第26回統合DBミーティング@NIBIO の内容を共有します。

1. 第26回統合DBミーティング
Integrated DB MTG in NIBIO
2013/11/19
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2. 本日の予定
• Sagace
– アクセス解析
– Sagaceに追加するDBについて
• 進捗報告
• 厚生労働科学研究成果データベース
のカタログ化
– 分担
• 分子生物学会
– 準備，当日の予定等の確認
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3. アクセス解析 (9/22-10/19 vs 10/20-11/16)
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4. アクセス数減少の原因
• 連携機関のトラブルやメンテナンス
により減少する傾向
• Googleの検索アルゴリズムのアップ
デートは直接的ではなさそう。
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5. 追加予定のDBについて
ファセット分類／
データベース名
日本で維持されてい
産業中毒文献検索 る可移植性腫瘍株一
覧表
文献・用語集・辞
データベースの種類
生物資源
書
生物種
特定生物なし
動物（ヒト以外）
生体の階層
その他
細胞・組織
分類
B
A
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6. 進捗報告
• Sagace
– 薬用植物総合情報データベースのメタデータ
作成
– RDFa Lite クローラーの完成
• http://sagace.nibio.go.jp/translation/rdfalite.php
• 基盤研内部のデータのRDF化
– 希少疾病用医薬品のRDFの修正
– Virtuosoを最新版の更新
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7. RDFa Lite クローラー
web page
html
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8. html
クローラーの検出結果
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9. 厚生労働科学研究成果データ
ベースのカタログ化
• カタログに既存に存在するもの，”デー
タベース”という語が存在するもの，
URLが存在するものを色付け。
• 50件済
– http://bit.ly/1iq6Bgm
• 一人60件程度
– （目安2時間程度）
• 12月中に完了を目処に。
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10. 分子生物学会の準備
• 12月3日〜6日＠神戸コンベンションセン
ター
• NBDCによる特別企画の1ブースを使用
• ブース名：医薬基盤研究所のデータベース
とLinked Open Dataへの取り組み
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11. 前日までの準備
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ポスター，チラシ作成
デモの準備
スライドショー用スライド作成（各15秒 5～10枚）
アンケートの作成
荷物（PC,ディスプレイ，チラシ等）の送付
前日準備
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12. ポスター・チラシ作成
• 昨年度はポスターはSagaceと基盤研
内のDB紹介のみ
• 案１：昨年度と同じ
• 案２：3分割して，Sagace,
TargetMine, Toxygatesをそれぞれ掲
載する。
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13. デモ
• 今年はデモ用ブースが存在
• 3〜5日のそれぞれの日の午後に1回ずつ
• １0～１5分程度，デモの時間あり。
– 案１ 毎日実施
• Sagace,TargetMine,Toxygatesについて５分ず
つくらい紹介する
• 案２ 一日１サービス紹介
• 案３ デモをしない。
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14. その他
• スライドショー用スライド作成
– 各15秒 5～10枚
– Sagace,TargetMine,Toxygates
• アンケートの作成
• 荷物（PC,ディスプレイ，チラシ等）の送付
• 前日準備
– 2日 14:00〜18:00
• 注意事項等
– 会場はwifiでの接続
– 展示説明員の名札 5枚
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15. 当日 ( 9:30 ~ 17:00 )
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•
デモ（NIBIOブース，デモブース）
チラシの配布
ポスターの紹介
サービスの紹介
アンケート
シフト
– ２時間半毎
– 今週中に都合の悪い時間帯を教えて下さい。
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16. 報告など・今後の予定
• 生命医薬情報学連合大会
• 今後の予定など
• 11月・12月
– 実験動物バンクのRDF化
– 外部データベースとの連携
– 分子生物学会
• 1月
– BioHackathon
国内版

17. 次回
• 暫定 12月20日（金）
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