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PubMed es una interface de búsqueda
creada dentro de la base de datos de
Medline, permitiendo el acceso a
usuarios profesionales de la salud y el
público en general.
Las ventajas que brinda es poder
obtener información gratuita de Medline,
encontrar artículos completos de
algunos artículos, al mismo tiempo
textos gratuitos en formato electrónico,
realizar búsquedas clínicas usando
filtros metodológicos.
El sistema PubMed ofrece una variedad de modos de
búsqueda para acercarse a las necesidades individuales de
los usuarios.
Para realizar una búsqueda básica en la base de datos que
maneja Pubmed basta con solo ingresar unos pocos términos
en el formulario de la página de inicio.
A continuación encontraremos la pantalla principal cuando
ingresamos a la página web.
En la pantalla inicial se encuentran rasgos cuatros áreas muy bien
especificadas:
1. Área de ingreso de texto: es el área donde se deben ingresar los términos
de
búsqueda.
2. Accesos a otras bases de datos: en el que se encuentran acceso directos a
otras
bases del NCBI como Nucleotide, Protein, Genome, Structure, OMIM, Journals,
etc.
3. Barra de Funciones de PubMed: está formado por una serie de
herramientas que
nos permitirán el refinamiento y la edición de las estrategias de búsqueda. En
ella
tenemos: límites, índice/vista previa, historial, portapapeles y Detalles de las
estrategias de búsqueda.
4. Acceso a servicios especiales de PubMed: este área de la pantalla siempre
acompañará al usuario en las diferentes instancias de búsqueda y cambiará las
opciones según el lugar donde se encuentre. En la página de inicio permite
acceder a
servicios tales como: Información General sobre PubMed, la Ayuda de PubMed,
Para ingresar alguna palabra de búsqueda solo debemos ingresar el término
en el cuadro de texto y luego presionar enter o darle click en Go que se esta
al lado del cuadro donde ingresamos la palabra; existen algunas
condiciones para poder ingresar los términos en el casillero de texto que
debemos tener en cuenta.
 Para ingresar varios términos de búsqueda debemos separarlos con un
espacio intermedio y luego presionar enter o darle click en Go.
 Para realizar una búsqueda por autores debe ser ingresado primero por el
apellido, generar un espacio y luego ingresar las iniciales o nombres sin
signos de puntuación.
 Realizar una búsqueda de títulos de Journals o revistas se puede ingresar de
la siguiente manera:
Completos: por ejemplo New England Journal of Medicine
Abreviados según el formato MEDLINE, por ejemplo: N Engl J Med
Números del International Standard Serial Number (ISSN): 0028-
4793
Si el nombre de la revista es igual a algún término MeSH, por ejemplo Gene Therapy,
Science o Cell, PubMed buscará el término como MeSH y como texto libre y no como
nombre de publicación. Para evitar lo antedicho habría que agregar el nombre del
campo, por ejemplo Science [TA], con lo cual sí será buscado en dicho campo para evitar
que sea buscado en todos los campos existentes. El número de ISSN no es recomendado
Luego de ingresar los términos en el cuadro de texto y oprimimos Go se
activan los mecanismos internos de búsqueda, encargadas de posibilitar la
recuperación de citas.
Mapeo automático de términos
Los términos que ingresamos en el formulario de búsqueda son comparados
(en este orden) contra las siguientes tablas de términos : MeSH (Medical
Subject Headings), Publicaciones, lista de frases y el índice de autores.
1. Tabla de traducción a MeSH
La tabla de traducción MeSH contiene los términos MeSH ,
Subencabezados, los sinónimos de los MeSH. Si se encuentra un
resultado será buscado como término MeSH y como palabra de texto. Por
ejemplo, si ingresamos vitamin h en el formulario de búsqueda, PubMed lo
traducirá en la siguiente búsqueda: ("Biotin"[MeSH Terms] OR vitamin h[Text
Word]). Vitamin h es un sinónimo para el término MeSH Biotin.
2. Tabla de traducción de Publicaciones
La tabla de traducción de publicaciones contiene el nombre
completo de la revista, la abreviatura de MEDLINE, y el
número ISSN. Por ejemplo, si ingresa el título new england
journal of medicine en el formulario, PubMed lo traducirá a: "N
Engl J Med"[Journal Name].
3. Lista de frases
Si no se encuentra resultados en las tablas MeSH y de
Publicaciones, PubMed consulta la lista de frases generada a
punto de partida de todos los componentes de la bases de
datos, ej., cold compresses.
4. Índice de Autores
Si no se encuentra la frase en los puntos anteriores y es una
palabra seguida de una o dos letras, PubMed chequea el
índice de autores. Si no se encuentran resultados, PubMed
descompone la frase y repite el proceso anterior hasta
encontrar resultados. Si los resultados no son positivos
combinara los términos mediante AND y buscará en todos los
campos.
Para realizar una búsqueda por frases en PubMed, el
buscador lo primero que realiza es una consulta de
frases y agrupa los términos en frases lógicas.
Se puede forzar la búsqueda agregándole comillas a la
frase que ingresamos, esto hace que se anule el mapeo
automático de términos.
Las citas recuperadas de la base MEDLINE son
mostradas en la página de resultados de PubMed,
además todas las citas pueden ser mostradas en otros
formatos disponibles:
Summary (default)
Brief
Abstract
Citation
MEDLINE
XML
UI List
LinkOut
ASN. 1
Related Articles
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Cited in Books
CancerChrom Links
Domain Links
3D Domain Links
GEO DataSet Links
Gene Links
Gene (Gene RIF) Links
Genome Links
Project Links
GENSAT Links
GEO Profile Links
HomoloGene Links
Nucleotide Links Protein Links
OMIA Links
OMIM (calculated) Links
OMIM (cited) Links
BioAssay Links
Compound Links
Compound via MeSH
Substance links
Substance via MeSH
PMC Links
Cited in PMC
PopSet Links
Probe Links
Protein Links
SNP Links
Structure Links
UniGene Links
UniSTS Links
Para ver las citas en otros formatos debe seguir los
siguientes pasos:
Cita Individual – darle click en el link que
contiene el nombre del autor para mostrar el
formato de Abstract para la cita.
Todas las citas - seleccione un formato del
menú desplegable “Display” y podrá ver todas las
citas en el formato seleccionado.
Citas seleccionadas - Clickee en las casillas
de verificación, a la izquierda de cada cita que
desea ver, y luego seleccione de la opción Display,
el formato en el cual desea verlas.
• Summary : Autor, título, Referencia bibliográfica, status de la cita, idioma (si
no es inglés), tipo de publicación si review o retracted publication, la leyenda
"No abstract available" y los PubMed y MEDLINE Unique Identifiers.
• Brief : - Autor y primeras 10 letras del
título con el PMID.
• Abstract: Referencia bibliográfica, status de la cita, título, indicación si el
artículo no está en inglés, autores, Domicilio del autor, Resumen ( si está
disponible), tipo de publicación (excepto Journal Article), PubMed y
MEDLINE Unique Identifiers. Es el más utilizado y el que generalmente se
selecciona para ver las citas recuperadas y luego imprimirlas o guardarlas.
• Citation: Referencia bibliográfica, status de la cita, título, indicación si el
artículo no está en inglés, autores, Domicilio del autor, Resumen ( si está
disponible), tipo de publicación (excepto Journal Article), PubMed y
MEDLINE Unique Identifiers, y Términos MeSH. La siguiente referencia
bibliográfica carece de resúmen (Abstract).
• MEDLINE : Cita completa con etiquetas de dos letras que identifican cada
campo. Este formato es útil para la utilización de software de manejo
bibliográfico como el EndNote.
PudMed brinda varias opciones para observar los
resultados además del formato de visualización.
En la figura se puede observar que a parte de la
opción de display existen otras tres opciones
en la página de resultados.
1. Show: esta opción permite elegir el número de referencias a
visualizar por página. Podemos elegir hasta un máximo de
500 referencias por página. Por defecto Pubmed muestra los
primeros 20 resultados de cada búsqueda. Es Conveniente
indicar un número mayor a la cantidad de citas obtenidas
para que los resultados bajen en una sola pantalla. El único
inconveniente es que si son muchas, puede haber demoras
al descargarlas.
2. Sort by: esta opción permite ordenar los resultados de
acuerdo a los siguientes criterios:
 Fecha de Publicación
 Primer Autor
 Último Autor
 Revista
3. Send to: permite guardar los resultados de una
búsqueda. A su vez dentro de esta opción
tenemos:
 Text
 File
 Printer
 Clipboard
 E-mail
 RSS-Feed
 Order
A continuación se detallara las opciones que son mas útiles:
o Text: permite visualizar los resultados en forma de texto, sin barras
de opciones, ni menú adicionales, es una opción eficiente para
poder realizar una impresión, es conveniente determinar el formato
de visualización seleccionándolo desde el Display.
o File: esta opción permite que las citas seleccionadas o todas
las citas guardarlas en un archivo de texto, es necesario
indicar el nombre y el lugar especifico donde se requiere
guardar ( solo se puede guardas hasta 10.000 citas).
o Clipboard: Esta opción permite guardar los
resultados encontrados en el porta papeles que
nos brinda PubMed. Para realizar este
procedimiento debemos seleccionar las citas que
deseamos almacenar, haciendo un click en el
cuadro que se encuentra a la izquierda de cada
cita, si se quieren guardar todas no se debe
seleccionar ninguna.
Luego presionar Send to Clipboard y las
referencias quedarán guardadas en el portapeles.
Para recuperarlas, simplemente haga clic en la
opción clipboard de la barra de opciones, y
aparecerán las citas que fueron seleccionadas y
guardadas en el portapapeles.
PubMed en esta opción permite guardar hasta
500 referencias, permaneciendo en el portapapeles
durante ocho horas de inactividad del navegador.
o E-mail: las citas seleccionadas o todas pueden ser enviadas a una casilla de
correo electrónico, sin importar a forma de visualización en la que se
encuentre, ya sea en formato de texto o html. Sólo es necesario ingresar la
dirección de correo electrónico del destinatario, también es posible enviar los
resultados de una búsqueda.
oOrder: permite encargar
una copia en texto
completo del artículo. Pero
esto es posible sólo a
través de una biblioteca, y
tiene un costo extra.
En la opción Select Page permite generar el número de
páginas que se requiere ver, la cantidad mínima es de 20
registros por página, en la figura podermos observar que los
resultados son mostrados en pestañas.
 Review (1): en esta solapa se utiliza un filtro, que permite
seleccionar a las revisiones en el campo Tipo de Publicación de
MedLine.
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filtro de búsqueda.
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REFERENCIA
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PubMed Central
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Revista.
 http://www.slideshare.net/munevarjuan/como-hacer-una-busqueda-
correctamente-en-pubmed
 http://bib.us.es/salud/aprendizaje_investigacion/common/Guias_pdf/Pu
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 http://pendientedemigracion.ucm.es/info/seas/invest/formac/06.Busque
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COMO REALIZAR UNA BUSQUED BASICA EN PUBMED

  • 1.
  • 2. PubMed es una interface de búsqueda creada dentro de la base de datos de Medline, permitiendo el acceso a usuarios profesionales de la salud y el público en general. Las ventajas que brinda es poder obtener información gratuita de Medline, encontrar artículos completos de algunos artículos, al mismo tiempo textos gratuitos en formato electrónico, realizar búsquedas clínicas usando filtros metodológicos.
  • 3. El sistema PubMed ofrece una variedad de modos de búsqueda para acercarse a las necesidades individuales de los usuarios. Para realizar una búsqueda básica en la base de datos que maneja Pubmed basta con solo ingresar unos pocos términos en el formulario de la página de inicio. A continuación encontraremos la pantalla principal cuando ingresamos a la página web.
  • 4.
  • 5. En la pantalla inicial se encuentran rasgos cuatros áreas muy bien especificadas: 1. Área de ingreso de texto: es el área donde se deben ingresar los términos de búsqueda. 2. Accesos a otras bases de datos: en el que se encuentran acceso directos a otras bases del NCBI como Nucleotide, Protein, Genome, Structure, OMIM, Journals, etc. 3. Barra de Funciones de PubMed: está formado por una serie de herramientas que nos permitirán el refinamiento y la edición de las estrategias de búsqueda. En ella tenemos: límites, índice/vista previa, historial, portapapeles y Detalles de las estrategias de búsqueda. 4. Acceso a servicios especiales de PubMed: este área de la pantalla siempre acompañará al usuario en las diferentes instancias de búsqueda y cambiará las opciones según el lugar donde se encuentre. En la página de inicio permite acceder a servicios tales como: Información General sobre PubMed, la Ayuda de PubMed,
  • 6. Para ingresar alguna palabra de búsqueda solo debemos ingresar el término en el cuadro de texto y luego presionar enter o darle click en Go que se esta al lado del cuadro donde ingresamos la palabra; existen algunas condiciones para poder ingresar los términos en el casillero de texto que debemos tener en cuenta.  Para ingresar varios términos de búsqueda debemos separarlos con un espacio intermedio y luego presionar enter o darle click en Go.  Para realizar una búsqueda por autores debe ser ingresado primero por el apellido, generar un espacio y luego ingresar las iniciales o nombres sin signos de puntuación.  Realizar una búsqueda de títulos de Journals o revistas se puede ingresar de la siguiente manera: Completos: por ejemplo New England Journal of Medicine Abreviados según el formato MEDLINE, por ejemplo: N Engl J Med Números del International Standard Serial Number (ISSN): 0028- 4793 Si el nombre de la revista es igual a algún término MeSH, por ejemplo Gene Therapy, Science o Cell, PubMed buscará el término como MeSH y como texto libre y no como nombre de publicación. Para evitar lo antedicho habría que agregar el nombre del campo, por ejemplo Science [TA], con lo cual sí será buscado en dicho campo para evitar que sea buscado en todos los campos existentes. El número de ISSN no es recomendado
  • 7. Luego de ingresar los términos en el cuadro de texto y oprimimos Go se activan los mecanismos internos de búsqueda, encargadas de posibilitar la recuperación de citas. Mapeo automático de términos Los términos que ingresamos en el formulario de búsqueda son comparados (en este orden) contra las siguientes tablas de términos : MeSH (Medical Subject Headings), Publicaciones, lista de frases y el índice de autores. 1. Tabla de traducción a MeSH La tabla de traducción MeSH contiene los términos MeSH , Subencabezados, los sinónimos de los MeSH. Si se encuentra un resultado será buscado como término MeSH y como palabra de texto. Por ejemplo, si ingresamos vitamin h en el formulario de búsqueda, PubMed lo traducirá en la siguiente búsqueda: ("Biotin"[MeSH Terms] OR vitamin h[Text Word]). Vitamin h es un sinónimo para el término MeSH Biotin.
  • 8. 2. Tabla de traducción de Publicaciones La tabla de traducción de publicaciones contiene el nombre completo de la revista, la abreviatura de MEDLINE, y el número ISSN. Por ejemplo, si ingresa el título new england journal of medicine en el formulario, PubMed lo traducirá a: "N Engl J Med"[Journal Name]. 3. Lista de frases Si no se encuentra resultados en las tablas MeSH y de Publicaciones, PubMed consulta la lista de frases generada a punto de partida de todos los componentes de la bases de datos, ej., cold compresses. 4. Índice de Autores Si no se encuentra la frase en los puntos anteriores y es una palabra seguida de una o dos letras, PubMed chequea el índice de autores. Si no se encuentran resultados, PubMed descompone la frase y repite el proceso anterior hasta encontrar resultados. Si los resultados no son positivos combinara los términos mediante AND y buscará en todos los campos.
  • 9. Para realizar una búsqueda por frases en PubMed, el buscador lo primero que realiza es una consulta de frases y agrupa los términos en frases lógicas. Se puede forzar la búsqueda agregándole comillas a la frase que ingresamos, esto hace que se anule el mapeo automático de términos. Las citas recuperadas de la base MEDLINE son mostradas en la página de resultados de PubMed, además todas las citas pueden ser mostradas en otros formatos disponibles:
  • 10. Summary (default) Brief Abstract Citation MEDLINE XML UI List LinkOut ASN. 1 Related Articles Cited Articles Cited in Books CancerChrom Links Domain Links 3D Domain Links GEO DataSet Links Gene Links Gene (Gene RIF) Links Genome Links Project Links GENSAT Links GEO Profile Links HomoloGene Links Nucleotide Links Protein Links OMIA Links OMIM (calculated) Links OMIM (cited) Links BioAssay Links Compound Links Compound via MeSH Substance links Substance via MeSH PMC Links Cited in PMC PopSet Links Probe Links Protein Links SNP Links Structure Links UniGene Links UniSTS Links
  • 11. Para ver las citas en otros formatos debe seguir los siguientes pasos: Cita Individual – darle click en el link que contiene el nombre del autor para mostrar el formato de Abstract para la cita. Todas las citas - seleccione un formato del menú desplegable “Display” y podrá ver todas las citas en el formato seleccionado. Citas seleccionadas - Clickee en las casillas de verificación, a la izquierda de cada cita que desea ver, y luego seleccione de la opción Display, el formato en el cual desea verlas.
  • 12. • Summary : Autor, título, Referencia bibliográfica, status de la cita, idioma (si no es inglés), tipo de publicación si review o retracted publication, la leyenda "No abstract available" y los PubMed y MEDLINE Unique Identifiers.
  • 13. • Brief : - Autor y primeras 10 letras del título con el PMID.
  • 14. • Abstract: Referencia bibliográfica, status de la cita, título, indicación si el artículo no está en inglés, autores, Domicilio del autor, Resumen ( si está disponible), tipo de publicación (excepto Journal Article), PubMed y MEDLINE Unique Identifiers. Es el más utilizado y el que generalmente se selecciona para ver las citas recuperadas y luego imprimirlas o guardarlas.
  • 15. • Citation: Referencia bibliográfica, status de la cita, título, indicación si el artículo no está en inglés, autores, Domicilio del autor, Resumen ( si está disponible), tipo de publicación (excepto Journal Article), PubMed y MEDLINE Unique Identifiers, y Términos MeSH. La siguiente referencia bibliográfica carece de resúmen (Abstract).
  • 16. • MEDLINE : Cita completa con etiquetas de dos letras que identifican cada campo. Este formato es útil para la utilización de software de manejo bibliográfico como el EndNote.
  • 17. PudMed brinda varias opciones para observar los resultados además del formato de visualización. En la figura se puede observar que a parte de la opción de display existen otras tres opciones en la página de resultados.
  • 18. 1. Show: esta opción permite elegir el número de referencias a visualizar por página. Podemos elegir hasta un máximo de 500 referencias por página. Por defecto Pubmed muestra los primeros 20 resultados de cada búsqueda. Es Conveniente indicar un número mayor a la cantidad de citas obtenidas para que los resultados bajen en una sola pantalla. El único inconveniente es que si son muchas, puede haber demoras al descargarlas. 2. Sort by: esta opción permite ordenar los resultados de acuerdo a los siguientes criterios:  Fecha de Publicación  Primer Autor  Último Autor  Revista
  • 19. 3. Send to: permite guardar los resultados de una búsqueda. A su vez dentro de esta opción tenemos:  Text  File  Printer  Clipboard  E-mail  RSS-Feed  Order
  • 20. A continuación se detallara las opciones que son mas útiles: o Text: permite visualizar los resultados en forma de texto, sin barras de opciones, ni menú adicionales, es una opción eficiente para poder realizar una impresión, es conveniente determinar el formato de visualización seleccionándolo desde el Display.
  • 21. o File: esta opción permite que las citas seleccionadas o todas las citas guardarlas en un archivo de texto, es necesario indicar el nombre y el lugar especifico donde se requiere guardar ( solo se puede guardas hasta 10.000 citas).
  • 22. o Clipboard: Esta opción permite guardar los resultados encontrados en el porta papeles que nos brinda PubMed. Para realizar este procedimiento debemos seleccionar las citas que deseamos almacenar, haciendo un click en el cuadro que se encuentra a la izquierda de cada cita, si se quieren guardar todas no se debe seleccionar ninguna. Luego presionar Send to Clipboard y las referencias quedarán guardadas en el portapeles. Para recuperarlas, simplemente haga clic en la opción clipboard de la barra de opciones, y aparecerán las citas que fueron seleccionadas y guardadas en el portapapeles. PubMed en esta opción permite guardar hasta 500 referencias, permaneciendo en el portapapeles durante ocho horas de inactividad del navegador.
  • 23.
  • 24. o E-mail: las citas seleccionadas o todas pueden ser enviadas a una casilla de correo electrónico, sin importar a forma de visualización en la que se encuentre, ya sea en formato de texto o html. Sólo es necesario ingresar la dirección de correo electrónico del destinatario, también es posible enviar los resultados de una búsqueda.
  • 25. oOrder: permite encargar una copia en texto completo del artículo. Pero esto es posible sólo a través de una biblioteca, y tiene un costo extra.
  • 26. En la opción Select Page permite generar el número de páginas que se requiere ver, la cantidad mínima es de 20 registros por página, en la figura podermos observar que los resultados son mostrados en pestañas.  Review (1): en esta solapa se utiliza un filtro, que permite seleccionar a las revisiones en el campo Tipo de Publicación de MedLine.  All (2): en esta solapa se muestran todos los resultados, sin ningún filtro de búsqueda.
  • 27. ICONOS UBICADOS A LA IZQUIERDA DE CADA REFERENCIA Existen 4 tipos de íconos que se pueden mostrar a la izquierda de cada referencia: Referencia sin resumen Referencia con resumen Texto completo disponible en forma gratuita a través de PubMed Central Texto completo disponible a través del sitio editor de la Revista.