7. Objetivos Clasificar a los organismos basándose en su similitud, generalmente en su morfología, o en cualidades observables, sin tomar en cuenta su filogenia o relación evolutiva. Clasificar a estos organismos en una tabla numérica facilitando el conteo de sus similitudes. aproximación razonable de la filogenia cuando los métodos cladísticos son computacionalmente demasiado complejos.
8. MARCO TEÓRICO En biología sistemática la fenética, también conocida como taxonomía numérica, es una técnica cuya finalidad es la clasificación de los organismos basándose en su similitud, generalmente en su morfología, o en cualidades observables, sin tomar en cuenta su filogenia o relación evolutiva. La fenética ha sido ampliamente sustituida por la cladística. Sin embargo, algunos biólogos continúan utilizando métodos fenéticos, como una aproximación razonable de la filogenia cuando los métodos cladísticos son computacionalmente demasiado complejos.
9. Marco teórico ¿EN QUE SE BASA LA FENÉTICA? Se basa en la clasificación politética del fenotipo de modo que todos los caracteres tomados se consideran de igual valor y se estudia cualitativamente en cuanto sus variables de presión, o en cuanto su ausencia o presencia. Las distintas taxonomías nos sirven para establecer modelos de clasificación por diferentes técnicas numéricas. Las unidades a clasificar se denominan unidades taxonómicas operativas. La elección de los caracteres es subjetiva recomendándose el mayor número posible de caracteres.
10. MARCO TEÓRICO Grupo politético es un grupo donde sus miembros comparten un gran número de atributos, pero ninguno de esos atributos es compartido por todos los miembros con la excepción del atributo de pertenecer a ese grupo. El fenotipo es una característica observable, identificable e individualizada del organismo, que expresa un genotipo(3) específico en un ambiente determinado. El genotipo es la constitución genética de un organismo, representada por todos los genes que posee como miembro de una especie
11. MARCO TEÓRICO - ¿QUE ES UPGMA? El UPGMA es el método de reconstrucción filogenética más sencillo de todos, fue inventado inicialmente para construir fenogramas taxonómicos, es decir, árboles que reflejaran las similitudes fenotípicas entre los OTUs (Sokal and Michener, 1958). Sin embargo puede ser utilizado para construir árboles filogenéticos si las tasas de evolución entre las secuencias son aproximadamente constantes entre linajes, de tal forma que existe una relación aproximada entre la distancia evolutiva y el tiempo de divergencia.
12. MARCO TEÒRICO – PREPARAR UNA MATRIZ Se parte de una matriz de distancias entre OTUs Primero se identifican los dos OTUs más similares entre si.
13. Supongamos que dAB tienen el menor valor. Entonces, los OTUs A y B se agrupan y se coloca un punto de ramificación a una dAB /2 sistituciones : MARCO TEÒRICO – PREPARAR UNA MATRIZ A B dAB /2
14. MARCO TEÒRICO – PREPARAR UNA MATRIZ Después del agrupamiento, A y B se tratan como un solo OTU compuesto y se computan las distancias nuevamente
15. En esta matriz: d(AB)C = ( dAC + dBC)/2 d(AB)D = ( dAD + dBD)/2 Si d(AB)C resulta ser la distancia mayor, entonces el OTU C se une al OTU compuesto (AB) y se coloca un nodo en d(AB)C /2. MARCO TEÒRICO – PREPARAR UNA MATRIZ A B C d(AB)C /2
16. El último paso consiste en agrupar el último OTU, D, al OTU compuesto (ABC). La raíz del árbol entero se coloca en: d(ABC)D /2 = [(dAD+ dBD + dCD)/ 3]/ 2 MARCO TEÒRICO – PREPARAR UNA MATRIZ A B C D d(ABC)D /2
17. MARCO TEÒRICO – PREPARAR UNA MATRIZ En general, la distancia entre dos grupos de OTUs X y Y es: dXY = dij/ (nXnY) i,j Donde la sumatoria es sobre cada i en el grupo X y cada j en el grupo Y ynX ynY son los números de OTUs en X y Y respectivamente.
23. Conclusiones La sistemática fenética es la clasificación de los organismos basándose en su similitud, generalmente en su morfología. Agrupa a los organismos estrictamente por el número de caracteres que tienen en común y los cuantifica en índices de similitud o de distancia.