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David L. Nelson and Michael M. Cox
                                                                                   6.1 Introducción a
        Lehninger Principles of
            Biochemistry                                                           las enzimas
                    Fifth Edition


                 Capítulo 6:
                  Enzimas


                             Copyright © 2004 by W. H. Freeman & Company




        INTRODUCCION                                                       INTRODUCCION
                                                                              Historia:
   Historia:                                                                   1897: Buchner descubrió que los
     1700: estudios de la digestión de carnes                                   extractos de levadura podían convertir
      mediante secreciones del estómago.                                         el azúcar en alcohol. Fermentación se
     1800: convertir almidón en azúcar mediante                                 llevaba a cabo por la presencia de
      la saliva.                                                                 moléculas.
     1810: comienzan estudios sobre                                            Kühne llamó las moléculas enzimas.
      fermentación.                                                             1926: ureasa fue aislada y
     1850: Louis Pasteur concluyó estudios sobre                                cristalizada.
      fermentación de azúcares en alcoholes por                                 1930: pepsina, tripsina, y otras
      levadura y catalizado por fermentos.                                       enzimas digestivas fueron
                                                                                 cristalizadas.




                                                                                                                          1
Propiedades generales

                                                                    Las enzimas son los agentes catalíticos
                                                                     de los sistemas biológicos.
                                                                    Todas las enzimas son proteínas
                                                                     excepto las riboenzimas.
                                                                    Funcionan bajo condiciones moderadas.
                                                                    Aumentan la velocidad de una reacción
                                                                     hasta por un factor de 1014 .
                                                                    Son altamente específicas.
                                                                    La acción enzimática es regulada.




                                                                 Ejemplos de metales usados
                                                                 como cofactores
                         ENZYMES
                       (holoenzyme)


   Apoenzyme             Chemical component
(amino acid portion)   (non-amino acid portion)


                              Cofactor


              metals         coenzymes        prosthetic group




                                                                                                               2
Nomenclatura




Nomenclatura

   De acuerdo al número de la Comisión
    Enzimática (Enzyme Commission number)
       Primer #: tipo de reacción catalizada.
       Segundo #: indica la subclase; dice el tipo
        de sustrato o el enlace que se rompe en
        forma mas precisa.
       Tercer #: indica la sub-subclase; nos dice el
        tipo de aceptador de electrones
        (oxidoreductasas) o el tipo de grupo que se
        remueve (liasas), etc.
       Cuarto #: indica el número de serie de la
        enzima en su sub-subclase.




                                                                       3
ESPECIFICIDAD
                    ENZIMATICA
6.2 Como trabajan    La especificidad enzimática puede
las enzimas           variar.
                     Pasos que ocurren durante la acción
                      enzimática:
                         Sustrato se enlaza a la enzima.
                         Ocurren alteraciones químicas que
                          incluyen rompimiento y formación de
                          enlaces.
                         La enzima libera el producto de la
                          reacción.




                                                                4
Teorías que explican la
actividad enzimática:
   Llave y cerradura: específica; un sustrato y
    una enzima.



   Adaptación inducida: menos específica, el
    centro activo se ajusta al sustrato que
    interviene.




                                                   5
Mecanismos de acción                                  Mecanismos de acción

   Estado de transición: forma activa de una      Energía de activación: cantidad de energía
    molécula en la cual la molécula realiza una     necesaria para convertir todas las
    reacción química parcial.                       moléculas de un mol de sustancia
   Energía libre: componente de la energía         reaccionando de su estado raso a su
    total de un sistema que puede realizar          estado de transición.
    trabajo a temperatura y presión constante.
                                                   Las enzimas aumentan la velocidad de la
        G reacción = G productos – G reactivos
                                                    reacción disminuyendo la energía de
       Reacción exergónica: ΔG es negativo         activación, pero no afectan los aspectos
        G= H-T S                                   termodinámicos de las reacciones.




                                                                                                 6
6.3 Cinética química




Cinética química

   Reacciones elementales
     AP
     A  I1  I2  P

   Ordenes de reacción
       Constante de rapidez




                                                      7
La ecuación describe el         Cinética de enzimas
progreso de una reacción
como función del tiempo. La
pendiente nos da la constante
de velocidad.




                                Ecuación Michaelis-Menten

                                   Paso #1




                                                            8
Ecuación Michaelis-Menten   Ecuación Michaelis-Menten

   Paso #2                    Paso #3




Ecuación Michaelis-Menten

   Paso #4




                                                        9
Significado Km y Vmax                            Turnover number
   KM es igual a la concentración de sustrato    Constante catalítica equivale al
    cuando 50% de los centros activos de la
    enzima están ocupados. También                 “turnover number”
    representa cuán fuerte la enzima se enlaza
    al sustrato.                                  La razón de kcat/Km representa una
   VMAX está relacionado con el turnover          medida de la eficiencia catalítica.
    number: número de moles de sustrato
    transformado en producto por mol de
    enzima por segundo.
       Mayor el “turnover number” mayor la
        eficiencia.
       Equivale a: Vmax/[Et]




                                                                                         10
Gráfica Lineweaver-Burk




                                          Mecanismos para reacciones
Reacciones de dos sustratos
                                          con más de un sustrato
   Reacciones secuenciales: reacciones      Al azar: no importa el orden de añadir
    de desplazamiento sencillo                un sustrato.
     Ordenado
     Al azar                                Ordenado: el orden en que se añaden
                                              los sustratos está definido.
   Reacciones Ping-pong: reacciones de
    desplazamiento doble
                                             Ping-pong: desplazamiento doble, no
                                              hay formación de compuesto ternario.




                                                                                       11
Tipos de inhibición

                            Inhibidores reversibles
                               • Competitivo: Compite con el sustrato por
                                 el centro activo. Se parecen al sustrato.
                               • No competitivo: el inhibidor no compite
                                 con el sustrato. Inhibidor tiene un punto
                                 diferente de enlace. Puede enlazar la E o
                                 el complejo ES.
                               • De incompetencia: el inhibidor se enlaza
                                 directamente al complejo enzima-sustrato
                                 y no a la enzima libre.




Inhibidor competitivo   Inhibidor competitivo




                                                                             12
Inhibidor no-competitivo
                     Aumenta el
                     Km y el Vmax
                     permanece
                     constante.




Inhibidor no-competitivo

                                                        Disminuye Vmax
                                                        y Km permanece
                                                        constante




                                                                         13
Disminuye Km y
Vmax




 Disminuye Vmax y
 Km puede
 aumentar o
 disminuir




                    14
Actividad enzimática depende
Tipos de inhibición
                                                               del pH
   Inhibidores irreversibles
       Se combina con o destruye un grupo
        funcional necesario para la actividad
        enzimática. Se forma un enlace covalente.
         • Ejemplo: Inhibidores de acetilcolinesterasa.
           Interfiere con la secuencia del impulso nervioso.
             • Diisopropylphosphofluoridate, tabun y sarin
               (nerve gases)
             • Parathion and malathion




6.5 Enzimas reguladoras

   Modificación alostérica
       Enlace de un efector positivo o negativo.
   Enzimas alostéricas
       Sufren cambios conformacionales en
        respuesta a enlace de efectores o
        moduladores.
       Ejemplos:
         • inhibidores
         • activadores




                                                                                              15
Regulación actividad
enzimática
   Mecanismos de retroalimentación
       Una enzima actúa sobre un paso
        determinado.
   Modificación covalente
       Formación o rompimiento de un
        enlace covalente.




                                         16
Regulación mediante
rompimiento proteolítico




                           17

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Cap%206%20 enzimas%202010

  • 1. David L. Nelson and Michael M. Cox 6.1 Introducción a Lehninger Principles of Biochemistry las enzimas Fifth Edition Capítulo 6: Enzimas Copyright © 2004 by W. H. Freeman & Company INTRODUCCION INTRODUCCION  Historia:  Historia:  1897: Buchner descubrió que los  1700: estudios de la digestión de carnes extractos de levadura podían convertir mediante secreciones del estómago. el azúcar en alcohol. Fermentación se  1800: convertir almidón en azúcar mediante llevaba a cabo por la presencia de la saliva. moléculas.  1810: comienzan estudios sobre  Kühne llamó las moléculas enzimas. fermentación.  1926: ureasa fue aislada y  1850: Louis Pasteur concluyó estudios sobre cristalizada. fermentación de azúcares en alcoholes por  1930: pepsina, tripsina, y otras levadura y catalizado por fermentos. enzimas digestivas fueron cristalizadas. 1
  • 2. Propiedades generales  Las enzimas son los agentes catalíticos de los sistemas biológicos.  Todas las enzimas son proteínas excepto las riboenzimas.  Funcionan bajo condiciones moderadas.  Aumentan la velocidad de una reacción hasta por un factor de 1014 .  Son altamente específicas.  La acción enzimática es regulada. Ejemplos de metales usados como cofactores ENZYMES (holoenzyme) Apoenzyme Chemical component (amino acid portion) (non-amino acid portion) Cofactor metals coenzymes prosthetic group 2
  • 3. Nomenclatura Nomenclatura  De acuerdo al número de la Comisión Enzimática (Enzyme Commission number)  Primer #: tipo de reacción catalizada.  Segundo #: indica la subclase; dice el tipo de sustrato o el enlace que se rompe en forma mas precisa.  Tercer #: indica la sub-subclase; nos dice el tipo de aceptador de electrones (oxidoreductasas) o el tipo de grupo que se remueve (liasas), etc.  Cuarto #: indica el número de serie de la enzima en su sub-subclase. 3
  • 4. ESPECIFICIDAD ENZIMATICA 6.2 Como trabajan  La especificidad enzimática puede las enzimas variar.  Pasos que ocurren durante la acción enzimática:  Sustrato se enlaza a la enzima.  Ocurren alteraciones químicas que incluyen rompimiento y formación de enlaces.  La enzima libera el producto de la reacción. 4
  • 5. Teorías que explican la actividad enzimática:  Llave y cerradura: específica; un sustrato y una enzima.  Adaptación inducida: menos específica, el centro activo se ajusta al sustrato que interviene. 5
  • 6. Mecanismos de acción Mecanismos de acción  Estado de transición: forma activa de una  Energía de activación: cantidad de energía molécula en la cual la molécula realiza una necesaria para convertir todas las reacción química parcial. moléculas de un mol de sustancia  Energía libre: componente de la energía reaccionando de su estado raso a su total de un sistema que puede realizar estado de transición. trabajo a temperatura y presión constante.  Las enzimas aumentan la velocidad de la  G reacción = G productos – G reactivos reacción disminuyendo la energía de  Reacción exergónica: ΔG es negativo activación, pero no afectan los aspectos  G= H-T S termodinámicos de las reacciones. 6
  • 7. 6.3 Cinética química Cinética química  Reacciones elementales  AP  A  I1  I2  P  Ordenes de reacción  Constante de rapidez 7
  • 8. La ecuación describe el Cinética de enzimas progreso de una reacción como función del tiempo. La pendiente nos da la constante de velocidad. Ecuación Michaelis-Menten  Paso #1 8
  • 9. Ecuación Michaelis-Menten Ecuación Michaelis-Menten  Paso #2  Paso #3 Ecuación Michaelis-Menten  Paso #4 9
  • 10. Significado Km y Vmax Turnover number  KM es igual a la concentración de sustrato  Constante catalítica equivale al cuando 50% de los centros activos de la enzima están ocupados. También “turnover number” representa cuán fuerte la enzima se enlaza al sustrato.  La razón de kcat/Km representa una  VMAX está relacionado con el turnover medida de la eficiencia catalítica. number: número de moles de sustrato transformado en producto por mol de enzima por segundo.  Mayor el “turnover number” mayor la eficiencia.  Equivale a: Vmax/[Et] 10
  • 11. Gráfica Lineweaver-Burk Mecanismos para reacciones Reacciones de dos sustratos con más de un sustrato  Reacciones secuenciales: reacciones  Al azar: no importa el orden de añadir de desplazamiento sencillo un sustrato.  Ordenado  Al azar  Ordenado: el orden en que se añaden los sustratos está definido.  Reacciones Ping-pong: reacciones de desplazamiento doble  Ping-pong: desplazamiento doble, no hay formación de compuesto ternario. 11
  • 12. Tipos de inhibición  Inhibidores reversibles • Competitivo: Compite con el sustrato por el centro activo. Se parecen al sustrato. • No competitivo: el inhibidor no compite con el sustrato. Inhibidor tiene un punto diferente de enlace. Puede enlazar la E o el complejo ES. • De incompetencia: el inhibidor se enlaza directamente al complejo enzima-sustrato y no a la enzima libre. Inhibidor competitivo Inhibidor competitivo 12
  • 13. Inhibidor no-competitivo Aumenta el Km y el Vmax permanece constante. Inhibidor no-competitivo Disminuye Vmax y Km permanece constante 13
  • 14. Disminuye Km y Vmax Disminuye Vmax y Km puede aumentar o disminuir 14
  • 15. Actividad enzimática depende Tipos de inhibición del pH  Inhibidores irreversibles  Se combina con o destruye un grupo funcional necesario para la actividad enzimática. Se forma un enlace covalente. • Ejemplo: Inhibidores de acetilcolinesterasa. Interfiere con la secuencia del impulso nervioso. • Diisopropylphosphofluoridate, tabun y sarin (nerve gases) • Parathion and malathion 6.5 Enzimas reguladoras  Modificación alostérica  Enlace de un efector positivo o negativo.  Enzimas alostéricas  Sufren cambios conformacionales en respuesta a enlace de efectores o moduladores.  Ejemplos: • inhibidores • activadores 15
  • 16. Regulación actividad enzimática  Mecanismos de retroalimentación  Una enzima actúa sobre un paso determinado.  Modificación covalente  Formación o rompimiento de un enlace covalente. 16