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Manejo y
Almacenamiento de
Bases de Datos
Proyecto Paisajes
Sostenibles
para la Amazonia
Karolina Argote
Christian Sosa
Reunión Annual SAL
Marzo 3, 2016
Cali, Colombia
“La información es poder si se usa con rapidez y eficacia”
Katherine Neville
Objetivos
• Diseñar la base de datos SAL, que integre y relacione todos
los datos colectados en el proyecto: económicos, sociales,
biofísicos y geográficos.
• Crear una BD amigable, de fácil uso, automatizada que facilite
la consulta de datos de cualquier actor que lo requiera en el
Proyecto.
• Proveer de manera organizada y sistematizada los datos del
proyecto a nivel de predio y a nivel de hogar que permitan
realizar el escalamiento de los resultados a las Unidades de
Paisaje.
La Base de Datos es Transversal a todos los objetivos del proyecto
Principios de la base de datos SAL
1. Redundancia mínima: Control para eliminar duplicidades
innecesarias. Si existen redundancias físicas necesarias serán
controladas por el mismo sistema para no generar inconsistencias.
2. Geo-referenciación de TODA la información
3. Integridad de los datos: Medidas de seguridad para impedir
que se introduzcan datos erróneos. Bien sea por motivos físicos
(hardware) o de operación (datos incoherentes).
4. Consultas complejas optimizadas. Queries
5. Control de acceso a la base de datos: Sistema de auditoría
para mantener el control de acceso a la base, con el objeto de saber
qué o quién realizó una determinada modificación y en qué
momento.
6. Respaldo y recuperación: Backup semanal
Sistemas de gestión de bases de datos
SQL (Structured Query Language) es un lenguaje de programación
para trabajar con bases de datos relacionales. Access utiliza SQL para
trabajar con datos. Porque SQL?
Es un lenguaje fácil de leer y entender, incluso para un principiante.
SQL es un estándar internacional que es reconocido por los
organismos de normalización como ISO y ANSI.
SQL permite describir conjuntos de datos y ayudarnos a responder
preguntas mediante consultas avanzadas.
Access es Posiblemente, la aplicación más compleja de la suite Office.
Contiene muy buenas herramientas de diseño y programación de
bases de datos relacionales.
+
Actividades Realizadas
1. Generación de identificadores únicos por predio, lote, y puntos de muestreo.
2. Diseño de la estructura general de la base de datos y asignación de relaciones.
3. Organización de los datos preliminares del muestreo de suelos realizado.
4. Gestion y organización del repositorio de datos SAL en los servidores del CIAT y del
FTP para compartir datos con los actores externos (socios, colaboradores, tesistas)
Actividades Realizadas: (1) Generación de identificadores únicos por predio, lote, y puntos de muestreo.
Ai1
Ai2
Ai3
Ai4
Moisture
0-5cm
Moisture
0-5cm
Moisture
0-5cm
0-5cm
0-10cm
10-20cm
20-35cm
35-50cm
Moisture
Bi1
Bi2
Bi3
Bi4
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0-5cm
Moisture
0-5cm
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0-5cm
Ci1
Ci2
Ci3
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0-5cm
0-5cm
0-10cm
10-20cm
20-35cm
35-50cm
Moisture
0-5cm
0-10cm
10-20cm
20-35cm
35-50cm
Moisture
LANDCOVER XX
FARM ZZZ
Con base al esquema gráfico del muestreo de suelos
se construyen los identificadores únicos de cada uno
de los puntos de muestreo, ubicados en lotes en las
coberturas dentro de los predios que a su vez están
dentro de una unidad de paisaje específica.
Actividades Realizadas: (1) Generación de identificadores únicos por predio, lote, y puntos de muestreo.
• ID_FARM: Cáda finca tiene un ID alfanumérico único compuesto por tres dígitos. El Colombia las
fincas de CIPAV inician con la letra (C) y las fincas de SINCHI con la letra (S), seguido de dos dígitos
numéricos. Ex. C09. En Perú todas las fincas inician con la letra (Y) de Yurimaguas seguidos de dos
digitos numéricos. Ex.Y01
• COVER_CODE: Cáda cobertura de la tierra tiene un ID compuesto por dos letras una mayúscula y
otra minúscula que permiten reconocer fácilmente la cobertura. Ex. Bn: Bosque Natural, Pl: Plátano.
• PLOT_CODE: Corresponde a las áreas de muestreo dentro de cada lote. En los exploratorios (e)
donde se muestrea un punto se denomina(Ae) y en las implementaciones (i) y testigos (t) que se
realiza por un transecto de tres puntos se denominan (Ai, Bi, Ci y At, Bt, Ct). Igual para Colombia y
Perú.
• ID_SOILPOINT: Corresponde al ID asignado a cada uno de los puntos de muestreo dentro de cada
área de muestreo, por lote, por cobertura. Ex. C09Bn_Ae1
ID_SOILPOINT = ID_FARM & COVER_CODE & PLOT_CODE
Actividades Realizadas: (2) Diseño de la estructura general de la base de datos y asignación de relaciones.
FARM_DATA
ID_FARM
ID_UP
…
SOCIAL_DATA
ID_HOGAR
ID_FARM
…
…
ECONOMIC_DATA
ID_HOGAR
ID_FARM
…
Social 1
Social 2
Social 3
Econo_1
Econo_ 2
Econo_3
Soil_1
Soil_2
Soil_3
LANDCOVER
ID_LANDCOVER
ID_FARM
…
SAMPLE_TYPE
ID_TYPE
ID_LANDCOVER
…
PLOT
ID_PLOT
ID_TYPE
…
SITE
ID_SITE
ID_PLOT
…
Relación uno a
muchos
Relación uno a
uno
DEPTH_A
ID_DEPTH_A
ID_SITE
…
DEPTH_B
ID_DEPTH_B
ID_SITE
…
Soil_1
Soil_2
Soil_3
UP
ID_UP
…
…
Actividades Realizadas: (4) Gestion y organización del repositorio de datos SAL en los servidores del CIAT y del FTP par
compartir datos con los actores externos.
Actividades Planeadas para 2016
Reunion por equipos
Estaremos contactando a cada uno de los equipos de
trabajo, con el fin de enteder los datos a organizar en la
base de datos, necesitamos entender las variables usadas
por cada equipo caracteristicas, definición, unidades,
restricciones, rangos etc:
Febrero: Equipo Suelos (Mirjam-César)
Marzo: Equipo Macrofauna (Patrick)
Abril: Equipo Socioeconómico (Alex)
Adicionalemente socializariamos el protocol para la
estandarizacion en la entrega de datos.
Actividades Planeadas para 2016
• MARZO-ABRIL: Crear protocolos para el manejo y distribución de datos en el Proyecto
SAL.
• MARZO-ABRIL: Generar esquema y estructura final para la base de datos SAL.
• MARZO: Base de datos para la línea base del Componente Coberturas-UP consolidada
para predios de implementacion Perú.
• JUNIO-JULIO: Base de datos para la línea base del Componente Coberturas-UP
consolidada para predios de implementacion Colombia.
• AGOSTO: Base de datos para la línea base del Componente Suelos y Macrofauna
consolidada para Colombia.
• OCTUBRE: Base de datos para la línea base del Componente Suelos y Macrofauna
consolidada para Perú.
• …
Plataformas para
compartir datos en
SAL
FTP
FTP (de la sigla en inglés de File Transfer Protocol, 'Protocolo de Transferencia de Archivos') es
un protocolo de red para la transferencia de archivos entre sistemas conectados a una
red TCP (Transmission Control Protocol), basado en la arquitectura cliente-servidor.
ftp://ftp.ciat.cgiar.org/DAPA/projects/SAL-project
FTP
 Para compartir datos desde CIAT a los socios
(No viceversa!)
 Pueden acceder desde cualquier computadora con
acceso a internet!
 Desde cualquier navegador y Sistema operativo.
 Cualquier persona con este link puede descarar
cualquiera de los archivos alli contenidos. Porfavor
manejarlo con prudencia, solo personas del
Proyecto SAL!
Slideshare es un sitio web de alojamiento de diapositivas que ofrece la
posibilidad de subir y compartir en público o en privado presentaciones de
diapositivas en PowerPoint, OpenOffice; Adobe PDF, Microsoft Word,
archivos de texto e incluso algunos formatos de audio y vídeo.
http://www.slideshare.net/bmuproject
2 seguidores! …Hay slides muy
interesantes aquí,
Quisieras unirte?
Flickr es un sitio de Internet para almacenar imágenes y videos creado por Ludicrop en
2004 y comprado por Yahoo! el año siguiente. Además de ser un sitio para compartir y
almacenar fotografías, flickr se utiliza para buscar y adjuntar fotografías en los blogs, paginas
web y en otras redes sociales.
Flickr, tiene 1 Terabyte de espacio de almacenamiento gratuito con lo que podríamos
guardar medio millón de fotos con una resolución de 6 megapíxeles.
https://www.flickr.com/photos/131075783@N02/albums
Por el momento tenemos 11 albumes
(uno por actividad de campo realizada),
compuestos por 495 fotos.
Pero solo tenemos 3 seguidores,
Porfavor Siguenos!
Mendeley es un gestor de referencias bibliográficas, gratuito y
multiplataforma (Windows, Linux y Mac) que combina una versión local con
una versión web lo que permite consultar información desde cualquier
ordenador con conexión a Internet.
16 seguidores,
(vamos mejorando)
Quisieras unirte?
Permite gestionar y compartir referencias bibliográficas y documentos de investigación, encontrar nuevas referencias y
documentos y colaborar en línea. Su comunidad está formada por 3 millones de usuarios y dispone de una base de datos
con más de 100 millones de referencias. Desde 2013 pertenece al grupo editorial Elsevier.
https://www.mendeley.com/groups/6880581/sustainable-amazonian-landscapes/members/
En todos los centros asociados a CGIAR se está implementando la política de libre acceso a los datos, que consiste en publicar las bases de datos de los
proyectos que se desarrollan en CIAT de una manera documentada.
Ejemplo
Dataverse es una aplicación web de código abierto desarrollada por la
Universidad de Harvard para compartir, preservar, citar y analizar datos de
investigación. Permite poner los datos de una investigación a disposición de los
demás y a su vez replicar e incluso mejorar otras investigaciones.
http://thedata.harvard.edu/dvn/dv/CIAT
Un repositorio Dataverse aloja varios dataverses. Cada Dataverse contiene un
datatset u otros dataverses, y cada conjunto de datos contiene metadatos
descriptivos y archivos de datos (incluyendo la documentación y el código que
acompañan a los datos).
Normaliza la cita de los conjuntos de datos para que sea más fácil para los
investigadores publicar sus datos y obtener un mejor reconocimiento de su trabajo.
Permite que los datos científicos sean lo más accesibles, reutilizables, y abiertos
posibles.
Colaboraciones
Estamos disponibles para colaborar con todos los equipos
del proyecto en el manejo y almacenamiento de datos!
Entre todos construiremos una eficaz base de datos!

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Presentación: manejo y almacenamiento de bases de datos

  • 1. Manejo y Almacenamiento de Bases de Datos Proyecto Paisajes Sostenibles para la Amazonia Karolina Argote Christian Sosa Reunión Annual SAL Marzo 3, 2016 Cali, Colombia
  • 2. “La información es poder si se usa con rapidez y eficacia” Katherine Neville
  • 3. Objetivos • Diseñar la base de datos SAL, que integre y relacione todos los datos colectados en el proyecto: económicos, sociales, biofísicos y geográficos. • Crear una BD amigable, de fácil uso, automatizada que facilite la consulta de datos de cualquier actor que lo requiera en el Proyecto. • Proveer de manera organizada y sistematizada los datos del proyecto a nivel de predio y a nivel de hogar que permitan realizar el escalamiento de los resultados a las Unidades de Paisaje.
  • 4. La Base de Datos es Transversal a todos los objetivos del proyecto
  • 5. Principios de la base de datos SAL 1. Redundancia mínima: Control para eliminar duplicidades innecesarias. Si existen redundancias físicas necesarias serán controladas por el mismo sistema para no generar inconsistencias. 2. Geo-referenciación de TODA la información 3. Integridad de los datos: Medidas de seguridad para impedir que se introduzcan datos erróneos. Bien sea por motivos físicos (hardware) o de operación (datos incoherentes). 4. Consultas complejas optimizadas. Queries 5. Control de acceso a la base de datos: Sistema de auditoría para mantener el control de acceso a la base, con el objeto de saber qué o quién realizó una determinada modificación y en qué momento. 6. Respaldo y recuperación: Backup semanal
  • 6. Sistemas de gestión de bases de datos SQL (Structured Query Language) es un lenguaje de programación para trabajar con bases de datos relacionales. Access utiliza SQL para trabajar con datos. Porque SQL? Es un lenguaje fácil de leer y entender, incluso para un principiante. SQL es un estándar internacional que es reconocido por los organismos de normalización como ISO y ANSI. SQL permite describir conjuntos de datos y ayudarnos a responder preguntas mediante consultas avanzadas. Access es Posiblemente, la aplicación más compleja de la suite Office. Contiene muy buenas herramientas de diseño y programación de bases de datos relacionales. +
  • 7. Actividades Realizadas 1. Generación de identificadores únicos por predio, lote, y puntos de muestreo. 2. Diseño de la estructura general de la base de datos y asignación de relaciones. 3. Organización de los datos preliminares del muestreo de suelos realizado. 4. Gestion y organización del repositorio de datos SAL en los servidores del CIAT y del FTP para compartir datos con los actores externos (socios, colaboradores, tesistas)
  • 8. Actividades Realizadas: (1) Generación de identificadores únicos por predio, lote, y puntos de muestreo. Ai1 Ai2 Ai3 Ai4 Moisture 0-5cm Moisture 0-5cm Moisture 0-5cm 0-5cm 0-10cm 10-20cm 20-35cm 35-50cm Moisture Bi1 Bi2 Bi3 Bi4 Moisture 0-5cm Moisture 0-5cm Moisture 0-5cm Ci1 Ci2 Ci3 Ci4 Moisture 0-5cm Moisture 0-5cm Moisture 0-5cm 0-5cm 0-10cm 10-20cm 20-35cm 35-50cm Moisture 0-5cm 0-10cm 10-20cm 20-35cm 35-50cm Moisture LANDCOVER XX FARM ZZZ Con base al esquema gráfico del muestreo de suelos se construyen los identificadores únicos de cada uno de los puntos de muestreo, ubicados en lotes en las coberturas dentro de los predios que a su vez están dentro de una unidad de paisaje específica.
  • 9. Actividades Realizadas: (1) Generación de identificadores únicos por predio, lote, y puntos de muestreo. • ID_FARM: Cáda finca tiene un ID alfanumérico único compuesto por tres dígitos. El Colombia las fincas de CIPAV inician con la letra (C) y las fincas de SINCHI con la letra (S), seguido de dos dígitos numéricos. Ex. C09. En Perú todas las fincas inician con la letra (Y) de Yurimaguas seguidos de dos digitos numéricos. Ex.Y01 • COVER_CODE: Cáda cobertura de la tierra tiene un ID compuesto por dos letras una mayúscula y otra minúscula que permiten reconocer fácilmente la cobertura. Ex. Bn: Bosque Natural, Pl: Plátano. • PLOT_CODE: Corresponde a las áreas de muestreo dentro de cada lote. En los exploratorios (e) donde se muestrea un punto se denomina(Ae) y en las implementaciones (i) y testigos (t) que se realiza por un transecto de tres puntos se denominan (Ai, Bi, Ci y At, Bt, Ct). Igual para Colombia y Perú. • ID_SOILPOINT: Corresponde al ID asignado a cada uno de los puntos de muestreo dentro de cada área de muestreo, por lote, por cobertura. Ex. C09Bn_Ae1 ID_SOILPOINT = ID_FARM & COVER_CODE & PLOT_CODE
  • 10. Actividades Realizadas: (2) Diseño de la estructura general de la base de datos y asignación de relaciones. FARM_DATA ID_FARM ID_UP … SOCIAL_DATA ID_HOGAR ID_FARM … … ECONOMIC_DATA ID_HOGAR ID_FARM … Social 1 Social 2 Social 3 Econo_1 Econo_ 2 Econo_3 Soil_1 Soil_2 Soil_3 LANDCOVER ID_LANDCOVER ID_FARM … SAMPLE_TYPE ID_TYPE ID_LANDCOVER … PLOT ID_PLOT ID_TYPE … SITE ID_SITE ID_PLOT … Relación uno a muchos Relación uno a uno DEPTH_A ID_DEPTH_A ID_SITE … DEPTH_B ID_DEPTH_B ID_SITE … Soil_1 Soil_2 Soil_3 UP ID_UP … …
  • 11. Actividades Realizadas: (4) Gestion y organización del repositorio de datos SAL en los servidores del CIAT y del FTP par compartir datos con los actores externos.
  • 12. Actividades Planeadas para 2016 Reunion por equipos Estaremos contactando a cada uno de los equipos de trabajo, con el fin de enteder los datos a organizar en la base de datos, necesitamos entender las variables usadas por cada equipo caracteristicas, definición, unidades, restricciones, rangos etc: Febrero: Equipo Suelos (Mirjam-César) Marzo: Equipo Macrofauna (Patrick) Abril: Equipo Socioeconómico (Alex) Adicionalemente socializariamos el protocol para la estandarizacion en la entrega de datos.
  • 13. Actividades Planeadas para 2016 • MARZO-ABRIL: Crear protocolos para el manejo y distribución de datos en el Proyecto SAL. • MARZO-ABRIL: Generar esquema y estructura final para la base de datos SAL. • MARZO: Base de datos para la línea base del Componente Coberturas-UP consolidada para predios de implementacion Perú. • JUNIO-JULIO: Base de datos para la línea base del Componente Coberturas-UP consolidada para predios de implementacion Colombia. • AGOSTO: Base de datos para la línea base del Componente Suelos y Macrofauna consolidada para Colombia. • OCTUBRE: Base de datos para la línea base del Componente Suelos y Macrofauna consolidada para Perú. • …
  • 15. FTP (de la sigla en inglés de File Transfer Protocol, 'Protocolo de Transferencia de Archivos') es un protocolo de red para la transferencia de archivos entre sistemas conectados a una red TCP (Transmission Control Protocol), basado en la arquitectura cliente-servidor. ftp://ftp.ciat.cgiar.org/DAPA/projects/SAL-project FTP  Para compartir datos desde CIAT a los socios (No viceversa!)  Pueden acceder desde cualquier computadora con acceso a internet!  Desde cualquier navegador y Sistema operativo.  Cualquier persona con este link puede descarar cualquiera de los archivos alli contenidos. Porfavor manejarlo con prudencia, solo personas del Proyecto SAL!
  • 16. Slideshare es un sitio web de alojamiento de diapositivas que ofrece la posibilidad de subir y compartir en público o en privado presentaciones de diapositivas en PowerPoint, OpenOffice; Adobe PDF, Microsoft Word, archivos de texto e incluso algunos formatos de audio y vídeo. http://www.slideshare.net/bmuproject 2 seguidores! …Hay slides muy interesantes aquí, Quisieras unirte?
  • 17. Flickr es un sitio de Internet para almacenar imágenes y videos creado por Ludicrop en 2004 y comprado por Yahoo! el año siguiente. Además de ser un sitio para compartir y almacenar fotografías, flickr se utiliza para buscar y adjuntar fotografías en los blogs, paginas web y en otras redes sociales. Flickr, tiene 1 Terabyte de espacio de almacenamiento gratuito con lo que podríamos guardar medio millón de fotos con una resolución de 6 megapíxeles. https://www.flickr.com/photos/131075783@N02/albums Por el momento tenemos 11 albumes (uno por actividad de campo realizada), compuestos por 495 fotos. Pero solo tenemos 3 seguidores, Porfavor Siguenos!
  • 18. Mendeley es un gestor de referencias bibliográficas, gratuito y multiplataforma (Windows, Linux y Mac) que combina una versión local con una versión web lo que permite consultar información desde cualquier ordenador con conexión a Internet. 16 seguidores, (vamos mejorando) Quisieras unirte? Permite gestionar y compartir referencias bibliográficas y documentos de investigación, encontrar nuevas referencias y documentos y colaborar en línea. Su comunidad está formada por 3 millones de usuarios y dispone de una base de datos con más de 100 millones de referencias. Desde 2013 pertenece al grupo editorial Elsevier. https://www.mendeley.com/groups/6880581/sustainable-amazonian-landscapes/members/
  • 19. En todos los centros asociados a CGIAR se está implementando la política de libre acceso a los datos, que consiste en publicar las bases de datos de los proyectos que se desarrollan en CIAT de una manera documentada. Ejemplo Dataverse es una aplicación web de código abierto desarrollada por la Universidad de Harvard para compartir, preservar, citar y analizar datos de investigación. Permite poner los datos de una investigación a disposición de los demás y a su vez replicar e incluso mejorar otras investigaciones. http://thedata.harvard.edu/dvn/dv/CIAT Un repositorio Dataverse aloja varios dataverses. Cada Dataverse contiene un datatset u otros dataverses, y cada conjunto de datos contiene metadatos descriptivos y archivos de datos (incluyendo la documentación y el código que acompañan a los datos). Normaliza la cita de los conjuntos de datos para que sea más fácil para los investigadores publicar sus datos y obtener un mejor reconocimiento de su trabajo. Permite que los datos científicos sean lo más accesibles, reutilizables, y abiertos posibles.
  • 20.
  • 21.
  • 22.
  • 23.
  • 24. Colaboraciones Estamos disponibles para colaborar con todos los equipos del proyecto en el manejo y almacenamiento de datos! Entre todos construiremos una eficaz base de datos!

Notas del editor

  1. BASIC
  2. No existe una definición ampliamente aceptada ni para paisajes ni para “enfoque de paisajes”, pero si es claro su potencial para afrontar algunos de los temas de investigación más recurrentes hoy dia como el cambio climático, el desarrollo sostenible, la gestión de los recursos naturales, la mitigación de la pobreza, la seguridad alimentaria y el bienestar humano en general, es sólido. Ejemplo: Lo que sucede en los bosques tiene impacto sobre la calidad y cantidad de agua. Lo que sucede con el agua tiene impacto en la productividad agrícola. Lo que sucede con la productividad agrícola tiene impacto en la cantidad de bosques que son retirados de ese paisaje. Esquema de la presentacion. Enfoque Dinamico, multiescala, Titulo + miembros del equipo que prepara la presentación (1 diapositiva) Objetivos del trabajo realizado (o por realizar) (máx 1 diapositiva) Breve presentación de actividades adelantadas hasta la fecha (máx 5 diapositivas) Próximos pasos en 2016 (máx 2 diapositivas) Colaboraciones y trabajo con otros participantes del proyecto (1 diapositiva) 10 principles for a landscape approach 1: Continual learning and adaptive management. 2: Common concern entry point. 3: Multiple scales. 4: Multifunctionality. 5: Multiple stakeholders. 6: Negotiated and transparent change logic. 7: Clarification of rights and responsibilities. 8: Participatory and user-friendly monitoring. 9: Resilience. 10: Strengthened stakeholder capacity.
  3. To compare soil characteristics and ecosystem services (ES) with and without proposed sustainable systems.Plot Level To establish biophysical and socioeconomic baseline of the selected landscape units. Farm and landscape level To analyze the effect of land cover on soils and ES at fam and landscape level. Farm and Landscape level To analyze effect of potential land use/management scenarios on sustainability. Landscape level
  4. 1. Redundancia mínima. Controlaremos la redundancia con el fin de eliminar duplicidades innecesarias. Cuando sean redundancias físicas necesarias (redundancia controlada). serán tratadas por el mismo sistema, de modo que no puedan producirse inconsistencias. Si un dato se actualizará lógicamente por el usuario en forma única, el sistema se encargara de cambiar físicamente todos aquellos campos en los que el dato estuviese repetido. 4. Integridad de los datos. Se refiere a las medidas de seguridad que impiden que se introduzcan datos erróneos. Esto puede suceder tanto por motivos físicos (defectos de hardware, actualización incompleta debido a causas externas), como de operación (introducción de datos incoherentes). 7. Seguridad de acceso y auditoría. Se refiere al derecho de acceso a los datos contenidos en la base por parte de cualquier integrante del proyecto. El sistema de auditoría mantiene el control de acceso a la base, con el objeto de saber qué o quién realizó una determinada modificación y en qué momento. 8. Respaldo y recuperación. Se refiere a la capacidad de un sistema de base de datos de recuperar su estado en un momento previo a la pérdida de datos.
  5. Meter una tabla UP
  6. 2 diapo