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  1. 1. Antonio Campo Buetas TEMA 4. PROTEÍNAS Alimentos ricos en proteínas Coronavirus SARS-Cov-2 (con sus espículas glucoproteicas S) Causante de la Covid-19 Estructura terciaria de una Proteína Glucoproteína S del SARS-Cov-2
  2. 2. • Introducción a las proteínas. • Los aminoácidos. Propiedades • El enlace peptídico. • Estructura de las proteínas: primaria, secundaria (concepto de hélice α y lámina β), terciaria y cuaternaria. • Propiedades de las proteínas: solubilidad, especificidad, desnaturalización. • Funciones de las proteínas. Glicina (aminoácido) TEMA 4. PROTEÍNAS
  3. 3. • Son biomoléculas orgánicas compuestas al menos, por cuatro bioelementos: C, H, O y N; pero muchas de ellas contienen S, P y otros bioelementos (Fe, Zn, Cu, etc.) • Son polímeros de aminoácidos. Los aminoácidos se unen entre sí mediante enlaces peptídicos para dar lugar a péptidos. Según su tamaño molecular, pueden ser oligopéptidos, formados por no más de diez aminoácidos y polipéptidos, constituidas por más de diez aminoácidos. Cuando el número de aminoácidos supera los 50 o el peso molecular es mayor de 5000 se habla propiamente de proteínas. • Se clasifican en dos grandes grupos: holoproteínas, formadas exclusivamente por aminoácidos y heteroproteínas, si contienen además otros componentes no proteicos. • Las proteínas son las moléculas orgánicas más abundantes en los seres vivos, suponen el 50% del peso celular en seco. Además, son importantes por la multitud de funciones que realizan en los seres vivos. INTRODUCCIÓN A LAS PROTEÍNAS
  4. 4. • Como su nombre indica los aminoácidos son moléculas que poseen, al menos, un grupo amino (-NH2) y un grupo ácido carboxílico (-COOH) unidos a un átomo de carbono central, denominado carbono α, un hidrógeno (-H) y un grupo R (radical) o cadena lateral variable. • Prácticamente todas las proteínas están constituidas con sólo 20 aminoácidos distintos que, según sus grupos R (radicales), se clasifican en cuatro grupos principales (a pH neutro): • Radicales apolares • Radicales polares sin carga • Radicales polares • Con carga positiva • Con carga negativa LOS AMINOÁCIDOS
  5. 5. CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
  6. 6. CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
  7. 7. CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
  8. 8. PROPIEDADES DE LOS AMINOÁCIDOS: CARÁCTER ANFÓTERO • Carácter anfótero: Los aminoácidos presentan carácter anfótero porque pueden comportarse como un ácido o una base dependiendo del pH del medio donde se encuentre: al tener un grupo carboxilo ( -COOH ) pueden desprender H+, por lo que tienen carácter ácido; por otra parte, al poseer un grupo amino, son capaces de aceptar H+ y, por tanto, también tienen carácter básico. Al pH existente habitualmente en los medios biológicos, ambos grupos suelen estar ionizados y los aminoácidos aparecen como iones dobles. A un pH más ácido, los aminoácidos tendrán carga neta positiva, pues los H+ del medio son captados por el grupo -COO-, neutralizando éste y quedando únicamente la carga del grupo -NH3+. Por el contrario, en un pH más básico, el grupo -NH3+ cederá un H+ al medio y el aminoácido quedará con carga negativa. • Para la glicina el pK1 del grupo carboxilo es 2,3 y el pK2 del grupo amino es 9,6. Esto significa que a pH inferiores a 2,3 los grupos carboxilo y amino estarán protonados y la carga neta de la molécula será positiva. A pH entre 2,3 y 9,6 el grupo carboxilo esta desprotonado y el grupo amino protonado, siendo la carga neta del aminoácido cero. A pH superiores a 9,6 ambos grupos estarán desprotonados, siendo la carga neta negativa. Glicina
  9. 9. PROPIEDADES DE LOS AMINOÁCIDOS: PUNTO ISOELÉCTRICO Punto isoeléctrico: El valor de pH para el cual un aminoácido tiene carga neta = 0, es decir, posee tantas cargas positivas como negativas, se denomina punto isoeléctrico. Como cada aminoácido, cadena polipeptídica o proteína presentan un punto isoeléctrico diferente, ya que poseen cadenas laterales y aminoácidos distintos, se puede utilizar un método de separación de aminoácidos y proteínas, denominado electroforesis, que se basa en este concepto. Dicho método consiste en situar una disolución de los aminoácidos o proteínas que se quieren separar en un campo eléctrico. Los aminoácidos o proteínas con carga neta negativa se desplazarán hacia el ánodo, mientras que los que tengan carga positiva lo harán hacia el cátodo y los que se encuentran en su punto isoeléctrico no se moverán. Al modificar el pH de la disolución, las cargas de los aminoácidos o proteínas irán variando y se podrán separar en el campo eléctrico. En general el desplazamiento será mayor, cuanto mayor sea la carga y menor sea el peso molecular de la molécula.
  10. 10. PROPIEDADES: ISOMERÍA Y AMINOÁCIDOS ESENCIALES Estereoisomería o isomería espacial: Los aminoácidos (salvo la glicina, con R = H) poseen al menos un carbono asimétrico. Presentan estereoisomería o isomería espacial de modo que las características de cada aminoácido dependen de su configuración espacial. Si utilizamos como referencia el monosacárido gliceraldehido, los isómeros se clasifican en D y L. En los isómeros D, el grupo amino se sitúa a la derecha del carbono α y en los isómeros L se localiza a la izquierda. El uno es la imagen especular del otro y, por tanto son enantiómeros. Los aminoácidos que constituyen las proteínas son de la serie L. Isomería óptica: Los aminoácidos que tienen un carbono asimétrico tienen la capacidad de desviar el plano de la luz polarizada. Hay dos formas: • Dextrógiros (+). Desvían la luz polarizada hacia la derecha. • Levógiros (-). Desvían la luz polarizada hacia la izquierda. • La L-alanina es (+), mientras que la L-leucina es (-). Aminoácidos esenciales: En el ser humano son aminoácidos esenciales aquellos que tienen que ser necesariamente incorporados en la dieta: lisina, triptófano, treonina, fenilalanina, valina, metionina, leucina e isoleucina. Además en niños son aminoácidos esenciales la arginina e histidina.
  11. 11. LOS AMINOÁCCIDOS EN BIOMODEL 3
  12. 12. • Dos aminoácidos se unen entre si mediante el enlace peptídico (que es un enlace amida de tipo covalente), que se establece por reacción entre el grupo carboxilo de un aminoácido y el grupo amino de otro, liberándose una molécula de agua; la molécula resultante es un dipéptido. Las proteínas son cadenas polipeptídicas de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos. • El enlace peptídico es un enlace covalente y se comporta como si fuera un doble enlace, no permite el giro. De esta manera, los cuatro átomos del enlace peptídico (C=O – N-H) permanecen en el mismo plano. El resultado es que la cadena peptídica presenta una forma más o menos en zigzag. EL ENLACE PEPTÍDICO
  13. 13. LOS ENLACES PEPTÍDICOS EN BIOMODEL 3
  14. 14. La función de una proteína depende en gran medida de la estructura tridimensional final que adquiere y que denominamos conformación. Podemos distinguir cuatro niveles progresivos de plegamiento o estructura en las proteínas: • Estructura Primaria • Estructura Secundaria • Estructura terciaria • Estructura cuaternaria. ESTRUCTURA DE LAS PROTEÍNAS
  15. 15. Estructura primaria: • Es la secuencia de los aminoácidos en la cadena polipeptídica. El número, el tipo y el orden o la secuencia de los aminoácidos es característico de cada proteína. • Siempre existe un extremo aminoterminal, con un aminoácido cuyo grupo amino está libre y otro extremo carboxiloterminal, con un aminoácido con su grupo carboxilo libre. • La cadena se dispone en planos en zig-zag articulados dado que los enlaces peptídicos se comportan como un doble enlace y están en el mismo plano. • Los Radicales de los aminoácidos van alternando en la secuencia de la cadena hacia arriba y hacia abajo. • La estructura primaria es importante porque determina la conformación tridimensional específica de la proteína, necesaria para su función. ESTRUCTURA PRIMARIA La estructura primaria viene determinada por el gen que codifica para esa cadena polipeptídica según el dogma central de la Biología Molecular y el código genético: ADN  ARNm  Cadena polipeptídica Transcripción Traducción
  16. 16. ESTRUCTURA SECUNDARIA Estructura secundaria: La cadena polipeptídica pueden plegarse adoptando diversas formas en el espacio pero existen dos que se repiten frecuentemente, se trata de la estructura secundaria en hélice α y en lámina plegada o lámina β. En las proteínas suelen coexistir ambas, aunque una de ellas puede predominar sobre la otra. Estas estructuras se estabilizan gracias a que se establecen puentes de hidrógeno entre los grupos -CO- y -NH- de los enlaces peptídicos que quedan próximos al plegarse la cadena polipeptídica.
  17. 17. ESTRUCTURA SECUNDARIA EN HÉLICE ALFA La hélice α: • Se describió al estudiar mediante difracción de rayos X la α- queratina de la piel y sus derivados (cabello, uñas, plumas). • Se produce cuando una cadena polipeptídica gira sobre sí misma en sentido dextrógiro (en el sentido de las agujas del reloj) y origina un cilindro en el que los enlaces peptídicos se unen por puentes de hidrógeno a otros enlaces peptídicos. Así se forman enrollamientos helicoidales en los que las cadenas laterales R de los aminoácidos se proyectan hacia el exterior de la hélice, que es bastante compacta. • En cada vuelta hay 3,6 restos de aminoácidos, con un paso de rosca de 0,56nm. • En la conformación de la proteína se suelen representar como dominios helicoidales.
  18. 18. ESTRUCTURA SECUNDARIA EN LÁMINA BETA Lámina β o lámina plegada: • Se describió mediante el análisis por rayos X de β-queratinas, como la fibroína de la seda. Las cadenas polipeptídicas paralelas de la conformación β están dispuestas en láminas plegadas, unidas transversalmente por puentes de hidrógeno intercatenarios, establecidos entre todos los enlaces peptídicos. Los grupos R están por encima y por debajo de los planos en zig-zag de la lámina plegada. • En la conformación de la proteína se suelen representar como flechas planas direccionales.
  19. 19. LA ESTRUCTURA SECUNDARIA EN BIOMODEL 3
  20. 20. ESTRUCTURA FIBRILAR DEL COLÁGENO (ANEXO)
  21. 21. ESTRUCTURA FIBRILAR DE LA QUERATINA DEL PELO (ANEXO)
  22. 22. Estructura terciaria: • En algunas proteínas aparecen segmentos con estructuras diferente: unos en hélice α y otros en lámina β. Estas unidades estructurales se conocen con el nombre de dominios y tienen funciones específicas. Además, no todas las proteínas adoptan estas estructuras secundarias; existen algunas o partes de las mismas, que presentan dominios dispuestos al azar. • A la estructura final de una proteína que la hace funcional le denominamos conformación. • Un ejemplo: la lisozima, enzima que se encuentra en la clara del huevo y las lágrimas de los ojos, presenta estructura en hélice α (40%), conformación β (12%) y el resto otras estructuras al azar. • La estructura terciaria está estabilizada por las interacciones que se establecen entre los radicales R de los diferentes aminoácidos. Estas interacciones son: • Puentes disulfuro • Puentes de hidrógeno • Interacciones electrostáticas • Interacciones hidrofóbicas • Fuerzas de Van der Waals ESTRUCTURA TERCIARIA lisozima
  23. 23. ESTRUCTURA TERCIARIA y Fuerzas de Van der Waals
  24. 24. LA ESTRUCTURA TERCIARIA EN BIOMODEL 3
  25. 25. Estructura cuaternaria: • Para ser funcionales, algunas proteínas requieren la asociación de varias cadenas polipeptídicas o subunidades; en este caso, decimos que presentan estructura cuaternaria, que se refiere a la disposición espacial de los polipéptidos para formar la proteína. • Se suelen mantener unidos por los siguientes enlaces o interacciones: • Puentes disulfuro • Puentes de hidrógeno • Interacciones electrostáticas • Interacciones hidrofóbicas • Fuerzas de Van der Waals • El número de polipéptidos que pueden formar parte de una proteína varía en cada caso; además, pueden ser iguales o distintos. • Ejemplo: En la hemoglobina se unen cuatro cadenas polipeptídicas iguales dos a dos con estructura globular (dos α y dos β). ESTRUCTURA CUATERNARIA Hemoglobina
  26. 26. ESTRUCTURA CUATERNARIA EN BIOMODEL 3
  27. 27. Estructuras supramoleculares: Las estructuras supramoleculares, como los complejos enzimáticos, los ribosomas, las membranas plasmáticas y los virus, se forman como agregados de subunidades ensambladas de forma no covalente. ESTRUCTURAS SUPRAMOLECULARES Ribosoma, ARNr, ARNts y ARNm Glucoproteína S del SARS-Cov-2
  28. 28. Solubilidad: Las proteínas con estructura fibrilar son insolubles en agua, mientras que las que poseen estructura globular son solubles. Debido a su elevada masa molecular, cuando las proteínas son solubles forman disoluciones coloidales. En ellas, muchos de los aminoácidos apolares se sitúan en el interior de la estructura, y los polares, que pueden unirse por puentes de hidrógeno a las moléculas de agua, se localizan en la periferia en contacto con éstas. Existe, pues, una capa de solvatación de agua alrededor de cada molécula proteica que impide la unión entre ellas. Si esta capa se pierde, las moléculas de proteína se unen entre sí y forman un agregado insoluble, lo que provoca su precipitación. Esto ocurre cuando aparecen iones (generalmente sales en disolución, pero también ácidos, bases y alcoholes) que compiten con las cargas de los aminoácidos para unirse a las moléculas de agua de la capa de solvatación. En solución, las proteínas pueden actuar como ácidos o como bases según presenten una carga electroquímica negativa o positiva, dependiendo del pH del medio. Esta propiedad es la base de una técnica de separación de proteínas, que como ya hemos visto, se denomina electroforesis. PROPIEDADES DE LAS PROTEÍNAS: SOLUBILIDAD
  29. 29. Especificidad: Las proteínas y los ácidos nucleicos son moléculas específicas, es decir, cada especie biológica posee algunas proteínas que otros organismos no tienen. Incluso proteínas que presentan la misma función y una estructura tridimensional muy semejante suelen tener una secuencia peptídica algo diferente en distintos organismos. Este hecho posee una gran importancia, ya que el análisis de las semejanzas que existen entre algunas proteínas de diversos grupos de seres vivos permite llevar a cabo estudios filogenéticos y establecer el parentesco evolutivo entre especies. PROPIEDADES DE LAS PROTEÍNAS: ESPECIFICIDAD
  30. 30. PROPIEDADES DE LAS PROTEÍNAS: ESPECIFICIDAD Especificidad Antígeno-anticuerpo: La especificidad proteica se observa en individuos de una misma especie. Se puede decir que cada individuo de una especie tiene unas características determinadas porque tiene unas proteínas propias. La especificidad de las proteínas es la causa del rechazo en los trasplantes de órganos y en las transfusiones sanguíneas. Al introducir una proteína foránea (no propia), el organismo la reconoce como extraña y responde produciendo anticuerpos para su destrucción; por eso se buscan siempre donantes y receptores compatibles.
  31. 31. PROPIEDADES DE LAS PROTEÍNAS: ESPECIFICIDAD Especificidad enzimática: También las enzimas, que son proteínas, presentan una gran especificidad por su sustrato. Cada reacción del metabolismo de un organismo está catalizada por una enzima específica que reconoce habitualmente a un sustrato único y no otro. Unión específica Enzima-Sustrato
  32. 32. Desnaturalización: La función biológica de las proteínas depende de su estructura tridimensional, también denominada conformación cuando está intacta. Cualquier cambio que suponga una alteración de esta conformación, como sucede, por ejemplo, cuando se rompen los enlaces de la estructura cuaternaria, terciaria y secundaria, afecta a la funcionalidad biológica de la proteína. Este proceso recibe el nombre de desnaturalización y puede ser reversible (si los factores responsables han actuado con escasa intensidad y durante poco tiempo) o irreversible. En el primer caso es posible recuperar la conformación cuando cesa la acción de los factores que han producido su desnaturalización, proceso conocido como renaturalización. Habitualmente, sin embargo, la desnaturalización proteica suele ser irreversible. Entre los factores que pueden provocar la desnaturalización proteica se encuentran las variaciones de presión y el aumento de temperatura (agentes físicos) y las variaciones de pH, así como los cambios en la concentración salina ( agentes químicos ). PROPIEDADES DE LAS PROTEÍNAS: DESNATURALIZACIÓN
  33. 33. FUNCIONES DE LAS PROTEÍNAS Las proteínas son las biomoléculas orgánicas más abundantes de la materia viva, constituyendo alrededor del 50% de su peso seco, y desempeñan funciones imprescindibles y muy diversas. Entre ellas destacan: • Función estructural: Las proteínas son el principal material de construcción de los seres vivos, formando parte de casi todas sus estructuras: desde la membrana plasmática hasta ser el principal constituyente del tejido conectivo (colágeno), del pelo, las uñas (queratina), etc. Se puede decir que, prácticamente, un ser vivo está hecho a base de proteínas. • Función Enzimática: La vida se puede considerar como un conjunto de reacciones químicas y todas ellas están catalizadas y controladas por unas proteínas, denominadas enzimas. Son las más numerosas y especializadas. En la queratina, dos cadenas de polipéptidos de α-queratina giran juntas formando una espiral. En el colágeno son 3 las α-hélices de polipéptidos de tropocolágeno que giran juntas ensamblándose para formar la fibrilla de colágeno.
  34. 34. FUNCIONES DE LAS PROTEÍNAS • Función de transporte: Muchos iones y moléculas pequeños son transportados por proteínas específicas: las proteínas transportadoras de oxigeno en la sangre de vertebrados (hemoglobina), en invertebrados (hemocianina) y en los músculos (mioglobina). Las lipoproteínas transportan lípidos por la sangre. Los citocromos transportan electrones. Las proteínas de la membrana plasmática que controlan el paso de sustancias a través de ella. • Función hormonal: Algunas hormonas son de naturaleza proteica, como la insulina y el glucagón (que regulan los niveles de glucosa en la sangre) o la hormona del crecimiento o la adrenocorticotrópica (regula la síntesis de corticoesteroides) o la calcitocina (regula el metabolismo del calcio). Hemoglobina Proteínas de membrana Insulina humana
  35. 35. FUNCIONES DE LAS PROTEÍNAS • Función contráctil: Algunas proteínas, como la actina y la miosina del músculo, son responsables de la contracción muscular. Otras como la tubulina de los movimientos de cilios y flagelos y el movimiento de los cromosomas durante la división celular por medio de las fibras del huso acromático. • Función defensiva: Los anticuerpos (inmunoglobulinas) son proteínas que reconocen y se combinan específicamente con sustancias extrañas o antígenos, presentes en virus, bacterias, células de otros organismos, etc, y los neutralizan. La trombina y el fibrinógeno contribuyen a la formación de coágulos sanguíneos para evitar hemorragias. Las mucinas con efecto germicida y protector de las mucosas. Algunas toxinas bacterianas, como la del botulismo, o venenos de serpientes, son proteínas fabricadas con funciones defensivas. Sarcómero con actina y miosina Toxina botulínica
  36. 36. FUNCIONES DE LAS PROTEÍNAS • Función de reserva: Algunas proteínas sirven de reserva proteica de aminoácidos, como la ovoalbúmina de la clara de huevo, la lactoalbúmina o caseína de la leche, la gliadina del grano de trigo. • Función reguladora: Algunas proteínas regulan la fracción de información genética contenida en el ADN (genes) que debe ser expresada en cada momento. Otras regulan la división celular. • Función homeostática: Algunas proteínas mantienen el equilibrio osmótico (presión oncótica). Otras actúan, junto con otros sistemas amortiguadores, para mantener constante el pH. Ovoalbúmina Función reguladora de las quinasas en el ciclo celular
  37. 37. Antonio Campo Buetas Biología 2º Bachillerato

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