vitesses au niveau des Relation temps-position dans la méthode multicoupes trois coupes, tangentes et calcul du temps de passage de l’onde afin d’établir une relation temps-position
  • 9. VOP – Bibliographie (2) • Méthode QA / Ultrasons [Rabben, S.I. et Stergiopulos, N., 2004] (A) Diamètre du vaisseau (continue), Vitesse maximale (--) dans l’artère carotide commune gauche. (B) flux sanguin. (C) le flux en fonction de la section de l’artère.
  • 10. VOP – Bibliographie (3) • Méthode de correlation [A. Qasem et A. Avolio, 2008] La décomposition de l’onde artérielle en onde directe et rétrograde Site de Site de mesure Réflexion
  • 12. Principe de mesure • Calcul du Délai entre deux Interne Externe courbes de surfaces au niveau de deux coupes distantes de 4 cm environ. • Le Passage de l’onde est reliée à la variation de la section de l’artère Artère Carotide primitive
  • 13. Matériels • IRM 1.5 T (CIMA – Necker). • IRM 3 T ( CHU Amiens). • Antenne: – Carotide (Surfacique). – Neurovasculaire (Volumique).
  • 14. Acquisition des images • Séquence FCGRE – Séquence dynamique / Lumière de l’artère = Blanc. Chronogramme de la séquence FCGRE Image axiale au niveau des carotides
  • 16.
  • 17. Optimisation de séquences selon l’antenne Antenne Carotides Antenne neurovasculaire SNR Grand (800 u.a) Petit (250 u.a) Volume Petit Grand Paramètres de la séquence TR (ms) 5/minimum (Déterminé par l’appareil) Tck (mm) 4 5 TD (ms) 10 ARW 20 % FOV (cm x cm) 14 x 14 16 x 16 TE Minimum (Déterminé par l’appareil) BWD 62.5 50 Flip Angle 50 50 Dimensions (Pixel x Pixel) 256 x 256
  • 18. Extraction des courbes de surfaces • Segmentation adaptative [Darwich, M., Capellino, S., Langevin, F. , 2008].
  • 19. Segmentation Image Référence Image turbulence Selection Interpolation Seuillage Sélection Erosion – Calcul de de la - Filtrage de l’objet dilatation la surface region ayant la d’ intérêt plus Adaptation grande du contour surface avec l’image reference
  • 20. Image: 31 / Area= 32.6653 mm² / Courbes de surface Segmented image number: 31 Image: 32 / Area= 32.8315 mm² / Segmented image number: 32 Image: 33 / Area= 32.8315 mm² / Segmented image number: 33 Image: 34 / Area= 32.4327 mm² / Segmented image number: 34 Image: 35 / Area= 31.7681 mm² / Segmented image number: 35 Image: 36 / Area= 31.469 mm² / Segmented image number: 36 Image: 37 / Area= 31.8014 mm² / Segmented image number: 37 Image: 38 / Area= 31.5687 mm² / Segmented image number: 38 Image: 39 / Area= 31.3361 mm² / Segmented image number: 39 Image: 40 / Area= 30.5386 mm² / Segmented image number: 40
  • 22. Là … on peut mesure la VOP • En calculant le délai entre les deux courbes … • 3 méthodes: – Inter corrélation. – Point d’inflexion. – Distance moyenne. • La pente.
  • 24. Point d’inflexion • Hypothèse : le passage de l’onde de pression peut être caractérisé comme le moment de variation maximale de surface de l’artère (dilatation la plus importante).
  • 25. Distance moyenne -Lissage. -Interpolation. -Normalisation. -Détermination de la zone d’intérêt (pente). -Calcul la moyenne du décalage entre les points de la pente.
  • 26. Interfaçage graphique GUI -Créer un outil capable de: -Faire toutes les étapes de la mesure dans une seule interface. -Montrer tous les résultats dans une seule fenêtre. -Créer et gérer les fichiers des patients. -D’être utilisé par quelqu’un qui ne maitrise pas la programmation Matlab.
  • 27. Coupe Inferieure Coupe supérieure Courbes de surfaces Images segmentées
  • 28. Message SNR Paramètres de la séquence Surface
  • 29.
  • 31. Calcul de la VOP avec les différentes méthodes de calcul de délai Patient M1 M2 M3 D G D G D G 1 2.5 2.3 2.4 2.8 2.4 2.7 2 --- 2.2 ---- 2.2 --- 2.7 3 3.5 2.3 3.6 3.2 3.3 2.7 4 4.5 ---- 4.7 --- 4.6 --- Valeurs moyennes de la VOP avec les 3 méthodes de calcul de délai Patient M1 M2 M3 D G D G D G 1 0.24 0.18 0.32 0.56 0.39 0.33 2 --- 0.19 ---- 0.23 --- 0.24 3 0.8 0.13 0.75 0.9 1.17 0.29 4 0.85 0.56 0.6 --- --- Déviation standards de la VOP avec les 3 méthodes de calcul de délai
  • 32. Calcul de la VOP avec différents paramètres de segmentation VOP h min M1 M2 M3 0.7 6 3.2 3.5 3.4 8 4.0 4.0 3.9 10 3.5 2.9 3.2 0.75 6 5.7 4.9 5.1 8 3.2 2.6 3.3 10 4.45 3.8 4.1 0.8 6 3.2 3.4 3.1 8 3.3 3.1 3.1 10 3.3 3.3 3.1 0.85 6 3.5 3.2 3.3 8 3.3 2.9 3.2 10 3 2.8 3.1 0.9 6 2.3 2.2 2.3 8 3.3 3.3 3.1 10 3.8 2.8 3.5 Moyenne 3.5 3.3 3.4 Dérivation St. 0.7 0.6 0.6
  • 33. Discussion - Influence des différents paramètres • Au niveau des acquisitions : (STD 0.3 m/s) – La grandeur du champ magnétique. – L’antenne utilisée. – Le temps de répétition. – L’épaisseur de la coupe. – Distance entre les deux coupes. • Au niveau de segmentation : (STD – 0.2 m/s) – Le facteur de seuillage. – Le facteur de correction de l’effet de la turbulence. • Au niveau du calcul du délai : (STD – 0.5 m/s) – La méthode avec laquelle on calcul le délai
  • 34. Conclusion • Optimisation de la séquence avec une antenne volumique. • Méthodes de calcul de délai. • Etude de la reproductibilité de la mesure. • Avantages: – Mesure locale. – Non-invasif. – Temps d’examen relativement court ( 7 – 10 min). – Non operateur dépendante • Inconvénient: • Dépend des paramètres de segmentation, antenne, Machine  Erreur qui ne dépasse pas le 10 %)
  • 35. Perspectives (1) • Corrélation entre la pression intracrânienne et la VOP. – VOP = ft (PA). [Mitchell, G.F et al., 2007] – PIC = ft (PA).  PIC = ft (VOP). [Otahal, J., Stephanik, Z., 2006]
  • 36. Perspectives (2) • Mesure de la pression artérielle dans l’artère pulmonaire: – Pression est en fonction linéaire avec la rigidités de l’artère (dépend seulement de la rigidité) – Calibration pression-VOP.
  • 37. Au niveau personnel • Expérience en IRM. – Maitrise de la machine. – Optimisation des séquences. • Contact avec des chercheurs, médecins, cadres scientifique. • Plus de connaissance et des compétences scientifiques. • Motivation pour continuer dans le domaine de recherche.
  • 38. Merci pour votre attention