1. CURSO: BIOTECNOLOGIA
DOCENTE:
DR. HEBERT HERNAN SOTO GONZALES
ESTUDIANTE:
ANCO MARTINEZ, SALMA GABRIELA
SIMULACIÓN DE
ELECTROFORESIS EN GEL DE
AGAROSA UTILIZANDO EL
SOFTWARE SNAPGENE
INFORME DE PRACTICA
ILO - PERU

2. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
INFORME DE PRÁCTICA:
SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA UTILIZANDO EL
PROGRAMA SNAP GENE EN BASE AL ARTÍCULO : Aislamiento de bacterias con
potencial biorremediador y análisis de comunidades bacterianas de zona impactada por
derrame de petróleo en Condorcanqui - Amazonas - Perú
CURSO:
BIOTECNOLOGÍA
ESTUDIANTE:
Anco Martínez, Salma Gabriela
DOCENTE:
Dr. Hebert Hernan Soto Gonzales
02 DE JUNIO DEL 2023
ILO- MOQUEGUA

3. ÍNDICE
1) INTRODUCCIÓN............................................................................................................... 3
2) OBJETIVOS.........................................................................................................................4
2.1 Objetivo General............................................................................................................ 4
2.2 Objetivos Específicos.....................................................................................................4
3) MARCO TEÓRICO............................................................................................................ 4
3.1 Software Snapgene.........................................................................................................4
3.2 Electroforesis..................................................................................................................5
3.3 Agarosa...........................................................................................................................5
3.4 ADN............................................................................................................................... 5
4) METODOLOGÍA................................................................................................................ 6
4.1 Materiales.......................................................................................................................6
4.2 Procedimiento.................................................................................................................6
5) RESULTADOS................................................................................................................... 10
5) CONCLUSIONES..............................................................................................................11
6) REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS.............................................................................11

4. 1) INTRODUCCIÓN
Con el paso del tiempo el avance científico y tecnológico van incrementando nuevas
metodologías para tratar la manipulación genética de los seres vivos, una de ellas presentes
en el mundo de la ciencia es el estudio de las moléculas de ADN con la finalidad de aislar
algunos de estos con una visión de realizar diferentes actividades como clonación de genes,
crear otras especies, mejorar la naturaleza de las especies, etc.
A través de estas tecnologías también se crearon sistemas tecnológicos como el
software SnapGene proporcionando una forma sencilla, segura de planificar, visualizar y
documentar los procedimientos diarios de biología molecular que admite el intercambio de
documentos y datos. SnapGene proporciona la forma sencilla de planificar, visualizar y
registrar sus procedimientos diarios de biología molecular. Es por eso que los científicos de
las principales instituciones y empresas del mundo confían en la eficiencia de tratamiento de
secuenciación de ADN en SnapGene.
La electroforesis como término en sí, se usa para poder describir la migración de una
partícula cargada bajo o la influencia de un campo eléctrico. Diversas moléculas importantes
(aminoácidos, péptidos, proteínas, nucleótidos, ácidos nucleicos) poseen grupos ionizables y
existen en solución como especies, que pueden ser aniones o cationes.

5. 2) OBJETIVOS
2.1 Objetivo General
Realizar una simulación de electroforesis en el gel agarosa utilizando el software Snap Gene
teniendo como base de datos el artículo “Aislamiento de bacterias con potencial biorremediador
y análisis de comunidades bacterianas de zona impactada por derrame de petróleo en
Condorcanqui - Amazonas - Perú
2.2 Objetivos Específicos
- Analizar las secuencias de 13 bandas de nucleótidos de los datos del artículo,
empleando la búsqueda eficaz en la página web NCBI para su obtención.
- Comprender el procedimiento sobre el software Snap Gene aplicando los
conocimientos adquiridos para generar la simulación de electroforesis en el gel de agarosa.
3) MARCO TEÓRICO
3.1 Software Snapgene
El software SnapGene permite de forma sencilla, segura de planificar, visualizar y
documentar los procedimientos cotidianos de biología molecular. Con una interfaz intuitiva,
el software permite la visualización de secuencias de ADN, la anotación de secuencias, la
edición de secuencias, la clonación, la visualización de proteínas y la simulación de métodos
de clonación comunes.
Este software es usado principalmente como complemento de los trabajos de
laboratorios y reconoce una gran cantidad de formatos de archivos y todos se pueden
compartir distintos mapas o secuencias generadas.

6. 3.2 Electroforesis
Es una técnica utilizada para separar fragmentos de ADN por su tamaño y carga. La
electroforesis consiste en aplicar una corriente a través de un gel que contiene las moléculas
de interés. Con base en su tamaño y carga, las moléculas se desplazan por el gel en diferentes
direcciones o a distintas velocidades, con lo que se separan unas de otras.
3.3 Agarosa
La agarosa es un producto natural que forma una matriz inerte y no tóxica que supone
una herramienta indispensable en gran cantidad de técnicas de biología molecular,
bioquímica y biología celular. Su uso más extendido es para construir geles que permitan
separar moléculas de ADN mediante electroforesis, además de ser utilizada para fijar
moléculas a su estructura como anticuerpos, antígenos y enzimas. Igualmente se utiliza para
el cultivo celular y en microbiología. Otros usos menos extendidos son la utilización de estos
geles como matrices en la reparación de tejidos dañados.
3.4 ADN
El ácido desoxirribonucleico (ADN) es la molécula que transporta información
genética para el desarrollo y funcionamiento de un organismo. Compuesto por dos cadenas
complementarias que se enrollan entre sí y parecen una escalera de caracol; esa forma se
conoce como doble hélice. Cada hebra tiene una estructura principal compuesta por grupos
alternados de azúcar (desoxirribosa) y fosfato. Unida a cada azúcar hay una de cuatro bases:
adenina (A), citosina (C), guanina (G) o timina (T). Las dos hebras se conectan por enlaces
químicos entre las bases: enlaces de adenina con timina y enlaces de citosina con guanina. La
secuencia de las bases a lo largo de la estructura principal del ADN codifica información
biológica, por ejemplo, las instrucciones para producir una proteína o molécula de ARN.

7. 4) METODOLOGÍA
4.1 Materiales
● Programa de SnapGene
● Página web NCBI
● Laptop
● Internet
4.2 Procedimiento
a) Primero se debe de ingresar a la página Web (NCBI) para lograr colocar el primer
código para descargar las secuencias a estudiar del artículo.
b) Luego repetimos el mismo paso en la página web NCBI para descargar todos los
datos que hay en la tabla del artículo.

8. c) Posterior a ello, abrimos las descripciones de la cepa que se va a utilizar y
descargamos su composición en formato FASTA para proceder a importar los
archivos al Software SnapGene.
d) Guardamos todos los 13 códigos mencionados con su respectivo nombre y en una
carpeta con el nombre “SECUENCIAS”.

9. e) Después se abre el software SnapGene para cargar el archivo descargado, para ello
se debe de presionar “OpenFiles” y aceptar.
f) Nos aparecerá la secuencia de ADN del primer dato cargado.
g) Una vez obtenida la secuencia, se realiza la simulación del gel de agarosa así que
se debe seleccionar en la barra de herramientas la opción “Tools” posterior a ello presionar en
“Simulate agarose Gel”.

10. h) Luego de seleccionar la simulación del gel de agarosa, nos aparece una nueva
ventana donde se aprecia en rango PCR. Realizamos el mismo procedimiento en orden de los
trece archivos descargados.

11. 5) RESULTADOS
Obtención de la simulación de gel de agarosa en los 13 códigos en archivos.
5) CONCLUSIONES
De los resultados se puede concluir que se logró finalizar con eficiencia la práctica de
simulación de electroforesis en gel de agarosa usando como recurso el programa de
SnapGene por el sistema sencillo con el que cuenta y gracias a los conocimientos adquiridos
por la explicación del docente encargado.
Por otro lado en el aspecto de marco conceptual se pudo comprender mediante la
práctica con un artículo científico que este tipo de técnica es precisa y favorece bastante el
campo científico así como las prácticas de laboratorio dentro del proceso meticuloso de
separación del ADN en fragmentos.

12. 6) REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Castillo Rogel, R. T., More Calero, F. J., Cornejo La Torre, M., Fernández Ponce, J.
N., & Mialhe Matonnier, E. L. (2020). Aislamiento de bacterias con potencial biorremediador
y análisis de comunidades bacterianas de zona impactada por derrame de petróleo en
Condorcanqui-Amazonas-Perú. Revista de Investigaciones Altoandinas, 22(3), 215-225.
Fierro, F. F. (2014). Electroforesis de ADN. Herramientas moleculares aplicadas en
ecología: aspectos teóricos y prácticos, 27.
Watson, J. D. (2018). ADN. El secreto de la vida. Taurus.
Hess, E. J., Jinnah, H. A., Kozak, C. A., & Wilson, M. C. (1992). Spontaneous
locomotor hyperactivity in a mouse mutant with a deletion including the Snap gene on
chromosome 2. Journal of Neuroscience, 12(7), 2865-2874.