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系統的レビュー研究計画書作成ワークショップ
第三回 Ovid Medline検索 文献管理
兵庫県立尼崎総合医療センター
Hospital Care Research Unit
辻本 啓/片岡 裕貴
復習:系統的検索とは?
~~を高めた検索のこと
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2
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3
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4
今回の目標
• 系統的レビューのためのOvid Medlineのデータ
ベース選択ができる
• Ovidを用いて統制語を探すことができる
• 先行文献を参考にOvidを用いて統制語、キー
ワードで検索できる
• 自分のRQについてOvid MEDLINE で大まかな検
索式をつくることができる
• 簡単なBackground sectionを作ることができる
• 文献管理ソフトを用いて文章に参考文献をつける
ことができる
5
Ovidは検索できるデータベースがいっぱい!
6
下にスクロール
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MEDLINEが出
てきます
MEDLINEがいっぱい!
7
MEDLINEがいっぱい!
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Ovid MEDLINE(R)
In-Process & Other Non-Indexed Citations
8
MEDLINEでもadvanced search
ゼロから作るのは大変なので
また似たP、似たIのレビューの組み合わせ
で検索式を作りましょう!
9
先人に学ぶ
10
Advanced searchを選択
11
12
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2.こちらに出てきます
13
0.ここは気にしなくてOK!
知らない記号がたくさん $?
14
MEDLINE via Ovidのゆらぎの演算子
前方一致 $, $n (=n文字目までの制限でゆらぎを許容)
ワイルドカード #, ?(#は何かwordが必ず入るが、?はなくてもOK)
例:
disease$=disease, diseases など
dog$2= dog, dogs (≠doghouse)
wom#n= woman, women
colo?r= color, colour
15
MEDLINE via Ovidの位置演算子
近接演算子:ADJ もしくは スペース=その語順で近接している語をhit
近接演算子:ADJn=語順不同でn語以内に近接しているものをhit
例:blood pressure = blood adj pressure
例:continuous adj2 dialysis =continuous peritoneal
dialysis, continuous venoveous dialysis etc.
16
ストップワード
出現頻度の高い一般的な語(例:the, or, of
など)は、ノイズを低減するため、検索対象
から除外されることがあります。
それらの語をストップワードと呼びます。
※仕様が結構変わるらしいので、ストップワードであるこ
とが分からなかったら試しに検索してみましょう
17
MEDLINE® 2016 Database Guide
(参考)応用編:変な結果だったら、簡単に動作確認
何故かマニュアルと違う動作をすることがあります
18
MEDLINE® 2016 Database Guide
“.mp.”って?
Multi-purposeの略
いろいろなフィールドをいっぺんに
フリーワード検索してくれる便利機能
→迷ったらこれで!
対象はtitle, original title, abstract, name of
substance word, subject heading wordなど
詳しくは
http://demo.ovid.com/demo/documents/d
ocs/English/MP%20fields.pdf
19
“.tw.”って?
フリーワードでタイトルを検索してくれる
先行研究がこれなら今回はこれでOK!
20
“/” スラッシュ
スラッシュで統制語を示します
21
用語の説明1:フィルターとは?
検索で研究デザインを指定する式のこと
→Cochrane reviewなどの系統的レビューで
使われるものには、RCT用があります
他は系統的レビューでは普通は使いません!
プロトコルができた段階で、必要であればコピ
ペで追加してもらいます!
今回は学習不要です。
22
用語の説明2:variant spellingsとは?
“tumour”と”tumor”
“hematoma”と”Haematoma”など
想定されるものがあれば or で加える
23
MeSHはどうやって検索する?
24
MeSHはどうやって検索する?
25
MeSHはどうやって検索する?ほとんど”explode”でOK
26
MeSHはどうやって検索する? ほとんどの場合すべてのsubheadingを選択
27
MeSHはどうやって検索する? 検索式に挿入
28
MeSHはどうやって検索する?
29
文献がたくさん!
30
文献管理ソフト
31
文献管理ソフトの使い方
どれも使ったことない人は、
講義スライドの終わりにのMendeley資料を
添付しています。
系統的レビューでは必須です。
32
文献管理ソフトが手に入ったら
レビュー計画書の
簡単なBackgroundを3-5文程度で書いてみ
ましょう!
今回は日本語です!
33
背景の構造 (PICOの例の計画書のテンプレ)
背景
1. 対象となる疾患について(リファレンスを
つけてください)
2. 対象となる介入方法について
3. 介入方法が有効なメカニズム
4. 本レビューを実施する意義
34
背景(PICOの例)
(病態が人類にとって”relevant”な理由=疫学データ)
(例: 世界での発生率) (引用 1).
(例: 致死率など) (引用 2).
近年_(I: 介入内容) _は___のようなを効果が言われおり
臨床試験で__アウトカムを改善したことが報告されている(引用 1) .
系統的レビューとして (P: 病態)に対する(I: 介入内容)_を評価したも
のは報告されていない.
それゆえ、今回(PI(E)CO)での系統的レビューを行った.
<文献リスト (bibliography)>
1. Kataoka Y. (2013) History of Tigers. Plos Ama, 8(12) 45-49
2. Tsujimoto H. (1998) Quality of Amagasaki Chanpon. Ama J
Clin Epidemiol 58 (3) 859-862
35
片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー@尼崎 グループワークシートを一部改変
背景1
対象となる疾患の疫学データ
(例: Pの世界での実数 etc.) (引用 1).
36
背景2
その介入について
近年 (I: 介入内容) の臨床試験で介入
の効果が報告されている (引用 1).
37
背景3
その介入が有効となるメカニズム
(I: 介入内容) は△△を予防することによ
り○○のアウトカムを改善すると考えられ
ている (引用 2).
38
背景4
本レビューを実施する意義
系統的レビューとして (P: 病態)に対する_
(I: 介入内容) を評価したものは報告され
ていない.
それゆえ、今回(PICO) に関して
系統的レビューを行った.
39
簡単なBackgroundができたら
文献管理ソフトを使って
引用文献をつけます
指定引用形式:Vancouver
※趣旨は引用をつける練習なので、
Backgroundは簡単でいいです。
40
Vancouver式を知らなくてもOK
文献管理ソフトで選択できます!
41
引用文献をつけてみる (例)
(病態が人類にとって”relevant”な理由=疫学データ)
(例: 世界での発生率) (引用 1).
(例: 致死率など) (引用 2).
近年_(I: 介入内容) __ の臨床試験で~の効果が報告されている
(引用 1).
系統的レビューとして (P: 病態)に対する_(I: 介入内容)_を評価した
ものは報告されていない.
それゆえ、今回(PI(E)CO)での系統的レビューを行った.
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1. Kataoka Y. (2013) History of Tigers. Plos Ama, 8(12) 45-49
2. Tsujimoto H. (1998) Quality of Amagasaki Chanpon. Ama J
Clin Epidemiol 58 (3) 859-862
42
片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー@尼崎 グループワークシートを一部改変
今回の目標
• 系統的レビューのためのOvid Medlineのデータ
ベース選択ができる
• Ovidを用いて統制語を探すことができる
• 先行文献を参考にOvidを用いて統制語、キー
ワードで検索できる
• 自分のRQについてOvid MEDLINE で大まかな検
索式をつくることができる
• 簡単なBackground sectionを作ることができる
• 文献管理ソフトを用いて文章に参考文献をつける
ことができる
43
参考資料
1. Lefebvre C, Manheimer E, Glanville J. Chapter 6: Searching for studies. Box 6.4 d.
Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions Version 5.1.0 (updated March
2011). 2010. 1-46 p.
available from http://community.cochrane.org/handbook
2. 『看護研究者・医療研究者のための系統的文献検索概説』諏訪敏幸 近畿病院図書室協議会 2013
3. Ovid Online Training http://www.ovid.com/site/support/training.jsp#tabs1
“MEDLINE”
https://www.brainshark.com/wkovid/vu?pi=zGizVDdlez34XJz0&cmpid=Brainshark:MedlineI
ntro
“Special techniques in MEDLINE”
https://www.brainshark.com/wkovid/vu?pi=zFvzXHuX2z34XJz0&cmpid=Brainshark:Medline
SpecialTechniques
4. 片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー@尼崎 グループワークシート
5. MEDLINE® 2016 Database Guide
available from http://access.ovid.com/training/ja/docs/FieldGuide_MEDLINE_JPN.pdf
6. Ovid 講習会ビデオシリーズ
http://access.ovid.com/training/ja/
44
[参考スライド] Mendeleyの使い方
たくさんある中でfreeのMendeleyを紹介
宿題はどのソフトを使ってもいいです!
45
参考スライドの目標 (Mendeleyの場合)
• 文献管理ソフトをインストールできる
• Wordへのプラグインをインストールでき
る
• Word内で文章へのcitationを入れること
ができる
• 参考文献リスト (Bibliography) を入れる
ことができる
46
1. Mendeleyのダウンロード
使い方はたくさん動画があります。
50
日本語 https://www.youtube.com/channel/UCyftgRDCOa09RYl63QBFPdg
英語
https://www.y
outube.com/u
ser/MendeleyR
esearch
MendeleyとMS wordを使った引用文献リスト作り方
51
https://w
ww.youtu
be.com/w
atch?v=zk
rVbBSrK_
w
[参考] PubMedについて
52
同じデータベース
(MEDLINEを検索している)
→ほとんど同じと考えてください
欠点:
1. 検索に使える演算子が少ない
複雑なfree word検索が必要な場合は検索の難易度が上がる
or ノイズが増える
2. 検索結果のダウンロードが面倒(件数上限があり、前半/
後半など、分けてやらないといけない)
MEDLINE via PubMedでの注意
1. 近接演算子はつかえない
2. ワイルドカードは使えない
3. 前方一致は*のみ(400パターンまで許容)
4. Automatic Term Mappingが作動
5. “and”や”or”などは必ず大文字で使用
53
Automatic Term Mappingとは
free word(=統制語でない言葉)をそのままPubMed
で入れると生じる便利な機能(系統的レビューの
本番の検索では邪魔)
語尾に[tiab]などのサーチタグをつける
ことでoffできる
※また、フレーズ検索は””で囲わないとこ
の機能でバラバラにされて検索される
54
さらにPubmedを知りたい方は
PubMed Tutorial
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial
/cover.html
東大図書館PubMedの使い方
http://www.lib.m.u-
tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf
ユサコ株式会社 MEDLINE簡易マニュアル
http://www.dl.itc.u-
tokyo.ac.jp/manual/medline_manual_1010.pdf
山梨大学付属図書館
PubMedとOvid MEDLINEの比較一覧
http://www.lib.yamanashi.ac.jp/db/ovid_ma/ovid%
20medline%20vs%20pubmed%20for%20Yamanashi
%20Univ_200712.pdf
55

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滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理

Notas del editor

  1. デモ
  2. あとはMendeleyの言う通りに