1. Bảng 4. Chu trình nhiệt cho gen ITS
Bước Nhiệt
độ(o
C)
Thời gian Chu
kỳ
Khởi
động
94 4p 1
Biến tính 94 40s
35
Gắn mồi 55 1p
Kéo dài 72 1p
Ổn đinh 72 7p 1
Bảo quản 4 ∞
Bảng 5. Chu trình nhiệt cho gen matK
Bước Nhiệt
độ(o
C)
Thời gian Chu
kỳ
Khởi
động
94 60s 1
Biến tính 94 30s
35
Gắn mồi 52 20s
Kéo dài 72 50s
Ổn đinh 72 5p 1
Bảo quản 4 ∞
2.2.4.Tinh sạch sản phẩm PCR và giải trình tự
Sản phẩm PCR sau khi tinh sạch sẽ được gửi đi giải trình tự tại hãng Bioneer tại Hàn
Quốc
2.2.5.Phƣơng pháp phân tích số liệu
Các chuỗi DNA được so sánh và liên kết với nhau bằng chương trình BioEdit trình
(phiên bản 4.1.4). Cây phát sinh được xây dựng dựa trên trình tự ADN của vùng gen ITS và
gen matK bằng phương pháp tiết kiệm tối đa (MP) và Bayesian trên phần mềm PAUP
(version 4.0 beta 10).
Chƣơng 3. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.1. Tách chiết ADN tổng số
Chúng tôi đã tách chiết thành công 12 mẫu Codonopsis (xem Bảng 9)
Hình 5. Kết quả điện di ADN tổng số các mẫu Codonopsis trên gel agarose 1%,
marker 1kb
Bảng 6. Kết quả đo OD một số mẫu nghiên cứu
Mẫu A260/280 [ADN] µg/µl
C2 1,50 86,2
C4 1,63 108,9
C11 1,52 85,1