O Programa Formação pela Escola é um programa de formação continuada a distância para agentes e parceiros envolvidos na execução, monitoramento, avaliação e controle social de programas educacionais financiados pelo FNDE, visando fortalecer sua atuação. Os cursos abordam tópicos como aplicação correta de recursos, ações do FNDE e participação cidadã, sendo oferecidos online e em mídias como PDF e vídeo.