Organização Digital para Escrita Científica - Aula 2 - Open Access e Métricas Alternativas

Publicação acadêmica digital:
Open Access
Atila Iamarino e Mário Henrique Barros
Parte I: os problemas e o acesso

Origem da Publicação Adadêmica
Como começa e quais os problemas

A criação dos periódicos
Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
Philosophical Transactions (of the
Royal Society of London) é criado
em 1665:
• Inaugura o conceito de peer-
review
• Estabelece prioridade de
descoberta
Arquivo das edições mais antigas:
http://onlinebooks.library.upenn.edu/webbin/se
rial?id=philtransactions

Papel dos primeiros periódicos
• Cientista:
– resultados
• Periódicos:
– revisão
– edição
– distribuição
– arquivamento

Problemas: peer-review
http://dx.doi.org/10.1126/science.1219861

Problemas: edição
http://dx.doi.org/10.1111/eth.12282

Problemas: journal-affordability
• Publicação tradicional: ótima para poucas
revistas
• 2,5M artigos por ano em 2004*: quem paga?
– Não seriam viáveis a preço de custo
* Harnad, S., Brody, T., Vallières, F., Carr, L., Hitchcock, S., Gingras, Y., Oppenheim, C., et al. (2004). The
Access/Impact Problem and the Green and Gold Roads to Open Access. Serials Review, 30(4), 310–314.
doi:10.1016/j.serrev.2004.09.013

Com a distribuição digital
• Cientista:
– resultados
• Periódicos:
– revisão (email)
– edição (automatizada)
– distribuição (grátis)
– arquivamento (digital)

No entanto
Association of Research Libraries
http://www.arl.org/bm~doc/monser04.pdf
• Cientista:
– resultados
• Periódicos:
– revisão (email)
– edição (automatizada)
– distribuição (grátis)
– arquivamento (digital)

No entanto
http://poeticeconomics.blogspot.ca /2012/01/enormous-profits-of-stm-scholarly.html
http://poeticeconomics.blogspot. com.br/2014/03/elsevier-stm-publishing-profits-rise-to.html
• Elsevier (2014): £826 milhões, lucro de 39%
• Springer (2010): € 294 milhões, lucro de 33,9%
• Wiley & Sons (2011): $106 milhões, lucro de 42%

Porque não discutimos
• Acesso à artigos em 2013: $ 93.872.151,111
– ~$32 milhões à Elsevier2
• ~$1,60 por artigo (desde 2005)3
[1] http://www.capes.gov.br/images/stories/download/Contas_Publicas/Relatorio-de-Gestao-2013.pdf
[2] https://gowers.wordpress.com/2014/04/24/elsevier-journals-some-facts/
[3] Almeida, E. C. E. de, Guimarães, J. A., & Alves, I. T. G. (2011). Dez anos do Portal de Periódicos da Capes: histórico,
evolução e utilização. Revista Brasileira de Pós-Graduação, 7(13). Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015

Eis que
http://www.michaeleisen.org/blog/?p=807

Eis que
Timothy Gowers - http://gowers.wordpress.com/2012/01/21/elsevier-my-part-in-its-downfall/

Eis que
http://thecostofknowledge.com/

Open Access
Acesso livre vs grátis

Acesso Grátis vs Acesso Aberto
Atribuição (by)
Atribuição - Compartilhamento pela mesma Licença (by-sa)
Atribuição - Não a Obras Derivadas (by-nd)
Atribuição - Uso Não Comercial (by-nc)
http://creativecommons.org.br/

Tipos de Open Access
• Green:
– 6 meses a um ano para arquivamento próprio do
manuscrito submetido
• Gold:
– Disponível imediatamente
– Quem paga entre $1000 e $5000?
• Preprints e repositórios
– ArXiv - http://arxiv.org/

Open Access: Acesso ao Público
Fausto, S., Machado, F. A., Bento, L. F. J., Iamarino, A., Nahas, T. R., & Munger, D. S. (2012). Research Blogging: Indexing and
Registering the Change in Science 2.0. PLoS ONE, 7(12), e50109. doi:10.1371/journal.pone.0050109

Open Access: Citações
Harnad, S., Brody, T., Vallières, F., Carr, L., Hitchcock, S., Gingras, Y., Oppenheim, C., et al. (2004). The
Access/Impact Problem and the Green and Gold Roads to Open Access. Serials Review, 30(4), 310–314.
doi:10.1016/j.serrev.2004.09.013

Open Access: Citações
Eysenbach, G. (2006). Citation advantage of open access articles. PLoS biology, 4(5), e157.
doi:10.1371/journal.pbio.0040157
Para a PNAS, artigos OA:
• Citado antes
• Mais chances de sere citados pelo menos 1 vez
• Mais citações

Open Access: Periódicos
http://plos.org/
• PLOS ONE
• PLOS Biology
• PLOS Medicine
• PLOS Genetics
• PLOS Computational
Biology
• PLOS Pathogens
• PLOS Neglected
Tropical Diseases

http://www.biomedcentral.com/

http://www.nature.com/srep/index.html

http://advances.sciencemag.org/

https://peerj.com/

http://www.jnrbm.com/

Cuidado!
• Alguns periódicos adotam as
práticas predatórias de
publicação
http://scholarlyoa.com/publishers/
Fonte: The Scientist

Cuidado!
http://scholarlyoa.com/2014/11/20/bogus-journal-accepts-profanity-laced-anti-spam-paper/
http://www.scs.stanford.edu/~dm/home/papers/remove.pdf Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015

Para mais:
Open Access: An Introduction
http://www.ercim.eu/publication/Ercim_News/enw64/jeffery.html
Wiki sobre OA
http://oad.simmons.edu/oadwiki/Main_Page
Blog do Kuramoto: Blog brasileiro sobre OA
http://kuramoto.blog.br/
Editorial Reformando a Ciência da Infection and Imunnity
http://iai.asm.org/content/80/3/891.full
http://iai.asm.org/content/80/3/897.full

Publicação acadêmica digital:
Altmetrics
Parte II: os dados gerados

Fator de Impacto
O que podemos medir não é tudo que há para medir

O Fator de Impacto
Como saber a relevância de um artigo?
• Eugene Garfield propõe em 1955 a contagem de citações
• Em 1961 começa o Science Citation Index proposto po
Garfield e Irving H. Sher
Garfield, E. (2006). The history and meaning of the journal impact factor. JAMA : the journal of the American
Medical Association, 295(1), 90–3. doi:10.1001/jama.295.1.90

Como funciona o IF
Quantas citações cada periódico recebeu nos dois anos anteriores
/ total de artigos publicados no período
“Correspondence, letters, commentaries, perspectives, news
stories, obituaries, editorials, interviews, and tributes are not
included in the JCR’s denominator.”
Artigos de 2013 Artigos de 2012 Artigos de 2011
FI 2013 FI 2012 FI 2011
Garfield, E. (2006). The history and meaning of the journal impact factor. JAMA : the journal of the American
Medical Association, 295(1), 90–3. doi:10.1001/jama.295.1.90

Problemas com o IF
• Nem todas áreas concentram citações em 2 a 3 anos
– Nature: sim Ecology: 7 a 8 anos*
• É tão acurado quanto a base de dados (Web of Science)
– 25 a 35% das citações contém erros*
• Pune áreas de interesse específicas
• Se aplica à revista, e não ao artigo
*Vanclay, J. K. (2011). Impact factor: outdated artefact or stepping-stone to journal certification?
Scientometrics, 92(2), 211–238. doi:10.1007/s11192-011-0561-0

Problemas com o IF
Seglen, P. O. (1997). Why the impact factor of journals should not be used for evaluating research. BMJ
(Clinical research ed.), 314(7079), 498–502.

Problemas com o IF
Rossner, M., Epps, H. Van, & Hill, E. (2007). Show me the data. Cell, 179(6), 1091–1092. doi:10.1371/journal
Propriedade da Thomson Scientific e não é reproduzido
http://noctique.deviantart.com/art/Fog-on-road-175259064

Problemas com o IF
Fang, F. C., & Casadevall, A. (2011). Retracted science and the retraction index. Infection and immunity,
79(10), 3855-9. doi:10.1128/IAI.05661-11

Fator de impacto
É o que tem
É o que tem?

Altmetrics
Medidas individuais de artigos e pesquisadores

Métricas alternativas: o que medir

Altmetrics
Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore
scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745 Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015

Métricas alternativas: agilidade
Eysenbach, G. (2011). Can tweets predict citations? Metrics of social impact based on Twitter and
correlation with traditional metrics of scientific impact. Journal of medical Internet research, 13(4), e123.
doi:10.2196/jmir.2012
• Menções no Twitter:
- menos de 2 dias
• Mais twetados:
- mais downloads
• 11x mais chances de
serem bem citados

Métricas alternativas: agilidade
scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745
Tags associadas

Métricas alternativas: abrangência
scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745 Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015

scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745
A: Citados e lidos
B: Lidos e pouco citados
C: Populares
D: Escolhidos por especialistas
E: Pouco impacto por estas medidas

http://blog.impactstory.org/2012/09/14/31524247207/

Métricas por artigo: quem perde
Lariviere, V., Lozano, G. A., & Gingras, Y. (2013). Are elite journals declining?, 12. Digital
Libraries. Retrieved from http://arxiv.org/abs/1304.6460

Métricas por artigo: quem perde
http://www.nature.com/news/science-publishing-the-golden-club-
1.13951?WT.ec_id=NEWS-20131022

Problemas com o glamour
[1] http://www.nature.com/news/retraction-challenges-
1.16023?WT.ec_id=NATURE-20141002
“Why the sudden pulse of Nature retractions in 2013
and 2014? […] We can only speculate.“1

Métricas alternativas: como fazer?
http://altmetric.com/

Métricas alternativas: como fazer?
Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015http://impactstory.org/

Programas de organização

Leitura
• Pocket
– http://getpocket.com/
• Instapaper
– http://www.instapaper.com/
• Readability
– http://www.readability.com/
• Evernote Web Clipper

Captura
• Web
• Ideias
• Fotos
• Arquivos
• PDFs
http://evernote.com/evernote/

Captura e organização de artigos
Atila Iamarino | ICB-5721-2 9 Março 2015
• Captura automática de artigos
• Páginas Web
• Acesso offline
• Anotação
• Sincronização
• PDFs
• Reference Manager
http://www.zotero.org/

Captura e organização de artigos
• PDFs
• Acesso offline
• Anotação
• Sincronização
• Reference Manager
• Rede social
• Compartilhamento
http://mendeley.com/

Para aula prática:
Montar caderno de notas do Evernote com:
• Uma nota com PDF anotado
• Uma nota com áudio
• Uma nota com um links
• Uma nota com link para arquivo do computador
• Uma nota com a resenha de um programa relacionado à disciplina
• Uma nota descrevendo seu projeto e como um dos programas poderia
ajudar
• Uma nota de laboratório (documentação de arquivo, foto de gel, etc)

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