Este documento presenta un resumen de los conceptos clave sobre enzimas. En pocas oraciones: Las enzimas son proteínas catalíticas que aceleran reacciones químicas en sistemas biológicos. Su actividad puede ser regulada por mecanismos como la inhibición, la modificación alostérica o el rompimiento proteolítico. La cinética enzimática sigue modelos como la ecuación de Michaelis-Menten que relaciona la velocidad de reacción con la concentración de sustrato.
2. Propiedades generales
Las enzimas son los agentes catalíticos
de los sistemas biológicos.
Todas las enzimas son proteínas
excepto las riboenzimas.
Funcionan bajo condiciones moderadas.
Aumentan la velocidad de una reacción
hasta por un factor de 1014 .
Son altamente específicas.
La acción enzimática es regulada.
Ejemplos de metales usados
como cofactores
ENZYMES
(holoenzyme)
Apoenzyme Chemical component
(amino acid portion) (non-amino acid portion)
Cofactor
metals coenzymes prosthetic group
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3. Nomenclatura
Nomenclatura
De acuerdo al número de la Comisión
Enzimática (Enzyme Commission number)
Primer #: tipo de reacción catalizada.
Segundo #: indica la subclase; dice el tipo
de sustrato o el enlace que se rompe en
forma mas precisa.
Tercer #: indica la sub-subclase; nos dice el
tipo de aceptador de electrones
(oxidoreductasas) o el tipo de grupo que se
remueve (liasas), etc.
Cuarto #: indica el número de serie de la
enzima en su sub-subclase.
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4. ESPECIFICIDAD
ENZIMATICA
6.2 Como trabajan La especificidad enzimática puede
las enzimas variar.
Pasos que ocurren durante la acción
enzimática:
Sustrato se enlaza a la enzima.
Ocurren alteraciones químicas que
incluyen rompimiento y formación de
enlaces.
La enzima libera el producto de la
reacción.
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5. Teorías que explican la
actividad enzimática:
Llave y cerradura: específica; un sustrato y
una enzima.
Adaptación inducida: menos específica, el
centro activo se ajusta al sustrato que
interviene.
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6. Mecanismos de acción Mecanismos de acción
Estado de transición: forma activa de una Energía de activación: cantidad de energía
molécula en la cual la molécula realiza una necesaria para convertir todas las
reacción química parcial. moléculas de un mol de sustancia
Energía libre: componente de la energía reaccionando de su estado raso a su
total de un sistema que puede realizar estado de transición.
trabajo a temperatura y presión constante.
Las enzimas aumentan la velocidad de la
G reacción = G productos – G reactivos
reacción disminuyendo la energía de
Reacción exergónica: ΔG es negativo activación, pero no afectan los aspectos
G= H-T S termodinámicos de las reacciones.
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7. 6.3 Cinética química
Cinética química
Reacciones elementales
AP
A I1 I2 P
Ordenes de reacción
Constante de rapidez
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8. La ecuación describe el Cinética de enzimas
progreso de una reacción
como función del tiempo. La
pendiente nos da la constante
de velocidad.
Ecuación Michaelis-Menten
Paso #1
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10. Significado Km y Vmax Turnover number
KM es igual a la concentración de sustrato Constante catalítica equivale al
cuando 50% de los centros activos de la
enzima están ocupados. También “turnover number”
representa cuán fuerte la enzima se enlaza
al sustrato. La razón de kcat/Km representa una
VMAX está relacionado con el turnover medida de la eficiencia catalítica.
number: número de moles de sustrato
transformado en producto por mol de
enzima por segundo.
Mayor el “turnover number” mayor la
eficiencia.
Equivale a: Vmax/[Et]
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11. Gráfica Lineweaver-Burk
Mecanismos para reacciones
Reacciones de dos sustratos
con más de un sustrato
Reacciones secuenciales: reacciones Al azar: no importa el orden de añadir
de desplazamiento sencillo un sustrato.
Ordenado
Al azar Ordenado: el orden en que se añaden
los sustratos está definido.
Reacciones Ping-pong: reacciones de
desplazamiento doble
Ping-pong: desplazamiento doble, no
hay formación de compuesto ternario.
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12. Tipos de inhibición
Inhibidores reversibles
• Competitivo: Compite con el sustrato por
el centro activo. Se parecen al sustrato.
• No competitivo: el inhibidor no compite
con el sustrato. Inhibidor tiene un punto
diferente de enlace. Puede enlazar la E o
el complejo ES.
• De incompetencia: el inhibidor se enlaza
directamente al complejo enzima-sustrato
y no a la enzima libre.
Inhibidor competitivo Inhibidor competitivo
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13. Inhibidor no-competitivo
Aumenta el
Km y el Vmax
permanece
constante.
Inhibidor no-competitivo
Disminuye Vmax
y Km permanece
constante
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15. Actividad enzimática depende
Tipos de inhibición
del pH
Inhibidores irreversibles
Se combina con o destruye un grupo
funcional necesario para la actividad
enzimática. Se forma un enlace covalente.
• Ejemplo: Inhibidores de acetilcolinesterasa.
Interfiere con la secuencia del impulso nervioso.
• Diisopropylphosphofluoridate, tabun y sarin
(nerve gases)
• Parathion and malathion
6.5 Enzimas reguladoras
Modificación alostérica
Enlace de un efector positivo o negativo.
Enzimas alostéricas
Sufren cambios conformacionales en
respuesta a enlace de efectores o
moduladores.
Ejemplos:
• inhibidores
• activadores
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16. Regulación actividad
enzimática
Mecanismos de retroalimentación
Una enzima actúa sobre un paso
determinado.
Modificación covalente
Formación o rompimiento de un
enlace covalente.
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