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Biotecnología El desarrollo de la ciencia  básica y el entendimiento  de los procesos que  gobiernan la biología  y a los seres vivos es fundamental.
Las tecnologías de ADN recombinante constituye una mezcla de técnicas, que permiten, la  fragmentación , la  separación ,  secuenciación ,  hibridación  de ácidos nucleicos, clonaje de ADN y la ingeniería genética .
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En los siguientes dibujos puede verse como actuarían estas enzimas.   En este esquema se indica el lugar en el que corta la enzima de restricción. Se aprecia la actuación en ambas hebras. En este esquema se ve el resultado de la actuación de la enzima de restricción. Ha quedado rota la molécula de ADN, quedando unos  bordes cohesivos  por donde puede unirse este ADN, con otro aunque sea de una especie diferente
Molécula A Molécula B Digestión de ambas moléculas con la  misma enzima de restricción,  BamHI Mezclar Tratar con ADN-ligasa ADN recombinante Extremos  cohesivos
 
las secuencias de reconocimiento de las enzimas de restricción frecuentemente tienen 6 pares de bases. Algunas enzimas como EcoRI y HindIII escinden el ADN dando como resultado extremos “pejagosos”. Las enzimas de restricción generalmente se obtienen de bacterias y su nombre deriva del nombre científico de esas bacterias: Hpal es de  Hemophilus parainfluenzae;  EcoRI es de E.coli y HindIII es de  Hemophilus influenzae
 
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Separación de los fragmentos de ADN (electroforesis)
Las bandas de ADN serán invisibles a menos que el ADN esté marcado o teñido de alguna manera. Un método sensible de tinción del ADN consiste en sumergir el gel después de la electroforesis en el colorante bromuro de etidio que cuando se encuentra unido al DNA, es fluorescente con luz ultravioleta. Para marcar moléculas de ADN aisladas se utiliza la enzima  polinucleótido quinasa  para transferir un P 32  hasta el extremo 5’ de cada hebra de ADN
Electroforesis en gel de ADN En la figura  (a)  se muestra  Diagrama de un aparato de gel vertical que muestra sus componentes  (b)   Equipo comercial de electroforesis en gel.  (c)  Carril que contiene una serie de fragmentos de ADN de tamaño conocido. Los números indican el número de pares de pases que contiene cada fragmento. Los fragmentos más pequeños se desplazan una mayor distancia. El gel de la derecha muestra los fragmentos que se originan cuando el fago lambda es digerido con la enzima de restricción  Hind  III.  
Electroforesis de DNA 20 min
Secuenciación de una molécula de ADN Se desarrollaron métodos que permitieron determinar de manera simple y rápida la secuencia nucleotídica de cualquier fragmento de ADN purificado. Uno de los métodos más utilizados es el de Maxam y Gilbert o también conocido como el método químico.   Este proceso se inicia con la obtención de un conjunto de moléculas de ADN de doble hebra marcadas en un extremo con P 32. en la primera etapa las hebras de ADN se disocian y se someten a un tratamiento suave con un agente químico que destruye una de las cuatro bases. Solo se destruye una de las bases, al azar.   Esto genera distintos fragmentos de ADN de distintas longitudes, que reflejan los lugares en que se produjo la destrucción de la base.
 
Los fragmentos se separan en un gel y se detectan por autorradiografía. Para determinar la secuencia completa, se realizan procedimientos similares a cuatro muestras separadas de la misma molécula de ADN, utilizando compuestos químicos que rompan el ADN de forma preferente por  T  en la primera muestra, por  C  en la segunda, por  G  en la tercera y por  A  en la cuarta. Los fragmentos resultantes son separados en carriles paralelos del mismo gel, obteniéndose un patrón de bandas de ADN radiactivas a partir de las cuales se lee la secuencia de ADN.
__ __ __  __  __ __  __ __ __ __  __ __ __ __  __  Secuenciación de ADN  Método químico de Maxam y Gilbert   T  C  G  A  La secuenciación del ADN permite  determinar de manera simple y rápida la  La secuencia nucleotídica.  T  C   G  A   Al realizar la electroforesis se obtienen  un patrón de bandas de ADN radiactivas a partir de las cuales se lee la secuencia. La lectura es del extremo 5’ a 3’ ( desde abajo hacia a arriba). En este caso la secuencia seria  5’-  A G TT A G CC TT A GG C T -3’  
electroforesis       
Hibridación de ácidos nucleicos. Cuando se tienen una doble hélice que se disocia en dos hebras separadas, estas se pueden volver a renaturalizar o hibridizar, siempre que ambas cadenas tengan una secuencia de nucleótidos complementarias. Para hibridizar se requiere un fragmento puro de una cadena sencilla de ADN cuya secuencia sea complementaria a la del ácido nucleico (ADN o ARN) que se desea detectar. El ADN debe estar marcado radiactivamente. La molécula de ADN de cadena sencilla utilizada de esta forma como indicador se denomina sonda de ADN .
Clonaje de ADN Mediante esta técnica un fragmento de ADN que contiene un gen de interés  se inserta en el genoma de ADN purificado de un plásmido o virus. Por ejemplo es posible unir, en el tubo de ensayo, un fragmento de ADN que contiene un gen humano con el cromosoma de un virus bacteriano, e introducir la nueva molécula de ADN  recombinante  en la célula bacteriana. El plásmido o virus (vector) utilizado de esta forma se conoce como vector de clonaje, y se dice que el ADN propagado mediante inserción en él se ha clonado.
Clonaje de AdN Plásmido
Librerías de ADN Para clonar un gen se empieza construyendo una librería de ADN, una colección de fragmentos de ADN, clonado. La genoteca puede construirse utilizando como vector tanto virus como plásmidos, y en general se mantienen en una población de células bacterianas.
[object Object],gen de resistencia  a la ampicilina Los vectores plasmídicos utilizados son pequeñas moléculas circulares de ADN de doble hebra. Los vectores se cortan con una enzima de restricción, y los fragmentos se añaden a los plásmidos cortados y se cierran, formando moléculas circulares de ADN recombinante. Son unidas mediante la enzima ADN ligasa. 2 Extremos cohesivos Plásmido 3 Molécula de ADN recombinante
Ensamblaje Tecnología de DNA recombinante Endonucleasas El DNA se corta con enzimas Ligasa T4 El DNA se une a plásmidos
El siguiente paso consiste en introducir las moléculas circulares de ADN recombinante en bacterias; se dice que estas células han sido transfectadas con el plásmido. A medida que estas células se dividen , los plásmidos también se van replicando y produciendo un enorme de copias de ADN circulares que contienen el ADN foráneo.
Muchos plásmidos bacterianos transportan genes que les confieren resistencia a los antibióticos, una propiedad que sirve para seleccionar las células que han sido transfectadas con éxito; si la bacteria se hace crecer en presencia del antibiótico, solamente sobrevivirán las células que contengan los plásmidos. Cada una de las bacterias que fue transfectada contendrá, en general, un fragmento de ADN insertado diferente; este inserto será heredado por las células de la progenie de la bacteria que formaran una pequeña colonia en una placa de cultivo.
 
El procedimiento de cortar el genoma completo de una célula mediante enzimas de restricción y colocarlo en diferentes plásmidos constituye una librería genómica. Por lo tanto la colección completa de plásmidos se denomina una  librería de ADN genómica.
Genotecas (librería de ADN genómica Genoma de hongos:  44 millones de pares de bases Huesped:  Escherichia coli Vector:  Bacteriófagos capacidad: 20 mil pares de bases Genoma humano:  3000 millones de pares de bases Huesped:   Saccharomyces cerevisiae Vector:  YAC (cromosoma artificial de levadura) MegaYAC (capacidad: 1 millón de pares de bases )
Aplicaciones de la ingeniería genética Obtención de proteínas de interés médico, comercial, etc... (insulina, hormona del crecimiento, factores de coagulación antes se Obtenían a partir de los tejidos que las producen o fluidos corporales) aplicaciones médicas
Obtención de vacunas recombinantes (aternativa al uso de organismos patógenos inactivos) Aplicaciones de la ingeniería genética aplicaciones médicas La levadura fabrica las  proteínas víricas  con poder inmunológico Inyección de proteínas  víricas en un chimpancé plásmido  bacteriano Integración del  plásmido híbrido  en el núcleo de una célula de levadura ADN Extracción del ADN  del virus
Conocimiento previo de la secuencia de ADN enfermo Mediante ingeniería genética se construye una sonda de ADN, marcada (marcaje fluorescente), con la secuencia complementaria del ADN enfermo ADN enfermo ADN sano ADN complementario del ADN enfermo Diagnóstico de enfermedades de origen genético ADN de la persona que se quiere diagnosticar ¿Hibridación? ¿No hibridación? Renaturalización del ADN con la sonda fluorescente Desnaturalización del ADN Aplicaciones de la ingeniería genética aplicaciones médicas Si aparecen bandas fluorescentes demuestra que la persona presenta la anomalía DIAGNÓSTICO Biochip Microarray DNAchip
Aplicaciones de la ingeniería genética en agricultura Plantas transgénicas Transgénesis = introducción de ADN extraño en un genoma, de modo que se mantenga estable de forma hereditaria y afecte a todas las células en los organismos multicelulares. Agrobacterium tumefaciens  es patógena de plantas.Produce tumores tumores célula vegetal Proliferación de hormonas crecimiento. Se forman tumores en las zonas de la lesión Plásmido Ti núcleo cromosoma cromosoma Agrobacterium inductor de tumores contiene oncogenes (genes onc) Ingeniero genético natural  tras sustitución de genes onc por genes de interés
Aplicaciones de la ingeniería genética en animales Clonación de animales  (TRANSFERENCIA NUCLEAR DE  CÉLULAS EMBRIONARIAS )
Clonan cerdos destinados a trasplantar sus órganos a humanos   La empresa escocesa PPL Therapeutics logra retirar de los cerditos el gen que provoca el rechazo en transplantes a humanos  "alfa 1,3 galactosil transferasa"  Enero 2002. AP Photo/Roanoke Times, Gene Dalton (IDEAL-EFE)  Paso importante en favor del xenotrasplante (transferencia de células u órganos de una especie a otra) Ayudará a superar la escasez de órganos humanos para hacer trasplantes de todo tipo
 

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Biotecnologas

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  • 2. Biotecnología El desarrollo de la ciencia básica y el entendimiento de los procesos que gobiernan la biología y a los seres vivos es fundamental.
  • 3. Las tecnologías de ADN recombinante constituye una mezcla de técnicas, que permiten, la fragmentación , la separación , secuenciación , hibridación de ácidos nucleicos, clonaje de ADN y la ingeniería genética .
  • 4.
  • 5.
  • 6. En los siguientes dibujos puede verse como actuarían estas enzimas. En este esquema se indica el lugar en el que corta la enzima de restricción. Se aprecia la actuación en ambas hebras. En este esquema se ve el resultado de la actuación de la enzima de restricción. Ha quedado rota la molécula de ADN, quedando unos bordes cohesivos por donde puede unirse este ADN, con otro aunque sea de una especie diferente
  • 7. Molécula A Molécula B Digestión de ambas moléculas con la misma enzima de restricción, BamHI Mezclar Tratar con ADN-ligasa ADN recombinante Extremos cohesivos
  • 8.  
  • 9. las secuencias de reconocimiento de las enzimas de restricción frecuentemente tienen 6 pares de bases. Algunas enzimas como EcoRI y HindIII escinden el ADN dando como resultado extremos “pejagosos”. Las enzimas de restricción generalmente se obtienen de bacterias y su nombre deriva del nombre científico de esas bacterias: Hpal es de Hemophilus parainfluenzae; EcoRI es de E.coli y HindIII es de Hemophilus influenzae
  • 10.  
  • 11.
  • 12. Separación de los fragmentos de ADN (electroforesis)
  • 13. Las bandas de ADN serán invisibles a menos que el ADN esté marcado o teñido de alguna manera. Un método sensible de tinción del ADN consiste en sumergir el gel después de la electroforesis en el colorante bromuro de etidio que cuando se encuentra unido al DNA, es fluorescente con luz ultravioleta. Para marcar moléculas de ADN aisladas se utiliza la enzima polinucleótido quinasa para transferir un P 32 hasta el extremo 5’ de cada hebra de ADN
  • 14. Electroforesis en gel de ADN En la figura (a) se muestra Diagrama de un aparato de gel vertical que muestra sus componentes (b) Equipo comercial de electroforesis en gel. (c) Carril que contiene una serie de fragmentos de ADN de tamaño conocido. Los números indican el número de pares de pases que contiene cada fragmento. Los fragmentos más pequeños se desplazan una mayor distancia. El gel de la derecha muestra los fragmentos que se originan cuando el fago lambda es digerido con la enzima de restricción Hind III.  
  • 16. Secuenciación de una molécula de ADN Se desarrollaron métodos que permitieron determinar de manera simple y rápida la secuencia nucleotídica de cualquier fragmento de ADN purificado. Uno de los métodos más utilizados es el de Maxam y Gilbert o también conocido como el método químico. Este proceso se inicia con la obtención de un conjunto de moléculas de ADN de doble hebra marcadas en un extremo con P 32. en la primera etapa las hebras de ADN se disocian y se someten a un tratamiento suave con un agente químico que destruye una de las cuatro bases. Solo se destruye una de las bases, al azar. Esto genera distintos fragmentos de ADN de distintas longitudes, que reflejan los lugares en que se produjo la destrucción de la base.
  • 17.  
  • 18. Los fragmentos se separan en un gel y se detectan por autorradiografía. Para determinar la secuencia completa, se realizan procedimientos similares a cuatro muestras separadas de la misma molécula de ADN, utilizando compuestos químicos que rompan el ADN de forma preferente por T en la primera muestra, por C en la segunda, por G en la tercera y por A en la cuarta. Los fragmentos resultantes son separados en carriles paralelos del mismo gel, obteniéndose un patrón de bandas de ADN radiactivas a partir de las cuales se lee la secuencia de ADN.
  • 19. __ __ __ __ __ __ __ __ __ __ __ __ __ __ __ Secuenciación de ADN Método químico de Maxam y Gilbert   T C G A La secuenciación del ADN permite determinar de manera simple y rápida la La secuencia nucleotídica. T C G A Al realizar la electroforesis se obtienen un patrón de bandas de ADN radiactivas a partir de las cuales se lee la secuencia. La lectura es del extremo 5’ a 3’ ( desde abajo hacia a arriba). En este caso la secuencia seria 5’- A G TT A G CC TT A GG C T -3’  
  • 21. Hibridación de ácidos nucleicos. Cuando se tienen una doble hélice que se disocia en dos hebras separadas, estas se pueden volver a renaturalizar o hibridizar, siempre que ambas cadenas tengan una secuencia de nucleótidos complementarias. Para hibridizar se requiere un fragmento puro de una cadena sencilla de ADN cuya secuencia sea complementaria a la del ácido nucleico (ADN o ARN) que se desea detectar. El ADN debe estar marcado radiactivamente. La molécula de ADN de cadena sencilla utilizada de esta forma como indicador se denomina sonda de ADN .
  • 22. Clonaje de ADN Mediante esta técnica un fragmento de ADN que contiene un gen de interés se inserta en el genoma de ADN purificado de un plásmido o virus. Por ejemplo es posible unir, en el tubo de ensayo, un fragmento de ADN que contiene un gen humano con el cromosoma de un virus bacteriano, e introducir la nueva molécula de ADN recombinante en la célula bacteriana. El plásmido o virus (vector) utilizado de esta forma se conoce como vector de clonaje, y se dice que el ADN propagado mediante inserción en él se ha clonado.
  • 23. Clonaje de AdN Plásmido
  • 24. Librerías de ADN Para clonar un gen se empieza construyendo una librería de ADN, una colección de fragmentos de ADN, clonado. La genoteca puede construirse utilizando como vector tanto virus como plásmidos, y en general se mantienen en una población de células bacterianas.
  • 25.
  • 26. Ensamblaje Tecnología de DNA recombinante Endonucleasas El DNA se corta con enzimas Ligasa T4 El DNA se une a plásmidos
  • 27. El siguiente paso consiste en introducir las moléculas circulares de ADN recombinante en bacterias; se dice que estas células han sido transfectadas con el plásmido. A medida que estas células se dividen , los plásmidos también se van replicando y produciendo un enorme de copias de ADN circulares que contienen el ADN foráneo.
  • 28. Muchos plásmidos bacterianos transportan genes que les confieren resistencia a los antibióticos, una propiedad que sirve para seleccionar las células que han sido transfectadas con éxito; si la bacteria se hace crecer en presencia del antibiótico, solamente sobrevivirán las células que contengan los plásmidos. Cada una de las bacterias que fue transfectada contendrá, en general, un fragmento de ADN insertado diferente; este inserto será heredado por las células de la progenie de la bacteria que formaran una pequeña colonia en una placa de cultivo.
  • 29.  
  • 30. El procedimiento de cortar el genoma completo de una célula mediante enzimas de restricción y colocarlo en diferentes plásmidos constituye una librería genómica. Por lo tanto la colección completa de plásmidos se denomina una librería de ADN genómica.
  • 31. Genotecas (librería de ADN genómica Genoma de hongos: 44 millones de pares de bases Huesped: Escherichia coli Vector: Bacteriófagos capacidad: 20 mil pares de bases Genoma humano: 3000 millones de pares de bases Huesped: Saccharomyces cerevisiae Vector: YAC (cromosoma artificial de levadura) MegaYAC (capacidad: 1 millón de pares de bases )
  • 32. Aplicaciones de la ingeniería genética Obtención de proteínas de interés médico, comercial, etc... (insulina, hormona del crecimiento, factores de coagulación antes se Obtenían a partir de los tejidos que las producen o fluidos corporales) aplicaciones médicas
  • 33. Obtención de vacunas recombinantes (aternativa al uso de organismos patógenos inactivos) Aplicaciones de la ingeniería genética aplicaciones médicas La levadura fabrica las proteínas víricas con poder inmunológico Inyección de proteínas víricas en un chimpancé plásmido bacteriano Integración del plásmido híbrido en el núcleo de una célula de levadura ADN Extracción del ADN del virus
  • 34. Conocimiento previo de la secuencia de ADN enfermo Mediante ingeniería genética se construye una sonda de ADN, marcada (marcaje fluorescente), con la secuencia complementaria del ADN enfermo ADN enfermo ADN sano ADN complementario del ADN enfermo Diagnóstico de enfermedades de origen genético ADN de la persona que se quiere diagnosticar ¿Hibridación? ¿No hibridación? Renaturalización del ADN con la sonda fluorescente Desnaturalización del ADN Aplicaciones de la ingeniería genética aplicaciones médicas Si aparecen bandas fluorescentes demuestra que la persona presenta la anomalía DIAGNÓSTICO Biochip Microarray DNAchip
  • 35. Aplicaciones de la ingeniería genética en agricultura Plantas transgénicas Transgénesis = introducción de ADN extraño en un genoma, de modo que se mantenga estable de forma hereditaria y afecte a todas las células en los organismos multicelulares. Agrobacterium tumefaciens es patógena de plantas.Produce tumores tumores célula vegetal Proliferación de hormonas crecimiento. Se forman tumores en las zonas de la lesión Plásmido Ti núcleo cromosoma cromosoma Agrobacterium inductor de tumores contiene oncogenes (genes onc) Ingeniero genético natural tras sustitución de genes onc por genes de interés
  • 36. Aplicaciones de la ingeniería genética en animales Clonación de animales (TRANSFERENCIA NUCLEAR DE CÉLULAS EMBRIONARIAS )
  • 37. Clonan cerdos destinados a trasplantar sus órganos a humanos La empresa escocesa PPL Therapeutics logra retirar de los cerditos el gen que provoca el rechazo en transplantes a humanos &quot;alfa 1,3 galactosil transferasa&quot; Enero 2002. AP Photo/Roanoke Times, Gene Dalton (IDEAL-EFE) Paso importante en favor del xenotrasplante (transferencia de células u órganos de una especie a otra) Ayudará a superar la escasez de órganos humanos para hacer trasplantes de todo tipo
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