SlideShare a Scribd company logo
1 of 31
Kore’ de Tavuk ve Domuz
Dışkısından İzole Edilen
E.faecalis İzolatlarının
Virulans Etmenlerinin
Belirlenmesi
GİRİŞ
   Enterococcus cinsi, insan ve
    hayvan doğal florasında
    bulunduğu gibi bazı yiyecek ve
    içeceklerde de bulunabilir. (süt,
    peynir, et, sebze gibi )
   Enterococcus cinsi, hastane
    enfeksiyonlarında büyük tehlike
    oluşturmaktadır. Örneğin; ürüner
    enfeksiyon, endokardit, kanda
    iltihap, yara iltihapları gibi önemli
    hastalıklara neden olmaktadır.

   Buna ek olarak, antibiyotik direnç
    genlerini ve virulans faktörlerini
    kazanabilme yeteneği vardır.
   Jelatinaz, ekstrasellüler çinko-
    endopeptidazdır ve birçok çalışmada
    virulans faktörü olduğu belirlenmiştir.

   Jelatinazı kodlayan gen, gelE’ dir.
    gelE yaygın olarak E.faecalis’ te fsr
    geni ile birlikte bulunur. Jelatinaz;
    jelatini, kazeini, hemoglobini ve diğer
    biyoaktif peptidleri hidrolize eder.
Hemolizin(sitolizin) birçok Gram(+)
    bakteride, bakterisidal etkiye ve
    hemolitik aktivitesi vardır.



   Bu enzim cylA, cylB, cylM genlerinin
    etkileşimi ile aktivitesini oluşturur.
   Enterococcus yüzey proteini (Esp),
    üriner enfeksiyonlar gibi birçok
    enterekok enfeksiyonlarının
    devamlılığını ve konalizasyonunu
    sağlarken ayrıca biofilm oluşumunu da
    sağlar.
   Virulans faktörleri E.faecalis’ te
    genellikle E.faecium’ a göre daha
    yaygındır. E.faecalis entrekok
    bağlantılı hastane enfeksiyonlarının
    %80’den daha fazla bir oranda
    sorumludur. E.faecalis’ in virulans
    faktörleri genel durumu iyi olan
    hastalarda daha zararsız olmasına
    rağmen hastanede yatan genel
    durumu kötü hastalardan daha
    etkilidir.
   Enterokok klinik izolatları, immün
    sistemi zayıf hastalarda potansiyel
    hastalık etmenidir.

   E.feacalis virulans belirleyicileri
    hastalığın şiddetiyle yakından
    ilişkilidir ve bu virulans faktörlerinin
    etkisi hayvan modellerinde ve
    hücrelerde gösterilmiştir. Ancak,
    hayvan ve gıda orijinli enterokok
    virulans faktör çalışmaları azdır.
   Bu nedenle, bu çalışmada Kore’de
    bulunan tavuklardan ve
    domuzlardan elde edilen E.faecalis
    izolatlarının üzerinde durulmuştur.
Materyal - Metod
   E.faecalis izolatları daha önceki
    çalışmalarda olduğu gibi Kore’ deki
    mezbahalarda izole edildi. Özellikle
    de fekal örnekler bile-esculin azide
    broth (BD BBL, Spark, MD, USA)’ da 24
    saat 35°C’ de inokule edildi ve izolatlar
    Enterecoccus agara (BD BBL) ekilip, 24
    saat boyunca 35°C’ de inkübe edildi.
    E.Faecalis’ in identifikasyonları VITEK
    system (bioMérieux,Hazelwood, MO,
    USA) kullanılarak yapıldı. E.Faecalis PCR
    ile teyit edildi.
   22 tanesi tavuktan, 19 tanesi domuzdan
    olmak üzere toplam 41 tane E.faecalis
    izolatı ve bu izolatlarda virulans
    faktörlerinin varlığı araştırıldı.
   Jelatinaz aktivitesi ve hemolizin aktivitesinin
    gelE, fsr , esp, cylA, cylB, cylM genlerinin
    ekspresyonu ile paralel olduğu anlaşılmıştır.
   Jelatinaz aktivitesinin belirlenmesi için,
    %1.5’ luk skim milk (Difco,MD,USA) içeren
    triptik soy agar plakalarına hazırlanıp 37°C’
    de gecelik inokulasyona bırakıldı.Daha
    sonra soğutulup 2 saat oda sıcaklığında
    bekletildi ve jelatinaz aktivitesi belirlendi.
   Jelatinaz aktivitesi gösteren kolonilerin etrafında şeffaf halde haleler
    belirlenmiştir.
   Hemolizin aktivitesinin belirlenmesi için,
    Columbia Blood Agar (Oxoid, UK)’ a %5lik
    defibrine at kanı içeren plakalarda 37°C’ de
    48saat inkübe edilmiştir.
   Kolonilerin etrafındaki beyaz zonlar ß-
    hemolitik aktiviteyi göstermektedir.
   Virulans genlerinin PCR ile
    belirlenmesinde jelatinaz; gelE, fsr, esp
    ve sitolizin ekspresyonlarıyla ilgli genler
    belirlenmiştir.
   Primer setleri ve PCR koşulları tabloda gösterilmiştir.

   E. faecalis’ in ATCC 51299 nolu suşunun DNA’ sı PCR
    reaksiyonlarında pozitif suş olarak belirlendi.
   41 örnek arasında belirlenen virulansların
    dağılımı jelatinaz ve ß-hemolitik aktiviteleri
    tablo-2 de gösterilmiştir.
   Toplam izolatların %85.4’ünde jelatinaz
    aktivitesi, %12.2’inde ise ß-hemolitik
    aktivite görülmüştür.
   Tavuk izolatlarının %91’inde jelatinaz
    aktivitesine rastlanmıştır. Kümes hayvan
    orijinli izole edilen daha önceki raporlarda
    bu oran %88di.
   Domuz izolatlarında %79 oranında
    jelatinaz aktivitesine rastlanmıştır.Bu oran
    domuzlarda daha önce %68.4 idi.
   Genel olarak jelatinaz aktivitesinin yaygınlığı
    bu çalışmada gıda ve klinik enterokok izolat
    raporlarınkinden daha çok bulunmuştur.
    (Gıda da %56, klinikte %33-55)
   Jelatinaz ile ß-hemolitik aktiviteyi
    karşılaştırırsak 41 izolatın, 5’ inde ß-
    hemolitik aktivite gösterilmiştir.

   5 örneğin 4’ü domuz orijinli olup, tavukta
    22 izolattan yalnızca 1’inde ß-hemolitik
    aktivite gözlemlenmiştir.
   PCR ile entrekok surface proteini (esp)
    kodlayan gen, 41 izolattan yalnızca 10
    tanesinde belirlenmiştir. Domuzdan izole
    edilen 19 tane izolatın, 8inde esp genine
    rastlanmıştır.

   İnsan izolatların da bakteremi ve endokardit
    hastalıklarında esp içeren Enterococcus
    belirlenebilir.
   Tabloda, ß-hemolitik aktiviteye sahip enterokokların
    hepsinin esp geni barındırdığını fakat jelatinaz aktiviteye
    sahip olanlarda esp geninin barındırmağı görülmektedir.
   ß-hemolizimin prevalansı (%12.2),(5) diğer
    raporlara göre çok daha düşüktür. (Klinik ve
    gıda izolatlarında %17-22)

   Tüm E.faecalis’ler yalnızca esp geni
    içermektedirler ve jelatinaz aktivitesinden
    yoksundurlar.

   Diğer kalan 36 izolatta tüm sitolizin genlerinin
    hepsine rastlanmamış ve hemolitik aktivite
    gözlemlenmemiştir.
   Jelatinaz aktivitesi ve gelE ve fsr
    lokularının(fsrA, fsrB, ve fsrC) genotipi
    lokularının
    arasındaki korelasyon tabloda
    gösterilmiştir.
   35 pozitif jelatinaz suşlardan 31 tanesi
    gelE ve fsrABC genlerini içermektedir.

   Geriye kalan 6 jelatinaz negatif suştan 2
    tanesi fsrABC ve gelE genlerini
    içermektedir. Fakat bu durum henüz
    açıklanmamıştır. Diğer yazarlarda bazı
    enterokok türlerinin genotip ve fenotip
    tutarsızlığını rapor etmiştir.
   Bu çalışmadaki bilgiler Kore’ nin çitflik
    hayvanlarının Enterococcus virulans
    faktörlerinin prevalansının
    gözlemlenmesinde yardımcı olabilir.

   Enterococcus türlerinin hayvan kaynaklı
    gıda ürünlerinde rezervuar olabileceği göz
    önüne alınabilir.
TEŞEKKÜRLER…


Nizamettin BİNGÖL

More Related Content

Viewers also liked

Viewers also liked (10)

Aspirations for Future Education
Aspirations for Future EducationAspirations for Future Education
Aspirations for Future Education
 
Osallisuuden kasvupolkua rakentamassa. Oppilaan näkökulma. KEOS2915
Osallisuuden kasvupolkua rakentamassa. Oppilaan näkökulma. KEOS2915Osallisuuden kasvupolkua rakentamassa. Oppilaan näkökulma. KEOS2915
Osallisuuden kasvupolkua rakentamassa. Oppilaan näkökulma. KEOS2915
 
Kehittämiskeskus OPINKIRJO. Maaliskuu 2016
Kehittämiskeskus OPINKIRJO. Maaliskuu 2016Kehittämiskeskus OPINKIRJO. Maaliskuu 2016
Kehittämiskeskus OPINKIRJO. Maaliskuu 2016
 
Learning pathway in media education
Learning pathway in media educationLearning pathway in media education
Learning pathway in media education
 
Reseptejä OPS2014:n toteuttamiseen
Reseptejä OPS2014:n toteuttamiseenReseptejä OPS2014:n toteuttamiseen
Reseptejä OPS2014:n toteuttamiseen
 
Microbial leaching
Microbial leachingMicrobial leaching
Microbial leaching
 
Rpp
RppRpp
Rpp
 
ELISA Test
ELISA TestELISA Test
ELISA Test
 
Dna dizi analizi ve klonlama
Dna dizi analizi ve klonlamaDna dizi analizi ve klonlama
Dna dizi analizi ve klonlama
 
Soal soal fisika
Soal soal fisikaSoal soal fisika
Soal soal fisika
 

Similar to Kore’ de tavuk ve domuz dışkısından i̇zole edilen e.faecalis i̇zolatlarının virulans etmenlerinin belirlenmesi

Bir slahevindeki mahkmlar arasnda gda kaynakl gastrointesti.pdf
Bir slahevindeki mahkmlar arasnda gda kaynakl gastrointesti.pdfBir slahevindeki mahkmlar arasnda gda kaynakl gastrointesti.pdf
Bir slahevindeki mahkmlar arasnda gda kaynakl gastrointesti.pdfadvaith20071
 
Hayvan doku kültürü EGEKÖK Maraton Kök Hücre
Hayvan doku kültürü EGEKÖK Maraton Kök HücreHayvan doku kültürü EGEKÖK Maraton Kök Hücre
Hayvan doku kültürü EGEKÖK Maraton Kök HücreÖkkeş Zortuk
 
Sepsi̇s prop sunum son
Sepsi̇s prop sunum sonSepsi̇s prop sunum son
Sepsi̇s prop sunum sontyfngnc
 
Inguinal hernia - Project presentation - TR - 2018
Inguinal hernia - Project presentation - TR - 2018Inguinal hernia - Project presentation - TR - 2018
Inguinal hernia - Project presentation - TR - 2018Oguz Kizilkaya
 
SIK GÖRÜLEN TEK GEN HASTALIKLARININ PRENATAL TANISI
SIK GÖRÜLEN TEK GEN HASTALIKLARININ PRENATAL TANISI SIK GÖRÜLEN TEK GEN HASTALIKLARININ PRENATAL TANISI
SIK GÖRÜLEN TEK GEN HASTALIKLARININ PRENATAL TANISI www.tipfakultesi. org
 
Sağlıkta laboratuvar
Sağlıkta laboratuvarSağlıkta laboratuvar
Sağlıkta laboratuvarAkaya Emerk
 
Egitim sunumu
Egitim sunumuEgitim sunumu
Egitim sunumuyunusov
 
İnfertiltitede Hormonal Değerlendirme - www.jinekolojivegebelik.com
İnfertiltitede Hormonal Değerlendirme - www.jinekolojivegebelik.comİnfertiltitede Hormonal Değerlendirme - www.jinekolojivegebelik.com
İnfertiltitede Hormonal Değerlendirme - www.jinekolojivegebelik.comjinekolojivegebelik.com
 
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıMTekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıMarda
 
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıMTekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıMarda
 

Similar to Kore’ de tavuk ve domuz dışkısından i̇zole edilen e.faecalis i̇zolatlarının virulans etmenlerinin belirlenmesi (12)

Bir slahevindeki mahkmlar arasnda gda kaynakl gastrointesti.pdf
Bir slahevindeki mahkmlar arasnda gda kaynakl gastrointesti.pdfBir slahevindeki mahkmlar arasnda gda kaynakl gastrointesti.pdf
Bir slahevindeki mahkmlar arasnda gda kaynakl gastrointesti.pdf
 
Hayvan doku kültürü EGEKÖK Maraton Kök Hücre
Hayvan doku kültürü EGEKÖK Maraton Kök HücreHayvan doku kültürü EGEKÖK Maraton Kök Hücre
Hayvan doku kültürü EGEKÖK Maraton Kök Hücre
 
Sepsi̇s prop sunum son
Sepsi̇s prop sunum sonSepsi̇s prop sunum son
Sepsi̇s prop sunum son
 
Inguinal hernia - Project presentation - TR - 2018
Inguinal hernia - Project presentation - TR - 2018Inguinal hernia - Project presentation - TR - 2018
Inguinal hernia - Project presentation - TR - 2018
 
SIK GÖRÜLEN TEK GEN HASTALIKLARININ PRENATAL TANISI
SIK GÖRÜLEN TEK GEN HASTALIKLARININ PRENATAL TANISI SIK GÖRÜLEN TEK GEN HASTALIKLARININ PRENATAL TANISI
SIK GÖRÜLEN TEK GEN HASTALIKLARININ PRENATAL TANISI
 
Fetal Nükleik ASit
Fetal Nükleik ASit Fetal Nükleik ASit
Fetal Nükleik ASit
 
Sağlıkta laboratuvar
Sağlıkta laboratuvarSağlıkta laboratuvar
Sağlıkta laboratuvar
 
Egitim sunumu
Egitim sunumuEgitim sunumu
Egitim sunumu
 
İnfertiltitede Hormonal Değerlendirme - www.jinekolojivegebelik.com
İnfertiltitede Hormonal Değerlendirme - www.jinekolojivegebelik.comİnfertiltitede Hormonal Değerlendirme - www.jinekolojivegebelik.com
İnfertiltitede Hormonal Değerlendirme - www.jinekolojivegebelik.com
 
Enterokoklar
EnterokoklarEnterokoklar
Enterokoklar
 
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıMTekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
 
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıMTekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
Tekrarlayan Gebelik KayıPlarıNa YaklasıM
 

Kore’ de tavuk ve domuz dışkısından i̇zole edilen e.faecalis i̇zolatlarının virulans etmenlerinin belirlenmesi

  • 1.
  • 2. Kore’ de Tavuk ve Domuz Dışkısından İzole Edilen E.faecalis İzolatlarının Virulans Etmenlerinin Belirlenmesi
  • 4. Enterococcus cinsi, insan ve hayvan doğal florasında bulunduğu gibi bazı yiyecek ve içeceklerde de bulunabilir. (süt, peynir, et, sebze gibi )
  • 5. Enterococcus cinsi, hastane enfeksiyonlarında büyük tehlike oluşturmaktadır. Örneğin; ürüner enfeksiyon, endokardit, kanda iltihap, yara iltihapları gibi önemli hastalıklara neden olmaktadır.  Buna ek olarak, antibiyotik direnç genlerini ve virulans faktörlerini kazanabilme yeteneği vardır.
  • 6. Jelatinaz, ekstrasellüler çinko- endopeptidazdır ve birçok çalışmada virulans faktörü olduğu belirlenmiştir.  Jelatinazı kodlayan gen, gelE’ dir. gelE yaygın olarak E.faecalis’ te fsr geni ile birlikte bulunur. Jelatinaz; jelatini, kazeini, hemoglobini ve diğer biyoaktif peptidleri hidrolize eder.
  • 7. Hemolizin(sitolizin) birçok Gram(+) bakteride, bakterisidal etkiye ve hemolitik aktivitesi vardır.  Bu enzim cylA, cylB, cylM genlerinin etkileşimi ile aktivitesini oluşturur.
  • 8. Enterococcus yüzey proteini (Esp), üriner enfeksiyonlar gibi birçok enterekok enfeksiyonlarının devamlılığını ve konalizasyonunu sağlarken ayrıca biofilm oluşumunu da sağlar.
  • 9. Virulans faktörleri E.faecalis’ te genellikle E.faecium’ a göre daha yaygındır. E.faecalis entrekok bağlantılı hastane enfeksiyonlarının %80’den daha fazla bir oranda sorumludur. E.faecalis’ in virulans faktörleri genel durumu iyi olan hastalarda daha zararsız olmasına rağmen hastanede yatan genel durumu kötü hastalardan daha etkilidir.
  • 10. Enterokok klinik izolatları, immün sistemi zayıf hastalarda potansiyel hastalık etmenidir.  E.feacalis virulans belirleyicileri hastalığın şiddetiyle yakından ilişkilidir ve bu virulans faktörlerinin etkisi hayvan modellerinde ve hücrelerde gösterilmiştir. Ancak, hayvan ve gıda orijinli enterokok virulans faktör çalışmaları azdır.
  • 11. Bu nedenle, bu çalışmada Kore’de bulunan tavuklardan ve domuzlardan elde edilen E.faecalis izolatlarının üzerinde durulmuştur.
  • 13. E.faecalis izolatları daha önceki çalışmalarda olduğu gibi Kore’ deki mezbahalarda izole edildi. Özellikle de fekal örnekler bile-esculin azide broth (BD BBL, Spark, MD, USA)’ da 24 saat 35°C’ de inokule edildi ve izolatlar Enterecoccus agara (BD BBL) ekilip, 24 saat boyunca 35°C’ de inkübe edildi. E.Faecalis’ in identifikasyonları VITEK system (bioMérieux,Hazelwood, MO, USA) kullanılarak yapıldı. E.Faecalis PCR ile teyit edildi.
  • 14. 22 tanesi tavuktan, 19 tanesi domuzdan olmak üzere toplam 41 tane E.faecalis izolatı ve bu izolatlarda virulans faktörlerinin varlığı araştırıldı.
  • 15. Jelatinaz aktivitesi ve hemolizin aktivitesinin gelE, fsr , esp, cylA, cylB, cylM genlerinin ekspresyonu ile paralel olduğu anlaşılmıştır.
  • 16. Jelatinaz aktivitesinin belirlenmesi için, %1.5’ luk skim milk (Difco,MD,USA) içeren triptik soy agar plakalarına hazırlanıp 37°C’ de gecelik inokulasyona bırakıldı.Daha sonra soğutulup 2 saat oda sıcaklığında bekletildi ve jelatinaz aktivitesi belirlendi.
  • 17. Jelatinaz aktivitesi gösteren kolonilerin etrafında şeffaf halde haleler belirlenmiştir.
  • 18. Hemolizin aktivitesinin belirlenmesi için, Columbia Blood Agar (Oxoid, UK)’ a %5lik defibrine at kanı içeren plakalarda 37°C’ de 48saat inkübe edilmiştir.  Kolonilerin etrafındaki beyaz zonlar ß- hemolitik aktiviteyi göstermektedir.
  • 19. Virulans genlerinin PCR ile belirlenmesinde jelatinaz; gelE, fsr, esp ve sitolizin ekspresyonlarıyla ilgli genler belirlenmiştir.
  • 20. Primer setleri ve PCR koşulları tabloda gösterilmiştir.  E. faecalis’ in ATCC 51299 nolu suşunun DNA’ sı PCR reaksiyonlarında pozitif suş olarak belirlendi.
  • 21. 41 örnek arasında belirlenen virulansların dağılımı jelatinaz ve ß-hemolitik aktiviteleri tablo-2 de gösterilmiştir.
  • 22. Toplam izolatların %85.4’ünde jelatinaz aktivitesi, %12.2’inde ise ß-hemolitik aktivite görülmüştür.  Tavuk izolatlarının %91’inde jelatinaz aktivitesine rastlanmıştır. Kümes hayvan orijinli izole edilen daha önceki raporlarda bu oran %88di.  Domuz izolatlarında %79 oranında jelatinaz aktivitesine rastlanmıştır.Bu oran domuzlarda daha önce %68.4 idi.
  • 23. Genel olarak jelatinaz aktivitesinin yaygınlığı bu çalışmada gıda ve klinik enterokok izolat raporlarınkinden daha çok bulunmuştur. (Gıda da %56, klinikte %33-55)
  • 24. Jelatinaz ile ß-hemolitik aktiviteyi karşılaştırırsak 41 izolatın, 5’ inde ß- hemolitik aktivite gösterilmiştir.  5 örneğin 4’ü domuz orijinli olup, tavukta 22 izolattan yalnızca 1’inde ß-hemolitik aktivite gözlemlenmiştir.
  • 25. PCR ile entrekok surface proteini (esp) kodlayan gen, 41 izolattan yalnızca 10 tanesinde belirlenmiştir. Domuzdan izole edilen 19 tane izolatın, 8inde esp genine rastlanmıştır.  İnsan izolatların da bakteremi ve endokardit hastalıklarında esp içeren Enterococcus belirlenebilir.
  • 26. Tabloda, ß-hemolitik aktiviteye sahip enterokokların hepsinin esp geni barındırdığını fakat jelatinaz aktiviteye sahip olanlarda esp geninin barındırmağı görülmektedir.
  • 27. ß-hemolizimin prevalansı (%12.2),(5) diğer raporlara göre çok daha düşüktür. (Klinik ve gıda izolatlarında %17-22)  Tüm E.faecalis’ler yalnızca esp geni içermektedirler ve jelatinaz aktivitesinden yoksundurlar.  Diğer kalan 36 izolatta tüm sitolizin genlerinin hepsine rastlanmamış ve hemolitik aktivite gözlemlenmemiştir.
  • 28. Jelatinaz aktivitesi ve gelE ve fsr lokularının(fsrA, fsrB, ve fsrC) genotipi lokularının arasındaki korelasyon tabloda gösterilmiştir.
  • 29. 35 pozitif jelatinaz suşlardan 31 tanesi gelE ve fsrABC genlerini içermektedir.  Geriye kalan 6 jelatinaz negatif suştan 2 tanesi fsrABC ve gelE genlerini içermektedir. Fakat bu durum henüz açıklanmamıştır. Diğer yazarlarda bazı enterokok türlerinin genotip ve fenotip tutarsızlığını rapor etmiştir.
  • 30. Bu çalışmadaki bilgiler Kore’ nin çitflik hayvanlarının Enterococcus virulans faktörlerinin prevalansının gözlemlenmesinde yardımcı olabilir.  Enterococcus türlerinin hayvan kaynaklı gıda ürünlerinde rezervuar olabileceği göz önüne alınabilir.