21. 無料学術文献データベース
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Apr.26th, 2013 at Tokyo University of Agriculture Hiroaki Yoshimoto Ph.D.
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32. 農大図書館からも行けます
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32
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38. 有料学術文献データベース
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医薬・看護系はこれが定番医中誌
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42. 研究のPDCAサイクル
PLAN
先行研究
リサーチ
仮説構築
実験計画
•プロトコル
•試薬検討
DO
予備実験
実証実験
CHECK
データ解析
•グラフ作成
•統計解析
追加試験
ACT
学会発表
• PPT
• ポスター
論文執筆
• 考察
• 引用文献
チェック
• 投稿
Apr.26th, 2013 at Tokyo University of Agriculture Hiroaki Yoshimoto Ph.D.
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43. 複雑だが重要な
引用文献リスト
科学論文の末尾には、引用文献リストがあります。
そのフォーマットは、投稿先によって規定があり、
記載方法は、複雑怪奇=めんどくさい!
しかし、引用文献リストの不備は、内容の不備を疑われる元。
正確に記載しなければなりません。
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46. パソコンでラクをする
文献管理法
パソコンを利用する目的は、
手作業では時間のかかる(≒できない)作業を
簡単に=ラクに、正確におこなうこと。
文献管理→引用文献一覧作成は、その典型です。
Apr.26th, 2013 at Tokyo University of Agriculture Hiroaki Yoshimoto Ph.D.
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47. 引用する文献は、整理するクセをつけよう
前項で見たように、引用文献リストは、複雑で面倒な
作業です。
さまざまなフォーマットにできるだけ対応できるように、
日ごろから読んだ文献を整理するクセをつけましょう。
初学者には、まずエクセルで一覧表を作ることから始
めるのが無難ですが・・・。
複雑な投稿規定に合わせてリストを作成し、本文の番
号と照合する作業は予想以上に大変です。
Apr.26th, 2013 at Tokyo University of Agriculture Hiroaki Yoshimoto Ph.D.
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そこで、文献管理ソフトの利用が有益
48. 引用文献作成のワークフロー
引用文献
検索
引用文献
選定
引用
フォーマット
チェック
本文に
引用番号
挿入
チェック
加除訂正
引用文献
一覧作成
Apr.26th, 2013 at Tokyo University of Agriculture Hiroaki Yoshimoto Ph.D.
脱稿
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投稿規定
文献管理ソフト
49. エクセルで文献を整理する
•少なくとも、並べ替えができるように、以下の項目は最低必要。
•著者名やタイトルは長くなるので、エクセルの「折り返して表示する」を使って、
狭い幅に表示させましょう。
A B C D E F G H
番号著者名タイトル雑誌名巻号ページ年
1
吉本博明, 江口文
陽
ヒメマツタケ(Agaricus blazeiMurr.) の
現状と課題
応用薬理72 5 130-132 2007
2
吉本博明, 江口文
陽, 河上誠樹
ヒメマツタケ廃菌床のナス栽培に対す
る施用効果
日本きのこ
学会誌
14 2 99-105 2006
3
吉本博明, 江口文
陽, 桧垣宮都, 大
賀祥治
ヒメマツタケの薬理効果におよぼす培
地基材の影響木材学会誌51 6 387-393 2005
50本程度なら、これでなんとかイケそうな気がしますが・・・
Apr.26th, 2013 at Tokyo University of Agriculture Hiroaki Yoshimoto Ph.D.
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50. 入力する書誌データの例
UI - 22739240
PMID- 14966678
DA - 20040217
IS - 1676-5680
VI - 2
IP - 3
DP - 2003 Sep 30
TI - Effects of crude extracts of Agaricus blazei on DNA damage and on rat
liver carcinogenesis induced by diethylnitrosamine.
PG - 295-308
AB - The effects of crude extracts of the mushroom Agaricus blazei Murrill
(Agaricaceae) on both DNA damage and placental form glutathione
S-transferase (GST-P)-positive liver foci induced by diethylnitrosamine
(DEN) were investigated. Six groups of adult male Wistar rats were used.
For two weeks, animals of groups 3 to 6 were treated with three aqueous
solutions of A. blazei (mean dry weight of solids being 1.2, 5.6, 11.5 and
11.5 mg/ml, respectively). After this period, groups 2 to 5 were given a
single ip injection 200 mg/kg DEN and groups 1 and 6 were treated with
0.9% NaCl. All animals were subjected to 70% partial hepatectomy at week
five and sacrificed 4, 24 and 48 h or 8 weeks after DEN or 0.9% NaCl
treatments (10th week after the beginning of the experiment). The alkaline
comet assay and GST-P-positive liver foci development were used to
evaluate the influence of the mushroom extracts on liver cell DNA damage
and on the initiation of liver carcinogenesis, respectively. Previous
treatment with the highest concentration of A. blazei (11.5 mg/ml)
significantly reduced DNA damage, indicating a protective effect against
DEN-induced liver cytotoxicity/genotoxicity. However, the same dose of
mushroom extract significantly increased the number of GST-P-positive
liver foci.
AD - Departamento de Morfologia, Instituto de Biologia, UNESP, Botucatu, SP,
Apr.26th, 2013 at Tokyo University of Agriculture Hiroaki Yoshimoto Ph.D.
50
Brasil. barbisan@ibb.unesp.br
FAU - Barbisan, Luis Fernando
AU - Barbisan LF
FAU - Scolastici, Clarissa
AU - Scolastici C
FAU -Miyamoto, Maristela
AU - Miyamoto M
FAU - Salvadori, Daisy Maria Favero
AU - Salvadori DM
FAU - Ribeiro, Lucia Regina
AU - Ribeiro LR
FAU - da Eira, Augusto Ferreira
AU - da Eira AF
FAU - de Camargo, Joao Lauro Viana
AU - de Camargo JL
LA - eng
PT - Journal Article
DEP - 20030930
PL - Brazil
TA - Genet Mol Res
JID - 101169387
SB - IM
EDAT- 2004/02/18 05:00
MHDA- 2004/02/18 05:00
AID - 0056 [pii]
PST - epublish
SO - Genet Mol Res 2003 Sep 30;2(3):295-308.
51. 関数で引用フォーマットを出す
例えば、以下のフォーマットで書き出したいとき。
【引用フォーマット】
吉本博明,〼江口文陽:ヒメマツタケ(Agaricus blazei Murr.) の現状と課題,〼応
用薬理,〼72(5),〼130-132(2007) ※ 〼は半角スペースを表す
【関数】
=B1&”:”&C1&”,〼”&D1&”,〼”&E1&”(”&F1&”),〼”&G1&”(”H1&”)”
※ &は、セルの文字を結合する演算子
※ “文字列”は、テキストを表示させる演算子
※ 最終著者名に&を付けたい時は、元セルで記載方法を変更
不可能ではない。しかし、煩雑=手間がかかる
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52. 文献管理ワークフロー比較
MS Excel 文献管理ソフト(Mendeley)
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データ入力
引用文献抽出
並べ替え
規定チェック
関数入力
一覧出力
本文に番号挿入
データ入力・自動取込
引用文献選択
規定選択・ワンクリック
本文挿入・ワンクリック
一覧出力・自動挿入
自動化率=時間短縮は圧倒的
53. Mendeley の利用法(1)
書誌データのインポート
Webで見つけた論文の書誌データは、
Googleであれ、有料DBであれ、ほとんどのデータが、
ブラウザに追加したインポートボタン、ワンクリックで
取り込むことができます。
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54. 文献管理ソフト
Software price language
Endnote (Win. Mac.) 49,800 (31,290 Sp.) Multilingual
Get A Ref (Win. Mac.) 20,790 (13,440:Sp.) Multilingual
Reference manager (Win.) 59,850 English
Bookends (Mac.) 8,500 English
Sente for iPad 2,300 English
Ref Works (Web based) $100 Multilingual
Mendeley Free English
Zotero (Win. Mac.) Free Multilingual
Ref EDITX (Mac.) Free English
Ref for Windows (Win.) Free Japanese
Sp.; Student price
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Hiroaki Yoshimoto Ph.D.
62. Mendeley の利用法(2)
Wordへの引用文献挿入
文献管理ソフトを導入する最大の理由
それは、Wordとの連携機能の利用でしょう。
正確に書くことが求められる引用文献情報を
さらに早く作成することで、
本来の論文執筆に注力できます。
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63. Mendeley desktop Tools→Install MS Word Plugin
ワンクリックでWordにプラグインがインストールされる
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65. 文献情報挿入方法まずWord画面で
Insert Citation を
クリックする
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挿入したい箇所をク
65
① リックして
②
③ Go To Medeley を
クリックする
66. Mendeleyで
④
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66
挿入したい論文を
クリックして
Send Citaion to
Word Processor を
クリック
⑤