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Genética de microorganismos
Prof. Dra. Adriana Dantas
 Dificuldade de cruzamentos intergenéricos ou
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 Incompatibilidade que ocorre entre duas
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Protoplastos
   •células livres de parede celular
A ausência da parede: sistema útil
   •extração de organelas celulares
   •transferência gênica através da técnica de transformação
   genética – eletroporação
   •produção de novos genótipos por hibridação somática
 Em 1957 isolado de leveduras
 Células esféricas em ambientes osmóticos
 Totalmente desprovidas de parede celular
 Enzimas de isolamento: driselase, helicase,
  zimolase e Novozyn 234
       Constituídos por celulases e quitinases
   Utiliza-se micélio de fungos filamentosos, células
    de leveduras, conídios germinando ou conídios
    intactos
 Não deve causar rompimento do protoplasto
 Estabilizadores osmóticos em meio liquido

 Sal (KCl, NaCl, MgSO4)

 Açucar – sacarose

 Valores de 0,5M a 1M
 Dois processos
 Substância fusogênicia polietilenoglicol (PEG)
     Induzformação de agregados de células e
      formação de pontes citoplasmática entre elas
   Eletrofusão
     Células expostas a uma fonte de corrente alternada
      e ficam em linha como um colar de pérolas, em
      seguida um pulso de corrente continua é dado e há
      uma quebra reversível da membrana, permitindo a
      fusão.
Desenvolvimento de produtos de fusão em meio contendo Aneurina (esquerda) ou
inositol (direita), utilizando as técnicas de seleção. Protoplastos fundidos foram
semeadas em discos de celofane contendo os suplementos apropriados e incubados
a 25°C por 4 dias.
 Duas formas:
 Duas linhagens auxotróficas distintas
     Em média 105 celulas parentais
     Produtos da fusão recuperados em MM

   Seleção de produtos de fusão com mutantes a
    agentes inibidores
     Cloranfenicol   e eritromicina
Linhagem A                                           Linhagem B
Auxotrofica a-b-                                     Auxotrofica c-d-

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                                heterocário


                                   diploide




    Seleção para obter diploides (MM)



Anaçlise genetica igual ao ciclo parassexual
 Quebras das barreiras de incompatibilidade
 Interespecíficas:
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   Intergenéricas:
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Hibridação somática
Híbridos nucleares ou
citoplasmáticos
(cíbridos)

•fusões
interespecíficas ,                           Fusão
                            Perda de um     nuclear
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 1973 – Neurospora crassa – DNA isolado de
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 1978 – S. cerevisae, protoplastos de mutantes
  deficientes para leucina (leu-) receberam DNA
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 1979 – Plasmidio de E. coli carregando genes
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   Utiliza-se vetores com plasmidios bacterianos que
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   Para tanto, o DNA é tratado com enzimas de restrição
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    plasmidio da bacteria E. coli
   São selecionados e multiplicados na E. coli
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       protoplastos na presença de PEG e CaCl2, ou por eletroporação, são
        altamente receptivos ao DNA exógeno

   Absorção do DNA
       Colocação do DNA junto com os protoplastos é feita com PEG e CaCl2.
        PEG causa fusão celular com auxilio do CaCl2.

   DNA total – ação das nucleases é intensa e parte é degradada;
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   Inibiçãod as nucleases: espermidina, heparina
   Realizar tanto a mutagênese insercional aleatória, como também a
    mutagênese dirigida.
   Mutagênese dirigida permite a realização da superexpressão de um ou
    mais genes, ou também o silenciamento gênico, seja ele parcial ou
    completo.
   Técnicas utilizando protoplastos, Agrobacterium tumefaciens e biobalística
    permitem a superexpressão de um gene tanto por integração heteróloga ou
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   Técnicas baseadas no RNA são capazes de realizar o silenciamento gênico
    por meio de regulação pós-transcricional do mRNA.
   Silenciamento gênico parcial pode ser conseguido com a utilização do RNA
    antisense e RNA de interferência; já o silenciamento completo é possível
    utilizando a interrupção do gene em vetores que permitam a recombinação
    homóloga, via ribozimas e transposons.
   Usado plasmidios de E. coli que contem um ou mais genes empregados no
    processo de transformação

   Três destinos:
      Uma permuta entre o plasmidio carregando o gene, e o gene no
        cromossomo do fungo provoca a integração no sitio homologo, ficando
        então o cromossomo do fungo com o gene mutante e o plasmidio
        carregando o gene selvagem

        O plasmidio é incorporado em um outro local não homologo do
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         selvagem

        Por uma permuta dupla ou mesmo conversão gênica, o gene do fungo
         no plasmidio bacteriano substitui o gene mutante no cromossomo do
         hospedeiro
 Tipo padrão é o pan7-1
 Se duplicam independentemente dos
  cromossomos
 São instáveis, podendo dar
  pseudotransformação ou transformação
  abortiva
 Seleção é feita na regeneração dos
  protoplastos que receberam o DNA exógeno
   (A) Atividades biológicas do GFP-tagged variantes de proteína NUDE. Uma cepa (SF2-9) e
    thenudF7 ts mutante foram transformadas com genes indicados no vetor.
   Transformantes foram cultivadas por 3 d em meio completo (YAG) sem ou com 0,6 M KCl a 43
    ° C, que é uma temperatura restritiva para o mutante nudF7.
   A cor de conídios na cepa ΔnudE é semelhante ao de cor acastanhada do micélio.
   A cor de conídios na cepa nudF7 é amarelo.
   (B) GFP:: NUDE variantes são expressos em níveis semelhantes. Extratos de proteína total
    foram feitas a partir de uma cepa ΔnudE transformado com genes indicados no vetor .
   Dois transformantes diferentes foram usados ​para cada GFP:: variante NUDE. Proteínas (12 mg
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Fusão de protoplastos em fungos

  • 1. UERGS – Bento Gonçalves Genética de microorganismos Prof. Dra. Adriana Dantas
  • 2.  Dificuldade de cruzamentos intergenéricos ou interespecificos  Incompatibilidade que ocorre entre duas linhagens por impedimento de anastomose das hifas  Possibilidade de produzir células sem parede celular (protoplasto) e a fusão destas celulas antes incompativeis  Cruzamentos entre especies ou generos distintos de fungos
  • 3. Protoplastos: Protoplastos •células livres de parede celular A ausência da parede: sistema útil •extração de organelas celulares •transferência gênica através da técnica de transformação genética – eletroporação •produção de novos genótipos por hibridação somática
  • 4.  Em 1957 isolado de leveduras  Células esféricas em ambientes osmóticos  Totalmente desprovidas de parede celular  Enzimas de isolamento: driselase, helicase, zimolase e Novozyn 234  Constituídos por celulases e quitinases  Utiliza-se micélio de fungos filamentosos, células de leveduras, conídios germinando ou conídios intactos
  • 5.  Não deve causar rompimento do protoplasto  Estabilizadores osmóticos em meio liquido  Sal (KCl, NaCl, MgSO4)  Açucar – sacarose  Valores de 0,5M a 1M
  • 6.
  • 7.  Dois processos  Substância fusogênicia polietilenoglicol (PEG)  Induzformação de agregados de células e formação de pontes citoplasmática entre elas  Eletrofusão  Células expostas a uma fonte de corrente alternada e ficam em linha como um colar de pérolas, em seguida um pulso de corrente continua é dado e há uma quebra reversível da membrana, permitindo a fusão.
  • 8. Desenvolvimento de produtos de fusão em meio contendo Aneurina (esquerda) ou inositol (direita), utilizando as técnicas de seleção. Protoplastos fundidos foram semeadas em discos de celofane contendo os suplementos apropriados e incubados a 25°C por 4 dias.
  • 9.
  • 10.  Duas formas:  Duas linhagens auxotróficas distintas  Em média 105 celulas parentais  Produtos da fusão recuperados em MM  Seleção de produtos de fusão com mutantes a agentes inibidores  Cloranfenicol e eritromicina
  • 11. Linhagem A Linhagem B Auxotrofica a-b- Auxotrofica c-d- Obtenção do protoplasto Fusão (PEG ou eletrofusão)
  • 12. Recuperação em MM heterocário diploide Seleção para obter diploides (MM) Anaçlise genetica igual ao ciclo parassexual
  • 13.  Quebras das barreiras de incompatibilidade  Interespecíficas:  Aspergillus nidulans x Aspergillus rugulosus  Obtenção de segregantes com cromossomos dos dois fungos  Intergenéricas:  Aspergillus x Penicillum; Candida tropicalis x Saccharomyces fibugera; S. cerevisiae x Schizossacharomyces pombe; S lipolytica x Pichia guillemondii
  • 14. Hibridação somática Híbridos nucleares ou citoplasmáticos (cíbridos) •fusões interespecíficas , Fusão Perda de um nuclear núcleo •intergenéricas entre parentais sexualmente compatíveis; •intergenéricos entre Cíbridos Synkarions parentais sexualmente (Híbridos incompatíveis. citoplasmáticos)
  • 15. Organelas celulares são transferidas para estudos de herança citoplasmatica  Obtenção de protoplastos anucleados e sua fusão com células nucleadas  Restauração da capacidade respiratória por ação de mitocôndrias  Biossíntese de produtos do metabolismo secundário  Obtenção de cariótipos moleculares  Transformação genética  Utilizados na separação e análise de cromossomos
  • 16.  1973 – Neurospora crassa – DNA isolado de linhagens selvagens transferidos para linhagensm deficiente para inositol  1978 – S. cerevisae, protoplastos de mutantes deficientes para leucina (leu-) receberam DNA de celulas de leu+  1979 – Plasmidio de E. coli carregando genes de levedura
  • 17. Células providas de espessa parede celular  Fungos filamentosos – micélio – nitrogênio liquido  Utiliza-se vetores com plasmidios bacterianos que carregam genes de fungos  Para tanto, o DNA é tratado com enzimas de restrição que quebram em pontos específicos e colocam o plasmidio da bacteria E. coli  São selecionados e multiplicados na E. coli  Plasmidio E.coli com fragmento contendo gene ga-2 de N. crassa; sintese de triptofano (trpC); arginina (argB); piridoxina (pyr-4); uracila (ura-5) de N.crassa, A. nidulans
  • 18. Em estado de competência  Conídios intactos ou germinados são tratado com acetato de íitio (0,1M)  Excelente estado de competência:  protoplastos na presença de PEG e CaCl2, ou por eletroporação, são altamente receptivos ao DNA exógeno  Absorção do DNA  Colocação do DNA junto com os protoplastos é feita com PEG e CaCl2. PEG causa fusão celular com auxilio do CaCl2.  DNA total – ação das nucleases é intensa e parte é degradada; proteção usando lipossomos  Inibiçãod as nucleases: espermidina, heparina
  • 19. Realizar tanto a mutagênese insercional aleatória, como também a mutagênese dirigida.  Mutagênese dirigida permite a realização da superexpressão de um ou mais genes, ou também o silenciamento gênico, seja ele parcial ou completo.  Técnicas utilizando protoplastos, Agrobacterium tumefaciens e biobalística permitem a superexpressão de um gene tanto por integração heteróloga ou por recombinação homóloga.  Técnicas baseadas no RNA são capazes de realizar o silenciamento gênico por meio de regulação pós-transcricional do mRNA.  Silenciamento gênico parcial pode ser conseguido com a utilização do RNA antisense e RNA de interferência; já o silenciamento completo é possível utilizando a interrupção do gene em vetores que permitam a recombinação homóloga, via ribozimas e transposons.
  • 20. Usado plasmidios de E. coli que contem um ou mais genes empregados no processo de transformação  Três destinos:  Uma permuta entre o plasmidio carregando o gene, e o gene no cromossomo do fungo provoca a integração no sitio homologo, ficando então o cromossomo do fungo com o gene mutante e o plasmidio carregando o gene selvagem  O plasmidio é incorporado em um outro local não homologo do cromossomo. O fungo fica com dois genes, um original mutante e outro selvagem  Por uma permuta dupla ou mesmo conversão gênica, o gene do fungo no plasmidio bacteriano substitui o gene mutante no cromossomo do hospedeiro
  • 21.  Tipo padrão é o pan7-1  Se duplicam independentemente dos cromossomos  São instáveis, podendo dar pseudotransformação ou transformação abortiva  Seleção é feita na regeneração dos protoplastos que receberam o DNA exógeno
  • 22.
  • 23. (A) Atividades biológicas do GFP-tagged variantes de proteína NUDE. Uma cepa (SF2-9) e thenudF7 ts mutante foram transformadas com genes indicados no vetor.  Transformantes foram cultivadas por 3 d em meio completo (YAG) sem ou com 0,6 M KCl a 43 ° C, que é uma temperatura restritiva para o mutante nudF7.  A cor de conídios na cepa ΔnudE é semelhante ao de cor acastanhada do micélio.  A cor de conídios na cepa nudF7 é amarelo.  (B) GFP:: NUDE variantes são expressos em níveis semelhantes. Extratos de proteína total foram feitas a partir de uma cepa ΔnudE transformado com genes indicados no vetor .  Dois transformantes diferentes foram usados ​para cada GFP:: variante NUDE. Proteínas (12 mg / pista) foram separados em 10% SDS-PAGE e immunoblotted com um anticorpo anti-GFP.