E-investigación bibliográfica: Web 2.0 y 3.0, teoría y práctica plática en 3M México, 8 agosto 2010

1. E-investigación
bibliográfica:
Web 2.0 y 3.0, teoría y
práctica
Layla Michán
Departamento de Biología Comparada

2. Laboratorio de Cienciometría, Información e Informática en Ciencias Biológicas
Facultad de Ciencias, UNAM
PROBLEMAS ENFOQUE MULTIDISCIPLINARIO
1. (R)evolución digital en las ciencias 1.Ciencia
2. Características de la E-ciencia 2. Ciencias de la información y
3. Dinámica, estructura y relaciones de la ciencia reciente documentación
4. Publicación científica en la Web 3. Tecnologías de la Información y
5. Recursos web y ciberinfraestructura para ciencia comunicación
6. Colecciones de datos 4.Ciencias de la computación e informática
7. Meta-análisis de literatura: bibliometría, análisis de redes, 5.Historia, sociología, filosofía y
minería de textos, semántica comunicación de la ciencia
TIPOS
1.científica
2.Bibliográfica 1. Objeto
3.Institucional INFORMACIÓN 2. Proceso
CIENTÍFICA 3. Producto
ÁREAS (Literatura)
1.Biodiversidad
2.Biomedicina
APLICACIONES
1.Análisis de la ciencias biológicas actuales: desarrollo, dinámica, estructura, relaciones y tendencias
2.Información e informática en ciencias , relacionadas y afines
3.Obtención de nuevo conocimiento científico
4.Planeación, evaluación, gestión y política científica

3. • Estructura
• Desarrollo
Impacto de la • Tendencias
revolución digital en • Métodos
biología • Patrones
Análisis de las
Ciencias Biológicas • Relaciones
Teorías
Métodos
Difundir
Herramientas electrónicas
Bibliometría
Análisis de redes
Búsqueda
Minería de textos
Recuperación
Semántica Manejo
Meta-análisis

4. Enfoques
actuales
Información, informática
y cienciometría
para el estudio del
envejecimiento
Retos
Perspectivas

5. (Re)evolución de la información
• Diseño de las computadoras, aparición del Internet masificación de
la web.
• Formato digital: bajo costo, poco espacio.
• Explosión de la información.
• Desapareció la distinción entre escribir y publicar, se volvió un
proceso simultáneo.
• Gran cantidad de colecciones de datos .
• Dinámica: cambia, está en modificación constante, tanto el
contenido como los formatos.
• Masiva
• Democrática: Cualquiera puede publicar información sin revisión o
edición

6. Contenido
• Introducción
– La Web 2.0 y 3.0

7. • Seis grados de separación es una teoría que intenta probar que
cualquiera en la Tierra puede estar conectado a cualquier otra persona del
planeta a través de una cadena de conocidos que no tiene más de cinco
intermediarios (conectando a ambas personas con sólo seis enlaces) o más
popularmante que "el mundo es un pañuelo". La teoría fue inicialmente
propuesta en 1930 por el escritor húngaro Frigyes Karinthy en un cuento
llamadoChains. El concepto está basado en la idea de que el número de
conocidos crece exponencialmente con el número de enlaces en la cadena,
y sólo un pequeño número de enlaces son necesarios para que el conjunto
de conocidos se convierta en la población humana entera.
• Según esta teoría, cada persona conoce de media, entre amigos, familiares
y compañeros de trabajo o escuela, a unas 100 personas. Si cada uno de
esos amigos o conocidos cercanos se relaciona con otras 100 personas,
cualquier individuo puede pasar un recado a 10.000 personas más tan sólo
pidiendo a un amigo que pase el mensaje a sus amigos.

8. E-ciencia
LA WEB

10. Efecto 10X
• En la industria de TI, la tecnología y el
uso evoluciona más rápido que tal vez en
cualquier otra industria.
• Como regla general, los
sistemas pueden crecer 10 veces en su actual
arquitectura o paradigma, entonces debe ser r
ediseñado.
• Este efecto hace que las tecnologías
de 10X de edad para convertirse
en los obsoletos y los nuevos que surjan.

11. Ley de Moore
• Describe el número de
transistores que pueden
caber en un circuito
integrado.
• Se duplica
aproximadamente cada 18
meses.
• La Internet se duplicará
en tamaño cada 5. 32
años.

14. Teoría de la evolución tecnológica
•
Según Richta y más tarde Bloomfield, [1] [2]
• La tecnología (que Richta define como "una
entidad material creado por la aplicación de un esfuerzo
mental y físico de la naturalezacon el fin de alcanzar un cierto
valor") se desarrolla en tres etapas: herramientas,máquina ,
La automatización.
• Esta evolución, dice, sigue dos tendencias: la sustitucióndel
trabajo físico, con más trabajo intelectual eficaz y el resultado
del grado mayor decontrol sobre el medio
ambiente natural, incluyendo la
capacidad para transformarmaterias primas en
productos cada vez más complejo y flexibl

15. E-ciencia
LA WEB

16. Cloud computing (cómputo en nube)
Es un enfoque transformador de la computación que involucra
muchos aspectos, entre los que se incluyen:
algoritmos a gran escala que se ejecutan en diversos conjuntos de
datos (estructurados, semi-estructurados y no estructurados),
almacenados en grandes equipos con enormes cantidades de datos
de enorme,
utilidades basadas en la rápida provisión de recursos informáticos
personalizados, y la web ubicua con aplicaciones accesibles
desde cualquier lugar.
Sin embargo, es mucho más que lo que la tecnología promete:
transformar radicalmente nuestra manera de interactuar con
la información.

17. Ecosistemas digitales
• En el mundo de Internet, el rápido crecimiento y el uso exponencial de
los medios digitales ha dado lugar a la aparición de
entornos virtuales denominados ecosistemas digitales.
• Están integrados por varias entidades independientes, como: individuos,
organizaciones, servicios, software y aplicaciones para
compartir una o varias misiones y centrarse sobre las interacciones e
interrelaciones entre ellos.
• Permiten la auto-organización de los ambientes, gracias a la
recombinación y la evolución de sus "componentes digitales", en
los que los recursos proporcionados
por cada entidad están bien conservadas y son factibles de gestionar y
utilizar en conjunto.
• Debido a la naturaleza multidisciplinar de los ecosistemas digitales
y sus características, son muy complejos para el estudio y diseño.
http://130.102.71.54/medes

18. ¿Qué son los Ecosistemas digitales?
Exhiben ambientes virtuales, gracias a la re-combinación y evolución de sus
―componentes virtuales‖
En el mundo del Internet, constantemente
Ambiente virtuales
hay un crecimiento rápido y exponencial
usando los medios digitales
Ecosistemas digitales
Formados por entidades múltiples e independientes:
• individuos
• organizaciones
• servicios Interacciones e interelaciones entre
• software equipos
• aplicaciones para compartir

19. La aplicación de las Tecnologías de la información pueden
ser mejoradas a través de técnicas novedosas, modelos y
metodologías para cada archivo como:
• la gestión de datos
• tecnologías Web
• redes
• seguridad
• interacciones computadora-humano
• inteligencia artificial
• e-servicios
• sistemas de auto-organización
Comprenden:
•manejo de datos Soporta la estabilidad de
los ecosistemas
•servicios innovadores
digitales y el manejo de
•inteligencia computacional sus recursos
•plataformas de auto-organización

20. Cómputo en grid
• No hay otro gran avance tecnológico ha
demostrado el poder de los individuos de
más de grid computing.
• Al donar su tiempo en la computadora sin
usar, puede empezar a cambiar
el mundo para mejor.
Empezar es fácil! Simplemente haga
clic aquí para unirse a la World Community
Griden la actualidad.

21. World Community Grid
• La computación grid se une a muchos equipos individuales, creando un gran
sistema con el poder computacional masivo que supera con creces el poder
de un puñado de superordenadores. Debido a que el trabajo se divide en
trozos pequeños que se pueden procesar simultáneamente, se reduce el tiempo de
investigación de años a meses. La tecnología también es más rentable, lo que
permite un mejor uso de los fondos de crítica.
• Cambiando nuestro mundo ahora. La computación grid no es
una tecnología futurista.
• World Community Grid está trabajando en este momento la aplicación
de esta tecnología a los proyectos de investigación que puede beneficiar a todos
nosotros.
• Nuestro primer proyecto, Pliegue del Proteoma Humano, es la identificación de las
proteínas producidas por los genes humanos. Con esta información, los científicos
pueden entender cómo los defectos en las proteínas pueden
causar enfermedades, por lo que es más fácil para encontrar la cura.
• En 2003, con la computación grid, en menos de tres meses los
científicos identificaron44 posibles tratamientos para combatir la enfermedad mortal
viruela. Sin la red, el trabajo se ha tomado más de un año en completarse.

22. Web 1.0
2000
• Páginas electrónicas
• Portales (sitios web)
• Motores de bùsqueda
•Consumidores
• Metabuscadores (contenido)
• Correo electrónico
• Chats
• Alertas Diferencias
• Listas de discusión •Tecnológicas
Web 2.0 •Estructurales
2003 •Filosóficas
•Comunidades (conexiones •Sociológicas
entre usuarios)
•Actualización constante
• Blogs •Intercambiar contenido
• Redes sociales •Compartir
• Wikis •Cargar
• Folksonomias (social bookmarking) •Creadores (contenido)
•Democrático
• Weminarios
•Se combina información de
• Web feed diferentes bases de datos
•Etiquetas
•Ratings

23. Etiquetar Compartir
Publicar Clasificar

26. Amigables
Fáciles
Aplicaciones
Web Web 2.0 y 3.0:
El proceso
Funciones
4. Actualizar
2. Buscar
3. Marcar
6. Analizar
5. Manejar
1. Explorar
7. Compartir

27. E-investigación bibliográfica en la
Web
• Explorar
– Personalizar: complementos
• Buscar
– Buscadores, metabuscadores, colecciones
• Guardar
– Marcar, compartir, etiquetar
• Actualizar
– Automatizar: RSS y lectores de feeds: automatizar
• Sistematizar
– Manejar, citar, compartir
• Difundir
– Redes sociales
• Meta-análisis

28. Navegadores COLECCIONES DE
Google, Bing DATOS
Alertas
Bases de datos
Correos electrónicos
Sistemas de
1 Navegar Listas de discusión
información
Agregadores
Proveedores
Recomendación
Buscar
Meta-análisis
Bibliometría
Selección Recuperación Análisis de redes
Descubrimiento Basado en Literatura
2 3
PUBLICACIÓN
PDF
HTLM Lectura Guardar
Marcadores
TXT Google marcadores y
5 4 block
Facebook
Obtener Folkosomias
Referencias metadatos Delicious
Citar
Citeulike
Comentar Gestores de
Gestores de 7 bibliografía
bibliografía Citar mientras
Endnote 6 escribo
Refworks 1/100
Comentar Ciberinfraestructura
Mendeley*
Zotero PDFs
Citeulike* Acrobat
PDF Exchange*

29. Herramientas electrónicas
•Programas
•Aplicaciones
•Recursos
•Utilidades
•Herramientas http://www.victorinox.ch/
•Servicios
•Complementos (gadgets y plugins)

30. Recursos Web 2.0

31. Marcadores/Guardar etiquetar
Marcador
bibliografía
Marcador web
Marcador
imágenes
Manejador
bibliografíaca

32. Library

33. Torres-Salinas, D. and E. Delgado-López-Cózar (2009, September). Estrategia para mejorar la difusión de los resultados de
investigación con la web 2.0. El Profesional de la Informacion 18 (5), 534-539.

34. Redes sociales/Marcar compartir

35. Varios

37. Delicious Visualizeus
Mendeley
CiteUlike
Barra de herramientas de Google
Vista Previa Interclue
Zotero
Interclue
Xmarks
Delicious

38. Publish or perish

39. Torres-Salinas, D. and E. Delgado-López-Cózar (2009, September). Estrategia para mejorar la difusión de los resultados de
investigación con la web 2.0. El Profesional de la Informacion 18 (5), 534-539.

40. Recursos Web 2.0

41. Meta-análisis
• Simultáneo al desarrollo de ciencias de la
información (CI) y las tecnologías la información y
la comunicación (TICS), en especial con el
desarrollo de las bases de datos y la Internet, se
han producido formas sistémicas de análisis de
cantidades colosales de información (terabites).
• Técnica cuantitativa que usa mediciones
específicas para indicar la fuerza (tendencias) de
relaciones variables en los estudios incluidos en el
análisis. La técnica enfatiza los resultados entre
múltiples estudios en oposición a los resultados
obtenidos de una sola investigación.

42. • La Web semántica (del inglés semantic web) es la
"Web de los datos".1 Se basa en la idea de
añadir metadatos semánticos y ontológicos a la World
Wide Web. Esas informaciones adicionales —que
describen el contenido, el significado y la relación de
los datos— se deben proporcionar de manera formal,
para que así sea posible evaluarlas automáticamente
por máquinas de procesamiento. El objetivo es
mejorar Internet ampliando la interoperabilidad entre
los sistemas informáticos usando "agentes
inteligentes". Agentes inteligentes son programas en
las computadoras que buscan información sin
operadores humanos.

47. Chilibot
Relaciones entre un subconjunto de genes afectados por el tratamiento con
cocaína.

52. Web 2.0

55. Artículos de vanguardia
Comentar
Calificar
c Ranking
Buscar
c
Marcar
Compartir

56. XML
XML, siglas en inglés
de eXtensible Markup Language ('lenguaje
de marcas extensible'), es
un metalenguaje extensible de etiquetas
desarrollado por el World Wide Web
Consortium (W3C).

57. http://www.personalizemedia.com/garys-social-media-count/

58. Metrics

59. MENDELEY

60. Library

61. Statistics

62. Browse I Aplicaciones Web II Colecciones bibliográficas
Web Metabrowser web browsers Libraries
Browsers s specialized
Editors
Suppliers
Search
Information systems
Bookmark Indexes and catalogs
Manage
Share
III Meta-analisis
• Scientometrics
• Network Analysis
• Text mining
Repositories
• Semantics

63. Colecciones/Sistematizar

64. Colecciones bibliográficas
Repositorios
Editoriales y revistas
Catálogos e índices
Sistemas de información
E-bibliotecas

65. La Web 2.0 (Social)
• Se centra en la capacidad de las personas para colaborar y compartir información en
línea.
• Transición de la Web estática a una dinámica, que es más organizada.
• Comunicación abierta con un énfasis en comunidades de usuarios e intercambio de
información.
• Ya no sólo se trata de ofrecer la posibilidad de encontrar información, sino de
lograr objetivos específicos, pues es factible, crear, etiquetar jerarquizar y compartir
datos.
• Lenguaje HTLM
Web 3.0 (Semántica)
• Basada en la idea de añadir metadatos semánticos e información (a través de
mapas
• cognitivos).
• Desarrollar nuevos sistemas de interoperabilidad que permitan interpretar
• metadatos para adaptarse a las acciones de los usuarios .
• Minería de textos y ontologías
• Lenguajes: XML (etiquetas) y RDF (metadatos)

66. Propósitos
1. Recuperación de información.
2. Obtención de nuevo conocimiento.
3. Evaluación.
4. Análisis, desarrollo, estructura y relaciones
de la dinámica científica.

70. Entomology

71. Resultados de la
encuesta: conjunto de datos más
grande analizados
http://www.kdnuggets.com/2011/05/largest-dataset-analyzed.html

72. Meta-análisis para PubMed
META-ANALISIS
Bibliometría Análisis de Text Mining
Redes

73. Bibliometría para
artículos

76. Búsqueda
Bibliometría para consultas
Tendencias

77. Bibliometría para dominios

78. 2002
1996
1990
1984
1978
Taxonomía AL
1972
1966
1960 Bibliometría para colecciones
1954
1948
1942
1936
1930
1924
Periodica
1918
Scopus
Biosis
1912
1906
1900
1894
1888
CAB
1882
SCI
SCI
ZR
1876
1870
1864
10
1
1000
100
100000
10000
log Documentos

79. Boquím y biol mol
Periódica
Agricultura
Biosis
CAB
SCI
ZR
Forestal
Enfer infecc
Bibliometría para colecciones
Fisiología
Taxonomía América Latina
Biol reprod
Parasitología
Taxonomía AL
Genética y herencia
Biodiv y conserv
Biol mar y acuát
Paleontología
Botànica
Anat y morf
Cienc biolog
Ecol y cienc amb
Zooloogía
Biol Evolut
0
100
90
80
70
60
50
40
30
20
10
%

80. Bibliometría para países/regiones

81. Redes para
obtención de nuevo
conocimiento

82. Redes para
palabras
Fig. 2. Co-word space of the top 50 highly frequent and bursty words used in the top
10% most highly cited PNAS publications in 1982-2001.

84. Chilibot
Relaciones entre un subconjunto de genes afectados por el tratamiento con
cocaína.

86. Redes para el
conocimiento

87. Bibliometría para el conocimiento

90. Modelos en Biomedicina SCI
3000 400
Neurospora (6640)
Dictyostelium (6191)
Chlamydomonas (5646)
Caenorhabditis (5353)
300
Schizosaccharomyces (3183)
Danio (973)
2500
Documentos
200
100
2000
0
1940
1945
1950
1955
1960
1965
1970
1975
1980
1985
1990
1995
2000
2005
Año
Documentos
1500 Escherichia (94873)
Drosophila (48989)
Saccharomyces (27549)
Arabidopsis (18094)
1000 Zea (7636)
Neurospora (6640)
Dictyostelium (6191)
Chlamydomonas (5646)
500
Caenorhabditis (5353)
Schizosaccharomyces (3183)
Danio (973)
0
1900
1905
1910
1915
1920
1925
1930
1935
1940
1945
1950
1955
1960
1965
1970
1975
1980
1985
1990
1995
2000
2005
Año

91. web semántica

92. La Web semántica
• (del inglés semantic web) es la "Web de los datos".1
• Se basa en la idea de
añadir metadatos semánticos y ontológicos a la World
Wide Web.
• Esta información adicional —que describen el
contenido, el significado y la relación de los datos— se
deben proporcionar de manera formal, para que así sea
posible evaluarlas automáticamente por máquinas de
procesamiento.
• El objetivo es mejorar Internet ampliando
la interoperabilidad entre los sistemas informáticos
usando "agentes inteligentes". Agentes inteligentes son
programas en las computadoras que buscan
información sin operadores humanos.

93. Tim Berners-Lee, el creador de la
idea, la expresó de la siguiente
manera:
"Mi sueño es una Web en la que las
máquinas sean capaces de analizar
todos los datos –contenido, enlaces
y transacciones entre la gente y los
ordenadores–. La 'Web Semántica',
que haría esto posible, está todavía
por llegar, pero cuando llegue, la
rutina de nuestras compras,
burocracia y vida diaria será
gestionada por máquinas hablando
con máquinas. Los 'Agentes
Inteligentes' que han sido
anunciados durante décadas se
harán por fin realidad".

94. Interoperatibilidad
La interoperabilidad es la propiedad de un producto o
sistema, cuyas interfaces se conocen por
completo, para trabajar con otros productos o sistemas,
presentes o futuros, sin ningún tipo de acceso
restringido o de ejecución.

95. Estándares
• XML (eXtensible Markup Language)
• RDF (Resource Description Framework)
• SPARQL (an RDF Query Language)

96. XML
XML, siglas en inglés
de eXtensible Markup Language ('lenguaje
de marcas extensible'), es
un metalenguaje extensible de etiquetas
desarrollado por el World Wide Web
Consortium (W3C).

97. Ontologías taxonomía
• Una ontología es una manera formal de
representar el conocimiento en el que los
conceptos son descritos por su significado y
su relación con los demás.
• Se asignan identificadores únicos que se
asocian con cada concepto
en ontologías biológicas (bio-
ontologías) puede ser utilizada para enlazar
información de diversas bases de datos.

99. http://richard.cyganiak.de/2007/10/lod/lod-datasets_2010-09-22_colored.html

100. Dublin Core Metadata Element
Set (DCMES)
• 15 elementos de meta-datos básicos.

102. Retos actuales
• Una nueva cultura (informática)
• La explosión de la cantidad y diversidad de
herramientas digitales (Web)
• Colaboración
• Estándares
• Colecciones
• Normalización
• Semántica (Ontologías)
• Nube
• Acceso Abierto
• Derechos de Autor (Plagio)
• Nuevas especialidades

103. http://biiiogeek.blogspot.com/

104. • Esta investigación se lleva a cabo
gracias al financiamiento de:
• DGAPA, UNAM. Proyecto PAPIME PE
201509
• CONACYT, Ciencia Básica. Proyecto
13276 2011-2014.

105. Licencia Creative
Commons
Forma de citar este trabajo
Michán, L. 2011. Presentación
http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/deed.es_GT