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Modelos Próbit

El modelo Próbit constituye una alternativa log-lineal para manejar conjuntos de datos
con variable dependiente categórica. Típicamente, este modelo se utiliza para analizar
datos del tipo dosis respuesta. Los datos obtenidos de un bioensayo no pueden ser
analizados con la metodología estadística tradicional que se usa en los ensayos de
campo sino que se debe utilizar lo que se llama estadística cuantal, la cual se caracteriza
por la respuesta a un estimulo de n unidades experimentales, donde r unidades
responden y n - r no lo hacen. El principal objetivo de este tipo de análisis es evaluar el
nivel de estimulo que es necesario para obtener una respuesta en un grupo de individuos
de la población. El nivel de estimulo que causa una respuesta en el 50% de los
individuos de una población bajo estudio es un importante parámetro de caracterización
denotado como DL50 por dosis letal media (o DE50 por dosis efectiva media, CL50 por
concentración letal media, CE50 por concentración efectiva media y Ltm por límite de
tolerancia media). El periodo de tiempo durante el cual se expone el estimulo debe ser
especificado, por ejemplo, 24 horas DL50, esto con el fin comparar y estimar la
potencia relativa del estimulo.

Variable respuesta: La variable respuesta Y, es binaria, y tiene distribución de
probabilidades binomial, por lo tanto la esperanza de la variable es la probabilidad de
suceso; E(Y)=P y su varianza V(Y)=P(1-P).

Ejemplo: Un insecticida que contiene rotenona como uno de sus componentes , es
rociado en una muestra de insectos. La tabla que a continuación se presenta, contiene las
concentraciones del insecticida (Dosis), el número de insectos en cada muestra (tamaño)
y el número de insectos muertos (casos). Se desea conocer la influencia del contenido
de rotenona para el control de insectos así mismo como su DL50:

                             Dosis (ppm) Tamaño Casos
                                10.2       50    44
                                 7.7       49    42
                                 5.1       46    24
                                 3.8       48    16
                                 2.6       50     6


Con el programa SPSS se procede de la siguiente forma:
Entrar al menú Analisis luego entrar a la opción regresión seleccionar la opción
Probit.
En el cuadro de dialogo análisis Probit en la opción:
*Frecuencia respuesta colocar la variable CASOS.
*En Total observado colocar la variable TAMAÑO.
*En covariables colocar la variable DOSIS.




*Habilitar en Modelo la opción Probit.
*En transformar colocar Log base 10.

En Opciones:
*Habilitar la opción Intervalos de confianza fiduciaria.
*En Nivel de significación para usar el factor de heterogeneidad colocar 0.05.
*Habilitar la opción Calcular a partir de los datos en la opción Tasa de respuesta
natural.
Los resultados muestran:


                                          Estimaciones de los parámetros

                                                                                       Intervalo de confianza al
                                                                                                  95%
                                                                                                         Límite
            Parámetro      Estimación   Error típico      Z            Sig.     Límite inferior         superior
  PROBIT(   DOSIS                4,213          ,929       4,535          ,000            2,392             6,034
  a)        Intersección        -2,887          ,878      -3,288          ,001           -3,766            -2,009
a Modelo PROBIT: PROBIT(p) = Intersección + BX (Las covariables X se transforman utilizando el
logaritmo en base 10,000.)

el modelo ajustado para esta aplicación es:

                                ф-1 (P)=-2.887 + 4.213*log DOSIS.


                             Contrastes de chi-cuadrado

                                         Chi-cuadrado        gl(a)         Sig.
 PROBIT     Contraste de la bondad
            de ajuste de Pearson                  1,729              2      ,421(b)

a Los estadísticos basados en casos individuales difieren de los estadísticos basados en casos
agregados.
b Como el nivel de significación es mayor que ,050, no se utiliza un factor de heterogeneidad en el
cálculo de los límites de confianza.
Se presenta la prueba de bondad de ajuste:
El contraste de la bondad de ajuste de Pearson (1.729) mediante las hipótesis:
Ho: El modelo esta bien ajustado. (P>0.05)
Hi: El ajuste del modelo no es bueno. (P<0.05).

P=0.421>0.05 permite concluir que no hay razones para dudar del modelo, es decir se
presenta un buen ajuste del modelo Probit.




                                                Límites de confianza

                        Límites de confianza al 95% para        Límites de confianza al 95% para
                                     DOSIS                               log(DOSIS)(a)
         Probabilida                 Límite        Límite                      Límite      Límite
         d             Estimación   inferior      superior    Estimación      inferior    superior
PROBIT   ,010               1,359        ,330         2,406         ,133          -,481         ,381
         ,020               1,577        ,429         2,674         ,198          -,368         ,427
         ,030              1,734        ,506          2,859            ,239      -,296         ,456
         ,040              1,861        ,573          3,007            ,270      -,242         ,478
         ,050              1,972        ,634          3,134            ,295      -,198         ,496
         ,060              2,072        ,691          3,246            ,316      -,161         ,511
         ,070              2,163        ,745          3,347            ,335      -,128         ,525
         ,080              2,248        ,797          3,441            ,352      -,099         ,537
         ,090              2,329        ,847          3,529            ,367      -,072         ,548
         ,100              2,405        ,896          3,612            ,381      -,048         ,558
         ,150              2,750       1,131          3,977            ,439       ,054         ,600
         ,200              3,059       1,361          4,296            ,486       ,134         ,633
         ,250              3,352       1,594          4,592            ,525       ,202         ,662
         ,300              3,638       1,836          4,877            ,561       ,264         ,688
         ,350              3,925       2,092          5,159            ,594       ,321         ,713
         ,400              4,219       2,367          5,446            ,625       ,374         ,736
         ,450              4,524       2,665          5,742            ,656       ,426         ,759
         ,500              4,845       2,993          6,054            ,685       ,476         ,782
         ,550              5,190       3,358          6,389            ,715       ,526         ,805
         ,600              5,565       3,768          6,759            ,745       ,576         ,830
         ,650              5,981       4,237          7,178            ,777       ,627         ,856
         ,700              6,454       4,780          7,670            ,810       ,679         ,885
         ,750              7,005       5,418          8,280            ,845       ,734         ,918
         ,800              7,675       6,179          9,089            ,885       ,791         ,959
         ,850              8,538       7,101         10,277            ,931       ,851        1,012
         ,900              9,761       8,258         12,285            ,990       ,917        1,089
,910               10,082    8,534   12,872      1,004     ,931        1,110
          ,920               10,443    8,833   13,560      1,019     ,946        1,132
          ,930               10,855    9,161   14,379      1,036     ,962        1,158
          ,940               11,333    9,527   15,374      1,054     ,979        1,187
          ,950               11,905    9,947   16,621      1,076     ,998        1,221
          ,960               12,614   10,446   18,247      1,101    1,019        1,261
          ,970               13,544   11,071   20,507      1,132    1,044        1,312
          ,980               14,887   11,930   24,011      1,173    1,077        1,380
          ,990               17,278   13,369   30,908      1,237    1,126        1,490
a Base del logaritmo = 10.



El DL50 corresponde a una dosis 4.845ppm, es decir que para alcanzar un 50% de
mortalidad en los insectos es necesario una dosis de 4.845ppm del insecticida que
contiene rotenona.

Aplicación:

La tabla contiene las dosis para las cepas de Bacillus thuringiensis probadas contra
larvas de S. frugiperda, el número de insectos en cada muestra (tamaño) y el número de
insectos muertos (casos). Se desea conocer la influencia del contenido de las cepas de
Bacillus thuringiensis para el control de S. frugiperda así mismo como su DL50:


                                Dosis (ppm) Tamaño Casos
                                   0,41       50     6
                                   0,58       48    16
                                   0,71       46    24
                                   0,89       49    42
                                   1,01       50    44
                                   1,31       48    54
                                   1,48       49    54
                                   1,61       50    59
                                   1,70       48    62

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Modelos probit

  • 1. Modelos Próbit El modelo Próbit constituye una alternativa log-lineal para manejar conjuntos de datos con variable dependiente categórica. Típicamente, este modelo se utiliza para analizar datos del tipo dosis respuesta. Los datos obtenidos de un bioensayo no pueden ser analizados con la metodología estadística tradicional que se usa en los ensayos de campo sino que se debe utilizar lo que se llama estadística cuantal, la cual se caracteriza por la respuesta a un estimulo de n unidades experimentales, donde r unidades responden y n - r no lo hacen. El principal objetivo de este tipo de análisis es evaluar el nivel de estimulo que es necesario para obtener una respuesta en un grupo de individuos de la población. El nivel de estimulo que causa una respuesta en el 50% de los individuos de una población bajo estudio es un importante parámetro de caracterización denotado como DL50 por dosis letal media (o DE50 por dosis efectiva media, CL50 por concentración letal media, CE50 por concentración efectiva media y Ltm por límite de tolerancia media). El periodo de tiempo durante el cual se expone el estimulo debe ser especificado, por ejemplo, 24 horas DL50, esto con el fin comparar y estimar la potencia relativa del estimulo. Variable respuesta: La variable respuesta Y, es binaria, y tiene distribución de probabilidades binomial, por lo tanto la esperanza de la variable es la probabilidad de suceso; E(Y)=P y su varianza V(Y)=P(1-P). Ejemplo: Un insecticida que contiene rotenona como uno de sus componentes , es rociado en una muestra de insectos. La tabla que a continuación se presenta, contiene las concentraciones del insecticida (Dosis), el número de insectos en cada muestra (tamaño) y el número de insectos muertos (casos). Se desea conocer la influencia del contenido de rotenona para el control de insectos así mismo como su DL50: Dosis (ppm) Tamaño Casos 10.2 50 44 7.7 49 42 5.1 46 24 3.8 48 16 2.6 50 6 Con el programa SPSS se procede de la siguiente forma: Entrar al menú Analisis luego entrar a la opción regresión seleccionar la opción Probit.
  • 2. En el cuadro de dialogo análisis Probit en la opción: *Frecuencia respuesta colocar la variable CASOS. *En Total observado colocar la variable TAMAÑO. *En covariables colocar la variable DOSIS. *Habilitar en Modelo la opción Probit. *En transformar colocar Log base 10. En Opciones: *Habilitar la opción Intervalos de confianza fiduciaria. *En Nivel de significación para usar el factor de heterogeneidad colocar 0.05. *Habilitar la opción Calcular a partir de los datos en la opción Tasa de respuesta natural.
  • 3. Los resultados muestran: Estimaciones de los parámetros Intervalo de confianza al 95% Límite Parámetro Estimación Error típico Z Sig. Límite inferior superior PROBIT( DOSIS 4,213 ,929 4,535 ,000 2,392 6,034 a) Intersección -2,887 ,878 -3,288 ,001 -3,766 -2,009 a Modelo PROBIT: PROBIT(p) = Intersección + BX (Las covariables X se transforman utilizando el logaritmo en base 10,000.) el modelo ajustado para esta aplicación es: ф-1 (P)=-2.887 + 4.213*log DOSIS. Contrastes de chi-cuadrado Chi-cuadrado gl(a) Sig. PROBIT Contraste de la bondad de ajuste de Pearson 1,729 2 ,421(b) a Los estadísticos basados en casos individuales difieren de los estadísticos basados en casos agregados. b Como el nivel de significación es mayor que ,050, no se utiliza un factor de heterogeneidad en el cálculo de los límites de confianza.
  • 4. Se presenta la prueba de bondad de ajuste: El contraste de la bondad de ajuste de Pearson (1.729) mediante las hipótesis: Ho: El modelo esta bien ajustado. (P>0.05) Hi: El ajuste del modelo no es bueno. (P<0.05). P=0.421>0.05 permite concluir que no hay razones para dudar del modelo, es decir se presenta un buen ajuste del modelo Probit. Límites de confianza Límites de confianza al 95% para Límites de confianza al 95% para DOSIS log(DOSIS)(a) Probabilida Límite Límite Límite Límite d Estimación inferior superior Estimación inferior superior PROBIT ,010 1,359 ,330 2,406 ,133 -,481 ,381 ,020 1,577 ,429 2,674 ,198 -,368 ,427 ,030 1,734 ,506 2,859 ,239 -,296 ,456 ,040 1,861 ,573 3,007 ,270 -,242 ,478 ,050 1,972 ,634 3,134 ,295 -,198 ,496 ,060 2,072 ,691 3,246 ,316 -,161 ,511 ,070 2,163 ,745 3,347 ,335 -,128 ,525 ,080 2,248 ,797 3,441 ,352 -,099 ,537 ,090 2,329 ,847 3,529 ,367 -,072 ,548 ,100 2,405 ,896 3,612 ,381 -,048 ,558 ,150 2,750 1,131 3,977 ,439 ,054 ,600 ,200 3,059 1,361 4,296 ,486 ,134 ,633 ,250 3,352 1,594 4,592 ,525 ,202 ,662 ,300 3,638 1,836 4,877 ,561 ,264 ,688 ,350 3,925 2,092 5,159 ,594 ,321 ,713 ,400 4,219 2,367 5,446 ,625 ,374 ,736 ,450 4,524 2,665 5,742 ,656 ,426 ,759 ,500 4,845 2,993 6,054 ,685 ,476 ,782 ,550 5,190 3,358 6,389 ,715 ,526 ,805 ,600 5,565 3,768 6,759 ,745 ,576 ,830 ,650 5,981 4,237 7,178 ,777 ,627 ,856 ,700 6,454 4,780 7,670 ,810 ,679 ,885 ,750 7,005 5,418 8,280 ,845 ,734 ,918 ,800 7,675 6,179 9,089 ,885 ,791 ,959 ,850 8,538 7,101 10,277 ,931 ,851 1,012 ,900 9,761 8,258 12,285 ,990 ,917 1,089
  • 5. ,910 10,082 8,534 12,872 1,004 ,931 1,110 ,920 10,443 8,833 13,560 1,019 ,946 1,132 ,930 10,855 9,161 14,379 1,036 ,962 1,158 ,940 11,333 9,527 15,374 1,054 ,979 1,187 ,950 11,905 9,947 16,621 1,076 ,998 1,221 ,960 12,614 10,446 18,247 1,101 1,019 1,261 ,970 13,544 11,071 20,507 1,132 1,044 1,312 ,980 14,887 11,930 24,011 1,173 1,077 1,380 ,990 17,278 13,369 30,908 1,237 1,126 1,490 a Base del logaritmo = 10. El DL50 corresponde a una dosis 4.845ppm, es decir que para alcanzar un 50% de mortalidad en los insectos es necesario una dosis de 4.845ppm del insecticida que contiene rotenona. Aplicación: La tabla contiene las dosis para las cepas de Bacillus thuringiensis probadas contra larvas de S. frugiperda, el número de insectos en cada muestra (tamaño) y el número de insectos muertos (casos). Se desea conocer la influencia del contenido de las cepas de Bacillus thuringiensis para el control de S. frugiperda así mismo como su DL50: Dosis (ppm) Tamaño Casos 0,41 50 6 0,58 48 16 0,71 46 24 0,89 49 42 1,01 50 44 1,31 48 54 1,48 49 54 1,61 50 59 1,70 48 62