10. CARACTÈRES ET ÉTATS Transition: Changement d’état. Différentes façons de représenter les transitions:
11.
12. Déterminé sur la base des données paléontologiques…Aquatiques Figure tirée de Bininda-Emonds et al., 1999.
13. CARACTÈRES ET ÉTATS Aquatique = dérivé Temps LIGNÉE Terrestre = primitif Changement
14. CARACTÈRES ET ÉTATS Aquatique = apomorphique Temps LIGNÉE Terrestre = plésiomorphique Changement
15. CARACTÈRES ET ÉTATS Si on veut parler des taxons qui présentent ces caractères: Aquatique = descendant Temps LIGNÉE Terrestre = ancestral Changement
16. CARACTÈRES ET ÉTATS Caractère dérivé unique. Autapomorphie Caractère dérivé partagé.Synapomorphie Origine indépendante Homoplasie
32. Figure tirée de Campbell, Biology, 6th ed. CLASSIFICATION DES ORGANISMES
33. DESCRIPTION DES RELATIONS PHYLOGÉNÉTIQUES Clade : Groupe de taxons descendant d’un ancêtre commun. F&H, Fig. 4.1
34. DESCRIPTION DES RELATIONS PHYLOGÉNÉTIQUES 2 3 Reptiles : pas un clade 1 Clade : Groupe de taxons descendant d’un ancêtre commun. Taxons frères : Plus proches parents. Figure tirée de Campbell, Biology, 6th ed.
40. DESCRIPTION DES RELATIONS PHYLOGÉNÉTIQUES Einae † † Les noeuds terminaux sont les espèces vivantes. Groupe couronne : Le clade qui inclut toutes les espèces vivantes et leur DAC.
41. DESCRIPTION DES RELATIONS PHYLOGÉNÉTIQUES Einae † † Groupe tige : Groupe d’espèces éteintes qui sont plus proche du groupe couronne que d’aucun autre groupe.
42. DESCRIPTION DES RELATIONS PHYLOGÉNÉTIQUES Aves (Oiseaux) Moa Fossile Groupe total : Couronne + Tige Archaeopteryx Tyranosaurus
43.
44.
45. DESCRIPTION DES RELATIONS PHYLOGÉNÉTIQUES Groupe à l’étude = Groupe interne : On assume ce groupe monophylétique.
46. DESCRIPTION DES RELATIONS PHYLOGÉNÉTIQUES Groupe externe: Groupe d’organismes plus ou moins éloignés du groupe interne.
50. L’ANALYSE PHYLOGÉNÉTIQUE But : Estimer le plus fidèlement possible la phylogénie d’un groupe. Méthode classique La parcimonie : Approche qui consiste à minimiser le nombre de transitions sur un arbre.