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Mini-manual
R-commander
R-commander
O R-Commander es una Interfaz Gráfica de

Usuario (GUI en inglés), creada por John
Fox, que permite acceder a muchas
capacidades del entorno estadístico R sin
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entorno.
Características
O

R proporciona un amplio abanico de herramientas estadísticas
(modelos lineales y no lineales, tests estadísticos, análisis de series
temporales, algoritmos de clasificación y agrupamiento, etc.) y
gráficas.
O Al igual que S, se trata de un lenguaje de programación, lo que permite
que los usuarios lo extiendan definiendo sus propias funciones. De
hecho, gran parte de las funciones de R están escritas en el mismo R,
aunque para algoritmos computacionalmente exigentes es posible
desarrollar bibliotecas en C, C++ o Fortran que se cargan
dinámicamente. Los usuarios más avanzados pueden también
manipular los objetos de R directamente desde código desarrollado en
C. R también puede extenderse a través de paquetes desarrollados por
su comunidad de usuarios.
O R hereda de S su orientación a objetos. La tarea de extender R se ve
facilitada por su permisiva política de lexical scoping.
O Además, R puede integrarse con distintas bases de datos .
O Empezaremos por:
O El archivo de instalación del software lo

puedes encontrar aqui:
http://cran.es.rproject.org/bin/windows/base/R-2.15.2win.exe
O Instalacion
O Ejecutar R
Así R está listo para funcionar como software de análisis de datos y
producción de gráficos. No obstante, R es origen un software "línea
de comandos", requiere el uso de instrucciones tipo texto para
funcionar.
Para hacerlo más fácil, podemos instalar R Commander, un plugin
que incorpora la navegación por menús más habitual.
Tenemos la siguiente Interfaz
EJECUTAR COMANDOS
O Si se desea ejecutar un único comando basta

con situar el cursor en cualquier punto del
comando y pulsar Submit . Si se desean
ejecutar varios comandos conjuntamente hay
que seleccionarlos todos con el ratón y a
continuación pulsar Submit . Las opciones
son: − File: para abrir ficheros con
instrucciones a ejecutar, o para guardar
datos, resultados, sintaxis, etc. − Edit: las
típicas opciones para cortar, pegar, borrar,
etc.
LECTURA DE DATOS DE UN FICHERO
EXTERNO
Abre una archivo que tenga una
base de datos
experimento_caso.xlsx en MS
Excel o similar
Copia todos los datos de la hoja
de cálculo al portapapeles.
A continuación, arrancad R, y
activad con library (Rcmdr) la
interfaz guiada de R
Commander
R asigna nombres a datos y a resultados de análisis

El origen de los datos en este caso: el portapapele

y la separación de columnas "Tabuladores"

la selección de coma o punto como delimitador de
decimales depende de la configuración regional del PC –
lo habitual en Español es que Windows use coma por
defecto
En R Commander, usad el menú Datos / Importar
datos para cargar los datos que desde el
portapapeles
Comprueba que los datos han sido importados
correctamente con Visualizar conjunto de datos
Los datos incluyen
- La variable que queremos evaluar  número de castañas
germinadas en el suelo del bosque
- Tratamientos experimentales: distintas condiciones aplicadas a
las castañas a fin de evaluar que factores afectan a la
germinación (predación, cobertura de mantillo)
O CERRAR R.
O Hay varias maneras de terminar su sesión en R.

Por ejemplo, puede seleccionar Fichero→Salir→
de Commander y R en los menús de R
Commander.
O Se le pedirá que conrme si desea salir, y a
continuación si quiere guardar los
O contenidos de la ventana de instrucciones y de
resultados. Del mismo modo, puede seleccionar
Fichero→Salir en R Console; en este caso, se le
preguntará si quiere guardar el área de trabajo R
(p.e., los datos que R guarda en la memoria);
normalmente contestará No.
Prueba de hipótesis e intervalo
de confianza para una
proporción.
Contraste la hipótesis nula de que la proporción de
respuesta positiva después del parto (aclact1) es
igual a 0,5. Construya el intervalo de confianza al
95% para la proporción poblacional de respuesta
positiva.
Resultados

rechazamos la hipótesis nula de que la proporción sea 0,5 con
p=0,002304.

Nótese que el estadístico X-squared es equivalente en valor de p a
la prueba z para una proporción.
Ejemplo
O Los siguientes datos corresponden al

rendimiento por hectárea de cierta nueva
variedad de trigo, medido en 9 lotes
experimentales: 3,35; 3,92; 4,26; 3,36; 3,72;
4,19, 3,42; 4,38; 4,5.
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Análisis R-Commander datos germinación castañas

  • 3. R-commander O R-Commander es una Interfaz Gráfica de Usuario (GUI en inglés), creada por John Fox, que permite acceder a muchas capacidades del entorno estadístico R sin que el usuario tenga que conocer el lenguaje de comandos propio de este entorno.
  • 4. Características O R proporciona un amplio abanico de herramientas estadísticas (modelos lineales y no lineales, tests estadísticos, análisis de series temporales, algoritmos de clasificación y agrupamiento, etc.) y gráficas. O Al igual que S, se trata de un lenguaje de programación, lo que permite que los usuarios lo extiendan definiendo sus propias funciones. De hecho, gran parte de las funciones de R están escritas en el mismo R, aunque para algoritmos computacionalmente exigentes es posible desarrollar bibliotecas en C, C++ o Fortran que se cargan dinámicamente. Los usuarios más avanzados pueden también manipular los objetos de R directamente desde código desarrollado en C. R también puede extenderse a través de paquetes desarrollados por su comunidad de usuarios. O R hereda de S su orientación a objetos. La tarea de extender R se ve facilitada por su permisiva política de lexical scoping. O Además, R puede integrarse con distintas bases de datos .
  • 5. O Empezaremos por: O El archivo de instalación del software lo puedes encontrar aqui: http://cran.es.rproject.org/bin/windows/base/R-2.15.2win.exe O Instalacion O Ejecutar R
  • 6. Así R está listo para funcionar como software de análisis de datos y producción de gráficos. No obstante, R es origen un software "línea de comandos", requiere el uso de instrucciones tipo texto para funcionar. Para hacerlo más fácil, podemos instalar R Commander, un plugin que incorpora la navegación por menús más habitual. Tenemos la siguiente Interfaz
  • 7.
  • 8. EJECUTAR COMANDOS O Si se desea ejecutar un único comando basta con situar el cursor en cualquier punto del comando y pulsar Submit . Si se desean ejecutar varios comandos conjuntamente hay que seleccionarlos todos con el ratón y a continuación pulsar Submit . Las opciones son: − File: para abrir ficheros con instrucciones a ejecutar, o para guardar datos, resultados, sintaxis, etc. − Edit: las típicas opciones para cortar, pegar, borrar, etc.
  • 9. LECTURA DE DATOS DE UN FICHERO EXTERNO Abre una archivo que tenga una base de datos experimento_caso.xlsx en MS Excel o similar Copia todos los datos de la hoja de cálculo al portapapeles. A continuación, arrancad R, y activad con library (Rcmdr) la interfaz guiada de R Commander
  • 10. R asigna nombres a datos y a resultados de análisis El origen de los datos en este caso: el portapapele y la separación de columnas "Tabuladores" la selección de coma o punto como delimitador de decimales depende de la configuración regional del PC – lo habitual en Español es que Windows use coma por defecto
  • 11. En R Commander, usad el menú Datos / Importar datos para cargar los datos que desde el portapapeles
  • 12. Comprueba que los datos han sido importados correctamente con Visualizar conjunto de datos
  • 13. Los datos incluyen - La variable que queremos evaluar  número de castañas germinadas en el suelo del bosque - Tratamientos experimentales: distintas condiciones aplicadas a las castañas a fin de evaluar que factores afectan a la germinación (predación, cobertura de mantillo)
  • 14. O CERRAR R. O Hay varias maneras de terminar su sesión en R. Por ejemplo, puede seleccionar Fichero→Salir→ de Commander y R en los menús de R Commander. O Se le pedirá que conrme si desea salir, y a continuación si quiere guardar los O contenidos de la ventana de instrucciones y de resultados. Del mismo modo, puede seleccionar Fichero→Salir en R Console; en este caso, se le preguntará si quiere guardar el área de trabajo R (p.e., los datos que R guarda en la memoria); normalmente contestará No.
  • 15. Prueba de hipótesis e intervalo de confianza para una proporción. Contraste la hipótesis nula de que la proporción de respuesta positiva después del parto (aclact1) es igual a 0,5. Construya el intervalo de confianza al 95% para la proporción poblacional de respuesta positiva.
  • 16.
  • 17. Resultados rechazamos la hipótesis nula de que la proporción sea 0,5 con p=0,002304. Nótese que el estadístico X-squared es equivalente en valor de p a la prueba z para una proporción.
  • 18. Ejemplo O Los siguientes datos corresponden al rendimiento por hectárea de cierta nueva variedad de trigo, medido en 9 lotes experimentales: 3,35; 3,92; 4,26; 3,36; 3,72; 4,19, 3,42; 4,38; 4,5. A )Construya un intervalo de confianza al 90% de confianza para el rendimiento promedio de la nueva variedad de trigo si suponemos que el rendimiento por hectárea se distribuye aproximadamente normal.