D. João III teve 10 filhos, incluindo D. Sebastião e D. Henrique. D. Sebastião morreu na batalha de Alcácer Quibir em 1578. Em 1580, D. Henrique também morreu e Portugal foi unificado com a Espanha sob Filipe II. Os holandeses atacaram o Brasil, capturando 13 povoações e 5 fortes em 7 anos. Eles expandiram a produção de açúcar sob o governador João Maurício de Nassau, mas foram expulsos após as batalhas dos Guarar