2. 7.1 GENETINIO KINTAMUMO
TIPAI
Genetinis kintamumas apibūdinamas kaip
skirtumai, stebimi tarp tos pačios rūšies
individų arba tarp skirtingų rūšių
Alelinis kintamumas atsiranda dėl mutacijų
individualiuose genuose
Chromosomų aberacijos atsiranda dėl esminių
chromosomų struktūros pokyčių
Jos, kaip taisyklė, paveikia daugiau nei vieną geną
Jos taip pat vadinamos chromosomų mutacijomis
7-2
3. Mutacijos
Terminas “mutacija” reiškia genetinės medžiagos
paveldimą pokytį
Mutacijos sukuria alelinį kintamumą
Teigiama mutacijų savybė yra ta, kod jos sukuria
genetinį evoliucijos pagrindą
Neigiama mutacijų savybė yra ta, kad jos yra daugelio
ligų priežastis
Kadangi mutacijos gali būti gana žalingos,
organizmuose išsivystė DNR reparacijos
priemonės
7-3
4. Mutacijos
7-4
Mutacijos gali būti trijų pagrindinių tipų
1. Chromosomų mutacijos
Chromosomų struktūros pokyčiai
2. Genominės mutacijos
Chromosomų skaičiaus pokyčiai
3. Genų mutacijos
Palyginti nedideli DNR struktūros pokyčiai, įvykę
viename gene
5. Chromosominio kintamumo tyrimai svarbūs dėl
keleto priežasčių
1. Jis gali turėti didelės reikšmės organizmo fenotipui
2. Jis gali turėti didelės reikšmės organizmo
palikuonims
3. Jis yra rūšių evoliucijos svarbi varomoji jėga
7-5
7.2 CHROMOSOMŲ
STRUKTŪROS KINTAMUMAS
6. Citogenetika yra genetikos sritis, nagrinėjanti
chromosomų struktūrą ir jų kiekį bei pokyčius.
Paprastai citogenetiniai tyrimai atliekami
mikroskopu, nustatant individualių ląstelių ar
organizmų chromosomų sudėtį
Tai leidžia nustatyti individus, turinčius nenormalius
chromosomų kiekius arba struktūrą
Šiuo metodu taip pat galima atskirti įvairias rūšis
7-6
Citogenetika
7. 7-7
Klasikinėje citogenetikoje
chromosomos atskiriamos
pagal tris pagrindinius
požymius
1. Dydį
2. Centromeros padėtį
3. Ruožų piešinį
Visos šios ypatybės yra matomos
kariotipe – organizmo chromosomų
rinkinyje, išdėstytame pagal
chromosomų dydį ir centromeros
padėtį
Citogenetika
9. 7-9
Tiksliai identifikacijai chromosomas reikia dažyti
naudojant specialius metodus tam, kad išryškėtų
būdingas ruožų piešinys
Pavyzdys: G-ruožuotumas
Chromosomos yra paveikiamos proteolitiniais fermentais
(tripsinu) ir dažomos Giemsa dažais
Prie kai kurių segmetų prisitvirtina daug dažo molekulių
Tamsūs ruožai
Prie kitų segmentų dažo prisijungia nedaug
Šviesūs ruožai
Žmogaus chromosomose
300 G ruožų matoma metafazės stadijoje
2,000 G ruožų – profazėje
Citogenetika
12. Dažymas išryškinant ruožuotumą yra
naudingas keletu požiūriu:
1. Padeda atskirti chromosomas vieną nuo kitos
2. Padeda aptikti net subtilius chromosomų
struktūros pokyčius
3. Padeda nustatyti glaudžiai susijusių rūšių
evoliucinius ryšius
Citogenetika
7-12
13. Šiuolaikinėje citogenetikoje chromosomų
identifikacijai plačiai taikomas fluorescencinės in
situ hibridizacijos metodas (FISH) ir jo modifikacijos
Citogenetika
7-13
14. Yra du pagrindiniai chromosomų struktūros
persitvarkymo būdai
1. Bendras genetinės informacijos kiekis
chromosomoje pakinta
Delecijos
Duplikacijos
2. Genetinė medžiaga lieka ta pati, tačiau ji
pertvarkoma
Inversijos
Translokacijos
7-14
Mutacijos gali pakeisti
chromosomų struktūrą
15. 7-15
Delecija
Chromosomos segmento praradimas
Duplikacija
Chromosominio segmento pasikartojimas, lyginant su
normalia chromosoma
Inversija
Genetinės medžiagos išsidėstymo krypties pasikeitimas
individualioje chromosomoje
Translokacija
Vienos chromosomos segmento prisitvirtinimas prie kitos
chromosomos
Paprasta translokacija
Vienkryptė pernaša
Reciprokinė translokacija
Dvikryptė pernaša
17. 7-17
Delecija įvyksta tada, kai chromosoma sulūžta, o
susidaręs fragmentas yra pametamas
Delecijos
a) Terminalinė delecija b) Intersticinė delecija
Vienas trūkis
Pametamas ir degraduoja Pametamas ir degraduoja
Du trūkiai ir likusių
dalių
susijungimas
18. 7-18
Fenotipinės delecijų pasekmės priklauso
1. Nuo delecijos dydžio
2. Nuo to, kurioje chromosomos vietoje įvyko delecija
Ar pamesti genai yra gyvybiškai svarbūs organizmui
Delecijos
Kai delecijos pasireiškia
fenotipiškai, jos, kaip
taisyklė, būna žalingos
Pavyzdžiui žmogaus cri-du-
chat sindromas
Atsiranda dėl 5 chromosmos
trumpojo peties delecijos
19. 7-19
Chromosomų delecijos aptinkamos įvairiais būdais
Citologiniais metodais
Naudojami didelėms delecijoms aptikti
Molekuliniais metodais
Genetiniais metodais
Jei mutantai negali sugrįžti į laukinį tipą, tai gali būti delecijos
požymis
Dėl delecijų gali atsirasti reiškinys, vadinamas
pseudodominavimu
Viena geno kopija pašalinama dėl delecijos
Tada gali vykti kitoje chromosomoje esančios
recesyvinio alelio ekspresija
20. 7-20
Chromosmų duplikacijos dažniausiai atsiranda dėl
rekombinacijos sutrikimų
Duplikacijos
Nelygus
krosingoveri
s
Duplikacija
Delecija
21. 7-21
Duplikacijų, kaip ir delecijų, fenotipinės pasekmės
priklauso nuo dydžio
Fenotipinių pasekmių tikimybė tuo didesnė, kuo didesnė
duplikacija
Tačiau duplikacijos, kaip taisyklė, yra mažiau
žalingos negu tokio paties dydžio delecijos
Duplikacijos
22. 7-22
Dauguma mažų duplikacijų neturi fenotipinių
pasekmių
Tačiau jos yra labai svarbios, nes padeda atsirasti
papildomiems genams
Galiausiai tai gali suformuoti genų šeimas
Genų šeimas sudaro du ar daugiau panašių genų
Duplikacijos ir genų šeimos
23. 7-23
Genai, kilę iš
vieno pirmtako
Nenormalūs genetiniai procesai
Sukelia geno duplikaciją
Per daugelį generacijų genai gali
pradėti skirtis dėl laipsniškos
mutacijų akumuliacijos
Mutacijų taškai
Homologiniai
genai
24. 7-24
Geras pavyzdys yra globinų genų šeima
Šie genai koduoja baltymus, kurių funkcija yra surišti
deguonį
Pvz.: hemoglobinas
Globinų genų šeimą sudaro 14 homologinių genų,
išsidėsčiusių trijose skirtingose chromosomose
Visi 14 genų yra kilę iš vieno protėvių geno
Skirtingų mutacijų kaupimasis skirtinguose šeimos
genuose sukūrė
1. Globinų genus, kurių ekspresija vyksta skirtingomis žmogaus
vystymosi stadijomis
2. Globinų baltymus, kurių funkcijos labiau specializuotos
25. 7-25
Duplikacija
Geriau prisijungia
ir saugo deguonį
raumenų ląstelėse
Geriau prisijungia
ir saugo deguonį
eritrocituose
Ekspresija ankstyvojo
embrioninio periodo
metu
Maksimali ekspresija nėštumo
antrojo ir trečiojo trimestro metu
Ekspresija po gimimo
26. 7-26
Inversija yra chromosomos segmentas, pakeitęs
savo orientaciją priešinga kryptimi
Inversijos
Centromera
invertuotos
srities viduje
Centromera už
invertuotos
srities ribų
a) Pericentrinė inversija b) Paracentrinė inversija
Normali chromosoma
Invertuota sritis Invertuota sritis
27. 7-27
Inversijos atveju bendras genetinės informacijos kiekis
nekinta
Todėl dauguma inversijų neturi fenotipinių pasekmių
Retais atvejais inversijos gali keisti individo fenotipą
Trūkio vietos pasekmė
Trūkiai, dėl kurių susidaro inversija, įvyksta gyvybiškai svarbiuose
genuose
Padėties pasikeitimo pasekmė
Dėl padėties pasikeitimo pasikeičia ir geno ekspresija
Maždaug 2% žmonių turi inversijas, kurias galima aptikti
šviesiniu mikroskopu
Dauguma individų yra fenotipiškai normalūs
Tačiau kai kurių palikuonys gali turėti genetinių defektų
28. 7-28
Chromosomų translokacija atsiranda tada, kai
vienos chromosomos segmentas prisitvirtina prie
kitos chromosomos
Formuojantis reciprokinėms translokacijoms,
genetine medžiaga apsikeičia dvi nehomologinės
chromosomos
Reciprokinės translokacijos atsiranda dėl skirtingų
priežasčių
1. Chromosomų trūkiai ir reparacija
2. Nenormalus krosingoveris
Translokacijos
29. 7-29
Telomeros saugo
chromosomų DNR nuo
sulipimo su kitos
chromosomos DNR
a) Chromosomų trūkiai ir reparacija
b) Nehomologinis
krosingoveris
30. 7-30
Reciprokinės translokacijos pertvarko genetinę
medžiagą, tačiau nekeičia jos bendro kiekio
Todėl jos vadinamos subalansuotomis translokacijomis
Reciprokinės translokacijos, kaip ir inversijos,
dažniausiai neturi fenotipinių pasekmių
Retais atvejais jos gali sukelti padėties pasikeitimo
pasekmes
Paprastos translokacijos genetinę medžiagą
perneša tik viena kryptimi
Jos taip pat vadinamos nesubalansuotomis
translokacijomis
Translokacijos
31. 7-31
Pavyzdys: šeiminis Dauno (Down) sindromas
Didesnioji 21-os chromosomos dalis yra
prisitvirtinusi prie 14-os chromosomos
Individas turi tris kopijas genų, esančių 21-oje
chromosomoje
Todėl jam būdingi Dauno sindromo bruožai
32. 7-32
Šeiminis Dauno sindromas yra Robertsono
translokacijos pavyzdys
Ši translokacija susiformuoja taip
Trūkiai įvyksta dviejų nehomologinių akrocentrinių
chromosomų pačiuose galuose
Maži acentriniai fragmentai pametami
Didesnieji fragmentai susilieja centromerinėmis sritimis,
sudarydami vieną chromosomą
Šio tipo translokacijos dažniausiai sutinkamos
žmogaus organizme
Nesubalansuotos translokacijos dažniausiai sukelia
sunkias fenotipines pasekmes ar net letalumą
33. Chromosomos persitvarkymas gali paveikti geno
veiklą dėl to, kad trūkis įvyksta geno viduje
Kai kuriais atvejais genas lieka nepaliestas, tačiau jo
ekspresija pakinta dėl jo naujos padėties
Tai vadinama padėties efektu
Padėties efektas pasireiškia dėl dviejų dažniausių
priežasčių:
1. Geno persikraustymo prie kitų reguliacinių sričių
2. Geno persikraustymo į heterochromatininę
chromosomos sritį
Chromosomų struktūros pokyčiai
gali veikti genų ekspresiją
7-33
34. 7-34
Reguliacinės sekos
dažnai yra dvikryptės
a) Padėties efektas dėl reguliacinių sekų
b) Padėties efektas dėl translokacijos į heterochromatininę sritį
35. Chromosomų skaičius gali kisti dviem
pagrindiniais būdais
Euploidija
Ištisų chromosomų rinkinių kiekio kitimas
Aneuploidija
Chromosomų rinkinio pavienių chromosomų skaičiaus kitimai
Euploidinis kintamumas retkarčiais aptinkamas tarp
gyvūnų ir dažnai – tarp augalų
Aneuploidinis kintamumas sukelia įvairius
nenormalumus
7.3 Chromosomų skaičiaus
kintamumas
7-35
37. 7-37
Kiekvienos eukariotų rūšies fenotipas priklauso nuo
tūkstančių skirtingų genų
Šių genų ekspresija yra sudėtingai koordinuojama tam, kad
išsivystytų fenotipiškai normalus individas
Aneuploidija dažniausiai sukelia nenormalų fenotipą
Tai įvyksta dėl genų produktų kiekio disbalanso
Aneuploidija
39. 7-39
Visais 12 galimų trisomijų
atvejais formavosi dėžutės
(išdžiūvę vaisiai), kurių
fenotipai skyrėsi
Be to, aneuploidiniai augalai
pasižymėjo ir kitomis
morfologinėmis ypatybėmis
Tarp jų buvo ir žalingų požymių
Aneuploidija
Žalingas aneuploidijos
poveikis pirmą kartą buvo
nustatytas, tiriant paprastąją
durnaropę Datura
stramonium
41. 7-41
Chromosomų skaičiaus pokyčiai gana dažnai įvyksta
formuojantis gametoms
Maždaug 5-10% visų žmogaus embrionų turi nenormalų
chromosomų skaičių
~ 50% visų spontaninių abortų yra dėl šios anomalijos
Kai kuriais atvejais chromosomų skaičiaus pokyčiai
nėra letalūs ir embrionai išgyvena. Tačiau tai visada
susiję su didesnio ar mažesnio laipsnio vystymosi
sutrikimais ir patologija
Aneuploidija
42. Žmogaus sindromai, susiję su aneuploidijomis
Stovis Dažnis Sindromas Ypatybės
Autosomų anomalijos
Trisomija 21 1/800 Dauno Protinis atsilikimas, nenormali dermatoglifika,
siauros akys, plokščias veidas, žemas ūgis
Trisomija 18 1/6000 Edvardo Protiniai ir fiziniai defektai, veido anomalijos,
aukštas raumenų tonusas, ankstyva mirtis
Trisomija 13 1/15000 Patau Protiniai ir fiziniai defektai, daugybinės vidaus
organų pažaidos, didelė trikampė nosis, ankstyva
mirtis
Lytinių chromosomų anomalijos
XXY 1/1000 (v) Klainfelterio Nevaisingumas, krūtinės pabrinkimas, elgsenos
anomalijos
XYY 1/1000 (v) Jakobso Aukštas ūgis, elgsenos anomalijos
XXX 1/1500 (m) Trigubos X Aukštos ir kūdos, nereguliarios menstruacijos,
didesnis psichinių ligų dažnis
X0 1/5000 (m) Ternerio Žemas ūgis, klostuostas kaklas, lytinis
neišsivystymas, lengvas protinis atsilikimas
7-42
43. 7-43
Autosomų aneuploidijos, leidžiančios embrionui
išgyventi, yra 13, 18 ir 21chromosomų trisomijos
Šios chromosomos yra santykinai mažos ir turi daug
heterochromatino
Lytinių chromosomų aneuploidijos sukelia mažiau
sunkias pasekmes negu autosomų aneuploidijos
Tai galima paaiškinti X chromosomos inaktyvacija
Todėl fenotipinės pasekmės gali atsirasti dėl
1. X chromosomoje esančių genų ekspresija iki X chromosomos
inaktyvacijos embrione
2. Pseudoautosominių genų ekspresijos disbalansu
44. 7-44
Kai kurių žmogaus aneuploidijų dažnis priklauso nuo
tėvų amžiaus
Vyresni tėvai dažniau susilaukia nenormalių palikuonių
Pavyzdys: Dauno sindromas (21 chr. trisomija)
Dažnis ypač priklauso nuo motinos amžiaus
45. 7-45
Dauguma gyvūnų rūšių yra diploidinės
Daugeliu atveju euploidiškumo pokyčiai nėra
toleruojami
Gyvūnams poliploidija dažniausiai yra letali
Tačiau kai kurie euploidijos variantai yra natūraliai
sutinkami gamtoje
Bičių patelės yra diploidinės
Bičių patinai (tranai) yra monoploidai
Jie turi tiktai vieną chromosomų rinkinį
Euploidija (gyvūnai)
46. Gamtoje aptikta tiktai keletas poliploidinių
stuburinių rūšių
Hyla chrysocelis (2n) Hyla versicolor (4n)
7-46
47. 7-47
Tačiau daugelio gyvūnų organizme yra audinių,
kuriuose chromosomų rinkinių skaičius varijuoja
natūraliai
Diploidiniai gyvūnai kartais turi poliploidinių audinių
Šis reiškinys vadinamas endopoliploidija
Pavyzdžiui, kepenų ląstelės gali būti triploidinės, tetraploidinės ar
net oktoploidinės (8n)
Vabzdžių politeninės chromosomos yra geras
natūralaus ploidiškumo kitimo pavyzdys
Euploidija (gyvūnai)
48. 7-48
Dažniausiai susidaro drozofilos ir kitų vabzdžių seilių
liaukose
Chromosomos keletą kartų replikuojasi, tačiau
ląstelės nesidalija
Drozofilos seilių liaukų chromosomų poros dvigubėja
maždaug 9 kartus (29
= 512)
Šie dvigubėjimai sudaro paraleliai išsidėsčiusių
chromosomų ryšulius
Tokios chromosomos vadinamos politeninėmis
Politeninės chromosomos
49. 7-49
Kiekviena chromosoma prisitvirtina prie
chromocentro šalia savo centromeros
Kartotinė chromosomų replikacija sukuria
politenines chromosomas
Politetinių chromosomų susidarymas
Iš normalių drozofilos chromosomų
Kiekvieną politeninės
chromosomos petį
sudaro šimtai
lygiagrečiai išsidėsčiusių
chromosomų
Chromocentras
Centrinis taškas, kur agreguoja
visos chromosomos
50. 7-50
Politetines chromosomas nesunku tirti mikroskopu dėl
jų ypatingo dydžio
Jos yra tokios didelės, kad gali būti tiriamos interfazėje
Politeninėms chromosomoms būdingas specifinis
ruožuotumas
Kiekvienas tamsus ruožas vadinamas chromomera
Tamsaus ruožo DNR yra kompaktiškesnė, nei esanti tarpruožyje
Drozofilos politeninėse chromosomose rasta apie 5000 ruožų
Politeninių chromosomų tyrimai padėjo išsiaiškinti
daugelį procesų, vykstančių chromosomose
interfazėje
51. 7-51
Priešingai nei gyvūnų, augalų poliploidija yra
būdingas reiškinys
30-35% visų paparčių ir žydinčių augalų yra poliploidai
Dauguma maistui vartojamų vaisių ir grūdų taip pat yra
poliploidiniai
Gana dažnai poliploidiniai augalai pasižymi geromis
agrokultūrinėmis ypatybėmis
Jie būna didesni ir atsparesni aplinkos poveikiui
Euploidija (augalai)
Diploidinės petunijos Tetraploidinės petunijos
52. 7-52
Poliploidai, turintys nelyginį chromosomų rinkinių
skaičių, paprastai būna sterilūs
Šių augalų gametos dažnai yra aneuploidinės
Pavyzdys: Triploidiniame organizme trys homologinės
chromosomos anafazės I metu netolygiai pasiskirsto tarp dukterinių
ląstelių
Kiekviena ląstelė
gauna po vieną kai
kurių chromosomų
kopiją
ir po dvi kitų
chromosomų kopijas
53. 7-53
Sterilumas paprastai yra žalingas požymis
Tačiau jis gali būti agrokultūriškai naudingas, nes
gali sukurti
1. Besėklius vaisius
Besėkliai arbūzai ir bananai
Triploidinės veislės
Dauginami nelytiniu keliu ūgliais
2. Besėkles gėles
Triploidinės veislės
54. Mitozės anomalijos
Genetinės anomalijos, įvykusios po apvaisinimo,
sukuria mozaicizmą
Dalis organizmo turi ląsteles, kurios genetiškai skiriasi nuo
likusios dalies ląstelių
Mozaikinės srities dydis ir padėtis priklauso nuo to,
kuriuo embrioninio vystymosi metu susidarė
anomalija
Kraštutiniu atveju anomalija gali įvykti pirmojo mitozinio
dalijimosi metu
7-54
55. Apvaisintas drozofilos kiaušinis turi dvi X chromosomas (XX)
Viena X chromosoma pametama pirmojo mitozinio dalijimosi metu
Tai sukuria XX ir X0 ląsteles
7-55
Iš ląstelės XX vystosi
moteriška drozofilos pusė
Iš ląstelės X0 vystosi
vyriška drozofilos pusė
Šis ypatingas ir retas individas yra vadinamas bilateraliniu
ginandromorfu
56. Tarprūšiniai hibridai
Pilnas neišsiskyrimas gali sukurti individus su
papildomais chromosomų rinkiniais
Tai vadinama autopoliploidija
7-56
Autopoliploidija
57. Tarprūšiniai hibridai
Daug dažnesnis chromosomų rinkinių skaičiaus
kitimo mechanizmas yra aloploidija
Ji atsiranda dėl tarprūšinės hibridizacijos
7-57
Aloploidija
58. Alodiploidai turi vieną chromosomų rinkinį, sudarytą
iš susikryžminusių rūšių chromosomų
7-58
Pavyzdys yra dviejų antilopių
(Hippotragus equinus ir
Hippotragus niger) hibridas
Šios dvi artimos rūšys turi vienodą
chromosomų skaičių, kurios, be to,
yra panašaus dydžio ir ruožuotumo
Evoliuciškai susijusios dviejų
skirtingų rūšių chromosomos
vadinamos homeologinėmis
Šis alodiploidas yra fertilus, nes
homeologinės chromosomos gali
sudaryti sinapses mejozės metu
59. Alopoliploidai susiformuoja įvykus autopoliploidijai ir
aloploidijai
Pavyzdžiai: Raphanobrasicca, Triticale, Gossipium var.
americana
7-59
Alotetraploidas:
turi du pilnus
chromosomų
rinkinius, gautus
iš skirtingų rūšių
Alopoliploidija
60. Taškinė mutacija yra vienos bazių poros pokytis
Tai gali būti bazių pakaitos
7-60
5’ AACGCTAGATC 3’
3’ TTGCGATCTAG 5’
5’ AACGCGAGATC 3’
3’ TTGCGCTCTAG 5’
Tranzicija yra pirimidino (C, T) pakeitimas kitu pirimidinu
arba purino (A, G) pakeitimas kitu purinu
Transversija yra pirimidino pakeitimas purinu ir
atvirkščiai
Tranzicijos aptinkamos dažniau už transversijas
7.4 GENŲ MUTACIJOS
Genų mutacijos keičia DNR sekas
61. Taškinės mutacijos taip pat susiformuoja dėl trumpų
DNR sekų insercijų (intarpų) ar delecijų (iškritų)
Genų mutacijos keičia DNR sekas
7-61
5’ AACGCTAGATC 3’
3’ TTGCGATCTAG 5’
5’ AACGCGC 3’
3’ TTGCGCG 5’
5’ AACGCTAGATC 3’
3’ TTGCGATCTAG 5’
5’ AACAGTCGCTAGATC 3’
3’ TTGTCAGCGATCTAG 5’
Keturių bazių porų delecija
Keturių bazių porų insercija
62. Mutacijos, įvykusios struktūrinio geno koduojančioje
srityje, gali turėti įvairias pasekmes polipeptidui
Tylinčios mutacijos yra tokios bazių pakaitos, kurios
nepakeičia aminorūgščių sekos polipeptide
Tai vyksta dėl genetinio kodo išsigimimo
Misens mutacijos yra tos bazių pakaitos, kurios pakeičia
aminorūgščių seką polipeptide
Pavyzdys: Siklemija
Jei pakeista aminorūgštis pasižymi panašiomis savybėmis, kaip ir
ankstesnioji, tai tokia mutacija vadinama neutralia
Genų mutacijos gali pakeisti
koduojančias geno sekas
7-62
63. Misens mutacija sukelia siklemiją
Siklemiją sukelia taškinė mutacija, dėl kurios β globino
polipeptide glutamo rūgštis pakeičiama valinu
a) Normalūs eritrocitai b) Siklemija sergančio žmogaus eritrocitai
7-63
64. Mutacijos, įvykusios struktūrinio geno koduojančioje
srityje, gali turėti įvairias pasekmes polipeptidui
Genų mutacijos gali pakeisti
koduojančias geno sekas
7-64
Nonsens mutacijos keičia normalų kodoną į terminalinį
kodoną
Rėmėlio poslinkio (frameshift) mutacijos atsiranda dėl
vienos bazės ar kartotinio dviems bazių skaičiaus
insercijos ar delecijos
Tai pakeičia skaitymo rėmelį taip, kad pasroviui nuo mutacijos
susiformuoja visiškai skirtinga aminorūgščių seka
65. 7-65
Taškinių mutacijų, įvykusių koduojančiose
sekose, pasekmės
Mutacijos
tipas
Mutacija
DNR
Pavyzdys
Nėra
Tylinti
Misens
Nonsens
Rėmelio
poslinkio
Nėra
Bazių pakaita
Bazių pakaita
Bazių pakaita
Insercija
66. Gamtinėse populiacijose dažniausiai sutinkamas
genotipas vadinamas laukinio tipo genotipu
Tiesioginė mutacija keičia laukinio tipo genotipą į
naują
Jei mutacija naudinga, naujas genotipas gali būti
išsaugotas evoliucijos
Priešingu atveju mutacija greičiausiai bus pašalinta iš
populiacijos
Grįžtamoji mutacija turi priešingą poveikį
Ji taip pat vadinama reversija
Genų mutacijos ir jų pasekmės
genotipui ir fenotipui
7-66
67. Mutavę individai dažnai skiriasi savo sugebėjimu
išgyventi
Žalingos mutacijos sumažina išgyvenimo tikimybę
Kraštutinis atvejis yra letalios mutacijos
Naudingos mutacijos sustiprina organizmo išgyvenamumą
arba jo reprodukcinę sėkmę
Kai kurios mutacijos yra vadinamos sąlyginėmis
Jos veikia fenotipą tik esant tam tikroms sąlygoms
Pavyzdžiui, temperatūrai jautrūs mutantai
7-67
Genų mutacijos ir jų pasekmės
genotipui ir fenotipui
68. Įvykusi antroji mutacija kartais turi įtakos pirmosios
mutacijos fenotipinei ekspresijai
Šios mutacijos vadinamos supresinėmis
mutacijomis arba tiesiog supresoriais
Supresoriai skirstomi į dvi grupes
Intrageniniai supresoriai
Antrosios mutacijos vieta yra tame pačiame gene (tačiau ne toje
pačioje vietoje!), kur įvyko pirmoji mutacija
Intergeniniai supresoriai
Antrosios mutacijos vieta yra kitame gene
7-68
Genų mutacijos ir jų pasekmės
genotipui ir fenotipui
70. Mutacijos nekoduojančiose sekose taip pat gali
paveikti genų ekspresiją
Mutacija gali pakeisti promotoriaus seką
Mutacijos “į promotorių” padaro promotorių panašesnį į konsenso
seką
Tai gali sustiprinti transkripciją
Mutacijos “nuo promotoriaus” mažina promotoriaus sekos
panašumą į konsenso seką
Tai gali susilpninti transkripciją
Mutacijos taip pat gali pakeisti splaisingo vietas eukariotų
genuose
Genų mutacijos nekoduojančiose
sekose
7-70
71. Keletas žmogaus genetinių ligų atsiranda dėl
neįprasto mutacijų tipo, vadinamo trinukleotidų
kartotinių sekų ekspansija (TNRE)
Dėl šio reiškinio ilgis sekų, sudarytų iš pasikartojančių 3
nukleotidų, gali keistis iš kartos į kartą
Dėl trinukleotidų ekspansijos atsiranda tokios
žmogaus ligos kaip:
Hantingtono liga
Martino-Belo sindromas (lūžiosios X sindromas;FRAXA)
Miotoninė raumenų distrofija
Mutacijos dėl kartotinių
trinukleotidų sekų
7-71
72. Kai kurios chromosomų sritys turi trinukleotidines
sekas, išsidėsčiusias tandemiškai
Sveiki individai perduoda nepakitusio ilgio sekas savo
palikuonims
Individų, sergančių trinuleotidų ekspansijos ligomis, sekų
ilgis viršija tam tikrą kritinę ribą
Jos taip pat gali lengvai pailgėti dar labiau
Tipiškas pavyzdys yra trinukleotido CAG ekspansija
7-72
CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG
CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG
n = 11
n = 18
Mutacijos dėl kartotinių
trinukleotidų sekų
73. Kai kada ekspansija vyksta koduojančioje geno
sekoje (Hantingtono liga)
Dažniausiai tai būna trinukleotidas CAG (glutaminas)
Todėl koduojamas baltymas turi ilgas glutamino sekas
Tai priverčia baltymus agreguoti
Agregacijos laipsnis koreliuoja su ligos sunkumu
Kitais atvejais ekspansija vyksta nekoduojančiose
geno srityse (Martino-Belo sindromas)
Tai sukelia DNR struktūros pokyčius
Dėl šių pokyčių atsiranda ligos simptomai
7-73
Mutacijos dėl kartotinių
trinukleotidų sekų
74. Trinukleotidų ekspansijos ligos pasižymi dviem
neįprastomis savybėmis
1. Šios ligos sunkumas progresuoja iš kartos į kartą
Šis reiškinys vadinamas anticipacija
2. Ligos sunkumas priklauso nuo to, kuris iš tėvų perdavė
trinukleotidinių pasikartojimų seką
Hantingtono ligos tikimybė didesnė, jei ji paveldima tėvo linija
Miotoninės raumenų distrofijos tikimybė didesnė, jei paveldima
motinos linija
7-74
Mutacijos dėl kartotinių
trinukleotidų sekų
75. Lūžios X chromosomos FMR1 geno
transkripcija
Premutacija virsta mutacija, bręstant moteriškoms lytinėms
ląstelėms. Ji pasireiškia tik premutaciją turinčių moterų sūnums
Ilgesni nei 200 CGG pasikartojimų ilgio DNR fragmentai yra metilinami.
Jei organizme dėl kokių nors priežasčių yra sutrikęs metilinimas,
Martino-Belo sindromas nepasireiškia
Geno FMR1 produktas baltymas FMRP nebesintetinamas
FMRP dalyvauja pernešant mRNR į poliribosomas dendrituose, todėl jo
trūkumas sukelia neuronų funkcionavimo sutrikimus
7-75
76. Oganizmų ląstelės gali būti dviejų tipų:
Generatyvinės ląstelės
Iš jų vystosi gametos, tokios kaip kiaušialąstė ir spermatozoidai
Somatinės ląstelės
Visos likusios ląstelės
Generatyvinės mutacijos tiesiogiai įvyksta kiaušialąstėse
ar spermatozoiduose arba šių lytinių ląstelių pirmtakuose
Somatinės mutacijos tiesiogiai įvyksta somatinėse
ląstelėse arba jų pirmtakuose
Mutacijos gali vykti lytinėse arba
somatinėse ląstelėse
7-76
77. 7-77
Mutacija gali būti
perduota sekančioms
kartoms
Dėmės dydis priklauso nuo
mutacijos atsiradimo laiko
Kuo anksčiau įvyko
mutacija, tuo didesnė dėmė
Mutacija negali būti
perduota sekančioms
kartoms
a) Generatyvinė mutacija b) Somatinė mutacija
78. Individai, turintys genotipiškai skirtingas somatines
sritis yra vadinami genetinėmis mozaikomis
7-78
79. Mutacijos gali atsirasti spontaniškai arba būti
indukuotos
Spontaninės mutacijos
Atsiranda dėl ląstelinių ar biologinių procesų sutrikimo
Pavyzdžiui, DNR replikacijos klaidos
Indukuotos mutacijos
Sukelia aplinkos veiksniai
Veiksniai, galintys pakeisti DNR struktūrą, yra vadinami
mutagenais
Tai gali būti biologiniai, cheminiai arba fiziniai veiksniai
7.4 MUTACIJŲ ATSIRADIMAS IR
PRIEŽASTYS
7-79
80. Mutacijų priežastys
7-80
Mutacijų priežastys Aprašymas
Spontaninės mutacijos
Nenormali rekombinacija Nenormalus krosingoveris gali sukelti delecijas, duplikacijas, translokacijas ir
inversijas
Nenormali segregacija Nenormali segregacija gali sukelti aneuploidiją ir poliploidiją
DNR replikacijos klaidos DNR polimerazės klaidos gali sukelti taškines mutacijas
Toksiški metabolizmo
produktai
Normalių metabolizmo procesų galutiniai arba tarpiniai produktai gali būti
chemiškai aktyvūs junginiai, pažeidžiantys DNR struktūrą
Transpozabilūs elementai Gali įsiterpti į geną ir sutrikdyti jo veiklą
Depurininimas Retkarčiais gali nutrūkti ryšys tarp purino ir dezoksiribozės
Deamininimas Citozinas ir 5-metilcitozinas gali būti deamininami ir virsti į uracilą ar timiną
Tautomeriniai virsmai Spontaniniai bazių struktūros pokyčiai gali sukelti mutacijas, jei jie įvyksta prieš
pat DNR replikaciją
Indukuotos mutacijos
Cheminiai veiksniai Cheminės medžiagos gali pakeisti DNR struktūrą
Fiziniai veiksniai UV šviesa ir rentgeno spinduliai gali pažeisti DNR struktūrą
81. Mutavimo greitis yra tikimybė, kad gene įvyks nauja
mutacija
Jo dažniausia išraiška yra naujų mutacijų skaičius, įvykęs
tiriamame gene per vieną generaciją
Mutavimo greičio skaitinė išraiška paprastai būna nuo 10-5
iki 10-9
per vieną generaciją
Tiriamojo geno mutavimo greitis nėra pastovus dydis
Jis gali padidėti, jei aplinkoje yra mutagenų
Skirtingų rūšių ar net skirtingų tos pačios rūšies linijų
mutavimo greitis gali gana žymiai skirtis
Mutavimo greitis ir mutacijų dažnis
7-81
82. Net to paties individo skirtingų genų mutavimo
greitis gali būti skirtingas
Kai kurie genai yra didesni už kitus
Tai padidina mutacijos tikimybę
Kai kurie genai yra taip išsidėstę chromosomose, kad
tampa jautresni mutacijoms
Jie yra vadinami karštaisiais taškais (hot spots)
Karštieji taškai taip pat gali būti randami ir geno viduje
Gene aptinkamos tam tikros sritys, kuriose mutacijos vyksta
žymiai dažniau, nei kitose srityse
Mutavimo greitis ir mutacijų dažnis
7-82
84. Geno mutacijų dažnis yra nustatomas mutavusių
genų skaičių padalinus iš bendro genų skaičiaus
populiacijoje
Jei 1 milijonas bakterijų buvo išsėta ir tarp jų nustatyta 10
mutantų, tada
mutacijų dažnis yra 1 iš 100,000 arba 10-5
Mutacijų dažnis priklauso ne tik nuo mutavimo greičio,
bet ir nuo
Mutacijų pasireiškimo laiko
Tikimybės, kad mutacija bus perduota sekančioms kartoms
Mutavimo greitis ir mutacijų dažnis
7-84
85. Spontaninės mutacijos atsiranda dėl trijų tipų
cheminių pokyčių
1. Depurininimo
2. Deamininimo
3. Tautomerinių virsmų
Spontaninių mutacijų priežastys
7-85
Dažniausias pokytis
86. Depurininimas yra purinų (guanino ir adenino)
pašalinimas iš DNR
Kovalentinės jungtys tarp dezoksiribozės ir purino yra kiek
nestabilios
Kartais įvyksta spontaninė reakcija su vandeniu, dėl kurios bazė
atkabinama nuo cukraus
Susidaro apurininis saitas (vieta)
Apurininiai saitai gali būti reparuojami
Tačiau jei reparacijos sitema nesuveikia, vykstant replikacijai gali
susidaryti mutacija
7-86
Spontaninių mutacijų priežastys
87. 7-87
Spontaninis depurininimas
a) Depurininimas
b) Apurininio saito replikacija
Depurininimas Apurininis saitas
DNR replikacija
X gali būti
A, T, G ar C
Trys iš keturių (A, T ir G) yra
neteisingi nukleotidai
Todėl mutacijos tikimybė
yra 75%
88. Deamininimas yra aminogrupės pašalinimas iš
citozino
Kitos bazės nėra lengvai deamininamos
7-88
DNR reparacijos fermentai gali atpažinti uracilą kaip
netinkamą DNR bazę ir jį pašalinti
Tačiau jei reparacijos sitema nesuveikia, po replikacijos į vyksta
mutacija, kurios metu C-G virsta į A-T
Citozino deamininimas
89. Taip pat gali vykti 5-metilcitozino deamininimas
7-89
Timinas yra normalus DNR komponentas
Tai sukelia problemų reparacijos fermentams
Jie negali nustatyti, kuri iš dviejų bazių, esančių dviejose DNR
grandinėse, yra klaidinga
Todėl metilintas citozinas yra mutacijų atsiradimo karštasis
taškas
5-metilcitozino deamininimas
90. Tautomeriniai virsmai yra laikinas bazių struktūros
pokytis
Įprastinė, stabili timino ir guanino yra ketoninė forma
Nedidelis T ir G bazių kiekis gali virsti enoline forma
Įprastinė, stabili adenino ir citozino yra amino forma
Nedidelis A ir C bazių kiekis gali virsti imino forma
Šios retos formos skatina AC ir GT bazių porų
susidarymą
Tautomeriniai virsmai sukelia mutacijas tada, kai
įvyksta prieš pat DNR replikaciją
7-90
93. 7-93
Laikinas
tautomerinis
virsmas
Grįžęs atgal į
normalią formą
Tautomeriniai virsmai ir replikacija sukelia mutacijas
Iki replikacijos
vyksta adenino
tautomerinis
virsmas
Poravimosi
klaida
Vyksta antroji
DNR
replikacija
DNR molekulės, randamos
4 dukterinėse ląstelėse
Mutacija
94. Daugelis veiksnių gali veikti kaip mutagenai, negrįžtamai
pakeičiantys DNR struktūrą
Mutagenai kelia problemų dėl dviejų pagrindinių priežasčių:
1. Mutagenai dažnai dalyvauja išsivystant žmogaus
onkologinėms ligoms
2. Mutagenai gali sukelti genų mutacijas, kurios gali būti žalingos
sekančioms organizmų kartoms
Mutageniški veiksniai dažnai klasifikuojami kaip cheminiai
arba fiziniai mutagenai
Kai kurie biologiniai veiksniai taip pat gali sukelti mutacijas
7-94
Mutagenų tipai
95. Mutagenų pavyzdžiai
7-95
Mutagenai Poveikis DNR struktūrai
Cheminiai mutagenai
Nitritinė rūgštis Deaminina bazes
Hidroksilaminas Hidroksilina citoziną
Azoto ipritas Alkilina bazes
Etilmetansulfonatas Alkilina bazes
Proflavinas Įsiterpia (interkaliuoja) į DNR grandinę
5-bromuracilas Bazės analogas (įsijungia į DNR vietoje timino)
2-aminopurinas Bazės analogas (įsijungia į DNR vietoje purino)
Fiziniai mutagenai
UV šviesa Skatina timino dimerų susiformavimą
Rentgeno spinduliai Sukelia bazių iškritas, DNR grandinių trūkius, sąsiuvas ir chromosomų trūkius
96. Cheminiai mutagenai skirstomi į tris pagrindines
grupes
1. Bazių modifikatoriai
2. Bazių analogai
3. Interkaliuojantys junginiai
7-96
Mutagenai pažeidžia DNR
struktūrą skirtingais būdais
97. Bazių modifikatoriai kovalentiškai modifikuoja
nukleotido struktūrą
Pavyzdžiui, nitritinė rūgštis pakeičia amino grupes keto
grupėmis (–NH2 į =O)
Tai gali paversti citoziną į uracilą, o adeniną į hipoksantiną
Tokios modifikuotos bazės poruojasi su kitokiais nukleotidais, nei
nemodifikuotos
Kai kurie cheminiai mutagenai suardo taisyklingas poras
alkilindami bazes, esančias DNR struktūroje
Pavyzdžiai: Azoto ipritas ir etilmetansulfonatas (EMS)
7-97
98. 7-98
Šis klaidingas poravimasis
gali sukelti mutacijas naujose
grandinėse po replikacijos
Modifikuotų bazių netaisyklingas poravimasis
Matricinė grandinė Po replikacijos
99. Interkaliuojantys junginiai turi plokščias planarines
struktūras, kurios geba įsiterpti į dvigubą DNR
spiralę
Tai pažeidžia spiralės struktūrą
Kai DNR, turinti šiuos įsiterpusius mutagenus,
replikuojasi, dukterinėje grandinėje gali susidaryti vieno
nukleotido intarpai arba iškritos
Pavyzdžiai:
Akridino dažai
Proflavinas
7-99
100. Bazių analogai įsijungia į dukterinę DNR grandinę
replikacijos metu
Pavyzdžiui, 5-bromuracilas yra timino analogas
Jis gali būti įjungtas į DNR vietoje timino
7-100
Normali pora
Šis tautomerinis
virsmas vyksta gana
dažnai
Klaidingas
poravimasis
5-BU poravimasis su adeninu arba guaninu
102. Fiziniai mutagenai būna dviejų pagrindinių tipų
1. Jonizuojanti radiacija
2. Nejonizuojanti radiacija
Jonizuojanti radiacija
Rentgeno ir gama spinduliai
Pasižymi trumpu bangos ilgiu ir didele energija
Gali gilia įsiskverbti į biologines molekules
Sukuria chemiškai aktyvias molekules, vadinamas laisvaisiais
radikalais
Gali sukelti
Bazių delecijas
DNR grandinių trūkius
Sąsiuvas
Chromosomų trūkius
7-102
103. 7-103
Nejonizuojanti radiacija
UV šviesa
Turi mažiau energijos
Negali giliai prasiskverbti į
biologines molekules
Formuoja susiūtus timino
dimerus
Timino dimerai gali sukelti
mutacijas kai vyksta DNR
replikacija
104. Mutageniškumui įvertinti yra naudojama daug
įvairių testų
Vienas dažniausiai naudojamų yra Eimso testas
Metodą sukūrė Briusas Eimsas (Bruce Ames)
Naudojamas Salmonella typhimurium kamienas, nesugebantis
sintetinti histidino
Šios bakterijos turi mutaciją gene, dalyvaujančiame histidino
biosintezėje. Todėl jos negali augti mitybinėje terpėje, kurioje nėra
histidino
Įvykusi kita mutacija (t.y. reversija) atstato gebėjimą sintetinti
histidiną. Tokios bakterijos sugeba augti terpėje be histidino
Eimso testu nustatomas mutantų kiekis, susiformavęs Petri
lėkštelėje, kurioje auga paveiktos tiriamąja medžiaga bakterijos
7-104
Tyrimai gali nustatyti, ar medžiaga
yra mutagenas
105. 7-105
Eimso mutageniškumo tyrimo testas
Fermentų,
galinčių
metabolizuoti
mutageną, šaltinis
Kontrolinė
lėkštelė rodo, kad
spontaninių
mutacijų dažnis
yra žemasDidelis kolonijų kiekis
rodo, kad tiriama medžiaga
gali būti mutagenas