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Sanidad 
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Búsqueda Multimedia sobre Historias Clínicas 
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¿Qué hemos hecho? 
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Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes 
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Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes 
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Arquitectura Solución 
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Análisis...
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Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes 
Conclusiones 
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Tecnologías semánticas en sanidad

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Daedalus desarrolla tecnología para extraer significado de contenidos no estructurados. En el sector de e-Salud (e-Sanidad), la tecnología semántica permite explotar automáticamente la información de la Historia Clínica Electrónica (HCE).
Esta presentación cubre la experiencia de Daedalus en:

• Monitorización de contenidos online sobre salud
• Enriquecimiento semántico (etiquetado) de historia clínica
• Anonimización de historias clínicas
• Búsqueda multimedia en historias clínicas
• Detección de interacciones entre medicamentos
• Analítica de texto y de datos en el sector de salud

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Tecnologías semánticas en sanidad

  1. 1. Presentación Daedalus Tecnología Semántica de Daedalus en el sector de la Sanidad Madrid, 2014
  2. 2. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad DAEDALUS en Sanidad Daedalus desarrolla tecnología para extraer el significado y estructurar todo tipo de contenido multimedia. Nuestros clientes pueden así rentabilizar sus contenidos automatizando sus procesos. 2
  3. 3. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad DAEDALUS en Sanidad Operaciones • ¿Cuántos datos estructurados se procesan de la Historia Clínica Electrónica? ¿Y con los no estructurados, qué se hace? • Aplicaciones: • Soporte a la codificación ICD9/10, SNOMED CT, CIMA, … • Sistemas de ayuda a operadores humanos: procesos de codificación (p.ej.: diagnósticos en partes de alta en urgencias) No Estructurados Estructurados 3
  4. 4. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad DAEDALUS en Sanidad Monitorización ! En EEUU 4 75% Internet Información sobre salud Redes Sociales Información sobre salud 42%
  5. 5. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad DAEDALUS en Sanidad Monitorización ! En España 5
  6. 6. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad DAEDALUS en Sanidad Monitorización ! ¿Qué monitorizar? 6 Fármacos Enfermedades Reacciones a medicamentos
  7. 7. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad DAEDALUS en Sanidad Monitorización ! ¿A quién interesa? 7 Farmacéuticas Centros de Salud (hospitales, clínicas privadas) Administradores de blogs, foros, …
  8. 8. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad PROYECTOS Y EXPERIENCIAS
  9. 9. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad HEALTH DASHBOARD
  10. 10. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Health Dashboard 10
  11. 11. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad AUTOMATIZACIÓN DE PROCESOS SOBRE HISTORIAS CLÍNICAS
  12. 12. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad ! Objetivo: Interoperabilidad semántica ! Elementos: • Vocabularios: UMLS " SNOMED CT, ICD-9, ICD-10, CIE-9, CIE-10, LOINC • Arquetipos: modelos clínicos reutilizables, openEHR • Plantillas: vistas sobre los arquetipos, HL7 • Modelos de Referencia: especificación para la definición de arquetipo, ISO13606 ! El tratamiento lingüístico automático ayuda a estructurar la Historia Clínica: • Etiquetado automático según vocabularios • Relación de informes clínicos con plantillas • Tratamiento multiligüe basado en tecnología Daedalus 12 Automatización de procesos sobre HC
  13. 13. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Caso de uso: clasificación automática de informes médicos ! Ejemplo de aplicación: asignar automáticamente códigos ICD a informes radiológicos. • ICD (International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems), estándar de la Organización Mundial de la Salud ! Objetivo: • Análisis de la justificación de pruebas médicas para empresas aseguradoras ! Datos del caso: • Datos de informes de urología de pacientes • Periodo de 1 año • 978 documentos y 45 etiquetas ICD-9-CM con 94 combinaciones • Proporcionado por el Departamento de Radiología del Hospital para Niños de Cincinnati 13 Automatización de procesos sobre HC
  14. 14. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad ANONIMIZACIÓN DE HISTORIAS CLÍNICAS
  15. 15. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad ! Objetivo: Facilitar el análisis y explotación de la información contenida en las Historias Clínicas. ! Tecnología de procesamiento lingüístico para detección de nombres de personas, direcciones, teléfonos con el fin de ocultar la identidad de los pacientes en transacciones médicas. 15 Anonimización de Historias Clínicas
  16. 16. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad BÚSQUEDA MULTIMEDIA SOBRE HISTORIAS CLÍNICAS
  17. 17. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Búsqueda Multimedia sobre Historias Clínicas Búsqueda de información por voz ! Acceso a la información mediante voz: • Reconocimiento de voz aplicado a sistemas de búsqueda de datos en historiales y documentación médica en general. 17 Transcripción Archivo Búsqueda
  18. 18. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Búsqueda sobre contenidos en audio o vídeo ! Ejemplo de aplicación: ! DALI, Digital Audio Library Indexing 18 Búsqueda Multimedia sobre Historias Clínicas
  19. 19. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Búsqueda en Historias Clínicas a partir de texto ! Localización de información: • Ofrece alternativas de búsqueda en situaciones en las que no se obtienen resultados. • Construcción de posibles alternativas que corrijan errores ortográficos comunes, calculando la similitud entre los términos de búsqueda y los términos de indización y ofreciendo posibilidades de selección al usuario (del tipo “usted quiso decir…”) • Búsqueda semántica mediante ontologías de dominio como SNOMED. 19 Búsqueda Multimedia sobre Historias Clínicas
  20. 20. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Caso de uso: Búsqueda sobre historias e imágenes médicas ! Búsquedas sobre una colección de casos médicos compuestos por: • imágenes (50.000 aprox.) • descripciones textuales de los casos (en inglés y francés) ! Para buscar se emplean sólo imágenes (radiografías, escáneres …) y, en ocasiones, texto ! Contexto del trabajo: experimentos en el foro europeo CLEF (Cross Language Evaluation Forum) de búsqueda de información 20 Búsqueda Multimedia sobre Historias Clínicas
  21. 21. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Caso de uso: Búsqueda sobre historias e imágenes médicas ! Experimentos en ImageCLEFMed (foro europeo CLEF) 21 Búsqueda Multimedia sobre Historias Clínicas
  22. 22. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Búsqueda Multimedia sobre Historias Clínicas Caso de uso: Búsqueda sobre historias e imágenes médicas 22 ! Ejemplos de búsqueda multilingüe de información en experimentos ImageCLEFMed (foro europeo CLEF)
  23. 23. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad EXPERIENCIA PILOTO SOBRE ETIQUETADO DE INFORMES
  24. 24. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes ¿Qué hemos hecho? ! Obtener recursos necesarios en el formato adecuado para la infraestructura de Textalytics. Basado en UMLS. ! Construir un etiquetador, capaz de analizar el texto de entrada, extraer sintagmas nominales y obtener el código que les corresponde atendiendo a su similitud con las entradas de los recursos. ! A partir de los informes reales proporcionados por un Hospital, se han transcrito combinando técnicas OCR con proceso manual, se ha tomado nota de los códigos y éstos se han empleado para evaluar el prototipo de etiquetador que se muestra a continuación. 24
  25. 25. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes Recursos lingüísticos UMLS Dicc. ICD9 ES • Términos en español • Combinación de SNOMED Inglés – ICD9 inglés y SNOMED español • Explotación de relaciones semánticas (same_as) referidas a conceptos 25
  26. 26. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes Recursos lingüísticos ! Filtrado de UMLS para obtener términos en español y el código ICD9 que les corresponde. ! Filtrado del thesauro resultante, formado por más de 45.000 términos. ! De esos términos y expresiones, muchos son palabras comunes, polisémicas, que conducen a un sobre-etiquetado. Se filtran apoyándose en los diccionarios de K-Site Core, quedando en alrededor de 25.000 términos. ! Se emplean datos de frecuencia de aparición de palabras en el thesauro para filtrar palabras con escaso contenido semántico. ! Se prevé incluir un diccionario adicional con acrónimos y abreviaturas en el dominio médico. 26
  27. 27. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Arquitectura prototipo STILUS Fuzzy Dicc. ICD9 ES STILUS Core Preproceso Texto Entrada Resultado 27 Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes
  28. 28. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Arquitectura solución STILUS Fuzzy Dicc. ICD9 ES STILUS Core Preproceso Resultado Texto Entrada Reglas y Patrones 28 Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes
  29. 29. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Arquitectura Solución ! Algunos elementos: 1. Preprocesado: Análisis lingüístico del texto de entrada mediante Stilus Core para identificar sintagmas nominales. 2. Reglas Inferencia para identificar códigos ICD9 mediante caracterizaciones. Ej.: Si la frase contiene estructuras “número”+”unidad de medida”, al menos un medicamento y la palabra ‘tratamiento’ entonces le corresponde el código V58.69 29 Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes
  30. 30. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Experiencia piloto sobre Etiquetado de Informes Conclusiones Estudiar necesidades (¿posibilidad de acotar? ¿secciones del informe? ...) Aún queda camino por recorrer Obtener reglas según metodología de etiquetado Especificar la intervención manual Precisión inicial en entorno desatendido superior al 60% 30
  31. 31. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad QUIENES SOMOS
  32. 32. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad Quiénes Somos ! Desde 1998 ofrecemos soluciones, productos y servicios para la sociedad de la información ! Sociedad anónima de capital nacional privado ! Nuestra principal línea de actividad se centra en la extracción de significado a partir de contenidos multimedia con el objetivo de rentabilizar al máximo los contenidos gestionados por nuestros clientes. ! Clientes: grandes empresas en todos los sectores: medios, defensa, telecomunicación, energía, administración pública… ! Vocación: innovación, con participación activa en proyectos de I+D nacionales y europeos 32
  33. 33. Tecnología de Daedalus en el sector de la Sanidad DAEDALUS, S.A. Oficina Central: López de Hoyos 15 28006 Madrid Depto. Técnico: Edificio Vallausa II Albufera 321 28031 Madrid Tel: +34 913.32.43.01 info@daedalus.es http://www.daedalus.es 33

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