Doctorat sciences - Libre accès et archives ouvertes

Le libre accès :
pourquoi et
comment?
Doctorants
Dernière mise à jour : 26/10/2015 - Auteur : Frédérique Flamerie

Programme
1. Pourquoi le libre accès?
2. Les 2 voies du libre accès
› Green et gold
› Gold open access
› Green open acces
3. Contribuer au libre accès : HAL-UPMC
› HAL à l’UPMC
› Les services HAL : collection et page chercheur
4. Trouver des publications en libre accès

1. Pourquoi le libre accès?
https://www.youtube.com/watch?v=L5rVH1KGBCY

Coût de la documentation@ pour l’UPMC
+ de 2 000 000 €/an
Pour la France : env. 100 000 000€/an
Pourquoi le libre accès?

4 éditeurs en position dominante, dont la marge bénéficiaire oscille
entre 30 et 40%
Nb : sont considérés
les dpts « édition
scientifique » des
groupes
Chiffre
d’affaires
Nombre de revues publiées
Elsevier 2126 M£
(2013)
+ de 2000 dont 1600 indexées dans le Web of
Science
Springer 600 M€
(2011)
Science
Wiley-Blackwell 804,7 M€
(2011)
Science
Informa (Taylor &
Francis et Routledge)
367 M£
(2013)
Science
Sources : Libre accès à l’information scientifique et technique, Les grands éditeurs scientifiques
développent rapidement leurs catalogues de revues en Gold « Open Access », 19/12/2012
The Imaginary Journal of Poetic Economics

Avis du Comité d’éthique au CNRS sur le libre accès aux publications scientifiques (« open
access ») du 29 juin 2012, p. 4. Disponible sur : http://www.cnrs.fr/comets/IMG/pdf/007-
avis-oa-120629.pdf
« Le transfert du droit de l’auteur par abandon total de
ses droits patrimoniaux au profit des maisons d’édition
bloque la réutilisation automatique de ses œuvres sur
d’autres supports ou dans de futures compilations et
notamment le droit pour l'auteur de pouvoir réutiliser
partiellement le matériau qu'il a soumis (utilisation des
figures par exemple), et le droit de pouvoir déposer le
texte complet sur une archive ouverte, qu'elle soit
disciplinaire, institutionnelle ou nationale. »

Jonathan A. Eisen
« And this is when I experienced the horror of closed-
access publishing. For unlike my colleagues at major
research universities that have subscriptions to all
journals, I worked at a 300-person nonprofit research
institute with a small library. So there I was - a
scientist and a taxpayer - desperate to read the
results of work that I helped pay for and work that
might give me more knowledge than possessed by
our doctors. And yet either I could not get the papers
or I had to pay to read them without knowing if they
would be helpful. »
Eisen, J. A. PLoS Biology 2.0. PLoS Biol 6, e48 (2008)

Auteur:ElectronicInformationforLibraries-CC
Par « accès libre » à cette littérature, nous entendons sa mise à disposition
gratuite sur l’Internet public, permettant à tout un chacun de lire,
télécharger, copier, transmettre, imprimer, chercher ou faire un lien vers le
texte intégral de ces articles, les disséquer pour les indexer, s’en servir de
données pour un logiciel, ou s’en servir à toute autre fin légale, sans barrière
financière, légale ou technique autre que celles indissociables de l’accès et
l’utilisation d’Internet.
Texte complet en français sur Libre accès à l’information scientifique (INIST)

2. Les 2 voies du libre accès

Les 2 voies du libre accès
•Les chiffres qui montrent
notre politique en action
‣ Un chiffre
‣ Un autre chiffre
Green open access =
archives ouvertes
Publications déposées et
archivées sur des
serveurs tiers
Différents types de
publication, à différents
stades de publication
Gold open access =
revues en libre accès
Différents modèles
économiques : APC,
barrière flottante,
financement public,
etc.

2011
HAL-UPMC
1991
xxx.lanl.gov qui
deviendra arXiv
1997
CogPrints
2000
Création du
CCSD (CNRS)
2008
Loi NIH
(Etats-
unis)
1998
Cyberthèses
(Lyon II)
2001
HAL
TEL
2005
ARCHIMER
HAL-INRIA
HAL-INSERM
1999
Open Archives
Initiative
2000
PubMed
Central
2001
PLoS
Copernicus
2013
CCSD = unité
mixte
Monde
France
2013
Obligation
de dépôt
INRIA
1999
revues.org
2003
DOAJ
1993
Serveur de
preprints du
CERN
2013
Loi Allemagne
Politique FNS
(Suisse)
Politique FRS
(Belgique)
2014
Episciences.org
2012
Politique RCUK
(Royaume-Uni)
2002
BOAI
Par:StevenDePolo-CC-BY-source:Flickr

Gold open access :
la voie dorée

Developing an Effective Market for Open Access Article Processing
Charges - Bo-Christer Björk and David Solomon - CC-BY
Gold open access

 Modèle hybride
Dans une revue sur abonnement, l’article peut être en lecture
gratuite, moyennant le paiement d’un supplément (Lancet :
5000$)…
… le coût des abonnements est-il diminué pour autant (double
dipping)? - voir ici
… les articles sont-ils bien en libre accès? - voir là
Ex : ACS AuthorChoice, Sponsorship Option (Elsevier), Online Open (Wiley-
Blackwell)
 Les articles en lecture gratuite
Articles des prix Nobel dans Cell
 Les revues « prédateurs »
La liste de Jeffrey Beall, bibliothécaire à l’Université de Colorado :
Potential, possible, or probable predatory scholarly open-
access publishers
Les faux amis et les vrais ennemis

Financeurs de la recherche
Wellcome Trust
Union européenne
• Horizon 2020
• FP7
Qui paie?
Ex. Royaume-Uni, voir :
Pinfield S. The Cost of Gold Open Access: A Case Study of the UK [En ligne]. 12 octobre 2015.
Disponible sur : <
http://jao2015.sciencesconf.org/conference/jao2015/pages/Couperin_Paris_201510.pdf >
Matthews D. « Open access fees hike universities’ journal bills ». In : Times Higher
Education, 2015. Disponible sur : < https://www.timeshighereducation.com/news/open-
access-fees-hike-universities-journal-bills >

Qui paie?
Source : Wellcome Trust. The Reckoning: An Analysis of Wellcome Trust Open Access Spend 2013-14 [En ligne].
Wellcome Trust Blog. Disponible sur : < http://blog.wellcome.ac.uk/2015/03/03/the-reckoning-an-analysis-of-
wellcome-trust-open-access-spend-2013-14/ >
The second key finding is that the average APC levied by hybrid journals is 64% higher than the
average APC charged by a fully OA title. This higher average fee is despite the fact that hybrid
journals also enjoy a revenue stream from subscriptions.

Qui paie?
Source : Dutch boycott of Elsevier – a game changer? | Unlocking Research [En ligne].
Disponible sur : < https://unlockingresearch.blog.lib.cam.ac.uk/?p=192 >
Elsevier is the world’s largest academic publisher. According to their Annual
Report the 2014 STM revenue was £2,048 million, with an operating profit of
£762 million. This is a profit margin of 37%. That means if we pay an Article
Processing Charge of $3000 then $1,170 of that (taxpayers’) money goes
directly to the shareholders of Elsevier.
The numbers involved in this space are staggering. The Wellcome Trust
stated in their report on 3 March 2015 The Reckoning: An Analysis of
Wellcome Trust Open Access Spend 2013 – 14: ‘The two traditional,
subscription-based publishers (Elsevier and Wiley) represent some 40% of
our total APC spend’.
And the RCUK has had similar results, as described in a Times Higher
Education article on 16 April 2015 Publishers share £10m in APC
payments: “Publishers Elsevier and Wiley have each received about £2
million in article processing charges from 55 institutions as a result of
RCUK’s open access policy”.

Le juste prix?
Source : Van Noorden R. « Open access: The true cost of science publishing ». Nature. 27 mars 2013. Vol.
495, n°7442, p. 426-429. Disponible sur : < http://dx.doi.org/10.1038/495426a >

Source : Theo A. « Gold Open Access : Counting the Costs ». Ariadne. 3 décembre 2012. Disponible sur : <
http://www.ariadne.ac.uk/print/issue70/andrew >
Voir aussi sur le site de l’Australian Open Access Support Group :
• Paying for Publication
• Cost of hybrid
Le juste prix?

Par hamed masoumi - Source : Flick’r
Perspectives

Perspectives
« Si nous voulons
que tout reste tel
que c’est, il faut
que tout
change.»
Le Guépard, Giuseppe
Tomasi di Lampedusa, trad.
Jean-Paul Manganaro

Developing an Effective Market for Open Access Article Processing
Charges - Bo-Christer Björk and David Solomon - CC-BY
Perspectives

Perspectives
Source : Kassab S. Perceptions de l’Open Access par les marchés financiers [En ligne]. 12 octobre 2015. Disponible sur :
<http://jao2015.sciencesconf.org/conference/jao2015/pages/Presentation_Sami_Kassab_12_Octobre_2015.pdf >

Perspectives
“The rise of Open Access appears to inflict
little or no damage on the leading
subscription publishers.
• Subscription publishing appears in good
health.
• The threat posed by OA seems to recede.
• OA funding may in fact be adding to the
profits of STM.”
Source : Aspesi C., Luong H. Reed Elsevier: Goodbye to Berlin - The Fading
Threat of Open Access (Upgrade to Market-Perform) [En ligne]. 24 septembre
2014. Disponible sur : < http://www.richardpoynder.co.uk/Aspesi.pdf >
(consulté le 27 octobre 2015)

http://www.leru.org/files/general/LERU%20Statement%20Moving%
20Forwards%20on%20Open%20Access(1).pdf
Perspectives

Green open access :
la voie verte

 Auto-archivage
 Dépôt sans retrait
→ Garantie scientifique
→ Possibilité de déposer des versions successives
 Modération de base ≠ peer review
 Respect des droits d’auteur et d’éditeur
 Tous types de publication
Dans HAL : de niveau scientifique recherche (pas de thèse d’exercice)
 A différents stades de publication
→ Preprints = version auteur avant peer review
→ Postprints = version auteur après peer review
→ Publications = PDF éditeur
→ Documents non publiés
Les archives ouvertes

Le postprint
Manuscrit auteur
de la version
définitive de
l’article accepté
pour publication,
avec les
modifications
apportées par le
comité de lecture,
mais sans la mise
en forme de
l’éditeur
≠ épreuves

La position des éditeurs
http://www.oaspectrum.org
http://www.sherpa.ac.uk/romeo/index.php

Les amis?
http://repositories.webometrics.info/en/top_portals

ResearchGate, Academia et Mendeley
Dans cette édition, ces trois services sont classés sous la rubrique
« Portails ». Ce n’est pas une situation courante, mais les auteurs
déposent parfois leurs articles sur ces sites au lieu de les déposer
dans leur archive institutionnelle. La valeur ajoutée limitée apportée
par la génération actuelle des logiciels d’archives ouvertes et
l’incapacité des bibliothécaires et des webmestres de ces archives à
améliorer leurs options de créations de profil et de personnalisation
conduisent à cette malheureuse tendance émergente.
Nous montrons donc la bonne performance de ces « compétiteurs »
afin de susciter une plus grande prise de conscience : il est
absolument nécessaire d’améliorer les archives ouvertes avec une
forte orientation vers l’utilisateur final (les auteurs ).
Traduction de : Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) C. L. « Corrected July 2015: New
edition description. » In : Ranking Web of Repositories [En ligne]. Disponible sur : <
http://repositories.webometrics.info/en/node/29 > (consulté le 1 septembre 2015).
Les amis?

Les amis?
• Conditions de réutilisation
des données téléchargées
imprécises
• Démarche individuelle
• Société commerciale : for
profit
• Les articles sont en accès
libre sans formalités
• Démarche pour l’intérêt
général
• Etablissement public :
non profit
• HAL : archivage pérenne
des articles déposés
Post sur ResearchGate : Does ResearchGate's promotion of user/author 'self-archiving' help or harm the
cause of open access publishing?
Diffuser ses articles par le
biais d’un réseau social
Déposer ses articles dans
une archive ouverte
ResearchGate propose désormais des liens
vers des sites tiers : il détecte
automatiquement le texte intégral déposé
dans HAL et permet d’y accéder depuis RG
→

Déposer des données?
https://www.timeshighereducation.com/news/papers-retracted-after-authors-used-
unauthorised-data-from-junior-researchers
https://zenodo.org/

HAL : 2 idées fausses
Dans HAL,
on trouve
n’importe
quoi
Personne ne connaît HAL en
dehors de la France (et encore)

HAL
et
HAL-UPMC
Parsperedenn-Source:Flick’r
HAL-UPMC = Ensemble des
dépôts dans HAL dont au
moins l’un des auteurs est
affilié à un labo UPMC,
quel que soit le portail de
dépôt utilisé (HAL-Inserm,
HAL générique, TEL, etc.)

halupmc@upmc.fr
Support BUPMC
• Vérification des dépôts
• Réponse à vos questions sur le libre accès
• Veille sur les publications UPMC et
« message HAL » aux auteurs
• Dépôt des articles en texte intégral

Administration du portail HAL-UPMC
• Création et paramétrage des collections
• Gestion des utilisateurs
• Gestion des référentiels http://aurehal.archives-ouvertes.fr/
› Structures de recherche
› « Formes auteurs »
• Modification des métadonnées de tous
les dépôts du portail
halupmc@upmc.fr

Les structures de recherche dans HAL
Institution
Laboratoire
Département
Equipe

Source : Flick’r – Sam Hames
Les services HAL : les
collections

Pourquoi une collection?
Collection dans HAL =
• corpus d’articles répondant à un
(ou des) critère(s), par ex.
code(s) UMR, ou requête multi-
critères ;
• auquel on peut ajouter des
articles manuellement ;
• peut être gérée par un
utilisateur.
1 collection a été
créée pour chacun
des laboratoires
actuels de l’UPMC

http://hal.upmc.fr/LISE
Une interface personnalisable

Des statistiques sur les dépôts

Réutilisation dans un site tiers
Alimentation
automatique de
la page
« Publications »
d’un site web

Outils développés par les utilisateurs
page Bibliopedia

Par : Dennis Skley - BY-ND – Source : Flick’r
Les services HAL : la page
chercheur

Pourquoi une page
chercheur dans HAL?
Page chercheur dans HAL =
• page web personnalisable,
• alimentée automatiquement par les dépôts
faits dans HAL,
• dynamique,
• connectable avec vos autres identifiants :
ORCID, ResearcherID, arXiv, IdRef, Twitter,
Facebook, Google, LinkedIn + lien vers un blog.

Autres nouveautés de Mon espace
• Mes partages de propriété
Plusieurs utilisateurs peuvent être propriétaires d’un dépôt :
modifier les métadonnées + déposer nouvelle version
• Mes documents sur l’espace FTP
L’espace FTP permet de transférer des fichiers de grande taille
(>100Mo)
• Mes recherches
• Ma bibliothèque
2 étapes

Voir les
documents
associés et les
sélectionner
Mon IdHAL
IdHAL proposé =
prénom+nom
Non modifiable
une fois créé

Personnaliser la page
Mon CV/Mes publications

Mon CV/Mes publications
Modifier l’ordre
d’affichage
Exemples :
Julien Sarrazin, Abderrezak
Rachedi, Philippe Gambette

4. Trouver des
publications en libre accès

4.1 Les moteurs de recherche
Auteur : Duncan Hull
CC-BY - Source : Flickr

Indexe le web scientifique (y compris pages
personnelles de chercheurs)
Google Scholar
couverture réelle inconnue
http://scholar.google.com
En savoir + sur l’invention de Google Scholar ici

afficher toutes les versions
disponibles en ligne
export de la référence au format
BibTeX ou RIS [à paramétrer]
Google Scholar
lien vers le
texte intégraltexte intégral accessible
par l’UPMC : lien vers le
menu SFX [à paramétrer]
En savoir + : support de formation Google Scholar
BUPMC

Google Scholar All n versions
archive
ouverte
Version postée sur academia.edu n’apparaît pas
Source : Mounce, Ross. « Easy steps towards open scholarship ». Ross Mounce. Consulté le 23
septembre 2014. http://rossmounce.co.uk/2013/05/20/easy-steps-towards-open-
scholarship/.
site
personnel?

BASE - Bielefeld Academic Search Engine
archive ouverte
http://www.base-search.net
• Indexe des archives ouvertes et des revues en libre
accès - indexe les métadonnées et non le texte
intégral
• Liste des sources avec indication du taux de
documents en libre accès (quand possible)

BASE - Bielefeld Academic Search Engine
Quelles différences avec Google Scholar ?
(outre la couverture + outil développé par université)
• Recherche avancée riche :
• outils linguistiques
• nbre de champs
• caractères spéciaux ( troncature)
• Résultats
• critères de tri
• affinage et filtres
• Requêtes sauvegardées

CORE - COnnecting REpositories
http://core.kmi.open.ac.uk/
• Indexe des archives ouvertes
• Indexe les métadonnées et le texte intégral
• Outil de découverte : propose des articles de
contenu similaire

4.2 Autres moyens
Auteur : Janneke Adema
CC-BY - Source : http://openreflections.wordpress.com/2010/01/26/ape-2010-open-access-and-thinking-beyond-the-document/

Open Access Button
(v2 oct. 2014)
https://www.openaccessbutton.org
• Bookmarklet
• Développée par 2 étudiants et soutenue
(notamment) par Right to Reseach Coalition
• Fonctionnalités :
› trouver des publications en libre accès
› augmenter le nombre de publications en
libre accès
› militer (advocay)

• Alimente une carte des paywalls
• Cherche dans Google Scholar et Core
• Si aucune version de l’article n’est disponible :
› Courriel à l’auteur pour demander la mise en libre
accès de l’article : si réponse positive, article
envoyé à tous les utilisateurs qui l’ont demandé
› Création d’une page pour chaque article demandé
• En savoir + :
https://www.openaccessbutton.org/about
Open Access Button
(v2 oct. 2014)

Lazy Scholar
http://www.lazyscholar.org
• Extension Google Chrome
• Recherche automatiquement le texte intégral dans
Google Scholar
• Outil de découverte : propose articles de contenu
similaire

Lazy Scholar
En +
• Copie rapide de la référence sous forme de
citation dans le presse-papiers (très peu de
formats)
• Recherche rapide dans Google Scholar :
• le texte sélectionné sur une page web (clic
droit)
• Préfixe « ls » dans barre d’adresse / « ls
pm » pour rechercher dans PubMed
• Poster d’un clic sur Twitter avec le hashtag
#icanhazpdf

Twitter #icanhazpdf [pas du libre accès et pas vraiment légal]

• D’abord utilisé par/créé pour
journalistes et blogueurs scientifiques
(i. e. sans accès institutionnel aux
publications scientifiques)
• Débat ici : How #icanhazpdf can hurt
our academic libraries, et là :
#icanhazpdf : Civil disobedience?
• Analyse là : Interactions : The Numbers
Behind #ICanHazPDF et sur Rue89
Twitter #icanhazpdf [pas du libre accès et pas vraiment légal]

http://openaccess.couperin.org/

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