Implementarea practica, pe probe recoltate din abator, a diagnosticului prin PCR in timp real privind contaminarea cu Salmonella

2. DDEETTEECCTTIIAA PPRREEZZEENNTTEEII
SSAALLMMOONNEELLLLAA sspppp
IINN PPRROODDUUSSEE DDEE OORRIIGGIINNEE
AAVVIIAARRAA PPRRIINN rrPPCCRR
VViirrggiilliiaa PPooppaa11,, EEdduuaarrdd MMaarriiuuss CCaappllaann11,, JJeenniiccaa BBuuccuurr22,,
MMaarriiaann CCuullcceessccuu11,, GGhheeoorrgghhee SSttrraattuullaatt11,,22
11SSNN IInnssttiittuuttuull PPaasstteeuurr SSAA,, 22FFAARRMMAAVVEETT SSAA..
IINNTTAALLNNIIRREEAA TTRRIIMMEESSTTRRIIAALLAA AA
SSOOCCIIEETTAATTIIII MMEEDDIICCIILLOORR VVEETTEERRIINNAARRII IINN PPAATTOOLLOOGGIIAA
AAVVIIAARRAA SSII AA AANNIIMMAALLEELLOORR MMIICCII DDIINN RROOMMAANNIIAA
AACCAADDEEMMIIAA DDEE SSTTIIIINNTTEE AAGGRRIICCOOLLEE SSII SSIILLVVIICCEE
““GGHHEEOORRGGHHEE IIOONNEESSCCUU –– SSIISSEESSTTII””
AAUULLAA MMAAGGNNAA
BBuuccuurreessttii 2255 sseepptteemmbbrriiee 22001144

3. SSaallmmoonneellllaa
““BBaacciilllluuss//EEbbeerrtthheellllaa ttyypphhii”” –– 11888800;;
““BBaacciilllluuss ssuuiippeessttiiffeerr”” -- 11888855
TTeeoobbaalldd
SSmmiitthh
11885599--11993344
DDaanniieell EEllmmeerr
SSaallmmoonn
11885500--11991144
KKaarrll JJoosseepphh
EEbbeerrtthh
11883355--11992266

4. SSAALLMMOONNEELLLLAA //
SSAALLMMOONNEELLOOZZEE
11995599 –– VV.. SSttooeenneessccuu
11996633 –– VV.. SSttooeenneessccuu,, SS.. SSaanndduulleessccuu,, CC.. VViioorr
11996655 –– SS.. BBeemm,, GG.. CCiioorrtteeaa,,EE.. MMaarrcceeaa,, RR.. GGaavvrriillaa
11997722 –– EE.. NNiiccuulleessccuu ((AAvvrraamm)),, SS.. SSaanndduulleessccuu,, GG.. PPaauunneessccuu,, EE.. MMaannoolleessccuu
11997766 –– EE.. GGoorrggaann,, CC.. LLaasslloo
11997777 –– SS.. SSaanndduulleessccuu,, VV..MMiihhaallaacchhee
11997799 –– VV.. RRuussuu,, RR.. DDoorroobbaannttuu
11998800 –– VV.. TTeeuussddeeaa
11998811 –– II..VV.. PPaattrraassccuu
11998833 –– MM.. SSiiddddiiqquuee,, MM.. NNeegguutt,, II.. BBeerrcceeaa,, GG.. SSttrraattuullaatt
11998866 –– OO.. SSiiccooee,, MM.. RRuussuu
11999944 –– GG.. SSttrraattuullaatt
11999955 –– DD.. DDaanneess eett aall..
11999988 –– VV.. PPooppaa,, MM.. BBoorrccaa,, DD.. DDaanneess,, DD.. NNiittaa,, EE.. AAvvrraamm,, II.. SSaanndduu,, MM.. GGrruuiiaa,, MM.. DDaanneess
22000033 –– AA.. SSttaanniiccaa
22000077 –– MM.. VVaanngghheellee,, HH.. CCoossttee,, MM.. IIoonneessccuu,, II.. SSaanndduu
22000088 –– AA.. UUnnggvvaarrii
22001144 –– MM.. RRaadduuttaa
RR.. CClleeppaa……
LLPPAA CClliinncceennii:: MM.. MMiihhaallaacchhee,, FF.. EEffttiimmiiee,, AA.. PPrreeddaa,, LL.. DDrraagghhiiaa
11996677 -- VVeerrddeess NN; 11997788 –– II..MMaannooiiuu,, SS.. NNeemmtteeaannuu; 11998811 –– VV..SSttaanneessccuu,, WW..KKlleemmmm,, CC.. LLaasslloo;
11998811 –– CC.. BBeerrbbiinnsscchhii,, CC.. FFaauurr,, GG.. OOnnttaannuu; 11998855 -- EEOO BBuuccuurr
RReevviissttaa ddee ccrreesstteerreeaa aanniimmaalleelloorr
RReevv.. ddee zzooootteehhnniiee ssii mmeeddiicciinnaa vveetteerriinnaarraa
LLuuccrraarriillee II..CC..VV..BB.. PPaasstteeuurr
SSttuuddiiii ssii cceerrcceettaarrii ddee mmeedd.. vveett..
LLuuccrraarrii ssttiiiinnttiittiiffiiccee FFMMVV
RReevv.. RRoomm.. MMeedd.. VVeett..
TTeezzee ddee ddooccttoorraatt FFMMVV

7. TTEEHHNNIICCII PPCCRR
- aammpplliiffiiccaarree ccllaassiiccaa –– ccoonnttrrooll ppoosstt--aammpplliiffiiccaarree
pprriinn ggeell--eelleeccttrrooffoorreezzaa ((eenndd--ppooiinntt))
-- aammpplliiffiiccaarree iinn ttiimmpp rreeaall ((ssppeeccttrrooffoottoommeettrriiccaa)) ––
ccoonnttrrooll iinn ttiimmppuull rreeaaccttiieeii
-- SSyybbrr GGrreeeenn
-- TTaaqqmmaann –– mmoonnoo,, mmuullttiipprriimmeerr // mmuullttiissoonnddaa

8. STANDARDE IISSOO// RREEGGLLEEMMEENNTTAARRII
SSAALLMMOONNEELLLLAA,, PPCCRR
- EENN IISSOO 66557799::22000022 –– MMiiccrroobbiioollooggyy ooff ffoooodd aanndd aanniimmaall ffeeeeddiinngg ssttuuffffss –– HHoorriizzoonnttaall mmeetthhoodd ffoorr
tthhee ddeetteeccttiioonn ooff SSaallmmoonneellllaa sspppp..
-- RReegguullaammeennttuull CCEE 22007733//22000055 pprriivviinndd ccrriitteerriiiillee mmiiccrroobbiioollooggiiccee ppeennttrruu pprroodduusseellee aalliimmeennttaarree
-- IISSOO//TTSS 2200883366::22000055
MMiiccrroobbiioollooggiiee ddeess aalliimmeennttss——RRééaaccttiioonn ddee ppoollyymméérriissaattiioonn eenn cchhaaîînnee ((PPCCRR)) ppoouurr llaa rreecchheerrcchhee
ddee mmiiccrroo--oorrggaanniissmmeess ppaatthhooggèènneess ddaannss lleess aalliimmeennttss——EEssssaaiiss ddee ppeerrffoorrmmaannccee ddeess
tthheerrmmooccyycclleeuurrss
IISSOO 2200883377::22000066
MMiiccrroobbiioollooggiiee ddeess aalliimmeennttss——RRééaaccttiioonn ddee ppoollyymméérriissaattiioonn eenn cchhaaîînnee ((PPCCRR)) ppoouurr llaa ddéétteeccttiioonn
ddeess mmiiccrroo--oorrggaanniissmmeess ppaatthhooggèènneess ddaannss lleess aalliimmeennttss——EExxiiggeenncceess rreellaattiivveess àà llaa pprrééppaarraattiioonn
ddeess éécchhaannttiilllloonnss ppoouurr llaa ddéétteeccttiioonn qquuaalliittaattiivvee
IISSOO 2200883388::22000066
MMiiccrroobbiioollooggiiee ddeess aalliimmeennttss——RRééaaccttiioonn ddee ppoollyymméérriissaattiioonn eenn cchhaaîînnee ((PPCCRR)) ppoouurr llaa ddéétteeccttiioonn
ddeess mmiiccrroo--oorrggaanniissmmeess ppaatthhooggèènneess ddaannss lleess aalliimmeennttss——EExxiiggeenncceess rreellaattiivveess àà ll’’aammpplliiffiiccaattiioonn eett
àà llaa ddéétteeccttiioonn ppoouurr lleess mméétthhooddeess qquuaalliittaattiivveess
IISSOO 2222117744::22000055
MMiiccrroobbiioollooggiiee ddeess aalliimmeennttss——RRééaaccttiioonn ddee ppoollyymméérriissaattiioonn eenn cchhaaîînnee ((PPCCRR)) ppoouurr llaa rreecchheerrcchhee
ddee mmiiccrroo--oorrggaanniissmmeess ppaatthhooggèènneess ddaannss lleess aalliimmeennttss——EExxiiggeenncceess ggéénnéérraalleess eett ddééffiinniittiioonnss
IISSOO 2222111188::22001111
MMiiccrroobbiioollooggiiee ddeess aalliimmeennttss——RRééaaccttiioonn ddee ppoollyymméérriissaattiioonn eenn cchhaaîînnee ((PPCCRR)) ppoouurr llaa ddéétteeccttiioonn eett
llaa qquuaannttiiffiiccaattiioonn ddeess mmiiccrroo--oorrggaanniissmmeess ppaatthhooggèènneess ddaannss lleess aalliimmeennttss——CCaarraaccttéérriissttiiqquueess ddee
ppeerrffoorrmmaannccee
IISSOO 2222111199::22001111

9. DDEETTEECCTTIIAA SSAALLMMOONNEELLLLAA sspppp
PPRRIINN RREEAALL TTIIMMEE PPCCRR
((qqPPCCRR //RReeTTiiPPCCRR//rrPPCCRR))
-- PPOOSS:: IIPP--CCDD--BBMM--331166
- mmeettooddaa PPCCRR iinn ttiimmpp rreeaall iinn ccaarree ssuunntt uuttiilliizzaattii ccoonnccoommiitteenntt ddooii fflluuoorrooffoorrii,, uunnuull
pprriinn ccaarree eessttee sseemmnnaallaatt // ddeetteeccttaatt AADDNN--uull ssppeecciiffiicc SSaallmmoonneellllaa sspppp,, iiaarr cceell ddee--aall
ddooiilleeaa sseemmnnaalliizzeeaazzaa pprreezzeennttaa // aabbsseennttaa iinnhhiibbiittoorriilloorr iinn rreeaaccttiiee
- aammpplliiffiiccaattoorr ssppeeccttrrooffoottoommeettrriicc ccaarree eessttee eecchhiippaatt ppeennttrruu ddeetteeccttiiaa
ccoonnccoommiitteennttaa aa ddoouuaa eemmiissiiii ddee fflluuoorreesscceennttaa llaa 552222 nnmm ssii llaa 555533 nnmm..
- lliimmiittaa ddee ddeetteeccttiiee aa kkiittuulluuii eessttee ddee ≤≤ 55 ccòòppiiii AADDNN;; ttoottuussii lliimmiittaa ddee ddeetteeccttiiee
ddeeppiinnddee ddee mmaattrriicceeaa pprroobbeeii,, ggrraadduull ddee pprroocceessaarree,, eexxttrraaccttiiaa AADDNN ssii ccoonnttiinnuuttuull
iinn AADDNN..
-kkiittuull aa ffoosstt vvaalliiddaatt ssii cceerrttiiffiiccaatt ddee AAOOAACC ((nnrr.. lliicceennttaa 004411110033)) ssii ddee MMiiccrroovvaall
((RRQQAA22000088LLRR2222))

10. DDEETTEECCTTIIAA SSAALLMMOONNEELLLLAA sspppp
PPRRIINN RREEAALL TTIIMMEE PPCCRR
((qqPPCCRR //RReeTTiiPPCCRR//rrPPCCRR))
MMeettooddaa rrPPCCRR ((aammpplliiffiiccaarree PPCCRR iinn ttiimmpp rreeaall)) ccuu ssoonnddaa TTaaqqmmaann pprriinn uuttiilliizzaarreeaa kkiittuulluuii ccoommeerrcciiaall „„SSuurree
FFoooodd PPaatthhooggeenn SSaallmmoonneellllaa PPlluuss VV”” ((vvaalliiddaatt MMiiccrroosseeqq ssii AAOOAACC))::
PPrroobbee:: pprroobbee ccuullttuurraa bbaacctteerriiaannaa ddee pprreeiimmbbooggaattiirree iinn BBPPWW ((BBuuffffeerreedd ppeeppttoonnee wwaatteerr)),, ddee 2200 oorree,,
oobbttiinnuuttee iinn LLaabboorraattoorruull ddee bbaacctteerriioollooggiiee –– IIPPaasstteeuurr,, ddiinn pprroobbee ccoommuunnee ccaarrnnee ppaassaarree
EExxttrraaccţţiiee AADDNN:: ccuu ttrruussaa QQIIAAaammpp DDNNAA MMiinnii KKiitt ((QQiiaaggeenn –– 5511330044,, ccff.. pprroottooccoolluulluuii ppeennttrruu bbaacctteerriiii))..
PPCCRR:: ccuu kkiittuull SSuurree FFoooodd PPaatthhooggeenn SSaallmmoonneellllaa PPlluuss VV ((rrBBiioopphhaarrmm -- SS55111111VV,, ccff.. pprroottooccoolluulluuii kkiittuulluuii))..
MMaarrttoorr((ii)) ppoozziittiivv((ii)):: mmaarrttoorr ppoozziittiivv ddiinn kkiitt;; mmaarrttoorr ddee eexxttrraaccttiiee -- eexxttrraacctt AADDNN ddiinnttrr--oo ttuullppiinnaa iizzoollaattaa iinn
22001133 ddee SSaallmmoonneellllaa sspppp ((ccoodd 77339966)),, oobbttiinnuutt ccuu kkiittuull QQiiaaggeenn;; mmaarrttoorr ddee eexxttrraaccttiiee -- eexxttrraacctt AADDNN ddiinnttrr--oo
ttuullppiinnaa iizzoollaattaa iinn 22001133 ddee SSaallmmoonneellllaa sspppp ((ccoodd 77339966)),, oobbttiinnuutt pprriinn lliizzaa tteerrmmiiccaa..
MMaarrttoorr((ii)) nneeggaattiivv((ii)):: aammeesstteeccuull ddee rreeaaccttiiee ddiinn kkiitt ((rreeaaggeennttiiii ppeennttrruu aammpplliiffiiccaarree,, ffaarraa AADDNN));; eexxttrraacctt AADDNN
ddiinnttrr--oo ttuullppiinnaa ddee EEsscchheerriicchhiiaa ccoollii ssttaannddaarrdd ((CC11aa GGEE HHeeaalltthhccaarree))..
AAmmpplliiffiiccaattoorr ssppeeccttrrooffoottoommeettrriicc:: MMxx33000055PP ((SSttrraattaaggeennee)).. SSooffttwwaarree MMxxPPrroo vv44..0011 -- 22000077 ((SSttrraattaaggeennee))..

11. DDEETTEECCTTIIAA SSAALLMMOONNEELLLLAA sspppp
PPRRIINN RREEAALL TTIIMMEE PPCCRR
((qqPPCCRR //RReeTTiiPPCCRR//rrPPCCRR))

12. DDEETTEECCTTIIAA SSAALLMMOONNEELLLLAA sspppp
PPRRIINN RREEAALL TTIIMMEE PPCCRR
((qqPPCCRR //RReeTTiiPPCCRR//rrPPCCRR))
Judet Nr. ferme Nr.probe Nr.probe + % probe +
A 9 40 18 45
B 1 4 1 25
C 1 4 1 25
D 4 17 11 65
15 65 31 48

13. DDEETTEECCTTIIAA SSAALLMMOONNEELLLLAA sspppp
PPRRIINN RREEAALL TTIIMMEE PPCCRR
((qqPPCCRR //RReeTTiiPPCCRR//rrPPCCRR))
11.. IInnssttrruummeenntt ppeennttrruu pprrooggrraammeellee ddee
aauuttooccoonnttrrooll
22.. RRaappiidd –– mmaaxxiimm 2244 ddee oorree ddee llaa pprriimmiirreeaa
pprroobbeelloorr
33.. SSeennssiibbiilliittaattee,, ssppeecciiffiicciittaattee,, rroobbuusstteettee
iinnaallttee

14. CCOONNTTRROOLL
DDEEZZIINNFFEECCTTAANNTTII // AANNTTIISSEEPPTTIICCEE